data_1C1J
#
_model_server_result.job_id            oE_Ha0uMzLjgyjfwk30rbw 
_model_server_result.datetime_utc      '2025-04-08 22:52:37' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1c1j 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"I","auth_seq_id":602}' 
#
_entry.id    1C1J 
#
_exptl.entry_id    1C1J 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              112.411 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CADMIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          111.59 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1C1J 
_cell.length_a            100.18 
_cell.length_b            54.01 
_cell.length_c            108.49 
_cell.Z_PDB               16 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1C1J 
_symmetry.cell_setting             monoclinic 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? dimeric 2 author_defined_assembly 1 
? dimeric 2 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,D,E,F,G,K,L,M,P 1 1 
B,C,H,I,J,N,O 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 G N N 
? 3 I N N 
? 3 J N N 
? 3 K N N 
? 3 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 26 A CYS 27 1_555 A SG CYS 115 A CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 28 A CYS 29 1_555 A SG CYS 44 A CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? 
disulf ? disulf3 A SG CYS 43 A CYS 44 1_555 A SG CYS 95 A CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? 
disulf ? disulf4 A SG CYS 49 A CYS 50 1_555 A SG CYS 122 A CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf5 A SG CYS 50 A CYS 51 1_555 A SG CYS 88 A CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? 
disulf ? disulf6 A SG CYS 57 A CYS 61 1_555 A SG CYS 81 A CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf7 A SG CYS 75 A CYS 84 1_555 A SG CYS 86 A CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf8 B SG CYS 26 B CYS 27 1_555 B SG CYS 115 B CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? 
disulf ? disulf9 B SG CYS 28 B CYS 29 1_555 B SG CYS 44 B CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf10 B SG CYS 43 B CYS 44 1_555 B SG CYS 95 B CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf11 B SG CYS 49 B CYS 50 1_555 B SG CYS 122 B CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf12 B SG CYS 50 B CYS 51 1_555 B SG CYS 88 B CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf13 B SG CYS 57 B CYS 61 1_555 B SG CYS 81 B CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf14 B SG CYS 75 B CYS 84 1_555 B SG CYS 86 B CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
disulf ? disulf15 C SG CYS 26 C CYS 27 1_555 C SG CYS 115 C CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? 
disulf ? disulf16 C SG CYS 28 C CYS 29 1_555 C SG CYS 44 C CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? 
disulf ? disulf17 C SG CYS 43 C CYS 44 1_555 C SG CYS 95 C CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf18 C SG CYS 49 C CYS 50 1_555 C SG CYS 122 C CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf19 C SG CYS 50 C CYS 51 1_555 C SG CYS 88 C CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf20 C SG CYS 57 C CYS 61 1_555 C SG CYS 81 C CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? 
disulf ? disulf21 C SG CYS 75 C CYS 84 1_555 C SG CYS 86 C CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? 
disulf ? disulf22 D SG CYS 26 D CYS 27 1_555 D SG CYS 115 D CYS 126 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf23 D SG CYS 28 D CYS 29 1_555 D SG CYS 44 D CYS 45 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
disulf ? disulf24 D SG CYS 43 D CYS 44 1_555 D SG CYS 95 D CYS 105 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? 
disulf ? disulf25 D SG CYS 49 D CYS 50 1_555 D SG CYS 122 D CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.02 ? 
disulf ? disulf26 D SG CYS 50 D CYS 51 1_555 D SG CYS 88 D CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? 
disulf ? disulf27 D SG CYS 57 D CYS 61 1_555 D SG CYS 81 D CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? 
disulf ? disulf28 D SG CYS 75 D CYS 84 1_555 D SG CYS 86 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
metalc ? metalc1 A O GLY 25 A GLY 26 1_555 G CD CD . A CD 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.968 ? 
metalc ? metalc2 A ND1 HIS 47 A HIS 48 1_555 F CD CD . A CD 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc3 A OD2 ASP 48 A ASP 49 1_555 F CD CD . A CD 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? 
metalc ? metalc4 A OD1 ASP 112 A ASP 122 1_555 G CD CD . A CD 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.097 ? 
metalc ? metalc5 F CD CD . A CD 601 1_555 M O HOH . A HOH 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.721 ? 
metalc ? metalc6 F CD CD . A CD 601 1_555 M O HOH . A HOH 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.861 ? 
metalc ? metalc7 B ND1 HIS 47 B HIS 48 1_555 I CD CD . B CD 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.753 ? 
metalc ? metalc8 B OD2 ASP 48 B ASP 49 1_555 I CD CD . B CD 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.846 ? 
metalc ? metalc9 I CD CD . B CD 602 1_555 N O HOH . B HOH 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.962 ? 
metalc ? metalc10 C ND1 HIS 47 C HIS 48 1_555 J CD CD . C CD 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.514 ? 
metalc ? metalc11 C OD2 ASP 48 C ASP 49 1_555 J CD CD . C CD 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.853 ? 
metalc ? metalc12 J CD CD . C CD 134 1_555 O O HOH . C HOH 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.779 ? 
metalc ? metalc13 D ND1 HIS 47 D HIS 48 1_555 K CD CD . D CD 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? 
metalc ? metalc14 D OD2 ASP 48 D ASP 49 1_555 K CD CD . D CD 134 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.037 ? 
metalc ? metalc15 D OD1 ASP 112 D ASP 122 1_555 L CD CD . D CD 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.014 ? 
metalc ? metalc16 K CD CD . D CD 134 1_555 P O HOH . D HOH 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.871 ? 
metalc ? metalc17 K CD CD . D CD 134 1_555 P O HOH . D HOH 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? 
#
_chem_comp.formula           'Cd 2' 
_chem_comp.formula_weight    112.411 
_chem_comp.id                CD 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CADMIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1C1J 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009982 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.00395 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.018515 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.009913 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 BOG A 1 600 600 BOG BOG . 
F 3 CD A 1 601 100 CD ICD . 
G 3 CD A 1 602 104 CD ICD . 
H 2 BOG B 1 601 601 BOG BOG . 
I 3 CD B 1 602 101 CD ICD . 
J 3 CD C 1 134 102 CD ICD . 
K 3 CD D 1 134 103 CD ICD . 
L 3 CD D 1 135 105 CD ICD . 
M 4 HOH A 1 603 4 HOH TIP . 
M 4 HOH A 2 604 5 HOH TIP . 
M 4 HOH A 3 605 8 HOH TIP . 
M 4 HOH A 4 606 9 HOH TIP . 
M 4 HOH A 5 607 10 HOH TIP . 
M 4 HOH A 6 608 11 HOH TIP . 
M 4 HOH A 7 609 13 HOH TIP . 
M 4 HOH A 8 610 25 HOH TIP . 
M 4 HOH A 9 611 26 HOH TIP . 
M 4 HOH A 10 612 27 HOH TIP . 
M 4 HOH A 11 613 32 HOH TIP . 
M 4 HOH A 12 614 35 HOH TIP . 
M 4 HOH A 13 615 39 HOH TIP . 
M 4 HOH A 14 616 41 HOH TIP . 
M 4 HOH A 15 617 42 HOH TIP . 
N 4 HOH B 1 603 1 HOH TIP . 
N 4 HOH B 2 604 2 HOH TIP . 
N 4 HOH B 3 605 12 HOH TIP . 
N 4 HOH B 4 606 14 HOH TIP . 
N 4 HOH B 5 607 23 HOH TIP . 
N 4 HOH B 6 608 24 HOH TIP . 
N 4 HOH B 7 609 40 HOH TIP . 
N 4 HOH B 8 610 47 HOH TIP . 
O 4 HOH C 1 135 3 HOH TIP . 
O 4 HOH C 2 136 7 HOH TIP . 
O 4 HOH C 3 137 15 HOH TIP . 
O 4 HOH C 4 138 16 HOH TIP . 
O 4 HOH C 5 139 30 HOH TIP . 
O 4 HOH C 6 140 33 HOH TIP . 
O 4 HOH C 7 141 36 HOH TIP . 
O 4 HOH C 8 142 38 HOH TIP . 
O 4 HOH C 9 143 43 HOH TIP . 
O 4 HOH C 10 144 44 HOH TIP . 
O 4 HOH C 11 145 45 HOH TIP . 
O 4 HOH C 12 146 46 HOH TIP . 
P 4 HOH D 1 136 6 HOH TIP . 
P 4 HOH D 2 137 17 HOH TIP . 
P 4 HOH D 3 138 18 HOH TIP . 
P 4 HOH D 4 139 19 HOH TIP . 
P 4 HOH D 5 140 20 HOH TIP . 
P 4 HOH D 6 141 21 HOH TIP . 
P 4 HOH D 7 142 22 HOH TIP . 
P 4 HOH D 8 143 28 HOH TIP . 
P 4 HOH D 9 144 29 HOH TIP . 
P 4 HOH D 10 145 31 HOH TIP . 
P 4 HOH D 11 146 34 HOH TIP . 
P 4 HOH D 12 147 37 HOH TIP . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CD 
_atom_site.label_atom_id         CD 
_atom_site.label_comp_id         CD 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         I 
_atom_site.label_entity_id       3 
_atom_site.Cartn_x               47.059 
_atom_site.Cartn_y               -7.282 
_atom_site.Cartn_z               36.075 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        77.49 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CD 
_atom_site.auth_comp_id          CD 
_atom_site.auth_seq_id           602 
_atom_site.auth_asym_id          B 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              70 
_model_server_stats.parse_time_ms           14 
_model_server_stats.create_model_time_ms    35 
_model_server_stats.query_time_ms           495 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           1 
#