data_1DLY # _model_server_result.job_id '_CMP7CnaywJPVh8uBrSTqQ' _model_server_result.datetime_utc '2024-12-01 08:59:21' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1dly # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":145}' # _entry.id 1DLY # _exptl.entry_id 1DLY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 62.068 _entity.id 5 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 1,2-ETHANEDIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1DLY _cell.length_a 34.598 _cell.length_b 53.082 _cell.length_c 67.186 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1DLY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 5 _struct_asym.id F _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A NE2 HIS 111 A HIS 68 1_555 E FE HEM . A HEM 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? metalc ? metalc2 B C CYN . A CYN 122 1_555 E FE HEM . A HEM 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.647 ? # _chem_comp.formula 'C2 H6 O2' _chem_comp.formula_weight 62.068 _chem_comp.id EDO _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 1,2-ETHANEDIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'ETHYLENE GLYCOL' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 EDO sing 84 n n C1 C2 EDO sing 85 n n C1 H11 EDO sing 86 n n C1 H12 EDO sing 87 n n O1 HO1 EDO sing 88 n n C2 O2 EDO sing 89 n n C2 H21 EDO sing 90 n n C2 H22 EDO sing 91 n n O2 HO2 EDO sing 92 n n # _atom_sites.entry_id 1DLY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.028903 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.018839 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014884 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CYN A 1 122 3 CYN CYN . C 3 SO4 A 1 123 1 SO4 SO4 . D 3 SO4 A 1 124 2 SO4 SO4 . E 4 HEM A 1 144 144 HEM HEM . F 5 EDO A 1 145 1 EDO ETH . G 6 HOH A 1 146 100 HOH WAT . G 6 HOH A 2 147 102 HOH WAT . G 6 HOH A 3 148 103 HOH WAT . G 6 HOH A 4 149 104 HOH WAT . G 6 HOH A 5 150 105 HOH WAT . G 6 HOH A 6 151 106 HOH WAT . G 6 HOH A 7 152 107 HOH WAT . G 6 HOH A 8 153 108 HOH WAT . G 6 HOH A 9 154 109 HOH WAT . G 6 HOH A 10 155 110 HOH WAT . G 6 HOH A 11 156 111 HOH WAT . G 6 HOH A 12 157 112 HOH WAT . G 6 HOH A 13 158 114 HOH WAT . G 6 HOH A 14 159 115 HOH WAT . G 6 HOH A 15 160 117 HOH WAT . G 6 HOH A 16 161 118 HOH WAT . G 6 HOH A 17 162 120 HOH WAT . G 6 HOH A 18 163 121 HOH WAT . G 6 HOH A 19 164 122 HOH WAT . G 6 HOH A 20 165 123 HOH WAT . G 6 HOH A 21 166 124 HOH WAT . G 6 HOH A 22 167 125 HOH WAT . G 6 HOH A 23 168 126 HOH WAT . G 6 HOH A 24 169 127 HOH WAT . G 6 HOH A 25 170 128 HOH WAT . G 6 HOH A 26 171 129 HOH WAT . G 6 HOH A 27 172 130 HOH WAT . G 6 HOH A 28 173 131 HOH WAT . G 6 HOH A 29 174 134 HOH WAT . G 6 HOH A 30 175 135 HOH WAT . G 6 HOH A 31 176 136 HOH WAT . G 6 HOH A 32 177 137 HOH WAT . G 6 HOH A 33 178 138 HOH WAT . G 6 HOH A 34 179 139 HOH WAT . G 6 HOH A 35 180 140 HOH WAT . G 6 HOH A 36 181 141 HOH WAT . G 6 HOH A 37 182 142 HOH WAT . G 6 HOH A 38 183 143 HOH WAT . G 6 HOH A 39 184 144 HOH WAT . G 6 HOH A 40 185 146 HOH WAT . G 6 HOH A 41 186 147 HOH WAT . G 6 HOH A 42 187 148 HOH WAT . G 6 HOH A 43 188 149 HOH WAT . G 6 HOH A 44 189 151 HOH WAT . G 6 HOH A 45 190 154 HOH WAT . G 6 HOH A 46 191 155 HOH WAT . G 6 HOH A 47 192 156 HOH WAT . G 6 HOH A 48 193 157 HOH WAT . G 6 HOH A 49 194 158 HOH WAT . G 6 HOH A 50 195 159 HOH WAT . G 6 HOH A 51 196 160 HOH WAT . G 6 HOH A 52 197 161 HOH WAT . G 6 HOH A 53 198 162 HOH WAT . G 6 HOH A 54 199 164 HOH WAT . G 6 HOH A 55 200 165 HOH WAT . G 6 HOH A 56 201 167 HOH WAT . G 6 HOH A 57 202 168 HOH WAT . G 6 HOH A 58 203 169 HOH WAT . G 6 HOH A 59 204 171 HOH WAT . G 6 HOH A 60 205 172 HOH WAT . G 6 HOH A 61 206 174 HOH WAT . G 6 HOH A 62 207 175 HOH WAT . G 6 HOH A 63 208 176 HOH WAT . G 6 HOH A 64 209 178 HOH WAT . G 6 HOH A 65 210 180 HOH WAT . G 6 HOH A 66 211 181 HOH WAT . G 6 HOH A 67 212 182 HOH WAT . G 6 HOH A 68 213 183 HOH WAT . G 6 HOH A 69 214 185 HOH WAT . G 6 HOH A 70 215 187 HOH WAT . G 6 HOH A 71 216 189 HOH WAT . G 6 HOH A 72 217 190 HOH WAT . G 6 HOH A 73 218 191 HOH WAT . G 6 HOH A 74 219 197 HOH WAT . G 6 HOH A 75 220 202 HOH WAT . G 6 HOH A 76 221 204 HOH WAT . G 6 HOH A 77 222 206 HOH WAT . G 6 HOH A 78 223 207 HOH WAT . G 6 HOH A 79 224 212 HOH WAT . G 6 HOH A 80 225 213 HOH WAT . G 6 HOH A 81 226 220 HOH WAT . G 6 HOH A 82 227 228 HOH WAT . G 6 HOH A 83 228 235 HOH WAT . G 6 HOH A 84 229 236 HOH WAT . G 6 HOH A 85 230 238 HOH WAT . G 6 HOH A 86 231 244 HOH WAT . G 6 HOH A 87 232 247 HOH WAT . G 6 HOH A 88 233 254 HOH WAT . G 6 HOH A 89 234 268 HOH WAT . G 6 HOH A 90 235 275 HOH WAT . G 6 HOH A 91 236 310 HOH WAT . G 6 HOH A 92 237 319 HOH WAT . G 6 HOH A 93 238 344 HOH WAT . G 6 HOH A 94 239 353 HOH WAT . G 6 HOH A 95 240 356 HOH WAT . G 6 HOH A 96 241 368 HOH WAT . G 6 HOH A 97 242 374 HOH WAT . G 6 HOH A 98 243 383 HOH WAT . G 6 HOH A 99 244 385 HOH WAT . G 6 HOH A 100 245 386 HOH WAT . G 6 HOH A 101 246 403 HOH WAT . G 6 HOH A 102 247 405 HOH WAT . G 6 HOH A 103 248 411 HOH WAT . G 6 HOH A 104 249 413 HOH WAT . G 6 HOH A 105 250 418 HOH WAT . G 6 HOH A 106 251 420 HOH WAT . G 6 HOH A 107 252 421 HOH WAT . G 6 HOH A 108 253 423 HOH WAT . G 6 HOH A 109 254 427 HOH WAT . G 6 HOH A 110 255 428 HOH WAT . G 6 HOH A 111 256 429 HOH WAT . G 6 HOH A 112 257 432 HOH WAT . G 6 HOH A 113 258 433 HOH WAT . G 6 HOH A 114 259 438 HOH WAT . G 6 HOH A 115 260 443 HOH WAT . G 6 HOH A 116 261 445 HOH WAT . G 6 HOH A 117 262 455 HOH WAT . G 6 HOH A 118 263 472 HOH WAT . G 6 HOH A 119 264 474 HOH WAT . G 6 HOH A 120 265 481 HOH WAT . G 6 HOH A 121 266 489 HOH WAT . G 6 HOH A 122 267 501 HOH WAT . G 6 HOH A 123 268 502 HOH WAT . G 6 HOH A 124 269 503 HOH WAT . G 6 HOH A 125 270 504 HOH WAT . G 6 HOH A 126 271 505 HOH WAT . G 6 HOH A 127 272 507 HOH WAT . G 6 HOH A 128 273 508 HOH WAT . G 6 HOH A 129 274 509 HOH WAT . G 6 HOH A 130 275 510 HOH WAT . G 6 HOH A 131 276 511 HOH WAT . G 6 HOH A 132 277 512 HOH WAT . G 6 HOH A 133 278 516 HOH WAT . G 6 HOH A 134 279 518 HOH WAT . G 6 HOH A 135 280 519 HOH WAT . G 6 HOH A 136 281 520 HOH WAT . G 6 HOH A 137 282 522 HOH WAT . G 6 HOH A 138 283 524 HOH WAT . G 6 HOH A 139 284 525 HOH WAT . G 6 HOH A 140 285 526 HOH WAT . G 6 HOH A 141 286 527 HOH WAT . G 6 HOH A 142 287 531 HOH WAT . G 6 HOH A 143 288 532 HOH WAT . G 6 HOH A 144 289 534 HOH WAT . G 6 HOH A 145 290 536 HOH WAT . G 6 HOH A 146 291 537 HOH WAT . G 6 HOH A 147 292 538 HOH WAT . G 6 HOH A 148 293 540 HOH WAT . G 6 HOH A 149 294 555 HOH WAT . G 6 HOH A 150 295 556 HOH WAT . G 6 HOH A 151 296 563 HOH WAT . G 6 HOH A 152 297 564 HOH WAT . G 6 HOH A 153 298 573 HOH WAT . G 6 HOH A 154 299 574 HOH WAT . G 6 HOH A 155 300 577 HOH WAT . G 6 HOH A 156 301 581 HOH WAT . G 6 HOH A 157 302 582 HOH WAT . G 6 HOH A 158 303 585 HOH WAT . G 6 HOH A 159 304 586 HOH WAT . G 6 HOH A 160 305 587 HOH WAT . G 6 HOH A 161 306 588 HOH WAT . G 6 HOH A 162 307 590 HOH WAT . G 6 HOH A 163 308 592 HOH WAT . G 6 HOH A 164 309 593 HOH WAT . G 6 HOH A 165 310 595 HOH WAT . G 6 HOH A 166 311 598 HOH WAT . G 6 HOH A 167 312 601 HOH WAT . G 6 HOH A 168 313 602 HOH WAT . G 6 HOH A 169 314 603 HOH WAT . G 6 HOH A 170 315 607 HOH WAT . G 6 HOH A 171 316 613 HOH WAT . G 6 HOH A 172 317 615 HOH WAT . G 6 HOH A 173 318 619 HOH WAT . G 6 HOH A 174 319 620 HOH WAT . G 6 HOH A 175 320 626 HOH WAT . G 6 HOH A 176 321 630 HOH WAT . G 6 HOH A 177 322 631 HOH WAT . G 6 HOH A 178 323 632 HOH WAT . G 6 HOH A 179 324 633 HOH WAT . G 6 HOH A 180 325 634 HOH WAT . G 6 HOH A 181 326 635 HOH WAT . G 6 HOH A 182 327 636 HOH WAT . G 6 HOH A 183 328 637 HOH WAT . G 6 HOH A 184 329 639 HOH WAT . G 6 HOH A 185 330 649 HOH WAT . G 6 HOH A 186 331 650 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 EDO . . . F 5 -1.291 -6.42 20.8 1 19.36 ? C1 EDO 145 A 1 HETATM 2 O O1 EDO . . . F 5 -1.301 -7.836 20.565 1 14.72 ? O1 EDO 145 A 1 HETATM 3 C C2 EDO . . . F 5 -2.599 -6.019 21.49 1 20.17 ? C2 EDO 145 A 1 HETATM 4 O O2 EDO . . . F 5 -2.691 -6.739 22.726 1 15.29 ? O2 EDO 145 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 283 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 4 #