data_1DBU # _model_server_result.job_id qJs7G4dYThxdKQrkIC1DcA _model_server_result.datetime_utc '2025-01-23 00:13:25' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1dbu # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":260}' # _entry.id 1DBU # _exptl.entry_id 1DBU _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 200.59 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MERCURY (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 104.17 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1DBU _cell.length_a 102.57 _cell.length_b 42.49 _cell.length_c 32.54 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1DBU _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A C ASN 68 A ASN 68 1_555 A N MSE 69 A MSE 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale2 A C MSE 69 A MSE 69 1_555 A N LEU 70 A LEU 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.345 ? covale ? covale3 A C GLU 85 A GLU 85 1_555 A N MSE 86 A MSE 86 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale4 A C MSE 86 A MSE 86 1_555 A N ALA 87 A ALA 87 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? metalc ? metalc1 A SG CYS 61 A CYS 61 1_555 B HG HG . A HG 260 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.005 ? metalc ? metalc2 A SG CYS 61 A CYS 61 1_555 B HG HG . A HG 260 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? metalc ? metalc3 A NE2 GLN 108 A GLN 108 1_555 B HG HG . A HG 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.352 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLN 108 A GLN 108 1_555 B HG HG . A HG 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.488 ? metalc ? metalc5 A OG1 THR 114 A THR 114 1_555 B HG HG . A HG 260 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.774 ? metalc ? metalc6 B HG HG . A HG 260 1_555 C O HOH . A HOH 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.808 ? metalc ? metalc7 B HG HG . A HG 260 1_555 C O HOH . A HOH 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.741 ? # _chem_comp.formula 'Hg 2' _chem_comp.formula_weight 200.59 _chem_comp.id HG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MERCURY (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1DBU _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00975 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00246 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.02353 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.0317 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 HG A 1 260 160 HG IUM . C 3 HOH A 1 261 1 HOH WAT . C 3 HOH A 2 262 2 HOH WAT . C 3 HOH A 3 263 3 HOH WAT . C 3 HOH A 4 264 4 HOH WAT . C 3 HOH A 5 265 5 HOH WAT . C 3 HOH A 6 266 6 HOH WAT . C 3 HOH A 7 267 7 HOH WAT . C 3 HOH A 8 268 8 HOH WAT . C 3 HOH A 9 269 9 HOH WAT . C 3 HOH A 10 270 10 HOH WAT . C 3 HOH A 11 271 11 HOH WAT . C 3 HOH A 12 272 12 HOH WAT . C 3 HOH A 13 273 13 HOH WAT . C 3 HOH A 14 274 14 HOH WAT . C 3 HOH A 15 275 15 HOH WAT . C 3 HOH A 16 276 16 HOH WAT . C 3 HOH A 17 277 17 HOH WAT . C 3 HOH A 18 278 18 HOH WAT . C 3 HOH A 19 279 19 HOH WAT . C 3 HOH A 20 280 20 HOH WAT . C 3 HOH A 21 281 21 HOH WAT . C 3 HOH A 22 282 22 HOH WAT . C 3 HOH A 23 283 23 HOH WAT . C 3 HOH A 24 284 24 HOH WAT . C 3 HOH A 25 285 25 HOH WAT . C 3 HOH A 26 286 26 HOH WAT . C 3 HOH A 27 287 27 HOH WAT . C 3 HOH A 28 288 28 HOH WAT . C 3 HOH A 29 289 29 HOH WAT . C 3 HOH A 30 290 30 HOH WAT . C 3 HOH A 31 291 31 HOH WAT . C 3 HOH A 32 292 32 HOH WAT . C 3 HOH A 33 293 33 HOH WAT . C 3 HOH A 34 294 34 HOH WAT . C 3 HOH A 35 295 35 HOH WAT . C 3 HOH A 36 296 36 HOH WAT . C 3 HOH A 37 297 37 HOH WAT . C 3 HOH A 38 298 38 HOH WAT . C 3 HOH A 39 299 39 HOH WAT . C 3 HOH A 40 300 40 HOH WAT . C 3 HOH A 41 301 41 HOH WAT . C 3 HOH A 42 302 42 HOH WAT . C 3 HOH A 43 303 43 HOH WAT . C 3 HOH A 44 304 44 HOH WAT . C 3 HOH A 45 305 45 HOH WAT . C 3 HOH A 46 306 46 HOH WAT . C 3 HOH A 47 307 47 HOH WAT . C 3 HOH A 48 308 48 HOH WAT . C 3 HOH A 49 309 49 HOH WAT . C 3 HOH A 50 310 50 HOH WAT . C 3 HOH A 51 311 51 HOH WAT . C 3 HOH A 52 312 52 HOH WAT . C 3 HOH A 53 313 53 HOH WAT . C 3 HOH A 54 314 54 HOH WAT . C 3 HOH A 55 315 55 HOH WAT . C 3 HOH A 56 316 56 HOH WAT . C 3 HOH A 57 317 57 HOH WAT . C 3 HOH A 58 318 58 HOH WAT . C 3 HOH A 59 319 59 HOH WAT . C 3 HOH A 60 320 60 HOH WAT . C 3 HOH A 61 321 61 HOH WAT . C 3 HOH A 62 322 62 HOH WAT . C 3 HOH A 63 323 63 HOH WAT . C 3 HOH A 64 324 64 HOH WAT . C 3 HOH A 65 325 65 HOH WAT . C 3 HOH A 66 326 66 HOH WAT . C 3 HOH A 67 327 67 HOH WAT . C 3 HOH A 68 328 68 HOH WAT . C 3 HOH A 69 329 69 HOH WAT . C 3 HOH A 70 330 70 HOH WAT . C 3 HOH A 71 331 71 HOH WAT . C 3 HOH A 72 332 72 HOH WAT . C 3 HOH A 73 333 73 HOH WAT . C 3 HOH A 74 334 74 HOH WAT . C 3 HOH A 75 335 75 HOH WAT . C 3 HOH A 76 336 76 HOH WAT . C 3 HOH A 77 337 77 HOH WAT . C 3 HOH A 78 338 78 HOH WAT . C 3 HOH A 79 339 79 HOH WAT . C 3 HOH A 80 340 80 HOH WAT . C 3 HOH A 81 341 81 HOH WAT . C 3 HOH A 82 342 82 HOH WAT . C 3 HOH A 83 343 83 HOH WAT . C 3 HOH A 84 344 84 HOH WAT . C 3 HOH A 85 345 85 HOH WAT . C 3 HOH A 86 346 86 HOH WAT . C 3 HOH A 87 347 87 HOH WAT . C 3 HOH A 88 348 88 HOH WAT . C 3 HOH A 89 349 89 HOH WAT . C 3 HOH A 90 350 90 HOH WAT . C 3 HOH A 91 351 91 HOH WAT . C 3 HOH A 92 352 92 HOH WAT . C 3 HOH A 93 353 93 HOH WAT . C 3 HOH A 94 354 94 HOH WAT . C 3 HOH A 95 355 95 HOH WAT . C 3 HOH A 96 356 96 HOH WAT . C 3 HOH A 97 357 97 HOH WAT . C 3 HOH A 98 358 98 HOH WAT . C 3 HOH A 99 359 99 HOH WAT . C 3 HOH A 100 360 100 HOH WAT . C 3 HOH A 101 361 101 HOH WAT . C 3 HOH A 102 362 102 HOH WAT . C 3 HOH A 103 363 103 HOH WAT . C 3 HOH A 104 364 104 HOH WAT . C 3 HOH A 105 365 105 HOH WAT . C 3 HOH A 106 366 106 HOH WAT . C 3 HOH A 107 367 107 HOH WAT . C 3 HOH A 108 368 108 HOH WAT . C 3 HOH A 109 369 109 HOH WAT . C 3 HOH A 110 370 110 HOH WAT . C 3 HOH A 111 371 111 HOH WAT . C 3 HOH A 112 372 112 HOH WAT . C 3 HOH A 113 373 113 HOH WAT . C 3 HOH A 114 374 114 HOH WAT . C 3 HOH A 115 375 115 HOH WAT . C 3 HOH A 116 376 116 HOH WAT . C 3 HOH A 117 377 117 HOH WAT . C 3 HOH A 118 378 118 HOH WAT . C 3 HOH A 119 379 119 HOH WAT . C 3 HOH A 120 380 120 HOH WAT . C 3 HOH A 121 381 121 HOH WAT . C 3 HOH A 122 382 122 HOH WAT . C 3 HOH A 123 383 123 HOH WAT . C 3 HOH A 124 384 124 HOH WAT . C 3 HOH A 125 385 125 HOH WAT . C 3 HOH A 126 386 126 HOH WAT . C 3 HOH A 127 387 127 HOH WAT . C 3 HOH A 128 388 128 HOH WAT . C 3 HOH A 129 389 129 HOH WAT . C 3 HOH A 130 390 130 HOH WAT . C 3 HOH A 131 391 131 HOH WAT . C 3 HOH A 132 392 132 HOH WAT . C 3 HOH A 133 393 133 HOH WAT . C 3 HOH A 134 394 134 HOH WAT . C 3 HOH A 135 395 135 HOH WAT . C 3 HOH A 136 396 136 HOH WAT . C 3 HOH A 137 397 137 HOH WAT . C 3 HOH A 138 398 138 HOH WAT . C 3 HOH A 139 399 139 HOH WAT . C 3 HOH A 140 400 140 HOH WAT . C 3 HOH A 141 401 141 HOH WAT . C 3 HOH A 142 402 142 HOH WAT . C 3 HOH A 143 403 143 HOH WAT . C 3 HOH A 144 404 144 HOH WAT . C 3 HOH A 145 405 145 HOH WAT . C 3 HOH A 146 406 146 HOH WAT . C 3 HOH A 147 407 147 HOH WAT . C 3 HOH A 148 408 148 HOH WAT . C 3 HOH A 149 409 149 HOH WAT . C 3 HOH A 150 410 150 HOH WAT . C 3 HOH A 151 411 151 HOH WAT . C 3 HOH A 152 412 152 HOH WAT . C 3 HOH A 153 413 153 HOH WAT . C 3 HOH A 154 414 154 HOH WAT . C 3 HOH A 155 415 155 HOH WAT . C 3 HOH A 156 416 156 HOH WAT . C 3 HOH A 157 417 157 HOH WAT . C 3 HOH A 158 418 158 HOH WAT . C 3 HOH A 159 419 159 HOH WAT . C 3 HOH A 160 420 160 HOH WAT . C 3 HOH A 161 421 161 HOH WAT . C 3 HOH A 162 422 162 HOH WAT . C 3 HOH A 163 423 163 HOH WAT . C 3 HOH A 164 424 164 HOH WAT . C 3 HOH A 165 425 165 HOH WAT . C 3 HOH A 166 426 167 HOH WAT . C 3 HOH A 167 427 168 HOH WAT . C 3 HOH A 168 428 169 HOH WAT . C 3 HOH A 169 429 170 HOH WAT . C 3 HOH A 170 430 171 HOH WAT . C 3 HOH A 171 431 172 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol HG _atom_site.label_atom_id HG _atom_site.label_comp_id HG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 16.956 _atom_site.Cartn_y 3.178 _atom_site.Cartn_z 4.924 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 35.72 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id HG _atom_site.auth_comp_id HG _atom_site.auth_seq_id 260 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 544 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #