data_1DVP
#
_model_server_result.job_id            Yh4o6Wm1tkdYRbYShzffRA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-10-12 14:29:01' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1dvp 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":401}' 
#
_entry.id    1DVP 
#
_exptl.entry_id    1DVP 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              65.409 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'ZINC ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          94.77 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1DVP 
_cell.length_a            116.706 
_cell.length_b            69.665 
_cell.length_c            41.799 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1DVP 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        ? 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    dimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      2 
_pdbx_struct_assembly.details               author_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 113.230159 0 41.654231 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 B N N 
? 2 C N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A SG CYS 164 A CYS 164 1_555 B ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? 
metalc ? metalc2 A SG CYS 167 A CYS 167 1_555 B ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.485 ? 
metalc ? metalc3 A SG CYS 180 A CYS 180 1_555 C ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.296 ? 
metalc ? metalc4 A SG CYS 183 A CYS 183 1_555 C ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? 
metalc ? metalc5 A SG CYS 188 A CYS 188 1_555 B ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc6 A SG CYS 191 A CYS 191 1_555 B ZN ZN . A ZN 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.385 ? 
metalc ? metalc7 A SG CYS 210 A CYS 210 1_555 C ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.412 ? 
metalc ? metalc8 A SG CYS 213 A CYS 213 1_555 C ZN ZN . A ZN 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.368 ? 
#
_chem_comp.formula           'Zn 2' 
_chem_comp.formula_weight    65.409 
_chem_comp.id                ZN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'ZINC ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1DVP 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008569 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000715 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.014354 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.024007 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 ZN A 1 401 401 ZN ZN . 
C 2 ZN A 1 402 402 ZN ZN . 
D 3 CIT A 1 300 300 CIT CIT . 
E 4 HOH A 1 403 1 HOH WAT . 
E 4 HOH A 2 404 2 HOH WAT . 
E 4 HOH A 3 405 3 HOH WAT . 
E 4 HOH A 4 406 4 HOH WAT . 
E 4 HOH A 5 407 5 HOH WAT . 
E 4 HOH A 6 408 6 HOH WAT . 
E 4 HOH A 7 409 7 HOH WAT . 
E 4 HOH A 8 410 8 HOH WAT . 
E 4 HOH A 9 411 9 HOH WAT . 
E 4 HOH A 10 412 10 HOH WAT . 
E 4 HOH A 11 413 11 HOH WAT . 
E 4 HOH A 12 414 12 HOH WAT . 
E 4 HOH A 13 415 13 HOH WAT . 
E 4 HOH A 14 416 14 HOH WAT . 
E 4 HOH A 15 417 15 HOH WAT . 
E 4 HOH A 16 418 16 HOH WAT . 
E 4 HOH A 17 419 17 HOH WAT . 
E 4 HOH A 18 420 18 HOH WAT . 
E 4 HOH A 19 421 19 HOH WAT . 
E 4 HOH A 20 422 20 HOH WAT . 
E 4 HOH A 21 423 21 HOH WAT . 
E 4 HOH A 22 424 22 HOH WAT . 
E 4 HOH A 23 425 23 HOH WAT . 
E 4 HOH A 24 426 24 HOH WAT . 
E 4 HOH A 25 427 25 HOH WAT . 
E 4 HOH A 26 428 26 HOH WAT . 
E 4 HOH A 27 429 27 HOH WAT . 
E 4 HOH A 28 430 28 HOH WAT . 
E 4 HOH A 29 431 29 HOH WAT . 
E 4 HOH A 30 432 30 HOH WAT . 
E 4 HOH A 31 433 31 HOH WAT . 
E 4 HOH A 32 434 32 HOH WAT . 
E 4 HOH A 33 435 33 HOH WAT . 
E 4 HOH A 34 436 34 HOH WAT . 
E 4 HOH A 35 437 35 HOH WAT . 
E 4 HOH A 36 438 36 HOH WAT . 
E 4 HOH A 37 439 37 HOH WAT . 
E 4 HOH A 38 440 38 HOH WAT . 
E 4 HOH A 39 441 39 HOH WAT . 
E 4 HOH A 40 442 40 HOH WAT . 
E 4 HOH A 41 443 41 HOH WAT . 
E 4 HOH A 42 444 42 HOH WAT . 
E 4 HOH A 43 445 43 HOH WAT . 
E 4 HOH A 44 446 44 HOH WAT . 
E 4 HOH A 45 447 45 HOH WAT . 
E 4 HOH A 46 448 46 HOH WAT . 
E 4 HOH A 47 449 47 HOH WAT . 
E 4 HOH A 48 450 48 HOH WAT . 
E 4 HOH A 49 451 49 HOH WAT . 
E 4 HOH A 50 452 50 HOH WAT . 
E 4 HOH A 51 453 51 HOH WAT . 
E 4 HOH A 52 454 52 HOH WAT . 
E 4 HOH A 53 455 53 HOH WAT . 
E 4 HOH A 54 456 54 HOH WAT . 
E 4 HOH A 55 457 55 HOH WAT . 
E 4 HOH A 56 458 56 HOH WAT . 
E 4 HOH A 57 459 57 HOH WAT . 
E 4 HOH A 58 460 58 HOH WAT . 
E 4 HOH A 59 461 59 HOH WAT . 
E 4 HOH A 60 462 60 HOH WAT . 
E 4 HOH A 61 463 61 HOH WAT . 
E 4 HOH A 62 464 62 HOH WAT . 
E 4 HOH A 63 465 63 HOH WAT . 
E 4 HOH A 64 466 64 HOH WAT . 
E 4 HOH A 65 467 65 HOH WAT . 
E 4 HOH A 66 468 66 HOH WAT . 
E 4 HOH A 67 469 67 HOH WAT . 
E 4 HOH A 68 470 68 HOH WAT . 
E 4 HOH A 69 471 69 HOH WAT . 
E 4 HOH A 70 472 70 HOH WAT . 
E 4 HOH A 71 473 71 HOH WAT . 
E 4 HOH A 72 474 72 HOH WAT . 
E 4 HOH A 73 475 73 HOH WAT . 
E 4 HOH A 74 476 74 HOH WAT . 
E 4 HOH A 75 477 75 HOH WAT . 
E 4 HOH A 76 478 76 HOH WAT . 
E 4 HOH A 77 479 77 HOH WAT . 
E 4 HOH A 78 480 78 HOH WAT . 
E 4 HOH A 79 481 79 HOH WAT . 
E 4 HOH A 80 482 80 HOH WAT . 
E 4 HOH A 81 483 81 HOH WAT . 
E 4 HOH A 82 484 82 HOH WAT . 
E 4 HOH A 83 485 83 HOH WAT . 
E 4 HOH A 84 486 84 HOH WAT . 
E 4 HOH A 85 487 85 HOH WAT . 
E 4 HOH A 86 488 86 HOH WAT . 
E 4 HOH A 87 489 87 HOH WAT . 
E 4 HOH A 88 490 88 HOH WAT . 
E 4 HOH A 89 491 89 HOH WAT . 
E 4 HOH A 90 492 90 HOH WAT . 
E 4 HOH A 91 493 91 HOH WAT . 
E 4 HOH A 92 494 92 HOH WAT . 
E 4 HOH A 93 495 93 HOH WAT . 
E 4 HOH A 94 496 94 HOH WAT . 
E 4 HOH A 95 497 95 HOH WAT . 
E 4 HOH A 96 498 96 HOH WAT . 
E 4 HOH A 97 499 97 HOH WAT . 
E 4 HOH A 98 500 98 HOH WAT . 
E 4 HOH A 99 501 99 HOH WAT . 
E 4 HOH A 100 502 100 HOH WAT . 
E 4 HOH A 101 503 101 HOH WAT . 
E 4 HOH A 102 504 102 HOH WAT . 
E 4 HOH A 103 505 103 HOH WAT . 
E 4 HOH A 104 506 104 HOH WAT . 
E 4 HOH A 105 507 105 HOH WAT . 
E 4 HOH A 106 508 106 HOH WAT . 
E 4 HOH A 107 509 107 HOH WAT . 
E 4 HOH A 108 510 108 HOH WAT . 
E 4 HOH A 109 511 109 HOH WAT . 
E 4 HOH A 110 512 110 HOH WAT . 
E 4 HOH A 111 513 111 HOH WAT . 
E 4 HOH A 112 514 112 HOH WAT . 
E 4 HOH A 113 515 113 HOH WAT . 
E 4 HOH A 114 516 114 HOH WAT . 
E 4 HOH A 115 517 115 HOH WAT . 
E 4 HOH A 116 518 116 HOH WAT . 
E 4 HOH A 117 519 117 HOH WAT . 
E 4 HOH A 118 520 118 HOH WAT . 
E 4 HOH A 119 521 119 HOH WAT . 
E 4 HOH A 120 522 120 HOH WAT . 
E 4 HOH A 121 523 121 HOH WAT . 
E 4 HOH A 122 524 122 HOH WAT . 
E 4 HOH A 123 525 123 HOH WAT . 
E 4 HOH A 124 526 124 HOH WAT . 
E 4 HOH A 125 527 125 HOH WAT . 
E 4 HOH A 126 528 126 HOH WAT . 
E 4 HOH A 127 529 127 HOH WAT . 
E 4 HOH A 128 530 128 HOH WAT . 
E 4 HOH A 129 531 129 HOH WAT . 
E 4 HOH A 130 532 130 HOH WAT . 
E 4 HOH A 131 533 131 HOH WAT . 
E 4 HOH A 132 534 132 HOH WAT . 
E 4 HOH A 133 535 133 HOH WAT . 
E 4 HOH A 134 536 134 HOH WAT . 
E 4 HOH A 135 537 135 HOH WAT . 
E 4 HOH A 136 538 136 HOH WAT . 
E 4 HOH A 137 539 137 HOH WAT . 
E 4 HOH A 138 540 138 HOH WAT . 
E 4 HOH A 139 541 139 HOH WAT . 
E 4 HOH A 140 542 140 HOH WAT . 
E 4 HOH A 141 543 141 HOH WAT . 
E 4 HOH A 142 544 142 HOH WAT . 
E 4 HOH A 143 545 143 HOH WAT . 
E 4 HOH A 144 546 144 HOH WAT . 
E 4 HOH A 145 547 145 HOH WAT . 
E 4 HOH A 146 548 146 HOH WAT . 
E 4 HOH A 147 549 147 HOH WAT . 
E 4 HOH A 148 550 148 HOH WAT . 
E 4 HOH A 149 551 149 HOH WAT . 
E 4 HOH A 150 552 150 HOH WAT . 
E 4 HOH A 151 553 151 HOH WAT . 
E 4 HOH A 152 554 152 HOH WAT . 
E 4 HOH A 153 555 153 HOH WAT . 
E 4 HOH A 154 556 154 HOH WAT . 
E 4 HOH A 155 557 155 HOH WAT . 
E 4 HOH A 156 558 156 HOH WAT . 
E 4 HOH A 157 559 157 HOH WAT . 
E 4 HOH A 158 560 158 HOH WAT . 
E 4 HOH A 159 561 159 HOH WAT . 
E 4 HOH A 160 562 160 HOH WAT . 
E 4 HOH A 161 563 161 HOH WAT . 
E 4 HOH A 162 564 162 HOH WAT . 
E 4 HOH A 163 565 163 HOH WAT . 
E 4 HOH A 164 566 164 HOH WAT . 
E 4 HOH A 165 567 165 HOH WAT . 
E 4 HOH A 166 568 166 HOH WAT . 
E 4 HOH A 167 569 167 HOH WAT . 
E 4 HOH A 168 570 168 HOH WAT . 
E 4 HOH A 169 571 169 HOH WAT . 
E 4 HOH A 170 572 170 HOH WAT . 
E 4 HOH A 171 573 171 HOH WAT . 
E 4 HOH A 172 574 172 HOH WAT . 
E 4 HOH A 173 575 173 HOH WAT . 
E 4 HOH A 174 576 174 HOH WAT . 
E 4 HOH A 175 577 175 HOH WAT . 
E 4 HOH A 176 578 176 HOH WAT . 
E 4 HOH A 177 579 177 HOH WAT . 
E 4 HOH A 178 580 178 HOH WAT . 
E 4 HOH A 179 581 179 HOH WAT . 
E 4 HOH A 180 582 180 HOH WAT . 
E 4 HOH A 181 583 181 HOH WAT . 
E 4 HOH A 182 584 182 HOH WAT . 
E 4 HOH A 183 585 183 HOH WAT . 
E 4 HOH A 184 586 184 HOH WAT . 
E 4 HOH A 185 587 185 HOH WAT . 
E 4 HOH A 186 588 186 HOH WAT . 
E 4 HOH A 187 589 187 HOH WAT . 
E 4 HOH A 188 590 188 HOH WAT . 
E 4 HOH A 189 591 189 HOH WAT . 
E 4 HOH A 190 592 190 HOH WAT . 
E 4 HOH A 191 593 191 HOH WAT . 
E 4 HOH A 192 594 192 HOH WAT . 
E 4 HOH A 193 595 193 HOH WAT . 
E 4 HOH A 194 596 194 HOH WAT . 
E 4 HOH A 195 597 195 HOH WAT . 
E 4 HOH A 196 598 196 HOH WAT . 
E 4 HOH A 197 599 197 HOH WAT . 
E 4 HOH A 198 600 198 HOH WAT . 
E 4 HOH A 199 601 199 HOH WAT . 
E 4 HOH A 200 602 200 HOH WAT . 
E 4 HOH A 201 603 201 HOH WAT . 
E 4 HOH A 202 604 202 HOH WAT . 
E 4 HOH A 203 605 203 HOH WAT . 
E 4 HOH A 204 606 204 HOH WAT . 
E 4 HOH A 205 607 205 HOH WAT . 
E 4 HOH A 206 608 206 HOH WAT . 
E 4 HOH A 207 609 207 HOH WAT . 
E 4 HOH A 208 610 208 HOH WAT . 
E 4 HOH A 209 611 209 HOH WAT . 
E 4 HOH A 210 612 210 HOH WAT . 
E 4 HOH A 211 613 211 HOH WAT . 
E 4 HOH A 212 614 212 HOH WAT . 
E 4 HOH A 213 615 213 HOH WAT . 
E 4 HOH A 214 616 214 HOH WAT . 
E 4 HOH A 215 617 215 HOH WAT . 
E 4 HOH A 216 618 216 HOH WAT . 
E 4 HOH A 217 619 217 HOH WAT . 
E 4 HOH A 218 620 218 HOH WAT . 
E 4 HOH A 219 621 219 HOH WAT . 
E 4 HOH A 220 622 220 HOH WAT . 
E 4 HOH A 221 623 221 HOH WAT . 
E 4 HOH A 222 624 222 HOH WAT . 
E 4 HOH A 223 625 223 HOH WAT . 
E 4 HOH A 224 626 224 HOH WAT . 
E 4 HOH A 225 627 225 HOH WAT . 
E 4 HOH A 226 628 226 HOH WAT . 
E 4 HOH A 227 629 227 HOH WAT . 
E 4 HOH A 228 630 228 HOH WAT . 
E 4 HOH A 229 631 229 HOH WAT . 
E 4 HOH A 230 632 230 HOH WAT . 
E 4 HOH A 231 633 231 HOH WAT . 
E 4 HOH A 232 634 232 HOH WAT . 
E 4 HOH A 233 635 233 HOH WAT . 
E 4 HOH A 234 636 234 HOH WAT . 
E 4 HOH A 235 637 235 HOH WAT . 
E 4 HOH A 236 638 236 HOH WAT . 
E 4 HOH A 237 639 237 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           ZN 
_atom_site.label_atom_id         ZN 
_atom_site.label_comp_id         ZN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         B 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               55.143 
_atom_site.Cartn_y               34.686 
_atom_site.Cartn_z               4.48 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        19.2 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          ZN 
_atom_site.auth_comp_id          ZN 
_atom_site.auth_seq_id           401 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              55 
_model_server_stats.parse_time_ms           7 
_model_server_stats.create_model_time_ms    2 
_model_server_stats.query_time_ms           273 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           1 
#