data_1BJQ
#
_model_server_result.job_id            '_Jt_LhzgHKvmpMIXphWT7Q' 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-04 22:56:30' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1bjq 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"J","auth_seq_id":302}' 
#
_entry.id    1BJQ 
#
_exptl.entry_id    1BJQ 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              54.938 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MANGANESE (II) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1BJQ 
_cell.length_a            81.377 
_cell.length_b            116.135 
_cell.length_c            224.62 
_cell.Z_PDB               32 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1BJQ 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? tetrameric 4 author_defined_assembly 1 
? tetrameric 4 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T 1 1 
E,F,G,H,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 J N N 
? 3 M N N 
? 3 P N N 
? 3 S N N 
? 3 V N N 
? 3 Y N N 
? 3 BA N N 
? 3 EA N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OE2 GLU 123 A GLU 123 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.469 ? 
metalc ? metalc2 A OD1 ASP 125 A ASP 125 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 125 A ASP 125 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? 
metalc ? metalc4 A OD2 ASP 125 A ASP 125 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? 
metalc ? metalc5 A O LEU 127 A LEU 127 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc6 A OD1 ASN 129 A ASN 129 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc7 A OD2 ASP 133 A ASP 133 1_555 I CA CA . A CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? 
metalc ? metalc8 A OD1 ASP 133 A ASP 133 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.435 ? 
metalc ? metalc9 A NE2 HIS 138 A HIS 138 1_555 J MN MN . A MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? 
metalc ? metalc10 B OE2 GLU 123 B GLU 123 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? 
metalc ? metalc11 B OD1 ASP 125 B ASP 125 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc12 B OD2 ASP 125 B ASP 125 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? 
metalc ? metalc13 B OD2 ASP 125 B ASP 125 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.314 ? 
metalc ? metalc14 B O LEU 127 B LEU 127 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc15 B OD1 ASN 129 B ASN 129 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.366 ? 
metalc ? metalc16 B OD2 ASP 133 B ASP 133 1_555 L CA CA . B CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
metalc ? metalc17 B OD1 ASP 133 B ASP 133 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc18 B NE2 HIS 138 B HIS 138 1_555 M MN MN . B MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.393 ? 
metalc ? metalc19 C OE2 GLU 123 C GLU 123 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? 
metalc ? metalc20 C OD1 ASP 125 C ASP 125 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? 
metalc ? metalc21 C OD2 ASP 125 C ASP 125 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? 
metalc ? metalc22 C OD2 ASP 125 C ASP 125 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc23 C O LEU 127 C LEU 127 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.209 ? 
metalc ? metalc24 C OD1 ASN 129 C ASN 129 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.361 ? 
metalc ? metalc25 C OD2 ASP 133 C ASP 133 1_555 O CA CA . C CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.404 ? 
metalc ? metalc26 C OD1 ASP 133 C ASP 133 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.43 ? 
metalc ? metalc27 C NE2 HIS 138 C HIS 138 1_555 P MN MN . C MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.431 ? 
metalc ? metalc28 D OE2 GLU 123 D GLU 123 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? 
metalc ? metalc29 D OD2 ASP 125 D ASP 125 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? 
metalc ? metalc30 D OD1 ASP 125 D ASP 125 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? 
metalc ? metalc31 D OD2 ASP 125 D ASP 125 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? 
metalc ? metalc32 D O LEU 127 D LEU 127 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? 
metalc ? metalc33 D OD1 ASN 129 D ASN 129 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.305 ? 
metalc ? metalc34 D OD2 ASP 133 D ASP 133 1_555 R CA CA . D CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? 
metalc ? metalc35 D OD1 ASP 133 D ASP 133 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc36 D NE2 HIS 138 D HIS 138 1_555 S MN MN . D MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? 
metalc ? metalc37 E OE2 GLU 123 E GLU 123 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.556 ? 
metalc ? metalc38 E OD2 ASP 125 E ASP 125 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.595 ? 
metalc ? metalc39 E OD1 ASP 125 E ASP 125 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.434 ? 
metalc ? metalc40 E OD2 ASP 125 E ASP 125 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.362 ? 
metalc ? metalc41 E O LEU 127 E LEU 127 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc42 E OD1 ASN 129 E ASN 129 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? 
metalc ? metalc43 E OD2 ASP 133 E ASP 133 1_555 U CA CA . E CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.373 ? 
metalc ? metalc44 E OD1 ASP 133 E ASP 133 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.341 ? 
metalc ? metalc45 E NE2 HIS 138 E HIS 138 1_555 V MN MN . E MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc46 F OE2 GLU 123 F GLU 123 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc47 F OD1 ASP 125 F ASP 125 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? 
metalc ? metalc48 F OD2 ASP 125 F ASP 125 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.45 ? 
metalc ? metalc49 F OD2 ASP 125 F ASP 125 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.58 ? 
metalc ? metalc50 F O LEU 127 F LEU 127 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.454 ? 
metalc ? metalc51 F OD1 ASN 129 F ASN 129 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.318 ? 
metalc ? metalc52 F OD2 ASP 133 F ASP 133 1_555 X CA CA . F CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? 
metalc ? metalc53 F OD1 ASP 133 F ASP 133 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? 
metalc ? metalc54 F NE2 HIS 138 F HIS 138 1_555 Y MN MN . F MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? 
metalc ? metalc55 G OE2 GLU 123 G GLU 123 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? 
metalc ? metalc56 G OD2 ASP 125 G ASP 125 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? 
metalc ? metalc57 G OD1 ASP 125 G ASP 125 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.574 ? 
metalc ? metalc58 G OD2 ASP 125 G ASP 125 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.453 ? 
metalc ? metalc59 G O LEU 127 G LEU 127 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? 
metalc ? metalc60 G OD1 ASN 129 G ASN 129 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc61 G OD2 ASP 133 G ASP 133 1_555 AA CA CA . G CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.383 ? 
metalc ? metalc62 G OD1 ASP 133 G ASP 133 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? 
metalc ? metalc63 G NE2 HIS 138 G HIS 138 1_555 BA MN MN . G MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? 
metalc ? metalc64 H OE2 GLU 123 H GLU 123 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? 
metalc ? metalc65 H OD2 ASP 125 H ASP 125 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.637 ? 
metalc ? metalc66 H OD1 ASP 125 H ASP 125 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? 
metalc ? metalc67 H OD2 ASP 125 H ASP 125 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
metalc ? metalc68 H O LEU 127 H LEU 127 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? 
metalc ? metalc69 H OD1 ASN 129 H ASN 129 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.246 ? 
metalc ? metalc70 H OD2 ASP 133 H ASP 133 1_555 DA CA CA . H CA 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc71 H OD1 ASP 133 H ASP 133 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.293 ? 
metalc ? metalc72 H NE2 HIS 138 H HIS 138 1_555 EA MN MN . H MN 302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.347 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mn 2' 
_chem_comp.formula_weight    54.938 
_chem_comp.id                MN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MANGANESE (II) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1BJQ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012288 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008611 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.004452 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
I 2 CA A 1 301 301 CA CA . 
J 3 MN A 1 302 302 MN MN . 
K 4 ADE A 1 601 601 ADE AD2 . 
L 2 CA B 1 301 301 CA CA . 
M 3 MN B 1 302 302 MN MN . 
N 4 ADE B 1 601 601 ADE AD2 . 
O 2 CA C 1 301 301 CA CA . 
P 3 MN C 1 302 302 MN MN . 
Q 4 ADE C 1 601 601 ADE AD2 . 
R 2 CA D 1 301 301 CA CA . 
S 3 MN D 1 302 302 MN MN . 
T 4 ADE D 1 601 601 ADE AD2 . 
U 2 CA E 1 301 301 CA CA . 
V 3 MN E 1 302 302 MN MN . 
W 4 ADE E 1 601 601 ADE AD2 . 
X 2 CA F 1 301 301 CA CA . 
Y 3 MN F 1 302 302 MN MN . 
Z 4 ADE F 1 601 601 ADE AD2 . 
AA 2 CA G 1 301 301 CA CA . 
BA 3 MN G 1 302 302 MN MN . 
CA 4 ADE G 1 601 601 ADE AD2 . 
DA 2 CA H 1 301 301 CA CA . 
EA 3 MN H 1 302 302 MN MN . 
FA 4 ADE H 1 601 601 ADE AD2 . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MN 
_atom_site.label_atom_id         MN 
_atom_site.label_comp_id         MN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         J 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               50.607 
_atom_site.Cartn_y               -5.188 
_atom_site.Cartn_z               47.611 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        45.68 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MN 
_atom_site.auth_comp_id          MN 
_atom_site.auth_seq_id           302 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              16 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    15 
_model_server_stats.query_time_ms           289 
_model_server_stats.encode_time_ms          9 
_model_server_stats.element_count           1 
#