data_1A52 # _model_server_result.job_id UXdAAcxKiO5ZUmOF_kol-w _model_server_result.datetime_utc '2024-10-12 05:29:14' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1a52 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":1}' # _entry.id 1A52 # _exptl.entry_id 1A52 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 272.382 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description ESTRADIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1A52 _cell.length_a 147 _cell.length_b 147 _cell.length_c 168.9 _cell.Z_PDB 36 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1A52 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 155 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'H 3 2' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 2 PISA tetrameric 4 software_defined_assembly 3 PISA dimeric 2 software_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 1 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L 2 1,2 A,C,D,E,F,K 3 1,3 B,G,H,I,J,L 3 2,4 A,C,D,E,F,K 4 1 B,G,H,I,J,L 4 2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 5_556 x-y,-y,-z+1 1 0 0 0 -1 0 0 0 -1 0 0 168.9 3 'crystal symmetry operation' 10_546 y+2/3,x-2/3,-z+4/3 -0.5 0.866025 0 0.866025 0.5 0 0 0 -1 147 -84.87049 225.2 4 'crystal symmetry operation' 8_545 -y+2/3,x-y-2/3,z+1/3 -0.5 -0.866025 0 0.866025 -0.5 0 0 0 1 147 -84.87049 56.3 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 D AU AU . A AU 2 1_555 A NE2 HIS 180 A HIS 476 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.326 ? metalc ? metalc2 H AU AU . B AU 12 1_555 B NE2 HIS 180 B HIS 476 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? # _chem_comp.formula 'C18 H24 O2' _chem_comp.formula_weight 272.382 _chem_comp.id EST _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name ESTRADIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 EST doub 83 n y C1 C10 EST sing 84 n y C1 H1 EST sing 85 n n C2 C3 EST sing 86 n y C2 H2 EST sing 87 n n C3 O3 EST sing 88 n n C3 C4 EST doub 89 n y O3 HO3 EST sing 90 n n C4 C5 EST sing 91 n y C4 H4 EST sing 92 n n C5 C6 EST sing 93 n n C5 C10 EST doub 94 n y C6 C7 EST sing 95 n n C6 H61 EST sing 96 n n C6 H62 EST sing 97 n n C7 C8 EST sing 98 n n C7 H71 EST sing 99 n n C7 H72 EST sing 100 n n C8 C9 EST sing 101 n n C8 C14 EST sing 102 n n C8 H8 EST sing 103 n n C9 C10 EST sing 104 n n C9 C11 EST sing 105 n n C9 H9 EST sing 106 n n C11 C12 EST sing 107 n n C11 H111 EST sing 108 n n C11 H112 EST sing 109 n n C12 C13 EST sing 110 n n C12 H121 EST sing 111 n n C12 H122 EST sing 112 n n C13 C14 EST sing 113 n n C13 C17 EST sing 114 n n C13 C18 EST sing 115 n n C14 C15 EST sing 116 n n C14 H14 EST sing 117 n n C15 C16 EST sing 118 n n C15 H151 EST sing 119 n n C15 H152 EST sing 120 n n C16 C17 EST sing 121 n n C16 H161 EST sing 122 n n C16 H162 EST sing 123 n n C17 O17 EST sing 124 n n C17 H17 EST sing 125 n n O17 HO7 EST sing 126 n n C18 H181 EST sing 127 n n C18 H182 EST sing 128 n n C18 H183 EST sing 129 n n # _atom_sites.entry_id 1A52 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.006803 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.003928 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.007855 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.005921 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 EST A 1 1 1 EST EST . D 3 AU A 1 2 2 AU AU . E 3 AU A 1 3 3 AU AU . F 3 AU A 1 5 5 AU AU . G 2 EST B 1 2 2 EST EST . H 3 AU B 1 12 12 AU AU . I 3 AU B 1 13 13 AU AU . J 3 AU B 1 15 15 AU AU . K 4 HOH A 1 555 3 HOH HOH . K 4 HOH A 2 556 6 HOH HOH . K 4 HOH A 3 557 8 HOH HOH . K 4 HOH A 4 558 13 HOH HOH . K 4 HOH A 5 559 24 HOH HOH . K 4 HOH A 6 560 27 HOH HOH . K 4 HOH A 7 561 31 HOH HOH . K 4 HOH A 8 562 38 HOH HOH . K 4 HOH A 9 563 45 HOH HOH . K 4 HOH A 10 564 50 HOH HOH . L 4 HOH B 1 4 4 HOH HOH . L 4 HOH B 2 10 10 HOH HOH . L 4 HOH B 3 17 17 HOH HOH . L 4 HOH B 4 18 18 HOH HOH . L 4 HOH B 5 19 19 HOH HOH . L 4 HOH B 6 20 20 HOH HOH . L 4 HOH B 7 21 21 HOH HOH . L 4 HOH B 8 23 23 HOH HOH . L 4 HOH B 9 25 25 HOH HOH . L 4 HOH B 10 28 28 HOH HOH . L 4 HOH B 11 35 35 HOH HOH . L 4 HOH B 12 39 39 HOH HOH . L 4 HOH B 13 40 40 HOH HOH . L 4 HOH B 14 41 41 HOH HOH . L 4 HOH B 15 42 42 HOH HOH . L 4 HOH B 16 43 43 HOH HOH . L 4 HOH B 17 44 44 HOH HOH . L 4 HOH B 18 46 46 HOH HOH . L 4 HOH B 19 49 49 HOH HOH . L 4 HOH B 20 51 51 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 EST . . . C 2 107.008 15.86 99.456 1 45.94 ? C1 EST 1 A 1 HETATM 2 C C2 EST . . . C 2 106.932 16.93 100.366 1 45.69 ? C2 EST 1 A 1 HETATM 3 C C3 EST . . . C 2 106.833 18.229 99.892 1 46.02 ? C3 EST 1 A 1 HETATM 4 O O3 EST . . . C 2 106.801 19.239 100.813 1 46.45 ? O3 EST 1 A 1 HETATM 5 C C4 EST . . . C 2 106.793 18.503 98.487 1 46.12 ? C4 EST 1 A 1 HETATM 6 C C5 EST . . . C 2 106.876 17.424 97.544 1 46.33 ? C5 EST 1 A 1 HETATM 7 C C6 EST . . . C 2 106.938 17.714 96.043 1 46.47 ? C6 EST 1 A 1 HETATM 8 C C7 EST . . . C 2 107.309 16.503 95.165 1 46.66 ? C7 EST 1 A 1 HETATM 9 C C8 EST . . . C 2 106.672 15.191 95.681 1 45.82 ? C8 EST 1 A 1 HETATM 10 C C9 EST . . . C 2 107.19 14.87 97.123 1 44.99 ? C9 EST 1 A 1 HETATM 11 C C10 EST . . . C 2 106.998 16.065 98.05 1 45.58 ? C10 EST 1 A 1 HETATM 12 C C11 EST . . . C 2 106.59 13.552 97.642 1 45.46 ? C11 EST 1 A 1 HETATM 13 C C12 EST . . . C 2 106.782 12.364 96.667 1 45.93 ? C12 EST 1 A 1 HETATM 14 C C13 EST . . . C 2 106.322 12.668 95.24 1 46.73 ? C13 EST 1 A 1 HETATM 15 C C14 EST . . . C 2 107.02 13.991 94.766 1 46.06 ? C14 EST 1 A 1 HETATM 16 C C15 EST . . . C 2 106.743 14.016 93.262 1 46.15 ? C15 EST 1 A 1 HETATM 17 C C16 EST . . . C 2 106.965 12.544 92.837 1 47.09 ? C16 EST 1 A 1 HETATM 18 C C17 EST . . . C 2 106.876 11.691 94.171 1 47.06 ? C17 EST 1 A 1 HETATM 19 O O17 EST . . . C 2 106.197 10.417 93.968 1 47.62 ? O17 EST 1 A 1 HETATM 20 C C18 EST . . . C 2 104.76 12.691 95.14 1 47.31 ? C18 EST 1 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 313 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 20 #