data_1DAY # _model_server_result.job_id Nr9l-QlZmx13YiXv5O_0bw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 22:01:35' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1day # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":341}' # _entry.id 1DAY # _exptl.entry_id 1DAY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 103.77 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1DAY _cell.length_a 142.7 _cell.length_b 58.82 _cell.length_c 46.18 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1DAY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD1 ASN 155 A ASN 161 1_555 C MG MG . A MG 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.226 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 169 A ASP 175 1_555 B MG MG . A MG 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.109 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 169 A ASP 175 1_555 B MG MG . A MG 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.102 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 169 A ASP 175 1_555 C MG MG . A MG 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.956 ? metalc ? metalc5 D O3G GNP . A GNP 340 1_555 B MG MG . A MG 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? metalc ? metalc6 D O2B GNP . A GNP 340 1_555 B MG MG . A MG 341 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc7 D O1G GNP . A GNP 340 1_555 C MG MG . A MG 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.842 ? metalc ? metalc8 D O2A GNP . A GNP 340 1_555 C MG MG . A MG 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.865 ? metalc ? metalc9 D O3A GNP . A GNP 340 1_555 C MG MG . A MG 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.772 ? metalc ? metalc10 D N3B GNP . A GNP 340 1_555 C MG MG . A MG 342 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.035 ? metalc ? metalc11 B MG MG . A MG 341 1_555 E O HOH . A HOH 362 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.107 ? metalc ? metalc12 B MG MG . A MG 341 1_555 E O HOH . A HOH 560 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.995 ? metalc ? metalc13 C MG MG . A MG 342 1_555 E O HOH . A HOH 355 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1DAY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007008 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001717 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.017001 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.022295 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MG A 1 341 341 MG IUM . C 2 MG A 1 342 342 MG IUM . D 3 GNP A 1 340 340 GNP GNP . E 4 HOH A 1 350 350 HOH WAT . E 4 HOH A 2 351 351 HOH WAT . E 4 HOH A 3 352 352 HOH WAT . E 4 HOH A 4 353 353 HOH WAT . E 4 HOH A 5 354 354 HOH WAT . E 4 HOH A 6 355 355 HOH WAT . E 4 HOH A 7 356 356 HOH WAT . E 4 HOH A 8 357 357 HOH WAT . E 4 HOH A 9 358 358 HOH WAT . E 4 HOH A 10 359 359 HOH WAT . E 4 HOH A 11 360 360 HOH WAT . E 4 HOH A 12 361 361 HOH WAT . E 4 HOH A 13 362 362 HOH WAT . E 4 HOH A 14 363 363 HOH WAT . E 4 HOH A 15 364 364 HOH WAT . E 4 HOH A 16 365 365 HOH WAT . E 4 HOH A 17 366 366 HOH WAT . E 4 HOH A 18 367 367 HOH WAT . E 4 HOH A 19 368 368 HOH WAT . E 4 HOH A 20 369 369 HOH WAT . E 4 HOH A 21 370 370 HOH WAT . E 4 HOH A 22 371 371 HOH WAT . E 4 HOH A 23 372 372 HOH WAT . E 4 HOH A 24 373 373 HOH WAT . E 4 HOH A 25 374 374 HOH WAT . E 4 HOH A 26 375 375 HOH WAT . E 4 HOH A 27 376 376 HOH WAT . E 4 HOH A 28 377 377 HOH WAT . E 4 HOH A 29 378 378 HOH WAT . E 4 HOH A 30 379 379 HOH WAT . E 4 HOH A 31 380 380 HOH WAT . E 4 HOH A 32 381 381 HOH WAT . E 4 HOH A 33 382 382 HOH WAT . E 4 HOH A 34 383 383 HOH WAT . E 4 HOH A 35 384 384 HOH WAT . E 4 HOH A 36 385 385 HOH WAT . E 4 HOH A 37 386 386 HOH WAT . E 4 HOH A 38 387 387 HOH WAT . E 4 HOH A 39 388 388 HOH WAT . E 4 HOH A 40 389 389 HOH WAT . E 4 HOH A 41 390 390 HOH WAT . E 4 HOH A 42 391 391 HOH WAT . E 4 HOH A 43 392 392 HOH WAT . E 4 HOH A 44 393 393 HOH WAT . E 4 HOH A 45 394 394 HOH WAT . E 4 HOH A 46 395 395 HOH WAT . E 4 HOH A 47 396 396 HOH WAT . E 4 HOH A 48 397 397 HOH WAT . E 4 HOH A 49 398 398 HOH WAT . E 4 HOH A 50 399 399 HOH WAT . E 4 HOH A 51 400 400 HOH WAT . E 4 HOH A 52 401 401 HOH WAT . E 4 HOH A 53 402 402 HOH WAT . E 4 HOH A 54 403 403 HOH WAT . E 4 HOH A 55 404 404 HOH WAT . E 4 HOH A 56 405 405 HOH WAT . E 4 HOH A 57 406 406 HOH WAT . E 4 HOH A 58 407 407 HOH WAT . E 4 HOH A 59 408 408 HOH WAT . E 4 HOH A 60 409 409 HOH WAT . E 4 HOH A 61 410 410 HOH WAT . E 4 HOH A 62 411 411 HOH WAT . E 4 HOH A 63 412 412 HOH WAT . E 4 HOH A 64 413 413 HOH WAT . E 4 HOH A 65 414 414 HOH WAT . E 4 HOH A 66 415 415 HOH WAT . E 4 HOH A 67 416 416 HOH WAT . E 4 HOH A 68 417 417 HOH WAT . E 4 HOH A 69 418 418 HOH WAT . E 4 HOH A 70 419 419 HOH WAT . E 4 HOH A 71 420 420 HOH WAT . E 4 HOH A 72 421 421 HOH WAT . E 4 HOH A 73 422 422 HOH WAT . E 4 HOH A 74 423 423 HOH WAT . E 4 HOH A 75 424 424 HOH WAT . E 4 HOH A 76 425 425 HOH WAT . E 4 HOH A 77 426 426 HOH WAT . E 4 HOH A 78 427 427 HOH WAT . E 4 HOH A 79 428 428 HOH WAT . E 4 HOH A 80 429 429 HOH WAT . E 4 HOH A 81 430 430 HOH WAT . E 4 HOH A 82 431 431 HOH WAT . E 4 HOH A 83 432 432 HOH WAT . E 4 HOH A 84 433 433 HOH WAT . E 4 HOH A 85 434 434 HOH WAT . E 4 HOH A 86 435 435 HOH WAT . E 4 HOH A 87 436 436 HOH WAT . E 4 HOH A 88 437 437 HOH WAT . E 4 HOH A 89 438 438 HOH WAT . E 4 HOH A 90 439 439 HOH WAT . E 4 HOH A 91 440 440 HOH WAT . E 4 HOH A 92 441 441 HOH WAT . E 4 HOH A 93 442 442 HOH WAT . E 4 HOH A 94 443 443 HOH WAT . E 4 HOH A 95 444 444 HOH WAT . E 4 HOH A 96 445 445 HOH WAT . E 4 HOH A 97 446 446 HOH WAT . E 4 HOH A 98 447 447 HOH WAT . E 4 HOH A 99 448 448 HOH WAT . E 4 HOH A 100 449 449 HOH WAT . E 4 HOH A 101 450 450 HOH WAT . E 4 HOH A 102 451 451 HOH WAT . E 4 HOH A 103 452 452 HOH WAT . E 4 HOH A 104 453 453 HOH WAT . E 4 HOH A 105 454 454 HOH WAT . E 4 HOH A 106 455 455 HOH WAT . E 4 HOH A 107 456 456 HOH WAT . E 4 HOH A 108 457 457 HOH WAT . E 4 HOH A 109 458 458 HOH WAT . E 4 HOH A 110 459 459 HOH WAT . E 4 HOH A 111 460 460 HOH WAT . E 4 HOH A 112 461 461 HOH WAT . E 4 HOH A 113 462 462 HOH WAT . E 4 HOH A 114 463 463 HOH WAT . E 4 HOH A 115 464 464 HOH WAT . E 4 HOH A 116 465 465 HOH WAT . E 4 HOH A 117 466 466 HOH WAT . E 4 HOH A 118 467 467 HOH WAT . E 4 HOH A 119 468 468 HOH WAT . E 4 HOH A 120 469 469 HOH WAT . E 4 HOH A 121 470 470 HOH WAT . E 4 HOH A 122 471 471 HOH WAT . E 4 HOH A 123 472 472 HOH WAT . E 4 HOH A 124 473 473 HOH WAT . E 4 HOH A 125 474 474 HOH WAT . E 4 HOH A 126 475 475 HOH WAT . E 4 HOH A 127 476 476 HOH WAT . E 4 HOH A 128 477 477 HOH WAT . E 4 HOH A 129 478 478 HOH WAT . E 4 HOH A 130 479 479 HOH WAT . E 4 HOH A 131 480 480 HOH WAT . E 4 HOH A 132 481 481 HOH WAT . E 4 HOH A 133 482 482 HOH WAT . E 4 HOH A 134 483 483 HOH WAT . E 4 HOH A 135 484 484 HOH WAT . E 4 HOH A 136 485 485 HOH WAT . E 4 HOH A 137 486 486 HOH WAT . E 4 HOH A 138 487 487 HOH WAT . E 4 HOH A 139 488 488 HOH WAT . E 4 HOH A 140 489 489 HOH WAT . E 4 HOH A 141 490 490 HOH WAT . E 4 HOH A 142 491 491 HOH WAT . E 4 HOH A 143 492 492 HOH WAT . E 4 HOH A 144 493 493 HOH WAT . E 4 HOH A 145 494 494 HOH WAT . E 4 HOH A 146 495 495 HOH WAT . E 4 HOH A 147 496 496 HOH WAT . E 4 HOH A 148 497 497 HOH WAT . E 4 HOH A 149 498 498 HOH WAT . E 4 HOH A 150 499 499 HOH WAT . E 4 HOH A 151 500 500 HOH WAT . E 4 HOH A 152 501 501 HOH WAT . E 4 HOH A 153 502 502 HOH WAT . E 4 HOH A 154 503 503 HOH WAT . E 4 HOH A 155 504 504 HOH WAT . E 4 HOH A 156 505 505 HOH WAT . E 4 HOH A 157 506 506 HOH WAT . E 4 HOH A 158 507 507 HOH WAT . E 4 HOH A 159 508 508 HOH WAT . E 4 HOH A 160 509 509 HOH WAT . E 4 HOH A 161 510 510 HOH WAT . E 4 HOH A 162 511 511 HOH WAT . E 4 HOH A 163 512 512 HOH WAT . E 4 HOH A 164 513 513 HOH WAT . E 4 HOH A 165 514 514 HOH WAT . E 4 HOH A 166 515 515 HOH WAT . E 4 HOH A 167 516 516 HOH WAT . E 4 HOH A 168 517 517 HOH WAT . E 4 HOH A 169 518 518 HOH WAT . E 4 HOH A 170 519 519 HOH WAT . E 4 HOH A 171 520 520 HOH WAT . E 4 HOH A 172 521 521 HOH WAT . E 4 HOH A 173 522 522 HOH WAT . E 4 HOH A 174 523 523 HOH WAT . E 4 HOH A 175 524 524 HOH WAT . E 4 HOH A 176 525 525 HOH WAT . E 4 HOH A 177 526 526 HOH WAT . E 4 HOH A 178 527 527 HOH WAT . E 4 HOH A 179 528 528 HOH WAT . E 4 HOH A 180 529 529 HOH WAT . E 4 HOH A 181 530 530 HOH WAT . E 4 HOH A 182 531 531 HOH WAT . E 4 HOH A 183 532 532 HOH WAT . E 4 HOH A 184 533 533 HOH WAT . E 4 HOH A 185 534 534 HOH WAT . E 4 HOH A 186 535 535 HOH WAT . E 4 HOH A 187 536 536 HOH WAT . E 4 HOH A 188 537 537 HOH WAT . E 4 HOH A 189 538 538 HOH WAT . E 4 HOH A 190 539 539 HOH WAT . E 4 HOH A 191 540 540 HOH WAT . E 4 HOH A 192 541 541 HOH WAT . E 4 HOH A 193 542 542 HOH WAT . E 4 HOH A 194 543 543 HOH WAT . E 4 HOH A 195 544 544 HOH WAT . E 4 HOH A 196 545 545 HOH WAT . E 4 HOH A 197 546 546 HOH WAT . E 4 HOH A 198 547 547 HOH WAT . E 4 HOH A 199 548 548 HOH WAT . E 4 HOH A 200 549 549 HOH WAT . E 4 HOH A 201 550 550 HOH WAT . E 4 HOH A 202 551 551 HOH WAT . E 4 HOH A 203 552 552 HOH WAT . E 4 HOH A 204 553 553 HOH WAT . E 4 HOH A 205 554 554 HOH WAT . E 4 HOH A 206 555 555 HOH WAT . E 4 HOH A 207 556 556 HOH WAT . E 4 HOH A 208 557 557 HOH WAT . E 4 HOH A 209 558 558 HOH WAT . E 4 HOH A 210 559 559 HOH WAT . E 4 HOH A 211 560 560 HOH WAT . E 4 HOH A 212 561 561 HOH WAT . E 4 HOH A 213 562 562 HOH WAT . E 4 HOH A 214 563 563 HOH WAT . E 4 HOH A 215 564 564 HOH WAT . E 4 HOH A 216 565 565 HOH WAT . E 4 HOH A 217 566 566 HOH WAT . E 4 HOH A 218 567 567 HOH WAT . E 4 HOH A 219 568 568 HOH WAT . E 4 HOH A 220 569 569 HOH WAT . E 4 HOH A 221 570 570 HOH WAT . E 4 HOH A 222 571 571 HOH WAT . E 4 HOH A 223 572 572 HOH WAT . E 4 HOH A 224 573 573 HOH WAT . E 4 HOH A 225 574 574 HOH WAT . E 4 HOH A 226 575 575 HOH WAT . E 4 HOH A 227 576 576 HOH WAT . E 4 HOH A 228 577 577 HOH WAT . E 4 HOH A 229 578 578 HOH WAT . E 4 HOH A 230 579 579 HOH WAT . E 4 HOH A 231 580 580 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 26.189 _atom_site.Cartn_y 1.22 _atom_site.Cartn_z 13.564 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 39.95 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 341 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 5 _model_server_stats.parse_time_ms 5 _model_server_stats.create_model_time_ms 8 _model_server_stats.query_time_ms 236 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #