data_1BCF # _model_server_result.job_id DhGhZcMkpiOWfJWl4tjwFQ _model_server_result.datetime_utc '2024-10-21 02:31:15' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1bcf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"IA","auth_seq_id":204}' # _entry.id 1BCF # _exptl.entry_id 1BCF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 616.487 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1BCF _cell.length_a 211.1 _cell.length_b 211.1 _cell.length_c 145.2 _cell.Z_PDB 96 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1BCF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 94 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 42 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 24-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 24 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 7_555 y,x,-z 0 1 0 1 0 0 0 0 -1 0 0 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 O N N ? 3 T N N ? 3 Y N N ? 3 DA N N ? 3 IA N N ? 3 NA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 18 A GLU 18 1_555 N MN MN . A MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 18 A GLU 18 1_555 N MN MN . A MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 51 A GLU 51 1_555 M MN MN . A MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 51 A GLU 51 1_555 N MN MN . A MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? metalc ? metalc5 A SD MET 52 A MET 52 1_555 O FE HEM . A HEM 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc6 A ND1 HIS 54 A HIS 54 1_555 N MN MN . A MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.813 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 94 A GLU 94 1_555 M MN MN . A MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc8 A OE1 GLU 127 A GLU 127 1_555 M MN MN . A MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc9 A OE2 GLU 127 A GLU 127 1_555 N MN MN . A MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc10 A ND1 HIS 130 A HIS 130 1_555 M MN MN . A MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc11 O FE HEM . A HEM 200 1_555 B SD MET 52 B MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc12 B OE2 GLU 18 B GLU 18 1_555 Q MN MN . B MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc13 B OE1 GLU 18 B GLU 18 1_555 Q MN MN . B MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc14 B OE2 GLU 51 B GLU 51 1_555 P MN MN . B MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc15 B OE1 GLU 51 B GLU 51 1_555 Q MN MN . B MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc16 B ND1 HIS 54 B HIS 54 1_555 Q MN MN . B MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? metalc ? metalc17 B OE1 GLU 94 B GLU 94 1_555 P MN MN . B MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc18 B OE2 GLU 94 B GLU 94 1_555 P MN MN . B MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc19 B OE1 GLU 127 B GLU 127 1_555 P MN MN . B MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc20 B OE2 GLU 127 B GLU 127 1_555 Q MN MN . B MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc21 B ND1 HIS 130 B HIS 130 1_555 P MN MN . B MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? metalc ? metalc22 C OE2 GLU 18 C GLU 18 1_555 S MN MN . C MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc23 C OE1 GLU 18 C GLU 18 1_555 S MN MN . C MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc24 C OE2 GLU 51 C GLU 51 1_555 R MN MN . C MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc25 C OE1 GLU 51 C GLU 51 1_555 S MN MN . C MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc26 C SD MET 52 C MET 52 1_555 T FE HEM . C HEM 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc27 C ND1 HIS 54 C HIS 54 1_555 S MN MN . C MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.813 ? metalc ? metalc28 C OE2 GLU 94 C GLU 94 1_555 R MN MN . C MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc29 C OE1 GLU 127 C GLU 127 1_555 R MN MN . C MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc30 C OE2 GLU 127 C GLU 127 1_555 S MN MN . C MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc31 C ND1 HIS 130 C HIS 130 1_555 R MN MN . C MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc32 T FE HEM . C HEM 201 1_555 D SD MET 52 D MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc33 D OE2 GLU 18 D GLU 18 1_555 V MN MN . D MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.153 ? metalc ? metalc34 D OE1 GLU 18 D GLU 18 1_555 V MN MN . D MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc35 D OE2 GLU 51 D GLU 51 1_555 U MN MN . D MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc36 D OE1 GLU 51 D GLU 51 1_555 V MN MN . D MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc37 D ND1 HIS 54 D HIS 54 1_555 V MN MN . D MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? metalc ? metalc38 D OE2 GLU 94 D GLU 94 1_555 U MN MN . D MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc39 D OE1 GLU 94 D GLU 94 1_555 U MN MN . D MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc40 D OE1 GLU 127 D GLU 127 1_555 U MN MN . D MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc41 D OE2 GLU 127 D GLU 127 1_555 V MN MN . D MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc42 D ND1 HIS 130 D HIS 130 1_555 U MN MN . D MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? metalc ? metalc43 E OE1 GLU 18 E GLU 18 1_555 X MN MN . E MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc44 E OE2 GLU 18 E GLU 18 1_555 X MN MN . E MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc45 E OE2 GLU 51 E GLU 51 1_555 W MN MN . E MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc46 E OE1 GLU 51 E GLU 51 1_555 X MN MN . E MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc47 E SD MET 52 E MET 52 1_555 Y FE HEM . E HEM 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc48 E ND1 HIS 54 E HIS 54 1_555 X MN MN . E MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.813 ? metalc ? metalc49 E OE2 GLU 94 E GLU 94 1_555 W MN MN . E MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc50 E OE1 GLU 127 E GLU 127 1_555 W MN MN . E MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc51 E OE2 GLU 127 E GLU 127 1_555 X MN MN . E MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? metalc ? metalc52 E ND1 HIS 130 E HIS 130 1_555 W MN MN . E MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc53 Y FE HEM . E HEM 202 1_555 F SD MET 52 F MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc54 F OE2 GLU 18 F GLU 18 1_555 AA MN MN . F MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc55 F OE1 GLU 18 F GLU 18 1_555 AA MN MN . F MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc ? metalc56 F OE2 GLU 51 F GLU 51 1_555 Z MN MN . F MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc57 F OE1 GLU 51 F GLU 51 1_555 AA MN MN . F MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc58 F ND1 HIS 54 F HIS 54 1_555 AA MN MN . F MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? metalc ? metalc59 F OE1 GLU 94 F GLU 94 1_555 Z MN MN . F MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc60 F OE2 GLU 94 F GLU 94 1_555 Z MN MN . F MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc61 F OE1 GLU 127 F GLU 127 1_555 Z MN MN . F MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc62 F OE2 GLU 127 F GLU 127 1_555 AA MN MN . F MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc63 F ND1 HIS 130 F HIS 130 1_555 Z MN MN . F MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? metalc ? metalc64 G OE2 GLU 18 G GLU 18 1_555 CA MN MN . G MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.111 ? metalc ? metalc65 G OE1 GLU 18 G GLU 18 1_555 CA MN MN . G MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc66 G OE2 GLU 51 G GLU 51 1_555 BA MN MN . G MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc67 G OE1 GLU 51 G GLU 51 1_555 CA MN MN . G MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? metalc ? metalc68 G SD MET 52 G MET 52 1_555 DA FE HEM . G HEM 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc69 G ND1 HIS 54 G HIS 54 1_555 CA MN MN . G MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.813 ? metalc ? metalc70 G OE2 GLU 94 G GLU 94 1_555 BA MN MN . G MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc71 G OE1 GLU 127 G GLU 127 1_555 BA MN MN . G MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc72 G OE2 GLU 127 G GLU 127 1_555 CA MN MN . G MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc73 G ND1 HIS 130 G HIS 130 1_555 BA MN MN . G MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc74 DA FE HEM . G HEM 203 1_555 H SD MET 52 H MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc75 H OE2 GLU 18 H GLU 18 1_555 FA MN MN . H MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc76 H OE1 GLU 18 H GLU 18 1_555 FA MN MN . H MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.599 ? metalc ? metalc77 H OE2 GLU 51 H GLU 51 1_555 EA MN MN . H MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc78 H OE1 GLU 51 H GLU 51 1_555 FA MN MN . H MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? metalc ? metalc79 H ND1 HIS 54 H HIS 54 1_555 FA MN MN . H MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? metalc ? metalc80 H OE1 GLU 94 H GLU 94 1_555 EA MN MN . H MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc81 H OE2 GLU 94 H GLU 94 1_555 EA MN MN . H MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc82 H OE1 GLU 127 H GLU 127 1_555 EA MN MN . H MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc83 H OE2 GLU 127 H GLU 127 1_555 FA MN MN . H MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc84 H ND1 HIS 130 H HIS 130 1_555 EA MN MN . H MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? metalc ? metalc85 I OE2 GLU 18 I GLU 18 1_555 HA MN MN . I MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc86 I OE1 GLU 18 I GLU 18 1_555 HA MN MN . I MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.553 ? metalc ? metalc87 I OE2 GLU 51 I GLU 51 1_555 GA MN MN . I MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? metalc ? metalc88 I OE1 GLU 51 I GLU 51 1_555 HA MN MN . I MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? metalc ? metalc89 I SD MET 52 I MET 52 1_555 IA FE HEM . I HEM 204 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.693 ? metalc ? metalc90 I ND1 HIS 54 I HIS 54 1_555 HA MN MN . I MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.813 ? metalc ? metalc91 I OE2 GLU 94 I GLU 94 1_555 GA MN MN . I MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.966 ? metalc ? metalc92 I OE1 GLU 127 I GLU 127 1_555 GA MN MN . I MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc93 I OE2 GLU 127 I GLU 127 1_555 HA MN MN . I MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc94 I ND1 HIS 130 I HIS 130 1_555 GA MN MN . I MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc95 IA FE HEM . I HEM 204 1_555 J SD MET 52 J MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc ? metalc96 J OE2 GLU 18 J GLU 18 1_555 KA MN MN . J MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc97 J OE1 GLU 18 J GLU 18 1_555 KA MN MN . J MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc98 J OE2 GLU 51 J GLU 51 1_555 JA MN MN . J MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.115 ? metalc ? metalc99 J OE1 GLU 51 J GLU 51 1_555 KA MN MN . J MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc100 J ND1 HIS 54 J HIS 54 1_555 KA MN MN . J MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.825 ? metalc ? metalc101 J OE2 GLU 94 J GLU 94 1_555 JA MN MN . J MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc102 J OE1 GLU 94 J GLU 94 1_555 JA MN MN . J MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? metalc ? metalc103 J OE1 GLU 127 J GLU 127 1_555 JA MN MN . J MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc104 J OE2 GLU 127 J GLU 127 1_555 KA MN MN . J MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc105 J ND1 HIS 130 J HIS 130 1_555 JA MN MN . J MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? metalc ? metalc106 K OE2 GLU 18 K GLU 18 1_555 MA MN MN . K MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc107 K OE1 GLU 18 K GLU 18 1_555 MA MN MN . K MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? metalc ? metalc108 K OE2 GLU 51 K GLU 51 1_555 LA MN MN . K MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.076 ? metalc ? metalc109 K OE1 GLU 51 K GLU 51 1_555 MA MN MN . K MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? metalc ? metalc110 K SD MET 52 K MET 52 1_555 NA FE HEM . K HEM 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.692 ? metalc ? metalc111 K ND1 HIS 54 K HIS 54 1_555 MA MN MN . K MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.812 ? metalc ? metalc112 K OE2 GLU 94 K GLU 94 1_555 LA MN MN . K MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.967 ? metalc ? metalc113 K OE1 GLU 127 K GLU 127 1_555 LA MN MN . K MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? metalc ? metalc114 K OE2 GLU 127 K GLU 127 1_555 MA MN MN . K MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? metalc ? metalc115 K ND1 HIS 130 K HIS 130 1_555 LA MN MN . K MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.873 ? metalc ? metalc116 NA FE HEM . K HEM 205 1_555 L SD MET 52 L MET 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.638 ? metalc ? metalc117 L OE2 GLU 18 L GLU 18 1_555 PA MN MN . L MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.154 ? metalc ? metalc118 L OE1 GLU 18 L GLU 18 1_555 PA MN MN . L MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.6 ? metalc ? metalc119 L OE2 GLU 51 L GLU 51 1_555 OA MN MN . L MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.114 ? metalc ? metalc120 L OE1 GLU 51 L GLU 51 1_555 PA MN MN . L MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? metalc ? metalc121 L ND1 HIS 54 L HIS 54 1_555 PA MN MN . L MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.826 ? metalc ? metalc122 L OE2 GLU 94 L GLU 94 1_555 OA MN MN . L MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc123 L OE1 GLU 94 L GLU 94 1_555 OA MN MN . L MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.727 ? metalc ? metalc124 L OE1 GLU 127 L GLU 127 1_555 OA MN MN . L MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? metalc ? metalc125 L OE2 GLU 127 L GLU 127 1_555 PA MN MN . L MN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? metalc ? metalc126 L ND1 HIS 130 L HIS 130 1_555 OA MN MN . L MN 600 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.841 ? # _chem_comp.formula 'C34 H32 Fe N4 O4' _chem_comp.formula_weight 616.487 _chem_comp.id HEM _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms HEME # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag CHA C1A HEM sing 116 n n CHA C4D HEM doub 117 n n CHA HHA HEM sing 118 n n CHB C4A HEM sing 119 n n CHB C1B HEM doub 120 n n CHB HHB HEM sing 121 n n CHC C4B HEM sing 122 n n CHC C1C HEM doub 123 n n CHC HHC HEM sing 124 n n CHD C4C HEM doub 125 n n CHD C1D HEM sing 126 n n CHD HHD HEM sing 127 n n C1A C2A HEM doub 128 n y C1A NA HEM sing 129 n y C2A C3A HEM sing 130 n y C2A CAA HEM sing 131 n n C3A C4A HEM doub 132 n y C3A CMA HEM sing 133 n n C4A NA HEM sing 134 n y CMA HMA HEM sing 135 n n CMA HMAA HEM sing 136 n n CMA HMAB HEM sing 137 n n CAA CBA HEM sing 138 n n CAA HAA HEM sing 139 n n CAA HAAA HEM sing 140 n n CBA CGA HEM sing 141 n n CBA HBA HEM sing 142 n n CBA HBAA HEM sing 143 n n CGA O1A HEM doub 144 n n CGA O2A HEM sing 145 n n C1B C2B HEM sing 146 n n C1B NB HEM sing 147 n n C2B C3B HEM doub 148 n n C2B CMB HEM sing 149 n n C3B C4B HEM sing 150 n n C3B CAB HEM sing 151 n n C4B NB HEM doub 152 n n CMB HMB HEM sing 153 n n CMB HMBA HEM sing 154 n n CMB HMBB HEM sing 155 n n CAB CBB HEM doub 156 n n CAB HAB HEM sing 157 n n CBB HBB HEM sing 158 n n CBB HBBA HEM sing 159 n n C1C C2C HEM sing 160 n y C1C NC HEM sing 161 n y C2C C3C HEM doub 162 n y C2C CMC HEM sing 163 n n C3C C4C HEM sing 164 n y C3C CAC HEM sing 165 n n C4C NC HEM sing 166 n y CMC HMC HEM sing 167 n n CMC HMCA HEM sing 168 n n CMC HMCB HEM sing 169 n n CAC CBC HEM doub 170 n n CAC HAC HEM sing 171 n n CBC HBC HEM sing 172 n n CBC HBCA HEM sing 173 n n C1D C2D HEM sing 174 n n C1D ND HEM doub 175 n n C2D C3D HEM doub 176 n n C2D CMD HEM sing 177 n n C3D C4D HEM sing 178 n n C3D CAD HEM sing 179 n n C4D ND HEM sing 180 n n CMD HMD HEM sing 181 n n CMD HMDA HEM sing 182 n n CMD HMDB HEM sing 183 n n CAD CBD HEM sing 184 n n CAD HAD HEM sing 185 n n CAD HADA HEM sing 186 n n CBD CGD HEM sing 187 n n CBD HBD HEM sing 188 n n CBD HBDA HEM sing 189 n n CGD O1D HEM doub 190 n n CGD O2D HEM sing 191 n n O2A H2A HEM sing 192 n n O2D H2D HEM sing 193 n n FE NA HEM sing 194 n n FE NB HEM sing 195 n n FE NC HEM sing 196 n n FE ND HEM sing 197 n n # _atom_sites.entry_id 1BCF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004737 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.004737 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006887 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 2 MN A 1 600 600 MN MN . N 2 MN A 1 601 601 MN MN . O 3 HEM A 1 200 200 HEM HEM . P 2 MN B 1 600 600 MN MN . Q 2 MN B 1 601 601 MN MN . R 2 MN C 1 600 600 MN MN . S 2 MN C 1 601 601 MN MN . T 3 HEM C 1 201 200 HEM HEM . U 2 MN D 1 600 600 MN MN . V 2 MN D 1 601 601 MN MN . W 2 MN E 1 600 600 MN MN . X 2 MN E 1 601 601 MN MN . Y 3 HEM E 1 202 200 HEM HEM . Z 2 MN F 1 600 600 MN MN . AA 2 MN F 1 601 601 MN MN . BA 2 MN G 1 600 600 MN MN . CA 2 MN G 1 601 601 MN MN . DA 3 HEM G 1 203 200 HEM HEM . EA 2 MN H 1 600 600 MN MN . FA 2 MN H 1 601 601 MN MN . GA 2 MN I 1 600 600 MN MN . HA 2 MN I 1 601 601 MN MN . IA 3 HEM I 1 204 200 HEM HEM . JA 2 MN J 1 600 600 MN MN . KA 2 MN J 1 601 601 MN MN . LA 2 MN K 1 600 600 MN MN . MA 2 MN K 1 601 601 MN MN . NA 3 HEM K 1 205 200 HEM HEM . OA 2 MN L 1 600 600 MN MN . PA 2 MN L 1 601 601 MN MN . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C CHA HEM . . . IA 3 54.335 14.574 -0.009 1 5.03 ? CHA HEM 204 I 1 HETATM 2 C CHB HEM . . . IA 3 56.395 10.94 2.492 1 9.02 ? CHB HEM 204 I 1 HETATM 3 C CHC HEM . . . IA 3 54.018 7.586 -0.315 1 6.27 ? CHC HEM 204 I 1 HETATM 4 C CHD HEM . . . IA 3 51.87 11.366 -2.744 1 8.99 ? CHD HEM 204 I 1 HETATM 5 C C1A HEM . . . IA 3 55.161 13.81 0.844 1 6.21 ? C1A HEM 204 I 1 HETATM 6 C C2A HEM . . . IA 3 55.862 14.336 1.975 1 6.67 ? C2A HEM 204 I 1 HETATM 7 C C3A HEM . . . IA 3 56.325 13.379 2.745 1 7.11 ? C3A HEM 204 I 1 HETATM 8 C C4A HEM . . . IA 3 55.981 12.17 2.061 1 7.2 ? C4A HEM 204 I 1 HETATM 9 C CMA HEM . . . IA 3 56.993 13.548 4.096 1 4.02 ? CMA HEM 204 I 1 HETATM 10 C CAA HEM . . . IA 3 55.987 15.761 2.293 1 9.37 ? CAA HEM 204 I 1 HETATM 11 C CBA HEM . . . IA 3 55.008 16.161 3.374 1 15.93 ? CBA HEM 204 I 1 HETATM 12 C CGA HEM . . . IA 3 54.799 17.666 3.395 1 18.56 ? CGA HEM 204 I 1 HETATM 13 O O1A HEM . . . IA 3 55 18.299 4.473 1 25.65 ? O1A HEM 204 I 1 HETATM 14 O O2A HEM . . . IA 3 54.455 18.22 2.31 1 23.44 ? O2A HEM 204 I 1 HETATM 15 C C1B HEM . . . IA 3 56.048 9.726 1.86 1 8.52 ? C1B HEM 204 I 1 HETATM 16 C C2B HEM . . . IA 3 56.548 8.444 2.332 1 6.99 ? C2B HEM 204 I 1 HETATM 17 C C3B HEM . . . IA 3 55.948 7.502 1.473 1 8.09 ? C3B HEM 204 I 1 HETATM 18 C C4B HEM . . . IA 3 55.024 8.192 0.509 1 7.26 ? C4B HEM 204 I 1 HETATM 19 C CMB HEM . . . IA 3 57.246 8.354 3.688 1 2 ? CMB HEM 204 I 1 HETATM 20 C CAB HEM . . . IA 3 56.042 6.113 1.579 1 9.48 ? CAB HEM 204 I 1 HETATM 21 C CBB HEM . . . IA 3 57.092 5.499 2.39 1 11.78 ? CBB HEM 204 I 1 HETATM 22 C C1C HEM . . . IA 3 53.043 8.314 -1.064 1 7.22 ? C1C HEM 204 I 1 HETATM 23 C C2C HEM . . . IA 3 52.121 7.743 -2.086 1 7.35 ? C2C HEM 204 I 1 HETATM 24 C C3C HEM . . . IA 3 51.706 8.82 -2.85 1 9.62 ? C3C HEM 204 I 1 HETATM 25 C C4C HEM . . . IA 3 52.17 10.068 -2.226 1 10.12 ? C4C HEM 204 I 1 HETATM 26 C CMC HEM . . . IA 3 51.765 6.284 -2.228 1 4.88 ? CMC HEM 204 I 1 HETATM 27 C CAC HEM . . . IA 3 51.237 8.936 -4.137 1 13.38 ? CAC HEM 204 I 1 HETATM 28 C CBC HEM . . . IA 3 50.488 7.958 -4.725 1 17.3 ? CBC HEM 204 I 1 HETATM 29 C C1D HEM . . . IA 3 52.373 12.535 -2.22 1 7.69 ? C1D HEM 204 I 1 HETATM 30 C C2D HEM . . . IA 3 52.041 13.862 -2.701 1 7.89 ? C2D HEM 204 I 1 HETATM 31 C C3D HEM . . . IA 3 52.635 14.741 -1.88 1 8.27 ? C3D HEM 204 I 1 HETATM 32 C C4D HEM . . . IA 3 53.386 13.999 -0.891 1 8.25 ? C4D HEM 204 I 1 HETATM 33 C CMD HEM . . . IA 3 51.207 14.156 -3.922 1 5.65 ? CMD HEM 204 I 1 HETATM 34 C CAD HEM . . . IA 3 52.654 16.251 -1.966 1 14.27 ? CAD HEM 204 I 1 HETATM 35 C CBD HEM . . . IA 3 53.381 16.899 -3.15 1 21.24 ? CBD HEM 204 I 1 HETATM 36 C CGD HEM . . . IA 3 53.465 18.428 -3.023 1 26.62 ? CGD HEM 204 I 1 HETATM 37 O O1D HEM . . . IA 3 54.536 18.999 -3.373 1 30.16 ? O1D HEM 204 I 1 HETATM 38 O O2D HEM . . . IA 3 52.467 19.076 -2.582 1 31.58 ? O2D HEM 204 I 1 HETATM 39 N NA HEM . . . IA 3 55.208 12.404 0.92 1 7.63 ? NA HEM 204 I 1 HETATM 40 N NB HEM . . . IA 3 55.122 9.59 0.763 1 8.41 ? NB HEM 204 I 1 HETATM 41 N NC HEM . . . IA 3 53.033 9.767 -1.153 1 8.81 ? NC HEM 204 I 1 HETATM 42 N ND HEM . . . IA 3 53.21 12.595 -1.1 1 7.79 ? ND HEM 204 I 1 HETATM 43 FE FE HEM . . . IA 3 54.119 11.084 -0.126 1 16.05 ? FE HEM 204 I 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 28 _model_server_stats.query_time_ms 262 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 43 #