data_1C9M # _model_server_result.job_id 397S0BigQ-eVdO1UxWdAuA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-09 02:38:48' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1c9m # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":278}' # _entry.id 1C9M # _exptl.entry_id 1C9M _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1C9M _cell.length_a 53.25 _cell.length_b 61.25 _cell.length_c 75.05 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1C9M _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 C N N ? 3 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C THR 214 A THR 220 1_555 A N SEB 215 A SEB 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.315 ? covale ? covale2 A C SEB 215 A SEB 221 1_555 A N MET 216 A MET 222 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.318 ? metalc ? metalc1 C CA CA . A CA 277 1_555 A OE1 GLN 2 A GLN 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.332 ? metalc ? metalc2 C CA CA . A CA 277 1_555 A OD1 ASN 75 A ASN 77 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.471 ? metalc ? metalc3 C CA CA . A CA 277 1_555 A O LEU 73 A LEU 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.245 ? metalc ? metalc4 C CA CA . A CA 277 1_555 A O ILE 77 A ILE 79 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.298 ? metalc ? metalc5 C CA CA . A CA 277 1_555 A O VAL 79 A VAL 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.394 ? metalc ? metalc6 C CA CA . A CA 277 1_555 A OD1 ASP 40 A ASP 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc7 C CA CA . A CA 277 1_555 A OD2 ASP 40 A ASP 41 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.488 ? metalc ? metalc8 D CA CA . A CA 278 1_555 A OD2 ASP 191 A ASP 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.192 ? metalc ? metalc9 D CA CA . A CA 278 1_555 E O HOH . A HOH 378 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.797 ? metalc ? metalc10 D CA CA . A CA 278 1_555 A O ALA 163 A ALA 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.682 ? metalc ? metalc11 D CA CA . A CA 278 1_555 A O TYR 165 A TYR 171 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.118 ? metalc ? metalc12 D CA CA . A CA 278 1_555 A O ALA 168 A ALA 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.845 ? metalc ? metalc13 D CA CA . A CA 278 1_555 A O GLY 189 A GLY 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.726 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1C9M _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.018779 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016327 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013324 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 SO4 A 1 276 276 SO4 SO4 . C 3 CA A 1 277 277 CA CA . D 3 CA A 1 278 278 CA CA . E 4 HOH A 1 279 279 HOH WAT . E 4 HOH A 2 280 280 HOH WAT . E 4 HOH A 3 281 281 HOH WAT . E 4 HOH A 4 282 282 HOH WAT . E 4 HOH A 5 283 283 HOH WAT . E 4 HOH A 6 284 284 HOH WAT . E 4 HOH A 7 285 285 HOH WAT . E 4 HOH A 8 286 286 HOH WAT . E 4 HOH A 9 287 287 HOH WAT . E 4 HOH A 10 288 288 HOH WAT . E 4 HOH A 11 289 289 HOH WAT . E 4 HOH A 12 290 290 HOH WAT . E 4 HOH A 13 291 291 HOH WAT . E 4 HOH A 14 292 292 HOH WAT . E 4 HOH A 15 293 293 HOH WAT . E 4 HOH A 16 294 294 HOH WAT . E 4 HOH A 17 295 295 HOH WAT . E 4 HOH A 18 296 296 HOH WAT . E 4 HOH A 19 297 297 HOH WAT . E 4 HOH A 20 298 298 HOH WAT . E 4 HOH A 21 299 299 HOH WAT . E 4 HOH A 22 300 300 HOH WAT . E 4 HOH A 23 301 301 HOH WAT . E 4 HOH A 24 302 302 HOH WAT . E 4 HOH A 25 303 303 HOH WAT . E 4 HOH A 26 304 304 HOH WAT . E 4 HOH A 27 305 305 HOH WAT . E 4 HOH A 28 306 306 HOH WAT . E 4 HOH A 29 307 307 HOH WAT . E 4 HOH A 30 308 308 HOH WAT . E 4 HOH A 31 309 309 HOH WAT . E 4 HOH A 32 310 310 HOH WAT . E 4 HOH A 33 311 311 HOH WAT . E 4 HOH A 34 312 312 HOH WAT . E 4 HOH A 35 313 313 HOH WAT . E 4 HOH A 36 314 314 HOH WAT . E 4 HOH A 37 315 315 HOH WAT . E 4 HOH A 38 316 316 HOH WAT . E 4 HOH A 39 317 317 HOH WAT . E 4 HOH A 40 318 318 HOH WAT . E 4 HOH A 41 319 319 HOH WAT . E 4 HOH A 42 320 320 HOH WAT . E 4 HOH A 43 321 321 HOH WAT . E 4 HOH A 44 322 322 HOH WAT . E 4 HOH A 45 323 323 HOH WAT . E 4 HOH A 46 324 324 HOH WAT . E 4 HOH A 47 325 325 HOH WAT . E 4 HOH A 48 326 326 HOH WAT . E 4 HOH A 49 327 327 HOH WAT . E 4 HOH A 50 328 328 HOH WAT . E 4 HOH A 51 329 329 HOH WAT . E 4 HOH A 52 330 330 HOH WAT . E 4 HOH A 53 331 331 HOH WAT . E 4 HOH A 54 332 332 HOH WAT . E 4 HOH A 55 333 333 HOH WAT . E 4 HOH A 56 334 334 HOH WAT . E 4 HOH A 57 335 335 HOH WAT . E 4 HOH A 58 336 336 HOH WAT . E 4 HOH A 59 337 337 HOH WAT . E 4 HOH A 60 338 338 HOH WAT . E 4 HOH A 61 339 339 HOH WAT . E 4 HOH A 62 340 340 HOH WAT . E 4 HOH A 63 341 341 HOH WAT . E 4 HOH A 64 342 342 HOH WAT . E 4 HOH A 65 343 343 HOH WAT . E 4 HOH A 66 344 344 HOH WAT . E 4 HOH A 67 345 345 HOH WAT . E 4 HOH A 68 346 346 HOH WAT . E 4 HOH A 69 347 347 HOH WAT . E 4 HOH A 70 348 348 HOH WAT . E 4 HOH A 71 349 349 HOH WAT . E 4 HOH A 72 350 350 HOH WAT . E 4 HOH A 73 351 351 HOH WAT . E 4 HOH A 74 352 352 HOH WAT . E 4 HOH A 75 353 353 HOH WAT . E 4 HOH A 76 354 354 HOH WAT . E 4 HOH A 77 355 355 HOH WAT . E 4 HOH A 78 356 356 HOH WAT . E 4 HOH A 79 357 357 HOH WAT . E 4 HOH A 80 358 358 HOH WAT . E 4 HOH A 81 359 359 HOH WAT . E 4 HOH A 82 360 360 HOH WAT . E 4 HOH A 83 361 361 HOH WAT . E 4 HOH A 84 362 362 HOH WAT . E 4 HOH A 85 363 363 HOH WAT . E 4 HOH A 86 364 364 HOH WAT . E 4 HOH A 87 365 365 HOH WAT . E 4 HOH A 88 366 366 HOH WAT . E 4 HOH A 89 367 367 HOH WAT . E 4 HOH A 90 368 368 HOH WAT . E 4 HOH A 91 369 369 HOH WAT . E 4 HOH A 92 370 370 HOH WAT . E 4 HOH A 93 371 371 HOH WAT . E 4 HOH A 94 372 372 HOH WAT . E 4 HOH A 95 373 373 HOH WAT . E 4 HOH A 96 374 374 HOH WAT . E 4 HOH A 97 375 375 HOH WAT . E 4 HOH A 98 376 376 HOH WAT . E 4 HOH A 99 377 377 HOH WAT . E 4 HOH A 100 378 378 HOH WAT . E 4 HOH A 101 379 379 HOH WAT . E 4 HOH A 102 380 380 HOH WAT . E 4 HOH A 103 381 381 HOH WAT . E 4 HOH A 104 382 382 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 7.889 _atom_site.Cartn_y -35.869 _atom_site.Cartn_z 4.411 _atom_site.occupancy 0.83 _atom_site.B_iso_or_equiv 37.18 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 278 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 43 _model_server_stats.parse_time_ms 5 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 261 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #