data_1D6J # _model_server_result.job_id vmPcj5fyJg4psB77RLWKjg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 07:26:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1d6j # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":212}' # _entry.id 1D6J # _exptl.entry_id 1D6J _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 150.087 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'L(+)-TARTARIC ACID' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1D6J _cell.length_a 78.862 _cell.length_b 83.484 _cell.length_c 141.951 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1D6J _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 20 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 2 2 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C4 H6 O6' _chem_comp.formula_weight 150.087 _chem_comp.id TLA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'L(+)-TARTARIC ACID' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag O1 C1 TLA doub 293 n n O11 C1 TLA sing 294 n n O11 H11 TLA sing 295 n n C1 C2 TLA sing 296 n n C2 O2 TLA sing 297 n n C2 C3 TLA sing 298 n n C2 H2 TLA sing 299 n n O2 HA TLA sing 300 n n C3 O3 TLA sing 301 n n C3 C4 TLA sing 302 n n C3 H3 TLA sing 303 n n O3 HB TLA sing 304 n n C4 O4 TLA doub 305 n n C4 O41 TLA sing 306 n n O41 H41 TLA sing 307 n n # _atom_sites.entry_id 1D6J _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01268 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011978 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007045 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 TLA A 1 212 201 TLA TAR . D 3 HOH A 1 213 1 HOH WAT . D 3 HOH A 2 214 3 HOH WAT . D 3 HOH A 3 215 6 HOH WAT . D 3 HOH A 4 216 7 HOH WAT . D 3 HOH A 5 217 8 HOH WAT . D 3 HOH A 6 218 9 HOH WAT . D 3 HOH A 7 219 10 HOH WAT . D 3 HOH A 8 220 11 HOH WAT . D 3 HOH A 9 221 12 HOH WAT . D 3 HOH A 10 222 14 HOH WAT . D 3 HOH A 11 223 15 HOH WAT . D 3 HOH A 12 224 16 HOH WAT . D 3 HOH A 13 225 17 HOH WAT . D 3 HOH A 14 226 18 HOH WAT . D 3 HOH A 15 227 19 HOH WAT . D 3 HOH A 16 228 20 HOH WAT . D 3 HOH A 17 229 21 HOH WAT . D 3 HOH A 18 230 22 HOH WAT . D 3 HOH A 19 231 24 HOH WAT . D 3 HOH A 20 232 25 HOH WAT . D 3 HOH A 21 233 27 HOH WAT . D 3 HOH A 22 234 28 HOH WAT . D 3 HOH A 23 235 30 HOH WAT . D 3 HOH A 24 236 31 HOH WAT . D 3 HOH A 25 237 32 HOH WAT . D 3 HOH A 26 238 33 HOH WAT . D 3 HOH A 27 239 35 HOH WAT . D 3 HOH A 28 240 36 HOH WAT . D 3 HOH A 29 241 37 HOH WAT . D 3 HOH A 30 242 38 HOH WAT . D 3 HOH A 31 243 39 HOH WAT . D 3 HOH A 32 244 41 HOH WAT . D 3 HOH A 33 245 42 HOH WAT . D 3 HOH A 34 246 43 HOH WAT . D 3 HOH A 35 247 44 HOH WAT . D 3 HOH A 36 248 48 HOH WAT . D 3 HOH A 37 249 50 HOH WAT . D 3 HOH A 38 250 51 HOH WAT . D 3 HOH A 39 251 53 HOH WAT . D 3 HOH A 40 252 54 HOH WAT . D 3 HOH A 41 253 55 HOH WAT . D 3 HOH A 42 254 56 HOH WAT . D 3 HOH A 43 255 60 HOH WAT . D 3 HOH A 44 256 61 HOH WAT . D 3 HOH A 45 257 62 HOH WAT . D 3 HOH A 46 258 63 HOH WAT . D 3 HOH A 47 259 64 HOH WAT . D 3 HOH A 48 260 65 HOH WAT . D 3 HOH A 49 261 69 HOH WAT . D 3 HOH A 50 262 70 HOH WAT . D 3 HOH A 51 263 71 HOH WAT . D 3 HOH A 52 264 72 HOH WAT . D 3 HOH A 53 265 73 HOH WAT . D 3 HOH A 54 266 79 HOH WAT . D 3 HOH A 55 267 81 HOH WAT . D 3 HOH A 56 268 82 HOH WAT . D 3 HOH A 57 269 83 HOH WAT . D 3 HOH A 58 270 84 HOH WAT . D 3 HOH A 59 271 85 HOH WAT . D 3 HOH A 60 272 86 HOH WAT . D 3 HOH A 61 273 87 HOH WAT . D 3 HOH A 62 274 88 HOH WAT . D 3 HOH A 63 275 90 HOH WAT . D 3 HOH A 64 276 99 HOH WAT . D 3 HOH A 65 277 102 HOH WAT . D 3 HOH A 66 278 104 HOH WAT . D 3 HOH A 67 279 105 HOH WAT . D 3 HOH A 68 280 106 HOH WAT . D 3 HOH A 69 281 108 HOH WAT . D 3 HOH A 70 282 109 HOH WAT . D 3 HOH A 71 283 110 HOH WAT . D 3 HOH A 72 284 111 HOH WAT . D 3 HOH A 73 285 112 HOH WAT . D 3 HOH A 74 286 113 HOH WAT . D 3 HOH A 75 287 114 HOH WAT . D 3 HOH A 76 288 115 HOH WAT . D 3 HOH A 77 289 116 HOH WAT . D 3 HOH A 78 290 117 HOH WAT . D 3 HOH A 79 291 118 HOH WAT . D 3 HOH A 80 292 119 HOH WAT . D 3 HOH A 81 293 125 HOH WAT . D 3 HOH A 82 294 126 HOH WAT . D 3 HOH A 83 295 127 HOH WAT . D 3 HOH A 84 296 130 HOH WAT . D 3 HOH A 85 297 131 HOH WAT . D 3 HOH A 86 298 132 HOH WAT . D 3 HOH A 87 299 133 HOH WAT . D 3 HOH A 88 300 134 HOH WAT . D 3 HOH A 89 301 135 HOH WAT . D 3 HOH A 90 302 136 HOH WAT . D 3 HOH A 91 303 139 HOH WAT . D 3 HOH A 92 304 140 HOH WAT . D 3 HOH A 93 305 141 HOH WAT . D 3 HOH A 94 306 142 HOH WAT . D 3 HOH A 95 307 143 HOH WAT . D 3 HOH A 96 308 145 HOH WAT . D 3 HOH A 97 309 146 HOH WAT . D 3 HOH A 98 310 148 HOH WAT . D 3 HOH A 99 311 149 HOH WAT . D 3 HOH A 100 312 150 HOH WAT . D 3 HOH A 101 313 151 HOH WAT . D 3 HOH A 102 314 152 HOH WAT . D 3 HOH A 103 315 153 HOH WAT . D 3 HOH A 104 316 154 HOH WAT . D 3 HOH A 105 317 155 HOH WAT . D 3 HOH A 106 318 156 HOH WAT . D 3 HOH A 107 319 167 HOH WAT . D 3 HOH A 108 320 169 HOH WAT . D 3 HOH A 109 321 171 HOH WAT . D 3 HOH A 110 322 172 HOH WAT . D 3 HOH A 111 323 173 HOH WAT . D 3 HOH A 112 324 176 HOH WAT . D 3 HOH A 113 325 177 HOH WAT . D 3 HOH A 114 326 178 HOH WAT . D 3 HOH A 115 327 180 HOH WAT . D 3 HOH A 116 328 181 HOH WAT . D 3 HOH A 117 329 182 HOH WAT . D 3 HOH A 118 330 184 HOH WAT . D 3 HOH A 119 331 186 HOH WAT . D 3 HOH A 120 332 190 HOH WAT . D 3 HOH A 121 333 191 HOH WAT . D 3 HOH A 122 334 192 HOH WAT . D 3 HOH A 123 335 196 HOH WAT . D 3 HOH A 124 336 197 HOH WAT . D 3 HOH A 125 337 198 HOH WAT . D 3 HOH A 126 338 199 HOH WAT . E 3 HOH B 1 212 2 HOH WAT . E 3 HOH B 2 213 4 HOH WAT . E 3 HOH B 3 214 5 HOH WAT . E 3 HOH B 4 215 13 HOH WAT . E 3 HOH B 5 216 23 HOH WAT . E 3 HOH B 6 217 26 HOH WAT . E 3 HOH B 7 218 29 HOH WAT . E 3 HOH B 8 219 34 HOH WAT . E 3 HOH B 9 220 40 HOH WAT . E 3 HOH B 10 221 45 HOH WAT . E 3 HOH B 11 222 46 HOH WAT . E 3 HOH B 12 223 47 HOH WAT . E 3 HOH B 13 224 49 HOH WAT . E 3 HOH B 14 225 52 HOH WAT . E 3 HOH B 15 226 57 HOH WAT . E 3 HOH B 16 227 58 HOH WAT . E 3 HOH B 17 228 59 HOH WAT . E 3 HOH B 18 229 66 HOH WAT . E 3 HOH B 19 230 67 HOH WAT . E 3 HOH B 20 231 68 HOH WAT . E 3 HOH B 21 232 74 HOH WAT . E 3 HOH B 22 233 75 HOH WAT . E 3 HOH B 23 234 76 HOH WAT . E 3 HOH B 24 235 77 HOH WAT . E 3 HOH B 25 236 78 HOH WAT . E 3 HOH B 26 237 80 HOH WAT . E 3 HOH B 27 238 89 HOH WAT . E 3 HOH B 28 239 91 HOH WAT . E 3 HOH B 29 240 92 HOH WAT . E 3 HOH B 30 241 93 HOH WAT . E 3 HOH B 31 242 94 HOH WAT . E 3 HOH B 32 243 95 HOH WAT . E 3 HOH B 33 244 96 HOH WAT . E 3 HOH B 34 245 97 HOH WAT . E 3 HOH B 35 246 98 HOH WAT . E 3 HOH B 36 247 100 HOH WAT . E 3 HOH B 37 248 101 HOH WAT . E 3 HOH B 38 249 103 HOH WAT . E 3 HOH B 39 250 107 HOH WAT . E 3 HOH B 40 251 120 HOH WAT . E 3 HOH B 41 252 121 HOH WAT . E 3 HOH B 42 253 122 HOH WAT . E 3 HOH B 43 254 123 HOH WAT . E 3 HOH B 44 255 124 HOH WAT . E 3 HOH B 45 256 128 HOH WAT . E 3 HOH B 46 257 129 HOH WAT . E 3 HOH B 47 258 137 HOH WAT . E 3 HOH B 48 259 138 HOH WAT . E 3 HOH B 49 260 144 HOH WAT . E 3 HOH B 50 261 157 HOH WAT . E 3 HOH B 51 262 158 HOH WAT . E 3 HOH B 52 263 159 HOH WAT . E 3 HOH B 53 264 160 HOH WAT . E 3 HOH B 54 265 161 HOH WAT . E 3 HOH B 55 266 162 HOH WAT . E 3 HOH B 56 267 163 HOH WAT . E 3 HOH B 57 268 164 HOH WAT . E 3 HOH B 58 269 165 HOH WAT . E 3 HOH B 59 270 166 HOH WAT . E 3 HOH B 60 271 168 HOH WAT . E 3 HOH B 61 272 170 HOH WAT . E 3 HOH B 62 273 174 HOH WAT . E 3 HOH B 63 274 175 HOH WAT . E 3 HOH B 64 275 179 HOH WAT . E 3 HOH B 65 276 183 HOH WAT . E 3 HOH B 66 277 185 HOH WAT . E 3 HOH B 67 278 187 HOH WAT . E 3 HOH B 68 279 188 HOH WAT . E 3 HOH B 69 280 189 HOH WAT . E 3 HOH B 70 281 193 HOH WAT . E 3 HOH B 71 282 194 HOH WAT . E 3 HOH B 72 283 195 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 O O1 TLA . . . C 2 30.998 40.732 39.39 1 56.45 ? O1 TLA 212 A 1 HETATM 2 O O11 TLA . . . C 2 30.843 38.455 39.793 1 51.62 ? O11 TLA 212 A 1 HETATM 3 C C1 TLA . . . C 2 31.172 39.457 39.109 1 57.11 ? C1 TLA 212 A 1 HETATM 4 C C2 TLA . . . C 2 31.888 39.341 37.759 1 56.54 ? C2 TLA 212 A 1 HETATM 5 O O2 TLA . . . C 2 31.874 37.967 37.384 1 39.65 ? O2 TLA 212 A 1 HETATM 6 C C3 TLA . . . C 2 33.313 39.858 37.955 1 64.72 ? C3 TLA 212 A 1 HETATM 7 O O3 TLA . . . C 2 33.91 39.239 39.157 1 60.57 ? O3 TLA 212 A 1 HETATM 8 C C4 TLA . . . C 2 34.073 39.492 36.687 1 67.45 ? C4 TLA 212 A 1 HETATM 9 O O4 TLA . . . C 2 33.781 40.332 35.726 1 68.33 ? O4 TLA 212 A 1 HETATM 10 O O41 TLA . . . C 2 34.811 38.551 36.586 1 53.08 ? O41 TLA 212 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 57 _model_server_stats.parse_time_ms 14 _model_server_stats.create_model_time_ms 25 _model_server_stats.query_time_ms 334 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 10 #