data_1AFB
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_entity.details                     ? 
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_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
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_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
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_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 
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_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
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_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
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loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 D N N 
? 2 I N N 
? 2 M N N 
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loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
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_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
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_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
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_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 56 1 CYS 128 1_555 A SG CYS 150 1 CYS 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 128 1 CYS 200 1_555 A SG CYS 142 1 CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 56 2 CYS 128 1_555 B SG CYS 150 2 CYS 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 128 2 CYS 200 1_555 B SG CYS 142 2 CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf5 C SG CYS 56 3 CYS 128 1_555 C SG CYS 150 3 CYS 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf6 C SG CYS 128 3 CYS 200 1_555 C SG CYS 142 3 CYS 214 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
metalc ? metalc1 D O4 NGA . 1 NGA 1 1_555 F CA CA . 1 CA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.662 ? 
metalc ? metalc2 D O3 NGA . 1 NGA 1 1_555 F CA CA . 1 CA 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? 
metalc ? metalc3 F CA CA . 1 CA 2 1_555 A OE1 GLN 113 1 GLN 185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? 
metalc ? metalc4 F CA CA . 1 CA 2 1_555 A OD1 ASP 115 1 ASP 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.445 ? 
metalc ? metalc5 F CA CA . 1 CA 2 1_555 A OE1 GLU 126 1 GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc6 F CA CA . 1 CA 2 1_555 A OD1 ASN 138 1 ASN 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.427 ? 
metalc ? metalc7 F CA CA . 1 CA 2 1_555 A OD1 ASP 139 1 ASP 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? 
metalc ? metalc8 F CA CA . 1 CA 2 1_555 A O ASP 139 1 ASP 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? 
metalc ? metalc9 G CA CA . 1 CA 3 1_555 A OE2 GLU 12 1 GLU 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.411 ? 
metalc ? metalc10 G CA CA . 1 CA 3 1_555 A OE1 GLU 93 1 GLU 165 3_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc11 G CA CA . 1 CA 3 1_555 A OD1 ASP 127 1 ASP 199 3_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? 
metalc ? metalc12 G CA CA . 1 CA 3 1_555 A OD2 ASP 127 1 ASP 199 3_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.503 ? 
metalc ? metalc13 G CA CA . 1 CA 3 1_555 R O HOH . 1 HOH 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? 
metalc ? metalc14 G CA CA . 1 CA 3 1_555 R O HOH . 1 HOH 273 3_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.413 ? 
metalc ? metalc15 G CA CA . 1 CA 3 1_555 R O HOH . 1 HOH 297 3_455 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.487 ? 
metalc ? metalc16 A OD1 ASP 89 1 ASP 161 1_555 E CA CA . 1 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? 
metalc ? metalc17 A OD2 ASP 89 1 ASP 161 1_555 E CA CA . 1 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? 
metalc ? metalc18 A OE1 GLU 93 1 GLU 165 1_555 E CA CA . 1 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? 
metalc ? metalc19 A OE2 GLU 93 1 GLU 165 1_555 E CA CA . 1 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.653 ? 
metalc ? metalc20 A OD1 ASP 116 1 ASP 188 1_555 E CA CA . 1 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? 
metalc ? metalc21 A O GLU 126 1 GLU 198 1_555 E CA CA . 1 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? 
metalc ? metalc22 A OD1 ASP 127 1 ASP 199 1_555 E CA CA . 1 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? 
metalc ? metalc23 E CA CA . 1 CA 227 1_555 R O HOH . 1 HOH 261 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc24 R O HOH . 1 HOH 250 1_555 P CA CA . 3 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.228 ? 
metalc ? metalc25 R O HOH . 1 HOH 279 4_555 J CA CA . 2 CA 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc26 J CA CA . 2 CA 1 1_555 B OD2 ASP 89 2 ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc27 J CA CA . 2 CA 1 1_555 B OD1 ASP 89 2 ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.73 ? 
metalc ? metalc28 J CA CA . 2 CA 1 1_555 B OE1 GLU 93 2 GLU 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.725 ? 
metalc ? metalc29 J CA CA . 2 CA 1 1_555 B OE2 GLU 93 2 GLU 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? 
metalc ? metalc30 J CA CA . 2 CA 1 1_555 B OD1 ASP 116 2 ASP 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? 
metalc ? metalc31 J CA CA . 2 CA 1 1_555 B O GLU 126 2 GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.475 ? 
metalc ? metalc32 J CA CA . 2 CA 1 1_555 B OD1 ASP 127 2 ASP 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.533 ? 
metalc ? metalc33 I O4 NGA . 2 NGA 2 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc34 I O3 NGA . 2 NGA 2 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.786 ? 
metalc ? metalc35 L CA CA . 2 CA 3 1_555 B OE1 GLU 93 2 GLU 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? 
metalc ? metalc36 L CA CA . 2 CA 3 1_555 B OD1 ASP 127 2 ASP 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.357 ? 
metalc ? metalc37 L CA CA . 2 CA 3 1_555 B OD2 ASP 127 2 ASP 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.648 ? 
metalc ? metalc38 L CA CA . 2 CA 3 1_555 S O HOH . 2 HOH 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc39 L CA CA . 2 CA 3 1_555 S O HOH . 2 HOH 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.906 ? 
metalc ? metalc40 B OE1 GLN 113 2 GLN 185 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? 
metalc ? metalc41 B OD1 ASP 115 2 ASP 187 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc42 B OE1 GLU 126 2 GLU 198 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.297 ? 
metalc ? metalc43 B OD1 ASN 138 2 ASN 210 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.729 ? 
metalc ? metalc44 B OD1 ASP 139 2 ASP 211 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc45 B O ASP 139 2 ASP 211 1_555 K CA CA . 2 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.616 ? 
metalc ? metalc46 N CA CA . 3 CA 1 1_555 C OD1 ASP 89 3 ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc47 N CA CA . 3 CA 1 1_555 C OD2 ASP 89 3 ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.267 ? 
metalc ? metalc48 N CA CA . 3 CA 1 1_555 C OE1 GLU 93 3 GLU 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.546 ? 
metalc ? metalc49 N CA CA . 3 CA 1 1_555 C OE2 GLU 93 3 GLU 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.633 ? 
metalc ? metalc50 N CA CA . 3 CA 1 1_555 C OD1 ASP 116 3 ASP 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.604 ? 
metalc ? metalc51 N CA CA . 3 CA 1 1_555 C O GLU 126 3 GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.474 ? 
metalc ? metalc52 N CA CA . 3 CA 1 1_555 C OD1 ASP 127 3 ASP 199 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? 
metalc ? metalc53 N CA CA . 3 CA 1 1_555 T O HOH . 3 HOH 259 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? 
metalc ? metalc54 O CA CA . 3 CA 2 1_555 M O3 NGA . 3 NGA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc55 O CA CA . 3 CA 2 1_555 M O4 NGA . 3 NGA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? 
metalc ? metalc56 O CA CA . 3 CA 2 1_555 C OE1 GLN 113 3 GLN 185 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
metalc ? metalc57 O CA CA . 3 CA 2 1_555 C OD1 ASP 115 3 ASP 187 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.44 ? 
metalc ? metalc58 O CA CA . 3 CA 2 1_555 C OE1 GLU 126 3 GLU 198 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.409 ? 
metalc ? metalc59 O CA CA . 3 CA 2 1_555 C OD1 ASN 138 3 ASN 210 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? 
metalc ? metalc60 O CA CA . 3 CA 2 1_555 C O ASP 139 3 ASP 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc61 O CA CA . 3 CA 2 1_555 C OD1 ASP 139 3 ASP 211 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? 
metalc ? metalc62 C OE2 GLU 12 3 GLU 84 1_555 P CA CA . 3 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.425 ? 
metalc ? metalc63 C OE1 GLU 93 3 GLU 165 3_445 P CA CA . 3 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? 
metalc ? metalc64 C OD1 ASP 127 3 ASP 199 3_445 P CA CA . 3 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? 
metalc ? metalc65 C OD2 ASP 127 3 ASP 199 3_445 P CA CA . 3 CA 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.472 ? 
metalc ? metalc66 P CA CA . 3 CA 227 1_555 T O HOH . 3 HOH 228 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? 
metalc ? metalc67 P CA CA . 3 CA 227 1_555 T O HOH . 3 HOH 335 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? 
#
_chem_comp.formula           'C8 H15 N O6' 
_chem_comp.formula_weight    221.208 
_chem_comp.id                NGA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactopyranose 
_chem_comp.type              'd-saccharide, beta linking' 
_chem_comp.pdbx_synonyms     N-acetyl-beta-D-galactosamine;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-galactose;2-acetamido-2-deoxy-D-galactose;2-acetamido-2-deoxy-galactose;N-ACETYL-D-GALACTOSAMINE 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 NGA sing 237 n n 
C1 O1 NGA sing 238 n n 
C1 O5 NGA sing 239 n n 
C1 H1 NGA sing 240 n n 
C2 C3 NGA sing 241 n n 
C2 N2 NGA sing 242 n n 
C2 H2 NGA sing 243 n n 
C3 C4 NGA sing 244 n n 
C3 O3 NGA sing 245 n n 
C3 H3 NGA sing 246 n n 
C4 C5 NGA sing 247 n n 
C4 O4 NGA sing 248 n n 
C4 H4 NGA sing 249 n n 
C5 C6 NGA sing 250 n n 
C5 O5 NGA sing 251 n n 
C5 H5 NGA sing 252 n n 
C6 O6 NGA sing 253 n n 
C6 H61 NGA sing 254 n n 
C6 H62 NGA sing 255 n n 
C7 C8 NGA sing 256 n n 
C7 N2 NGA sing 257 n n 
C7 O7 NGA doub 258 n n 
C8 H81 NGA sing 259 n n 
C8 H82 NGA sing 260 n n 
C8 H83 NGA sing 261 n n 
N2 HN2 NGA sing 262 n n 
O1 HO1 NGA sing 263 n n 
O3 HO3 NGA sing 264 n n 
O4 HO4 NGA sing 265 n n 
O6 HO6 NGA sing 266 n n 
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
NGA DGalpNAcb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 
NGA N-acetyl-b-D-galactopyranosamine 'COMMON NAME' GMML 1 
NGA b-D-GalpNAc 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 
NGA GalNAc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 
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S 5 HOH 2 11 238 61 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 13 240 63 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 14 241 64 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 20 247 86 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 21 248 87 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 42 269 203 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 51 278 235 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 53 280 251 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 54 281 252 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 56 283 254 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 57 284 255 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 58 285 272 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 59 286 274 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 60 287 275 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 61 288 281 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 62 289 283 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 63 290 286 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 64 291 289 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 65 292 295 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 66 293 303 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 68 295 306 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 69 296 308 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 70 297 314 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 71 298 318 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 72 299 319 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 73 300 323 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 74 301 324 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 75 302 325 HOH HOH . 
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S 5 HOH 2 77 304 330 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 78 305 331 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 79 306 332 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 80 307 333 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 81 308 334 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 82 309 335 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 83 310 338 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 84 311 339 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 85 312 341 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 86 313 342 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 87 314 343 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 88 315 344 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 89 316 350 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 90 317 351 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 91 318 352 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 92 319 353 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 93 320 357 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 94 321 361 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 95 322 370 HOH HOH . 
S 5 HOH 2 96 323 371 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 1 228 1 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 2 229 2 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 3 230 3 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 4 231 18 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 5 232 19 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 6 233 20 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 7 234 21 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 8 235 22 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 9 236 23 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 10 237 34 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 11 238 35 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 12 239 41 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 13 240 44 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 14 241 52 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 15 242 53 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 16 243 54 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 17 244 55 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 18 245 56 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 19 246 57 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 20 247 58 HOH HOH . 
T 5 HOH 3 21 248 59 HOH HOH . 
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