data_1A25
#
_model_server_result.job_id            PMUsw7GCfPb7TcVfcDBEMw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-04 07:20:14' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1a25 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":290}' 
#
_entry.id    1A25 
#
_exptl.entry_id    1A25 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1A25 
_cell.length_a            77.798 
_cell.length_b            77.798 
_cell.length_c            140.826 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1A25 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        96 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43 21 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A O MET 46 A MET 186 1_555 D CA CA . A CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 47 A ASP 187 1_555 C CA CA . A CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 47 A ASP 187 1_555 C CA CA . A CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.482 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASP 47 A ASP 187 1_555 D CA CA . A CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? 
metalc ? metalc5 A OD2 ASP 53 A ASP 193 1_555 C CA CA . A CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? 
metalc ? metalc6 A OD2 ASP 106 A ASP 246 1_555 C CA CA . A CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.209 ? 
metalc ? metalc7 A OD1 ASP 106 A ASP 246 1_555 C CA CA . A CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? 
metalc ? metalc8 A OD2 ASP 106 A ASP 246 1_555 D CA CA . A CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
metalc ? metalc9 A O TRP 107 A TRP 247 1_555 C CA CA . A CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc10 A OD1 ASP 108 A ASP 248 1_555 C CA CA . A CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
metalc ? metalc11 A OD2 ASP 108 A ASP 248 1_555 D CA CA . A CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? 
metalc ? metalc12 A OD1 ASP 108 A ASP 248 1_555 D CA CA . A CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.591 ? 
metalc ? metalc13 A OD2 ASP 108 A ASP 248 1_555 E CA CA . A CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? 
metalc ? metalc14 A OG SER 111 A SER 251 1_555 E CA CA . A CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? 
metalc ? metalc15 A O ARG 112 A ARG 252 1_555 E CA CA . A CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? 
metalc ? metalc16 A OD2 ASP 114 A ASP 254 1_555 D CA CA . A CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc17 A OD1 ASP 114 A ASP 254 1_555 E CA CA . A CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.569 ? 
metalc ? metalc18 A OE1 GLU 141 A GLU 281 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? 
metalc ? metalc19 A OE2 GLU 141 A GLU 281 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? 
metalc ? metalc20 A OE2 GLU 141 A GLU 281 1_555 H CA CA . B CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.414 ? 
metalc ? metalc21 D CA CA . A CA 291 1_555 B OE2 GLU 141 B GLU 281 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.921 ? 
metalc ? metalc22 D CA CA . A CA 291 1_555 B OE1 GLU 141 B GLU 281 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.63 ? 
metalc ? metalc23 E CA CA . A CA 292 1_555 B OE2 GLU 141 B GLU 281 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc24 B O MET 46 B MET 186 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.644 ? 
metalc ? metalc25 B OD1 ASP 47 B ASP 187 1_555 F CA CA . B CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.619 ? 
metalc ? metalc26 B OD2 ASP 47 B ASP 187 1_555 F CA CA . B CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? 
metalc ? metalc27 B OD1 ASP 47 B ASP 187 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.365 ? 
metalc ? metalc28 B OD2 ASP 53 B ASP 193 1_555 F CA CA . B CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.32 ? 
metalc ? metalc29 B OD1 ASP 106 B ASP 246 1_555 F CA CA . B CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc30 B OD2 ASP 106 B ASP 246 1_555 F CA CA . B CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.033 ? 
metalc ? metalc31 B OD2 ASP 106 B ASP 246 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? 
metalc ? metalc32 B O TRP 107 B TRP 247 1_555 F CA CA . B CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.34 ? 
metalc ? metalc33 B OD1 ASP 108 B ASP 248 1_555 F CA CA . B CA 290 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
metalc ? metalc34 B OD2 ASP 108 B ASP 248 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.506 ? 
metalc ? metalc35 B OD1 ASP 108 B ASP 248 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.615 ? 
metalc ? metalc36 B OD2 ASP 108 B ASP 248 1_555 H CA CA . B CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.492 ? 
metalc ? metalc37 B OG SER 111 B SER 251 1_555 H CA CA . B CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.674 ? 
metalc ? metalc38 B O ARG 112 B ARG 252 1_555 H CA CA . B CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? 
metalc ? metalc39 B OD2 ASP 114 B ASP 254 1_555 G CA CA . B CA 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.442 ? 
metalc ? metalc40 B OD1 ASP 114 B ASP 254 1_555 H CA CA . B CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
metalc ? metalc41 B OD2 ASP 114 B ASP 254 1_555 H CA CA . B CA 292 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.375 ? 
metalc ? metalc42 F CA CA . B CA 290 1_555 K O HOH . B HOH 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.543 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1A25 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012854 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.012854 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007101 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 CA A 1 290 289 CA CA . 
D 2 CA A 1 291 290 CA CA . 
E 2 CA A 1 292 291 CA CA . 
F 2 CA B 1 290 289 CA CA . 
G 2 CA B 1 291 290 CA CA . 
H 2 CA B 1 292 291 CA CA . 
I 3 PSE B 1 1 1 PSE PSE . 
J 4 HOH A 1 2 2 HOH HOH . 
J 4 HOH A 2 4 4 HOH HOH . 
J 4 HOH A 3 5 5 HOH HOH . 
J 4 HOH A 4 6 6 HOH HOH . 
J 4 HOH A 5 8 8 HOH HOH . 
J 4 HOH A 6 10 10 HOH HOH . 
J 4 HOH A 7 11 11 HOH HOH . 
J 4 HOH A 8 14 14 HOH HOH . 
J 4 HOH A 9 16 16 HOH HOH . 
J 4 HOH A 10 17 17 HOH HOH . 
J 4 HOH A 11 19 19 HOH HOH . 
J 4 HOH A 12 24 24 HOH HOH . 
J 4 HOH A 13 25 25 HOH HOH . 
J 4 HOH A 14 27 27 HOH HOH . 
J 4 HOH A 15 29 29 HOH HOH . 
J 4 HOH A 16 32 32 HOH HOH . 
J 4 HOH A 17 35 35 HOH HOH . 
J 4 HOH A 18 36 36 HOH HOH . 
J 4 HOH A 19 37 37 HOH HOH . 
J 4 HOH A 20 38 38 HOH HOH . 
J 4 HOH A 21 41 41 HOH HOH . 
J 4 HOH A 22 42 42 HOH HOH . 
J 4 HOH A 23 43 43 HOH HOH . 
J 4 HOH A 24 44 44 HOH HOH . 
J 4 HOH A 25 47 47 HOH HOH . 
J 4 HOH A 26 48 48 HOH HOH . 
K 4 HOH B 1 293 1 HOH HOH . 
K 4 HOH B 2 294 3 HOH HOH . 
K 4 HOH B 3 295 7 HOH HOH . 
K 4 HOH B 4 296 9 HOH HOH . 
K 4 HOH B 5 297 12 HOH HOH . 
K 4 HOH B 6 298 13 HOH HOH . 
K 4 HOH B 7 299 15 HOH HOH . 
K 4 HOH B 8 300 18 HOH HOH . 
K 4 HOH B 9 301 20 HOH HOH . 
K 4 HOH B 10 302 21 HOH HOH . 
K 4 HOH B 11 303 22 HOH HOH . 
K 4 HOH B 12 304 23 HOH HOH . 
K 4 HOH B 13 305 26 HOH HOH . 
K 4 HOH B 14 306 28 HOH HOH . 
K 4 HOH B 15 307 30 HOH HOH . 
K 4 HOH B 16 308 31 HOH HOH . 
K 4 HOH B 17 309 33 HOH HOH . 
K 4 HOH B 18 310 34 HOH HOH . 
K 4 HOH B 19 311 39 HOH HOH . 
K 4 HOH B 20 312 40 HOH HOH . 
K 4 HOH B 21 313 45 HOH HOH . 
K 4 HOH B 22 314 46 HOH HOH . 
K 4 HOH B 23 315 49 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         F 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -4.936 
_atom_site.Cartn_y               42.363 
_atom_site.Cartn_z               8.498 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        22.66 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           290 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           14 
_model_server_stats.create_model_time_ms    16 
_model_server_stats.query_time_ms           282 
_model_server_stats.encode_time_ms          6 
_model_server_stats.element_count           1 
#