data_1DBK
#
_model_server_result.job_id            eMJ3w0sTLzSD-n5hNDSnOw 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-05 01:16:37' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1dbk 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":229}' 
#
_entry.id    1DBK 
#
_exptl.entry_id    1DBK 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              288.424 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            5-BETA-ANDROSTANE-3,17-DIONE 
_entity.pdbx_number_of_molecules    1 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            1DBK 
_cell.length_a            134.76 
_cell.length_b            134.76 
_cell.length_c            124.21 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1DBK 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        181 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 64 2 2' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
_struct_asym.details                        ? 
_struct_asym.entity_id                      3 
_struct_asym.id                             C 
_struct_asym.pdbx_modified                  N 
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag    N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 23 L CYS 23 1_555 A SG CYS 93 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.006 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 139 L CYS 134 1_555 A SG CYS 199 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.014 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 22 H CYS 22 1_555 B SG CYS 96 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 146 H CYS 142 1_555 B SG CYS 201 H CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 ? 
#
_chem_comp.formula           'C19 H28 O2' 
_chem_comp.formula_weight    288.424 
_chem_comp.id                ANO 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              5-BETA-ANDROSTANE-3,17-DIONE 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 C2 ANO sing 13 n n 
C1 C10 ANO sing 14 n n 
C1 H11 ANO sing 15 n n 
C1 H12 ANO sing 16 n n 
C2 C3 ANO sing 17 n n 
C2 H21 ANO sing 18 n n 
C2 H22 ANO sing 19 n n 
C3 O3 ANO doub 20 n n 
C3 C4 ANO sing 21 n n 
C4 C5 ANO sing 22 n n 
C4 H41 ANO sing 23 n n 
C4 H42 ANO sing 24 n n 
C5 C6 ANO sing 25 n n 
C5 C10 ANO sing 26 n n 
C5 H5 ANO sing 27 n n 
C6 C7 ANO sing 28 n n 
C6 H61 ANO sing 29 n n 
C6 H62 ANO sing 30 n n 
C7 C8 ANO sing 31 n n 
C7 H71 ANO sing 32 n n 
C7 H72 ANO sing 33 n n 
C8 C9 ANO sing 34 n n 
C8 C14 ANO sing 35 n n 
C8 H8 ANO sing 36 n n 
C9 C10 ANO sing 37 n n 
C9 C11 ANO sing 38 n n 
C9 H9 ANO sing 39 n n 
C10 C19 ANO sing 40 n n 
C11 C12 ANO sing 41 n n 
C11 H111 ANO sing 42 n n 
C11 H112 ANO sing 43 n n 
C12 C13 ANO sing 44 n n 
C12 H121 ANO sing 45 n n 
C12 H122 ANO sing 46 n n 
C13 C14 ANO sing 47 n n 
C13 C17 ANO sing 48 n n 
C13 C18 ANO sing 49 n n 
C14 C15 ANO sing 50 n n 
C14 H14 ANO sing 51 n n 
C15 C16 ANO sing 52 n n 
C15 H151 ANO sing 53 n n 
C15 H152 ANO sing 54 n n 
C16 C17 ANO sing 55 n n 
C16 H161 ANO sing 56 n n 
C16 H162 ANO sing 57 n n 
C17 O17 ANO doub 58 n n 
C18 H181 ANO sing 59 n n 
C18 H182 ANO sing 60 n n 
C18 H183 ANO sing 61 n n 
C19 H191 ANO sing 62 n n 
C19 H192 ANO sing 63 n n 
C19 H193 ANO sing 64 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1DBK 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007421 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.004284 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008569 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008051 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 ANO H 1 229 1 ANO ANO . 
D 4 HOH L 1 212 2 HOH HOH . 
E 4 HOH H 1 230 1 HOH HOH . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 ANO . . . C 3 -19.046 42.423 -11.719 1 23.19 ? C1 ANO 229 H 1 
HETATM 2 C C2 ANO . . . C 3 -19.552 40.968 -11.683 1 22.28 ? C2 ANO 229 H 1 
HETATM 3 C C3 ANO . . . C 3 -20.389 40.385 -12.835 1 22.21 ? C3 ANO 229 H 1 
HETATM 4 O O3 ANO . . . C 3 -20.699 39.191 -12.979 1 20.06 ? O3 ANO 229 H 1 
HETATM 5 C C4 ANO . . . C 3 -20.92 41.52 -13.724 1 23.17 ? C4 ANO 229 H 1 
HETATM 6 C C5 ANO . . . C 3 -20.161 42.84 -13.85 1 20.6 ? C5 ANO 229 H 1 
HETATM 7 C C6 ANO . . . C 3 -21.028 43.703 -14.689 1 20.35 ? C6 ANO 229 H 1 
HETATM 8 C C7 ANO . . . C 3 -22.28 44.219 -14.001 1 23.33 ? C7 ANO 229 H 1 
HETATM 9 C C8 ANO . . . C 3 -22.041 44.799 -12.625 1 24.19 ? C8 ANO 229 H 1 
HETATM 10 C C9 ANO . . . C 3 -21.301 43.73 -11.772 1 23.55 ? C9 ANO 229 H 1 
HETATM 11 C C10 ANO . . . C 3 -19.928 43.428 -12.431 1 22.54 ? C10 ANO 229 H 1 
HETATM 12 C C11 ANO . . . C 3 -21.119 44.202 -10.315 1 24.02 ? C11 ANO 229 H 1 
HETATM 13 C C12 ANO . . . C 3 -22.46 44.494 -9.644 1 24.07 ? C12 ANO 229 H 1 
HETATM 14 C C13 ANO . . . C 3 -23.158 45.511 -10.471 1 25.57 ? C13 ANO 229 H 1 
HETATM 15 C C14 ANO . . . C 3 -23.397 45.132 -11.954 1 25.44 ? C14 ANO 229 H 1 
HETATM 16 C C15 ANO . . . C 3 -24.386 46.192 -12.498 1 27.28 ? C15 ANO 229 H 1 
HETATM 17 C C16 ANO . . . C 3 -25.363 46.302 -11.318 1 28.72 ? C16 ANO 229 H 1 
HETATM 18 C C17 ANO . . . C 3 -24.634 45.644 -10.127 1 28.68 ? C17 ANO 229 H 1 
HETATM 19 O O17 ANO . . . C 3 -25.177 45.256 -9.085 1 31.44 ? O17 ANO 229 H 1 
HETATM 20 C C18 ANO . . . C 3 -22.489 46.85 -10.201 1 24.65 ? C18 ANO 229 H 1 
HETATM 21 C C19 ANO . . . C 3 -19.151 44.748 -12.462 1 25.66 ? C19 ANO 229 H 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              49 
_model_server_stats.parse_time_ms           5 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           212 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           21 
#