data_1DIZ
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_model_server_params.name     atom_site 
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_entry.id    1DIZ 
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_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
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_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              22.99 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'SODIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
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_cell.angle_alpha         90 
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_cell.entry_id            1DIZ 
_cell.length_a            82.4 
_cell.length_b            82.4 
_cell.length_c            199.7 
_cell.Z_PDB               12 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1DIZ 
_symmetry.cell_setting             trigonal 
_symmetry.Int_Tables_number        152 
_symmetry.space_group_name_Hall    ? 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 31 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? trimeric 3 author_defined_assembly 1 
? trimeric 3 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
C,D,E,G,K,L,M 1 1 
A,B,F,H,I,J,N 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
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_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 G N N 
? 4 H N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
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_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A O3' DA 7 C DA 7 1_555 A P NRI 8 C NRI 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.573 ? 
covale ? covale2 A O3' NRI 8 C NRI 8 1_555 A P DT 9 C DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.677 ? 
covale ? covale3 C O3' DA 7 E DA 7 1_555 C P NRI 8 E NRI 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.546 ? 
covale ? covale4 C O3' NRI 8 E NRI 8 1_555 C P DT 9 E DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.779 ? 
metalc ? metalc1 A OP2 DC 11 C DC 11 1_555 H NA NA . B NA 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? 
metalc ? metalc2 C OP2 DC 11 E DC 11 1_555 G NA NA . A NA 825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.528 ? 
metalc ? metalc3 E O GLN 210 A GLN 210 1_555 G NA NA . A NA 825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? 
metalc ? metalc4 E O PHE 212 A PHE 212 1_555 G NA NA . A NA 825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.835 ? 
metalc ? metalc5 E O ILE 215 A ILE 215 1_555 G NA NA . A NA 825 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.74 ? 
metalc ? metalc6 G NA NA . A NA 825 1_555 M O HOH . A HOH 850 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.565 ? 
metalc ? metalc7 F O GLN 210 B GLN 210 1_555 H NA NA . B NA 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.675 ? 
metalc ? metalc8 F O PHE 212 B PHE 212 1_555 H NA NA . B NA 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.623 ? 
metalc ? metalc9 F O ILE 215 B ILE 215 1_555 H NA NA . B NA 824 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? 
metalc ? metalc10 H NA NA . B NA 824 1_555 N O HOH . B HOH 844 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.842 ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N1 DG 1 C DG 1 1_555 B N3 DC 12 D DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N2 DG 1 C DG 1 1_555 B O2 DC 12 D DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O6 DG 1 C DG 1 1_555 B N4 DC 12 D DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 DA 2 C DA 2 1_555 B N3 DT 11 D DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N6 DA 2 C DA 2 1_555 B O4 DT 11 D DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A N3 DC 3 C DC 3 1_555 B N1 DG 10 D DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N4 DC 3 C DC 3 1_555 B O6 DG 10 D DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A O2 DC 3 C DC 3 1_555 B N2 DG 10 D DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A N1 DA 4 C DA 4 1_555 B N3 DT 9 D DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N6 DA 4 C DA 4 1_555 B O4 DT 9 D DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A N3 DT 5 C DT 5 1_555 B N1 DA 8 D DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A O4 DT 5 C DT 5 1_555 B N6 DA 8 D DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N1 DG 6 C DG 6 1_555 B N3 DC 7 D DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A N2 DG 6 C DG 6 1_555 B O2 DC 7 D DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A O6 DG 6 C DG 6 1_555 B N4 DC 7 D DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N1 DA 7 C DA 7 1_555 B N3 DT 6 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A N6 DA 7 C DA 7 1_555 B O4 DT 6 D DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog18 A N3 DT 9 C DT 9 1_555 B N1 DA 4 D DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog19 A O4 DT 9 C DT 9 1_555 B N6 DA 4 D DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog20 A N1 DG 10 C DG 10 1_555 B N3 DC 3 D DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog21 A N2 DG 10 C DG 10 1_555 B O2 DC 3 D DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog22 A O6 DG 10 C DG 10 1_555 B N4 DC 3 D DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog23 A N3 DC 11 C DC 11 1_555 B N1 DG 2 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog24 A N4 DC 11 C DC 11 1_555 B O6 DG 2 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog25 A O2 DC 11 C DC 11 1_555 B N2 DG 2 D DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog26 A N3 DC 12 C DC 12 1_555 B N1 DG 1 D DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog27 A N4 DC 12 C DC 12 1_555 B O6 DG 1 D DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A O2 DC 12 C DC 12 1_555 B N2 DG 1 D DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog29 C N1 DG 1 E DG 1 1_555 D N3 DC 12 F DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog30 C N2 DG 1 E DG 1 1_555 D O2 DC 12 F DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog31 C O6 DG 1 E DG 1 1_555 D N4 DC 12 F DC 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog32 C N1 DA 2 E DA 2 1_555 D N3 DT 11 F DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog33 C N6 DA 2 E DA 2 1_555 D O4 DT 11 F DT 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog34 C N3 DC 3 E DC 3 1_555 D N1 DG 10 F DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog35 C N4 DC 3 E DC 3 1_555 D O6 DG 10 F DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog36 C O2 DC 3 E DC 3 1_555 D N2 DG 10 F DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog37 C N1 DA 4 E DA 4 1_555 D N3 DT 9 F DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog38 C N6 DA 4 E DA 4 1_555 D O4 DT 9 F DT 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog39 C N3 DT 5 E DT 5 1_555 D N1 DA 8 F DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog40 C O4 DT 5 E DT 5 1_555 D N6 DA 8 F DA 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog41 C N1 DG 6 E DG 6 1_555 D N3 DC 7 F DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog42 C N2 DG 6 E DG 6 1_555 D O2 DC 7 F DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog43 C O6 DG 6 E DG 6 1_555 D N4 DC 7 F DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog44 C N1 DA 7 E DA 7 1_555 D N3 DT 6 F DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog45 C N6 DA 7 E DA 7 1_555 D O4 DT 6 F DT 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog46 C N3 DT 9 E DT 9 1_555 D N1 DA 4 F DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog47 C O4 DT 9 E DT 9 1_555 D N6 DA 4 F DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog48 C N1 DG 10 E DG 10 1_555 D N3 DC 3 F DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog49 C N2 DG 10 E DG 10 1_555 D O2 DC 3 F DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog50 C O6 DG 10 E DG 10 1_555 D N4 DC 3 F DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog51 C N3 DC 11 E DC 11 1_555 D N1 DG 2 F DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog52 C N4 DC 11 E DC 11 1_555 D O6 DG 2 F DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog53 C O2 DC 11 E DC 11 1_555 D N2 DG 2 F DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog54 C N3 DC 12 E DC 12 1_555 D N1 DG 1 F DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog55 C N4 DC 12 E DC 12 1_555 D O6 DG 1 F DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
hydrog WATSON-CRICK hydrog56 C O2 DC 12 E DC 12 1_555 D N2 DG 1 F DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 
#
_chem_comp.formula           'Na 1' 
_chem_comp.formula_weight    22.99 
_chem_comp.id                NA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'SODIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1DIZ 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012136 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.007007 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.014013 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005008 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
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loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 4 NA A 1 825 825 NA NA . 
H 4 NA B 1 824 824 NA NA . 
I 5 HOH C 1 14 8 HOH WAT . 
I 5 HOH C 2 15 25 HOH WAT . 
I 5 HOH C 3 16 41 HOH WAT . 
I 5 HOH C 4 17 47 HOH WAT . 
I 5 HOH C 5 18 77 HOH WAT . 
I 5 HOH C 6 19 95 HOH WAT . 
I 5 HOH C 7 20 98 HOH WAT . 
I 5 HOH C 8 21 114 HOH WAT . 
I 5 HOH C 9 22 131 HOH WAT . 
I 5 HOH C 10 23 139 HOH WAT . 
I 5 HOH C 11 24 142 HOH WAT . 
I 5 HOH C 12 25 150 HOH WAT . 
I 5 HOH C 13 26 164 HOH WAT . 
I 5 HOH C 14 27 194 HOH WAT . 
I 5 HOH C 15 28 197 HOH WAT . 
J 5 HOH D 1 46 46 HOH WAT . 
J 5 HOH D 2 59 59 HOH WAT . 
J 5 HOH D 3 81 81 HOH WAT . 
J 5 HOH D 4 82 82 HOH WAT . 
J 5 HOH D 5 93 93 HOH WAT . 
J 5 HOH D 6 110 110 HOH WAT . 
J 5 HOH D 7 123 123 HOH WAT . 
J 5 HOH D 8 168 168 HOH WAT . 
J 5 HOH D 9 181 181 HOH WAT . 
J 5 HOH D 10 196 196 HOH WAT . 
J 5 HOH D 11 200 200 HOH WAT . 
K 5 HOH E 1 17 17 HOH WAT . 
K 5 HOH E 2 24 24 HOH WAT . 
K 5 HOH E 3 32 32 HOH WAT . 
K 5 HOH E 4 44 44 HOH WAT . 
K 5 HOH E 5 84 84 HOH WAT . 
K 5 HOH E 6 88 88 HOH WAT . 
K 5 HOH E 7 100 100 HOH WAT . 
K 5 HOH E 8 113 113 HOH WAT . 
K 5 HOH E 9 126 126 HOH WAT . 
K 5 HOH E 10 128 128 HOH WAT . 
K 5 HOH E 11 138 138 HOH WAT . 
K 5 HOH E 12 155 155 HOH WAT . 
K 5 HOH E 13 165 165 HOH WAT . 
K 5 HOH E 14 190 190 HOH WAT . 
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