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covale ? covale79 C C TRP 322 C TRP 2342 1_555 C N MSE 323 C MSE 2343 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale80 C C MSE 323 C MSE 2343 1_555 C N PHE 324 C PHE 2344 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale81 C C ALA 386 C ALA 2406 1_555 C N MSE 387 C MSE 2407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale82 C C MSE 387 C MSE 2407 1_555 C N ALA 388 C ALA 2408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale83 C C LYS 518 C LYS 2538 1_555 C N MSE 519 C MSE 2539 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale84 C C MSE 519 C MSE 2539 1_555 C N ALA 520 C ALA 2540 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale85 D C LEU 8 D LEU 3028 1_555 D N MSE 9 D MSE 3029 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale86 D C MSE 9 D MSE 3029 1_555 D N LEU 10 D LEU 3030 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale87 D C GLY 17 D GLY 3037 1_555 D N MSE 18 D MSE 3038 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale88 D C MSE 18 D MSE 3038 1_555 D N ALA 19 D ALA 3039 1_555 ? 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? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale99 D C TYR 198 D TYR 3218 1_555 D N MSE 199 D MSE 3219 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale100 D C MSE 199 D MSE 3219 1_555 D N GLY 200 D GLY 3220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale101 D C PHE 218 D PHE 3238 1_555 D N MSE 219 D MSE 3239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale102 D C MSE 219 D MSE 3239 1_555 D N LYS 220 D LYS 3240 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? covale ? covale103 D C VAL 304 D VAL 3324 1_555 D N MSE 305 D MSE 3325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale104 D C MSE 305 D MSE 3325 1_555 D N SER 306 D SER 3326 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.321 ? covale ? covale105 D C SER 306 D SER 3326 1_555 D N MSE 307 D MSE 3327 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.335 ? covale ? covale106 D C MSE 307 D MSE 3327 1_555 D N VAL 308 D VAL 3328 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale107 D C TRP 322 D TRP 3342 1_555 D N MSE 323 D MSE 3343 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 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B MN 1604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.364 ? metalc ? metalc11 I O4 OXL . B OXL 1603 1_555 J MN MN . B MN 1604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? metalc ? metalc12 J MN MN . B MN 1604 1_555 V O HOH . B HOH 1606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.39 ? metalc ? metalc13 C OE1 GLU 235 C GLU 2255 1_555 N MN MN . C MN 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.295 ? metalc ? metalc14 C OD1 ASP 236 C ASP 2256 1_555 N MN MN . C MN 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.233 ? metalc ? metalc15 C OD1 ASP 259 C ASP 2279 1_555 N MN MN . C MN 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.181 ? metalc ? metalc16 M O1 OXL . C OXL 2603 1_555 N MN MN . C MN 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? metalc ? metalc17 M O4 OXL . C OXL 2603 1_555 N MN MN . C MN 2604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc18 N MN MN . C MN 2604 1_555 W O HOH . C HOH 2606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.555 ? metalc ? metalc19 D OE1 GLU 235 D GLU 3255 1_555 R MN MN . D MN 3604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc20 D OD1 ASP 236 D ASP 3256 1_555 R MN MN . D MN 3604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc21 D OD1 ASP 259 D ASP 3279 1_555 R MN MN . D MN 3604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? metalc ? metalc22 Q O1 OXL . D OXL 3603 1_555 R MN MN . D MN 3604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.339 ? metalc ? metalc23 Q O4 OXL . D OXL 3603 1_555 R MN MN . D MN 3604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc24 R MN MN . D MN 3604 1_555 X O HOH . D HOH 3606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? # _chem_comp.formula 'C21 H27 N7 O14 P2' _chem_comp.formula_weight 663.425 _chem_comp.id NAD _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag PA O1A NAD doub 237 n n PA O2A NAD sing 238 n n PA O5B NAD sing 239 n n PA O3 NAD sing 240 n n O2A HOA2 NAD sing 241 n n O5B C5B NAD sing 242 n n C5B C4B NAD sing 243 n n C5B H51A NAD sing 244 n n C5B H52A NAD sing 245 n n C4B O4B NAD sing 246 n n C4B C3B NAD sing 247 n n C4B H4B NAD sing 248 n n O4B C1B NAD sing 249 n n C3B O3B NAD sing 250 n n C3B C2B NAD sing 251 n n C3B H3B NAD sing 252 n n O3B HO3A NAD sing 253 n n C2B O2B NAD sing 254 n n C2B C1B NAD sing 255 n n C2B H2B NAD sing 256 n n O2B HO2A NAD sing 257 n n C1B N9A NAD sing 258 n n C1B H1B NAD sing 259 n n N9A C8A NAD sing 260 n y N9A C4A NAD sing 261 n y C8A N7A NAD doub 262 n y C8A H8A NAD sing 263 n n N7A C5A NAD sing 264 n y C5A C6A NAD sing 265 n y C5A C4A NAD doub 266 n y C6A N6A NAD sing 267 n n C6A N1A NAD doub 268 n y N6A H61A NAD sing 269 n n N6A H62A NAD sing 270 n n N1A C2A NAD sing 271 n y C2A N3A NAD doub 272 n y C2A H2A NAD sing 273 n n N3A C4A NAD sing 274 n y O3 PN NAD sing 275 n n PN O1N NAD doub 276 n n PN O2N NAD sing 277 n n PN O5D NAD sing 278 n n O5D C5D NAD sing 279 n n C5D C4D NAD sing 280 n n C5D H51N NAD sing 281 n n C5D H52N NAD sing 282 n n C4D O4D NAD sing 283 n n C4D C3D NAD sing 284 n n C4D H4D NAD sing 285 n n O4D C1D NAD sing 286 n n C3D O3D NAD sing 287 n n C3D C2D NAD sing 288 n n C3D H3D NAD sing 289 n n O3D HO3N NAD sing 290 n n C2D O2D NAD sing 291 n n C2D C1D NAD sing 292 n n C2D H2D NAD sing 293 n n O2D HO2N NAD sing 294 n n C1D N1N NAD sing 295 n n C1D H1D NAD sing 296 n n N1N C2N NAD sing 297 n y N1N C6N NAD doub 298 n y C2N C3N NAD doub 299 n y C2N H2N NAD sing 300 n n C3N C7N NAD sing 301 n n C3N C4N NAD sing 302 n y C7N O7N NAD doub 303 n n C7N N7N NAD sing 304 n n N7N H71N NAD sing 305 n n N7N H72N NAD sing 306 n n C4N C5N NAD doub 307 n y C4N H4N NAD sing 308 n n C5N C6N NAD sing 309 n y C5N H5N NAD sing 310 n n C6N H6N NAD sing 311 n n # _atom_sites.entry_id 1DO8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.004367 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001555 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.008425 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009394 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 OXL A 1 603 603 OXL OXL . 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