data_1BZY
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_model_server_result.query_name        ligand 
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_model_server_params.name     atom_site 
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_entry.id    1BZY 
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
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_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'PHOSPHORIC ACID MONO-[5-(2-AMINO-4-OXO-4,5-DIHYDRO-3H-PYRROLO[3,2-D]PYRIMIDIN-7-YL)-3,4-DIHYDROXY-PYRROLIDIN-2-YLMETHYL] ESTER' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.length_c            144.27 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
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_symmetry.Int_Tables_number        19 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 21 21 21' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 G N N 
? 3 K N N 
? 3 O N N 
? 3 S N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OD1 ASP 193 A ASP 193 1_555 F MG MG . A MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.139 ? 
metalc ? metalc2 G O3' IMU . A IMU 300 1_555 E MG MG . A MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc3 G O2' IMU . A IMU 300 1_555 E MG MG . A MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc4 H O2 POP . A POP 400 1_555 E MG MG . A MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.092 ? 
metalc ? metalc5 H O5 POP . A POP 400 1_555 E MG MG . A MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc6 H O3 POP . A POP 400 1_555 F MG MG . A MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? 
metalc ? metalc7 H O4 POP . A POP 400 1_555 F MG MG . A MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? 
metalc ? metalc8 U O HOH . A HOH 582 1_555 E MG MG . A MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? 
metalc ? metalc9 U O HOH . A HOH 630 1_555 F MG MG . A MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? 
metalc ? metalc10 U O HOH . A HOH 631 1_555 E MG MG . A MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.18 ? 
metalc ? metalc11 U O HOH . A HOH 657 1_555 F MG MG . A MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? 
metalc ? metalc12 U O HOH . A HOH 706 1_555 F MG MG . A MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.221 ? 
metalc ? metalc13 B OD1 ASP 193 B ASP 193 1_555 J MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.184 ? 
metalc ? metalc14 K O3' IMU . B IMU 300 1_555 I MG MG . B MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.131 ? 
metalc ? metalc15 K O2' IMU . B IMU 300 1_555 I MG MG . B MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc16 L O2 POP . B POP 400 1_555 I MG MG . B MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? 
metalc ? metalc17 L O5 POP . B POP 400 1_555 I MG MG . B MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.38 ? 
metalc ? metalc18 L O3 POP . B POP 400 1_555 J MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? 
metalc ? metalc19 L O4 POP . B POP 400 1_555 J MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.173 ? 
metalc ? metalc20 L O POP . B POP 400 1_555 J MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.083 ? 
metalc ? metalc21 V O HOH . B HOH 577 1_555 I MG MG . B MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? 
metalc ? metalc22 V O HOH . B HOH 597 1_555 J MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.415 ? 
metalc ? metalc23 V O HOH . B HOH 635 1_555 I MG MG . B MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? 
metalc ? metalc24 V O HOH . B HOH 655 1_555 J MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc25 V O HOH . B HOH 704 1_555 J MG MG . B MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? 
metalc ? metalc26 C OD1 ASP 193 C ASP 193 1_555 N MG MG . C MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.166 ? 
metalc ? metalc27 O O3' IMU . C IMU 300 1_555 M MG MG . C MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.182 ? 
metalc ? metalc28 O O2' IMU . C IMU 300 1_555 M MG MG . C MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc29 P O2 POP . C POP 400 1_555 M MG MG . C MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.128 ? 
metalc ? metalc30 P O5 POP . C POP 400 1_555 M MG MG . C MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? 
metalc ? metalc31 P O3 POP . C POP 400 1_555 N MG MG . C MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.276 ? 
metalc ? metalc32 P O4 POP . C POP 400 1_555 N MG MG . C MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.24 ? 
metalc ? metalc33 P O POP . C POP 400 1_555 N MG MG . C MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.931 ? 
metalc ? metalc34 W O HOH . C HOH 586 1_555 N MG MG . C MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? 
metalc ? metalc35 W O HOH . C HOH 640 1_555 N MG MG . C MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.325 ? 
metalc ? metalc36 W O HOH . C HOH 654 1_555 M MG MG . C MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.186 ? 
metalc ? metalc37 W O HOH . C HOH 698 1_555 N MG MG . C MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? 
metalc ? metalc38 W O HOH . C HOH 757 1_555 M MG MG . C MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
metalc ? metalc39 D OD1 ASP 193 D ASP 193 1_555 R MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.27 ? 
metalc ? metalc40 S O3' IMU . D IMU 300 1_555 Q MG MG . D MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? 
metalc ? metalc41 S O2' IMU . D IMU 300 1_555 Q MG MG . D MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.328 ? 
metalc ? metalc42 T O2 POP . D POP 400 1_555 Q MG MG . D MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.125 ? 
metalc ? metalc43 T O5 POP . D POP 400 1_555 Q MG MG . D MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.47 ? 
metalc ? metalc44 T O3 POP . D POP 400 1_555 R MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.303 ? 
metalc ? metalc45 T O4 POP . D POP 400 1_555 R MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? 
metalc ? metalc46 X O HOH . D HOH 627 1_555 R MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc47 X O HOH . D HOH 653 1_555 Q MG MG . D MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? 
metalc ? metalc48 X O HOH . D HOH 659 1_555 Q MG MG . D MG 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.263 ? 
metalc ? metalc49 X O HOH . D HOH 751 1_555 R MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.218 ? 
metalc ? metalc50 X O HOH . D HOH 770 1_555 R MG MG . D MG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? 
#
_chem_comp.formula           'C11 H16 N5 O7 P' 
_chem_comp.formula_weight    361.248 
_chem_comp.id                IMU 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'PHOSPHORIC ACID MONO-[5-(2-AMINO-4-OXO-4,5-DIHYDRO-3H-PYRROLO[3,2-D]PYRIMIDIN-7-YL)-3,4-DIHYDROXY-PYRROLIDIN-2-YLMETHYL] ESTER' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'MODIFIED QUANOSINE-5-PHOSPHATE' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
P O1P IMU sing 173 n n 
P O2P IMU doub 174 n n 
P O3P IMU sing 175 n n 
P O5' IMU sing 176 n n 
C2 N1 IMU sing 177 n y 
C2 N2 IMU sing 178 n n 
C2 N3 IMU doub 179 n y 
O1P HO1P IMU sing 180 n n 
O3P HO3P IMU sing 181 n n 
O5' C5' IMU sing 182 n n 
C5' C4' IMU sing 183 n n 
C5' "H5'1" IMU sing 184 n n 
C5' "H5'2" IMU sing 185 n n 
C4' N4' IMU sing 186 n n 
C4' C3' IMU sing 187 n n 
C4' H4' IMU sing 188 n n 
N4' C1' IMU sing 189 n n 
N4' HN4' IMU sing 190 n n 
C3' O3' IMU sing 191 n n 
C3' C2' IMU sing 192 n n 
C3' H3' IMU sing 193 n n 
O3' HO3' IMU sing 194 n n 
C2' O2' IMU sing 195 n n 
C2' C1' IMU sing 196 n n 
C2' H2' IMU sing 197 n n 
O2' HO2' IMU sing 198 n n 
C1' C9 IMU sing 199 n n 
C1' H1' IMU sing 200 n n 
C9 C8 IMU doub 201 n y 
C9 C4 IMU sing 202 n y 
C8 N7 IMU sing 203 n y 
C8 H8 IMU sing 204 n n 
N7 C5 IMU sing 205 n y 
N7 HN7 IMU sing 206 n n 
C5 C6 IMU sing 207 n y 
C5 C4 IMU doub 208 n y 
C6 O6 IMU doub 209 n n 
C6 N1 IMU sing 210 n y 
N1 HN1 IMU sing 211 n n 
N2 HN21 IMU sing 212 n n 
N2 HN22 IMU sing 213 n n 
N3 C4 IMU sing 214 n y 
#
_atom_sites.entry_id                     1BZY 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.018882 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.009803 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.006931 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 MG A 1 900 900 MG MG . 
F 2 MG A 1 901 901 MG MG . 
G 3 IMU A 1 300 300 IMU IMU . 
H 4 POP A 1 400 400 POP POP . 
I 2 MG B 1 900 900 MG MG . 
J 2 MG B 1 901 901 MG MG . 
K 3 IMU B 1 300 300 IMU IMU . 
L 4 POP B 1 400 400 POP POP . 
M 2 MG C 1 900 900 MG MG . 
N 2 MG C 1 901 901 MG MG . 
O 3 IMU C 1 300 300 IMU IMU . 
P 4 POP C 1 400 400 POP POP . 
Q 2 MG D 1 900 900 MG MG . 
R 2 MG D 1 901 901 MG MG . 
S 3 IMU D 1 300 300 IMU IMU . 
T 4 POP D 1 400 400 POP POP . 
U 5 HOH A 1 500 500 HOH HOH . 
U 5 HOH A 2 506 506 HOH HOH . 
U 5 HOH A 3 508 508 HOH HOH . 
U 5 HOH A 4 511 511 HOH HOH . 
U 5 HOH A 5 514 514 HOH HOH . 
U 5 HOH A 6 517 517 HOH HOH . 
U 5 HOH A 7 523 523 HOH HOH . 
U 5 HOH A 8 526 526 HOH HOH . 
U 5 HOH A 9 527 527 HOH HOH . 
U 5 HOH A 10 530 530 HOH HOH . 
U 5 HOH A 11 532 532 HOH HOH . 
U 5 HOH A 12 534 534 HOH HOH . 
U 5 HOH A 13 551 551 HOH HOH . 
U 5 HOH A 14 553 553 HOH HOH . 
U 5 HOH A 15 554 554 HOH HOH . 
U 5 HOH A 16 564 564 HOH HOH . 
U 5 HOH A 17 574 574 HOH HOH . 
U 5 HOH A 18 576 576 HOH HOH . 
U 5 HOH A 19 579 579 HOH HOH . 
U 5 HOH A 20 580 580 HOH HOH . 
U 5 HOH A 21 582 582 HOH HOH . 
U 5 HOH A 22 583 583 HOH HOH . 
U 5 HOH A 23 585 585 HOH HOH . 
U 5 HOH A 24 590 590 HOH HOH . 
U 5 HOH A 25 598 598 HOH HOH . 
U 5 HOH A 26 599 599 HOH HOH . 
U 5 HOH A 27 600 600 HOH HOH . 
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HETATM 21 N N1 IMU . . . K 3 6.965 118.618 45.48 1 10.42 ? N1 IMU 300 B 1 
HETATM 22 N N2 IMU . . . K 3 8.402 116.779 45.682 1 9.85 ? N2 IMU 300 B 1 
HETATM 23 N N3 IMU . . . K 3 6.85 116.745 43.935 1 12.52 ? N3 IMU 300 B 1 
HETATM 24 C C4 IMU . . . K 3 5.823 117.47 43.333 1 10.5 ? C4 IMU 300 B 1 
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