data_1DTL # _model_server_result.job_id 8UgsP5MgGmBLERI8mke2yg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-21 13:09:52' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1dtl # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":203}' # _entry.id 1DTL # _exptl.entry_id 1DTL _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1DTL _cell.length_a 36.27 _cell.length_b 62.04 _cell.length_c 62.04 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1DTL _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 65 A ASP 65 1_555 B CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 67 A ASP 67 1_555 B CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc3 A OG SER 69 A SER 69 1_555 B CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.304 ? metalc ? metalc4 A O THR 71 A THR 71 1_555 B CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.313 ? metalc ? metalc5 A OE1 GLU 76 A GLU 76 1_555 B CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.593 ? metalc ? metalc6 A OE2 GLU 76 A GLU 76 1_555 B CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc7 A OD1 ASP 105 A ASP 105 1_555 C CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.289 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 107 A ASN 107 1_555 C CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.306 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 109 A ASP 109 1_555 C CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.585 ? metalc ? metalc10 A O TYR 111 A TYR 111 1_555 C CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.436 ? metalc ? metalc11 A OE1 GLU 116 A GLU 116 1_555 C CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.695 ? metalc ? metalc12 A OE2 GLU 116 A GLU 116 1_555 C CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.558 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 141 A ASP 141 1_555 D CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.507 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASN 143 A ASN 143 1_555 D CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 145 A ASP 145 1_555 D CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? metalc ? metalc16 A O ARG 147 A ARG 147 1_555 D CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.285 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 152 A GLU 152 1_555 D CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.509 ? metalc ? metalc18 A OE2 GLU 152 A GLU 152 1_555 D CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.685 ? metalc ? metalc19 B CA CA . A CA 201 1_555 H O HOH . A HOH 414 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc20 C CA CA . A CA 202 1_555 H O HOH . A HOH 408 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc21 D CA CA . A CA 203 1_555 H O HOH . A HOH 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.37 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1DTL _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.027571 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016119 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016119 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 201 201 CA CA . C 2 CA A 1 202 202 CA CA . D 2 CA A 1 203 203 CA CA . E 3 BEP A 1 204 1 BEP BEP . F 3 BEP A 1 205 2 BEP BEP . G 3 BEP A 1 206 3 BEP BEP . H 4 HOH A 1 401 401 HOH WAT . H 4 HOH A 2 402 402 HOH WAT . H 4 HOH A 3 403 403 HOH WAT . H 4 HOH A 4 404 404 HOH WAT . H 4 HOH A 5 405 405 HOH WAT . H 4 HOH A 6 406 406 HOH WAT . H 4 HOH A 7 407 407 HOH WAT . H 4 HOH A 8 408 408 HOH WAT . H 4 HOH A 9 409 409 HOH WAT . H 4 HOH A 10 410 410 HOH WAT . H 4 HOH A 11 411 411 HOH WAT . H 4 HOH A 12 412 412 HOH WAT . H 4 HOH A 13 413 413 HOH WAT . H 4 HOH A 14 414 414 HOH WAT . H 4 HOH A 15 415 415 HOH WAT . H 4 HOH A 16 416 416 HOH WAT . H 4 HOH A 17 417 417 HOH WAT . H 4 HOH A 18 418 418 HOH WAT . H 4 HOH A 19 419 419 HOH WAT . H 4 HOH A 20 420 420 HOH WAT . H 4 HOH A 21 421 421 HOH WAT . H 4 HOH A 22 422 422 HOH WAT . H 4 HOH A 23 423 423 HOH WAT . H 4 HOH A 24 424 424 HOH WAT . H 4 HOH A 25 425 425 HOH WAT . H 4 HOH A 26 426 426 HOH WAT . H 4 HOH A 27 427 427 HOH WAT . H 4 HOH A 28 428 428 HOH WAT . H 4 HOH A 29 430 430 HOH WAT . H 4 HOH A 30 431 431 HOH WAT . H 4 HOH A 31 432 432 HOH WAT . H 4 HOH A 32 433 433 HOH WAT . H 4 HOH A 33 434 434 HOH WAT . H 4 HOH A 34 436 436 HOH WAT . H 4 HOH A 35 437 437 HOH WAT . H 4 HOH A 36 438 438 HOH WAT . H 4 HOH A 37 439 439 HOH WAT . H 4 HOH A 38 440 440 HOH WAT . H 4 HOH A 39 441 441 HOH WAT . H 4 HOH A 40 442 442 HOH WAT . H 4 HOH A 41 443 443 HOH WAT . H 4 HOH A 42 444 444 HOH WAT . H 4 HOH A 43 445 445 HOH WAT . H 4 HOH A 44 446 446 HOH WAT . H 4 HOH A 45 447 447 HOH WAT . H 4 HOH A 46 448 448 HOH WAT . H 4 HOH A 47 449 449 HOH WAT . H 4 HOH A 48 450 450 HOH WAT . H 4 HOH A 49 451 451 HOH WAT . H 4 HOH A 50 452 452 HOH WAT . H 4 HOH A 51 454 454 HOH WAT . H 4 HOH A 52 455 455 HOH WAT . H 4 HOH A 53 456 456 HOH WAT . H 4 HOH A 54 457 457 HOH WAT . H 4 HOH A 55 458 458 HOH WAT . H 4 HOH A 56 459 459 HOH WAT . H 4 HOH A 57 460 460 HOH WAT . H 4 HOH A 58 462 462 HOH WAT . H 4 HOH A 59 463 463 HOH WAT . H 4 HOH A 60 464 464 HOH WAT . H 4 HOH A 61 465 465 HOH WAT . H 4 HOH A 62 466 466 HOH WAT . H 4 HOH A 63 467 467 HOH WAT . H 4 HOH A 64 468 468 HOH WAT . H 4 HOH A 65 469 469 HOH WAT . H 4 HOH A 66 470 470 HOH WAT . H 4 HOH A 67 472 472 HOH WAT . H 4 HOH A 68 474 474 HOH WAT . H 4 HOH A 69 475 475 HOH WAT . H 4 HOH A 70 476 476 HOH WAT . H 4 HOH A 71 477 477 HOH WAT . H 4 HOH A 72 478 478 HOH WAT . H 4 HOH A 73 479 479 HOH WAT . H 4 HOH A 74 480 480 HOH WAT . H 4 HOH A 75 481 481 HOH WAT . H 4 HOH A 76 482 482 HOH WAT . H 4 HOH A 77 483 483 HOH WAT . H 4 HOH A 78 484 484 HOH WAT . H 4 HOH A 79 485 485 HOH WAT . H 4 HOH A 80 486 486 HOH WAT . H 4 HOH A 81 487 487 HOH WAT . H 4 HOH A 82 488 488 HOH WAT . H 4 HOH A 83 489 489 HOH WAT . H 4 HOH A 84 490 490 HOH WAT . H 4 HOH A 85 491 491 HOH WAT . H 4 HOH A 86 492 492 HOH WAT . H 4 HOH A 87 493 493 HOH WAT . H 4 HOH A 88 494 494 HOH WAT . H 4 HOH A 89 495 495 HOH WAT . H 4 HOH A 90 496 496 HOH WAT . H 4 HOH A 91 497 497 HOH WAT . H 4 HOH A 92 498 498 HOH WAT . H 4 HOH A 93 499 499 HOH WAT . H 4 HOH A 94 500 500 HOH WAT . H 4 HOH A 95 501 501 HOH WAT . H 4 HOH A 96 504 504 HOH WAT . H 4 HOH A 97 507 507 HOH WAT . H 4 HOH A 98 509 509 HOH WAT . H 4 HOH A 99 510 510 HOH WAT . H 4 HOH A 100 511 511 HOH WAT . H 4 HOH A 101 512 512 HOH WAT . H 4 HOH A 102 513 513 HOH WAT . H 4 HOH A 103 514 514 HOH WAT . H 4 HOH A 104 515 515 HOH WAT . H 4 HOH A 105 516 516 HOH WAT . H 4 HOH A 106 517 517 HOH WAT . H 4 HOH A 107 518 518 HOH WAT . H 4 HOH A 108 519 519 HOH WAT . H 4 HOH A 109 520 520 HOH WAT . H 4 HOH A 110 521 521 HOH WAT . H 4 HOH A 111 523 523 HOH WAT . H 4 HOH A 112 524 524 HOH WAT . H 4 HOH A 113 525 525 HOH WAT . H 4 HOH A 114 526 526 HOH WAT . H 4 HOH A 115 527 527 HOH WAT . H 4 HOH A 116 528 528 HOH WAT . H 4 HOH A 117 529 529 HOH WAT . H 4 HOH A 118 530 530 HOH WAT . H 4 HOH A 119 531 531 HOH WAT . H 4 HOH A 120 532 532 HOH WAT . H 4 HOH A 121 533 533 HOH WAT . H 4 HOH A 122 534 534 HOH WAT . H 4 HOH A 123 536 536 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 12.749 _atom_site.Cartn_y 17.88 _atom_site.Cartn_z 17.391 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 24.8 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 203 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 303 _model_server_stats.encode_time_ms 5 _model_server_stats.element_count 1 #