data_1ALX # _model_server_result.job_id mPMdh37084qn6m3Ii5xCHw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-23 20:46:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1alx # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":519}' # _entry.id 1ALX # _exptl.entry_id 1ALX _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 32.042 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description METHANOL _entity.pdbx_number_of_molecules 20 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 92.03 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1ALX _cell.length_a 14.907 _cell.length_b 26.014 _cell.length_c 31.911 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1ALX _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 C N N ? 3 D N N ? 3 E N N ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 J N N ? 3 K N N ? 3 L N N ? 3 M N N ? 3 N N N ? 3 O N N ? 3 P N N ? 3 Q N N ? 3 R N N ? 3 S N N ? 3 T N N ? 3 U N N ? 3 V N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C FVA 1 A FVA 1 1_555 A N GLY 2 A GLY 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.295 ? covale ? covale2 A C ALA 3 A ALA 3 1_555 A N DLE 4 A DLE 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? covale ? covale3 A C DLE 4 A DLE 4 1_555 A N ALA 5 A ALA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? covale ? covale4 A C ALA 5 A ALA 5 1_555 A N DVA 6 A DVA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.322 ? covale ? covale5 A C DVA 6 A DVA 6 1_555 A N VAL 7 A VAL 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.303 ? covale ? covale6 A C VAL 7 A VAL 7 1_555 A N DVA 8 A DVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.316 ? covale ? covale7 A C DVA 8 A DVA 8 1_555 A N TRP 9 A TRP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.346 ? covale ? covale8 A C TRP 9 A TRP 9 1_555 A N DLE 10 A DLE 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale9 A C DLE 10 A DLE 10 1_555 A N TRP 11 A TRP 11 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale10 A C DLE 10 A DLE 10 1_555 A N TYR 11 A TYR 11 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale11 A C TYR 11 A TYR 11 1_555 A N DLE 12 A DLE 12 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.358 ? covale ? covale12 A C TRP 11 A TRP 11 1_555 A N DLE 12 A DLE 12 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.358 ? covale ? covale13 A C DLE 12 A DLE 12 1_555 A N TRP 13 A TRP 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.28 ? covale ? covale14 A C TRP 13 A TRP 13 1_555 A N DLE 14 A DLE 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale15 A C DLE 14 A DLE 14 1_555 A N TRP 15 A TRP 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale16 A C TRP 15 A TRP 15 1_555 A N ETA 16 A ETA 16 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.311 ? covale ? covale17 A C TRP 15 A TRP 15 1_555 A N ETA 16 A ETA 16 1_555 ? ? ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale18 A C TRP 15 A TRP 15 1_555 A N ETA 16 A ETA 16 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale19 B C FVA 1 B FVA 1 1_555 B N GLY 2 B GLY 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.323 ? covale ? covale20 B C ALA 3 B ALA 3 1_555 B N DLE 4 B DLE 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.314 ? covale ? covale21 B C DLE 4 B DLE 4 1_555 B N ALA 5 B ALA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? covale ? covale22 B C ALA 5 B ALA 5 1_555 B N DVA 6 B DVA 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? covale ? covale23 B C DVA 6 B DVA 6 1_555 B N VAL 7 B VAL 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale24 B C VAL 7 B VAL 7 1_555 B N DVA 8 B DVA 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale25 B C DVA 8 B DVA 8 1_555 B N TRP 9 B TRP 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? covale ? covale26 B C TRP 9 B TRP 9 1_555 B N DLE 10 B DLE 10 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale27 B C DLE 10 B DLE 10 1_555 B N TRP 11 B TRP 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.354 ? covale ? covale28 B C TRP 11 B TRP 11 1_555 B N DLE 12 B DLE 12 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale29 B C DLE 12 B DLE 12 1_555 B N TRP 13 B TRP 13 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.307 ? covale ? covale30 B C TRP 13 B TRP 13 1_555 B N DLE 14 B DLE 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale31 B C DLE 14 B DLE 14 1_555 B N TRP 15 B TRP 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.317 ? covale ? covale32 B C TRP 15 B TRP 15 1_555 B N ETA 16 B ETA 16 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale33 B C TRP 15 B TRP 15 1_555 B N ETA 16 B ETA 16 1_555 ? ? ? ? C ? ? ? ? ? ? ? 1.341 ? covale ? covale34 B C TRP 15 B TRP 15 1_555 B N ETA 16 B ETA 16 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.34 ? # _chem_comp.formula 'C H4 O' _chem_comp.formula_weight 32.042 _chem_comp.id MOH _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name METHANOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C O MOH sing 91 n n C H1 MOH sing 92 n n C H2 MOH sing 93 n n C H3 MOH sing 94 n n O HO MOH sing 95 n n # _atom_sites.entry_id 1ALX _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.067083 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002378 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.038441 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.031357 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 MOH A 1 501 501 MOH MOH . D 3 MOH A 1 502 502 MOH MOH . E 3 MOH A 1 505 505 MOH MOH . F 3 MOH A 1 506 506 MOH MOH . G 3 MOH A 1 508 508 MOH MOH . H 3 MOH A 1 515 515 MOH MOH . I 3 MOH A 1 516 516 MOH MOH . J 3 MOH A 1 518 518 MOH MOH . K 3 MOH A 1 519 519 MOH MOH . L 3 MOH B 1 503 503 MOH MOH . M 3 MOH B 1 504 504 MOH MOH . N 3 MOH B 1 507 507 MOH MOH . O 3 MOH B 1 509 509 MOH MOH . P 3 MOH B 1 510 510 MOH MOH . Q 3 MOH B 1 511 511 MOH MOH . R 3 MOH B 1 512 512 MOH MOH . S 3 MOH B 1 513 513 MOH MOH . T 3 MOH B 1 514 514 MOH MOH . U 3 MOH B 1 517 517 MOH MOH . V 3 MOH B 1 520 520 MOH MOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C MOH . A . K 3 7.379 -4.013 -25.626 0.25 5.93 ? C MOH 519 A 1 HETATM 2 C C MOH . B . K 3 6.034 -4.037 -26.04 0.25 18.44 ? C MOH 519 A 1 HETATM 3 C C MOH . C . K 3 5.165 -2.408 -24.24 0.25 22.86 ? C MOH 519 A 1 HETATM 4 C C MOH . D . K 3 7.096 -5.003 -25.532 0.25 14.68 ? C MOH 519 A 1 HETATM 5 O O MOH . A . K 3 7.764 -4.792 -24.487 0.25 5.67 ? O MOH 519 A 1 HETATM 6 O O MOH . B . K 3 5.634 -3.067 -25.071 0.25 23.85 ? O MOH 519 A 1 HETATM 7 O O MOH . C . K 3 6.571 -2.651 -24.455 0.25 21.84 ? O MOH 519 A 1 HETATM 8 O O MOH . D . K 3 7.726 -4.439 -24.375 0.25 14.79 ? O MOH 519 A 1 HETATM 9 H H1 MOH . A . K 3 6.44 -4.129 -25.79 0.25 8.9 ? H1 MOH 519 A 1 HETATM 10 H H1 MOH . B . K 3 5.432 -4.785 -26.013 0.25 27.66 ? H1 MOH 519 A 1 HETATM 11 H H1 MOH . C . K 3 4.822 -3.049 -23.613 0.25 34.3 ? H1 MOH 519 A 1 HETATM 12 H H1 MOH . D . K 3 6.178 -4.726 -25.563 0.25 22.02 ? H1 MOH 519 A 1 HETATM 13 H H2 MOH . A . K 3 7.877 -4.302 -26.394 0.25 8.9 ? H2 MOH 519 A 1 HETATM 14 H H2 MOH . B . K 3 6.925 -4.337 -25.844 0.25 27.66 ? H2 MOH 519 A 1 HETATM 15 H H2 MOH . C . K 3 4.695 -2.491 -25.072 0.25 34.3 ? H2 MOH 519 A 1 HETATM 16 H H2 MOH . D . K 3 7.14 -5.961 -25.486 0.25 22.02 ? H2 MOH 519 A 1 HETATM 17 H H3 MOH . A . K 3 7.563 -3.086 -25.456 0.25 8.9 ? H3 MOH 519 A 1 HETATM 18 H H3 MOH . B . K 3 6.014 -3.642 -26.915 0.25 27.66 ? H3 MOH 519 A 1 HETATM 19 H H3 MOH . C . K 3 5.044 -1.522 -23.891 0.25 34.3 ? H3 MOH 519 A 1 HETATM 20 H H3 MOH . D . K 3 7.549 -4.7 -26.322 0.25 22.02 ? H3 MOH 519 A 1 HETATM 21 H HO MOH . A . K 3 7.117 -5.216 -24.214 0.25 8.51 ? HO MOH 519 A 1 HETATM 22 H HO MOH . B . K 3 5.387 -3.449 -24.388 0.25 35.78 ? HO MOH 519 A 1 HETATM 23 H HO MOH . C . K 3 6.668 -3.361 -24.853 0.25 32.76 ? HO MOH 519 A 1 HETATM 24 H HO MOH . D . K 3 7.448 -3.677 -24.256 0.25 22.18 ? HO MOH 519 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 290 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 24 #