data_1BJQ # _model_server_result.job_id 19AZJ4Xx9iHnHhvL8utz3w _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 23:00:37' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1bjq # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"O","auth_seq_id":301}' # _entry.id 1BJQ # _exptl.entry_id 1BJQ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 8 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1BJQ _cell.length_a 81.377 _cell.length_b 116.135 _cell.length_c 224.62 _cell.Z_PDB 32 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1BJQ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? tetrameric 4 author_defined_assembly 1 ? tetrameric 4 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 1 1 E,F,G,H,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 I N N ? 2 L N N ? 2 O N N ? 2 R N N ? 2 U N N ? 2 X N N ? 2 AA N N ? 2 DA N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE2 GLU 123 A GLU 123 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 125 A ASP 125 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc3 A OD2 ASP 125 A ASP 125 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 125 A ASP 125 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc5 A O LEU 127 A LEU 127 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASN 129 A ASN 129 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 133 A ASP 133 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 133 A ASP 133 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? metalc ? metalc9 A NE2 HIS 138 A HIS 138 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? metalc ? metalc10 B OE2 GLU 123 B GLU 123 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? metalc ? metalc11 B OD1 ASP 125 B ASP 125 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc12 B OD2 ASP 125 B ASP 125 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? metalc ? metalc13 B OD2 ASP 125 B ASP 125 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? metalc ? metalc14 B O LEU 127 B LEU 127 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? metalc ? metalc15 B OD1 ASN 129 B ASN 129 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? metalc ? metalc16 B OD2 ASP 133 B ASP 133 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? metalc ? metalc17 B OD1 ASP 133 B ASP 133 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? metalc ? metalc18 B NE2 HIS 138 B HIS 138 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? metalc ? metalc19 C OE2 GLU 123 C GLU 123 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc20 C OD1 ASP 125 C ASP 125 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc ? metalc21 C OD2 ASP 125 C ASP 125 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc ? metalc22 C OD2 ASP 125 C ASP 125 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc23 C O LEU 127 C LEU 127 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? metalc ? metalc24 C OD1 ASN 129 C ASN 129 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? metalc ? metalc25 C OD2 ASP 133 C ASP 133 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? metalc ? metalc26 C OD1 ASP 133 C ASP 133 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? metalc ? metalc27 C NE2 HIS 138 C HIS 138 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? metalc ? metalc28 D OE2 GLU 123 D GLU 123 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc29 D OD2 ASP 125 D ASP 125 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc30 D OD1 ASP 125 D ASP 125 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc31 D OD2 ASP 125 D ASP 125 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc32 D O LEU 127 D LEU 127 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc33 D OD1 ASN 129 D ASN 129 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? metalc ? metalc34 D OD2 ASP 133 D ASP 133 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc35 D OD1 ASP 133 D ASP 133 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? metalc ? metalc36 D NE2 HIS 138 D HIS 138 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc37 E OE2 GLU 123 E GLU 123 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? metalc ? metalc38 E OD2 ASP 125 E ASP 125 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? metalc ? metalc39 E OD1 ASP 125 E ASP 125 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? metalc ? metalc40 E OD2 ASP 125 E ASP 125 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? metalc ? metalc41 E O LEU 127 E LEU 127 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc42 E OD1 ASN 129 E ASN 129 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? metalc ? metalc43 E OD2 ASP 133 E ASP 133 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? metalc ? metalc44 E OD1 ASP 133 E ASP 133 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? metalc ? metalc45 E NE2 HIS 138 E HIS 138 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? metalc ? metalc46 F OE2 GLU 123 F GLU 123 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? metalc ? metalc47 F OD1 ASP 125 F ASP 125 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc48 F OD2 ASP 125 F ASP 125 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? metalc ? metalc49 F OD2 ASP 125 F ASP 125 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? metalc ? metalc50 F O LEU 127 F LEU 127 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? metalc ? metalc51 F OD1 ASN 129 F ASN 129 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? metalc ? metalc52 F OD2 ASP 133 F ASP 133 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc53 F OD1 ASP 133 F ASP 133 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc54 F NE2 HIS 138 F HIS 138 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc55 G OE2 GLU 123 G GLU 123 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc56 G OD2 ASP 125 G ASP 125 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc57 G OD1 ASP 125 G ASP 125 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? metalc ? metalc58 G OD2 ASP 125 G ASP 125 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? metalc ? metalc59 G O LEU 127 G LEU 127 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? metalc ? metalc60 G OD1 ASN 129 G ASN 129 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? metalc ? metalc61 G OD2 ASP 133 G ASP 133 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? metalc ? metalc62 G OD1 ASP 133 G ASP 133 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? metalc ? metalc63 G NE2 HIS 138 G HIS 138 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? metalc ? metalc64 H OE2 GLU 123 H GLU 123 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? metalc ? metalc65 H OD2 ASP 125 H ASP 125 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? metalc ? metalc66 H OD1 ASP 125 H ASP 125 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? metalc ? metalc67 H OD2 ASP 125 H ASP 125 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc68 H O LEU 127 H LEU 127 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? metalc ? metalc69 H OD1 ASN 129 H ASN 129 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? metalc ? metalc70 H OD2 ASP 133 H ASP 133 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? metalc ? metalc71 H OD1 ASP 133 H ASP 133 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? metalc ? metalc72 H NE2 HIS 138 H HIS 138 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1BJQ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012288 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008611 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.004452 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code I 2 CA A 1 301 301 CA CA . J 3 MN A 1 302 302 MN MN . K 4 ADE A 1 601 601 ADE AD2 . L 2 CA B 1 301 301 CA CA . M 3 MN B 1 302 302 MN MN . N 4 ADE B 1 601 601 ADE AD2 . O 2 CA C 1 301 301 CA CA . P 3 MN C 1 302 302 MN MN . Q 4 ADE C 1 601 601 ADE AD2 . R 2 CA D 1 301 301 CA CA . S 3 MN D 1 302 302 MN MN . T 4 ADE D 1 601 601 ADE AD2 . U 2 CA E 1 301 301 CA CA . V 3 MN E 1 302 302 MN MN . W 4 ADE E 1 601 601 ADE AD2 . X 2 CA F 1 301 301 CA CA . Y 3 MN F 1 302 302 MN MN . Z 4 ADE F 1 601 601 ADE AD2 . AA 2 CA G 1 301 301 CA CA . BA 3 MN G 1 302 302 MN MN . CA 4 ADE G 1 601 601 ADE AD2 . DA 2 CA H 1 301 301 CA CA . EA 3 MN H 1 302 302 MN MN . FA 4 ADE H 1 601 601 ADE AD2 . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id O _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 52.281 _atom_site.Cartn_y -9.507 _atom_site.Cartn_z 9.544 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 19.24 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 301 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 0 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 29 _model_server_stats.query_time_ms 285 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #