data_1DF7 # _model_server_result.job_id GsW_1k3ovzFqtWRM3dIQnQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-28 10:07:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1df7 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":504}' # _entry.id 1DF7 # _exptl.entry_id 1DF7 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1DF7 _cell.length_a 60.51 _cell.length_b 60.51 _cell.length_c 58.83 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1DF7 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 76 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 5 E N N ? 5 F N N ? 5 G N N ? 5 H N N # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 129 n n C1 C2 GOL sing 130 n n C1 H11 GOL sing 131 n n C1 H12 GOL sing 132 n n O1 HO1 GOL sing 133 n n C2 O2 GOL sing 134 n n C2 C3 GOL sing 135 n n C2 H2 GOL sing 136 n n O2 HO2 GOL sing 137 n n C3 O3 GOL sing 138 n n C3 H31 GOL sing 139 n n C3 H32 GOL sing 140 n n O3 HO3 GOL sing 141 n n # _atom_sites.entry_id 1DF7 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016526 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016526 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016998 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 SO4 A 1 506 5 SO4 SO4 . C 3 NDP A 1 500 1 NDP NDP . D 4 MTX A 1 501 2 MTX MTX . E 5 GOL A 1 502 1 GOL GOL . F 5 GOL A 1 503 2 GOL GOL . G 5 GOL A 1 504 3 GOL GOL . H 5 GOL A 1 505 4 GOL GOL . I 6 HOH A 1 507 1 HOH WAT . I 6 HOH A 2 508 2 HOH WAT . I 6 HOH A 3 509 3 HOH WAT . I 6 HOH A 4 510 4 HOH WAT . I 6 HOH A 5 511 5 HOH WAT . I 6 HOH A 6 512 6 HOH WAT . I 6 HOH A 7 513 7 HOH WAT . I 6 HOH A 8 514 8 HOH WAT . I 6 HOH A 9 515 9 HOH WAT . I 6 HOH A 10 516 10 HOH WAT . I 6 HOH A 11 517 11 HOH WAT . I 6 HOH A 12 518 12 HOH WAT . I 6 HOH A 13 519 13 HOH WAT . I 6 HOH A 14 520 14 HOH WAT . I 6 HOH A 15 521 15 HOH WAT . I 6 HOH A 16 522 16 HOH WAT . I 6 HOH A 17 523 17 HOH WAT . I 6 HOH A 18 524 18 HOH WAT . I 6 HOH A 19 525 19 HOH WAT . I 6 HOH A 20 526 20 HOH WAT . I 6 HOH A 21 527 21 HOH WAT . I 6 HOH A 22 528 22 HOH WAT . I 6 HOH A 23 529 23 HOH WAT . I 6 HOH A 24 530 24 HOH WAT . I 6 HOH A 25 531 25 HOH WAT . I 6 HOH A 26 532 26 HOH WAT . I 6 HOH A 27 533 27 HOH WAT . I 6 HOH A 28 534 28 HOH WAT . I 6 HOH A 29 535 29 HOH WAT . I 6 HOH A 30 536 30 HOH WAT . I 6 HOH A 31 537 31 HOH WAT . I 6 HOH A 32 538 32 HOH WAT . I 6 HOH A 33 539 33 HOH WAT . I 6 HOH A 34 540 34 HOH WAT . I 6 HOH A 35 541 35 HOH WAT . I 6 HOH A 36 542 36 HOH WAT . I 6 HOH A 37 543 37 HOH WAT . I 6 HOH A 38 544 38 HOH WAT . I 6 HOH A 39 545 39 HOH WAT . I 6 HOH A 40 546 40 HOH WAT . I 6 HOH A 41 547 41 HOH WAT . I 6 HOH A 42 548 42 HOH WAT . I 6 HOH A 43 549 43 HOH WAT . I 6 HOH A 44 550 44 HOH WAT . I 6 HOH A 45 551 45 HOH WAT . I 6 HOH A 46 552 46 HOH WAT . I 6 HOH A 47 553 47 HOH WAT . I 6 HOH A 48 554 48 HOH WAT . I 6 HOH A 49 555 49 HOH WAT . I 6 HOH A 50 556 50 HOH WAT . I 6 HOH A 51 557 51 HOH WAT . I 6 HOH A 52 558 52 HOH WAT . I 6 HOH A 53 559 53 HOH WAT . I 6 HOH A 54 560 54 HOH WAT . I 6 HOH A 55 561 55 HOH WAT . I 6 HOH A 56 562 56 HOH WAT . I 6 HOH A 57 563 57 HOH WAT . I 6 HOH A 58 564 58 HOH WAT . I 6 HOH A 59 565 59 HOH WAT . I 6 HOH A 60 566 60 HOH WAT . I 6 HOH A 61 567 61 HOH WAT . I 6 HOH A 62 568 62 HOH WAT . I 6 HOH A 63 569 63 HOH WAT . I 6 HOH A 64 570 64 HOH WAT . I 6 HOH A 65 571 65 HOH WAT . I 6 HOH A 66 572 66 HOH WAT . I 6 HOH A 67 573 67 HOH WAT . I 6 HOH A 68 574 68 HOH WAT . I 6 HOH A 69 575 69 HOH WAT . I 6 HOH A 70 576 70 HOH WAT . I 6 HOH A 71 577 71 HOH WAT . I 6 HOH A 72 578 72 HOH WAT . I 6 HOH A 73 579 73 HOH WAT . I 6 HOH A 74 580 74 HOH WAT . I 6 HOH A 75 581 75 HOH WAT . I 6 HOH A 76 582 76 HOH WAT . I 6 HOH A 77 583 77 HOH WAT . I 6 HOH A 78 584 78 HOH WAT . I 6 HOH A 79 585 79 HOH WAT . I 6 HOH A 80 586 80 HOH WAT . I 6 HOH A 81 587 81 HOH WAT . I 6 HOH A 82 588 82 HOH WAT . I 6 HOH A 83 589 83 HOH WAT . I 6 HOH A 84 590 84 HOH WAT . I 6 HOH A 85 591 85 HOH WAT . I 6 HOH A 86 592 86 HOH WAT . I 6 HOH A 87 593 87 HOH WAT . I 6 HOH A 88 594 88 HOH WAT . I 6 HOH A 89 595 89 HOH WAT . I 6 HOH A 90 596 90 HOH WAT . I 6 HOH A 91 597 91 HOH WAT . I 6 HOH A 92 598 92 HOH WAT . I 6 HOH A 93 599 93 HOH WAT . I 6 HOH A 94 600 94 HOH WAT . I 6 HOH A 95 601 95 HOH WAT . I 6 HOH A 96 602 96 HOH WAT . I 6 HOH A 97 603 97 HOH WAT . I 6 HOH A 98 604 98 HOH WAT . I 6 HOH A 99 605 99 HOH WAT . I 6 HOH A 100 606 100 HOH WAT . I 6 HOH A 101 607 101 HOH WAT . I 6 HOH A 102 608 102 HOH WAT . I 6 HOH A 103 609 103 HOH WAT . I 6 HOH A 104 610 104 HOH WAT . I 6 HOH A 105 611 105 HOH WAT . I 6 HOH A 106 612 106 HOH WAT . I 6 HOH A 107 613 107 HOH WAT . I 6 HOH A 108 614 108 HOH WAT . I 6 HOH A 109 615 109 HOH WAT . I 6 HOH A 110 616 110 HOH WAT . I 6 HOH A 111 617 111 HOH WAT . I 6 HOH A 112 618 112 HOH WAT . I 6 HOH A 113 619 113 HOH WAT . I 6 HOH A 114 620 114 HOH WAT . I 6 HOH A 115 621 115 HOH WAT . I 6 HOH A 116 622 116 HOH WAT . I 6 HOH A 117 623 117 HOH WAT . I 6 HOH A 118 624 118 HOH WAT . I 6 HOH A 119 625 119 HOH WAT . I 6 HOH A 120 626 120 HOH WAT . I 6 HOH A 121 627 121 HOH WAT . I 6 HOH A 122 628 122 HOH WAT . I 6 HOH A 123 629 123 HOH WAT . I 6 HOH A 124 630 124 HOH WAT . I 6 HOH A 125 631 125 HOH WAT . I 6 HOH A 126 632 126 HOH WAT . I 6 HOH A 127 633 127 HOH WAT . I 6 HOH A 128 634 128 HOH WAT . I 6 HOH A 129 635 129 HOH WAT . I 6 HOH A 130 636 130 HOH WAT . I 6 HOH A 131 637 131 HOH WAT . I 6 HOH A 132 638 132 HOH WAT . I 6 HOH A 133 639 133 HOH WAT . I 6 HOH A 134 640 134 HOH WAT . I 6 HOH A 135 641 135 HOH WAT . I 6 HOH A 136 642 136 HOH WAT . I 6 HOH A 137 643 137 HOH WAT . I 6 HOH A 138 644 138 HOH WAT . I 6 HOH A 139 645 139 HOH WAT . I 6 HOH A 140 646 140 HOH WAT . I 6 HOH A 141 647 141 HOH WAT . I 6 HOH A 142 648 142 HOH WAT . I 6 HOH A 143 649 143 HOH WAT . I 6 HOH A 144 650 144 HOH WAT . I 6 HOH A 145 651 145 HOH WAT . I 6 HOH A 146 652 146 HOH WAT . I 6 HOH A 147 653 147 HOH WAT . I 6 HOH A 148 654 148 HOH WAT . I 6 HOH A 149 655 149 HOH WAT . I 6 HOH A 150 656 150 HOH WAT . I 6 HOH A 151 657 151 HOH WAT . I 6 HOH A 152 658 152 HOH WAT . I 6 HOH A 153 659 153 HOH WAT . I 6 HOH A 154 660 154 HOH WAT . I 6 HOH A 155 661 155 HOH WAT . I 6 HOH A 156 662 156 HOH WAT . I 6 HOH A 157 663 157 HOH WAT . I 6 HOH A 158 664 158 HOH WAT . I 6 HOH A 159 665 159 HOH WAT . I 6 HOH A 160 666 160 HOH WAT . I 6 HOH A 161 667 161 HOH WAT . I 6 HOH A 162 668 162 HOH WAT . I 6 HOH A 163 669 163 HOH WAT . I 6 HOH A 164 670 164 HOH WAT . I 6 HOH A 165 671 165 HOH WAT . I 6 HOH A 166 672 166 HOH WAT . I 6 HOH A 167 673 167 HOH WAT . I 6 HOH A 168 674 168 HOH WAT . I 6 HOH A 169 675 169 HOH WAT . I 6 HOH A 170 676 170 HOH WAT . I 6 HOH A 171 677 171 HOH WAT . I 6 HOH A 172 678 172 HOH WAT . I 6 HOH A 173 679 173 HOH WAT . I 6 HOH A 174 680 174 HOH WAT . I 6 HOH A 175 681 175 HOH WAT . I 6 HOH A 176 682 176 HOH WAT . I 6 HOH A 177 683 177 HOH WAT . I 6 HOH A 178 684 178 HOH WAT . I 6 HOH A 179 685 179 HOH WAT . I 6 HOH A 180 686 180 HOH WAT . I 6 HOH A 181 687 181 HOH WAT . I 6 HOH A 182 688 182 HOH WAT . I 6 HOH A 183 689 183 HOH WAT . I 6 HOH A 184 690 184 HOH WAT . I 6 HOH A 185 691 185 HOH WAT . I 6 HOH A 186 692 186 HOH WAT . I 6 HOH A 187 693 187 HOH WAT . I 6 HOH A 188 694 188 HOH WAT . I 6 HOH A 189 695 189 HOH WAT . I 6 HOH A 190 696 190 HOH WAT . I 6 HOH A 191 697 191 HOH WAT . I 6 HOH A 192 698 192 HOH WAT . I 6 HOH A 193 699 193 HOH WAT . I 6 HOH A 194 700 194 HOH WAT . I 6 HOH A 195 701 195 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . G 5 1.95 28.421 -3.352 1 45.44 ? C1 GOL 504 A 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . G 5 2.59 29.237 -4.367 1 45.63 ? O1 GOL 504 A 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . G 5 0.998 29.315 -2.503 1 45.06 ? C2 GOL 504 A 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . G 5 -0.141 29.865 -3.133 1 45.09 ? O2 GOL 504 A 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . G 5 1.587 30.167 -1.367 1 45.32 ? C3 GOL 504 A 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . G 5 1.257 29.636 -0.085 1 47.34 ? O3 GOL 504 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 322 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 6 #