data_1EHI # _model_server_result.job_id wMKjfuMbaaTlOqJUWtuwdw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-06 03:05:40' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1ehi # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":784}' # _entry.id 1EHI # _exptl.entry_id 1EHI _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details 'Made by Prof. Paul A. Bartlett, Dept. of Chem., UC Berkeley' _entity.formula_weight 24.305 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'MAGNESIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 92.1 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1EHI _cell.length_a 118.2 _cell.length_b 90.8 _cell.length_c 82.1 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1EHI _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OE1 GLU 316 A GLU 316 1_555 C MG MG . A MG 783 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.307 ? metalc ? metalc2 A OE2 GLU 316 A GLU 316 1_555 C MG MG . A MG 783 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.831 ? metalc ? metalc3 A OE2 GLU 316 A GLU 316 1_555 D MG MG . A MG 784 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASN 318 A ASN 318 1_555 C MG MG . A MG 783 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.542 ? metalc ? metalc5 E O3B ADP . A ADP 781 1_555 C MG MG . A MG 783 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.476 ? metalc ? metalc6 E O2B ADP . A ADP 781 1_555 D MG MG . A MG 784 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc7 E O2A ADP . A ADP 781 1_555 D MG MG . A MG 784 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.664 ? metalc ? metalc8 F O5P PHY . A PHY 782 1_555 C MG MG . A MG 783 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.2 ? metalc ? metalc9 F O4P PHY . A PHY 782 1_555 D MG MG . A MG 784 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.248 ? # _chem_comp.formula 'Mg 2' _chem_comp.formula_weight 24.305 _chem_comp.id MG _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'MAGNESIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1EHI _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00846 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00031 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011013 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012188 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 MG A 1 783 783 MG MG . D 2 MG A 1 784 784 MG MG . E 3 ADP A 1 781 781 ADP ADP . F 4 PHY A 1 782 782 PHY PHY . G 5 HOH A 1 801 801 HOH WAT . G 5 HOH A 2 803 803 HOH WAT . G 5 HOH A 3 804 804 HOH WAT . G 5 HOH A 4 807 807 HOH WAT . G 5 HOH A 5 809 809 HOH WAT . G 5 HOH A 6 810 810 HOH WAT . G 5 HOH A 7 811 811 HOH WAT . G 5 HOH A 8 812 812 HOH WAT . G 5 HOH A 9 815 815 HOH WAT . G 5 HOH A 10 817 817 HOH WAT . G 5 HOH A 11 818 818 HOH WAT . G 5 HOH A 12 819 819 HOH WAT . G 5 HOH A 13 824 824 HOH WAT . G 5 HOH A 14 825 825 HOH WAT . G 5 HOH A 15 826 826 HOH WAT . G 5 HOH A 16 827 827 HOH WAT . G 5 HOH A 17 828 828 HOH WAT . G 5 HOH A 18 829 829 HOH WAT . G 5 HOH A 19 832 832 HOH WAT . G 5 HOH A 20 833 833 HOH WAT . G 5 HOH A 21 834 834 HOH WAT . G 5 HOH A 22 835 835 HOH WAT . G 5 HOH A 23 837 837 HOH WAT . G 5 HOH A 24 838 838 HOH WAT . G 5 HOH A 25 840 840 HOH WAT . G 5 HOH A 26 841 841 HOH WAT . G 5 HOH A 27 842 842 HOH WAT . G 5 HOH A 28 843 843 HOH WAT . G 5 HOH A 29 844 844 HOH WAT . G 5 HOH A 30 846 846 HOH WAT . G 5 HOH A 31 847 847 HOH WAT . G 5 HOH A 32 848 848 HOH WAT . G 5 HOH A 33 849 849 HOH WAT . G 5 HOH A 34 850 850 HOH WAT . G 5 HOH A 35 852 852 HOH WAT . G 5 HOH A 36 853 853 HOH WAT . G 5 HOH A 37 854 854 HOH WAT . G 5 HOH A 38 855 855 HOH WAT . G 5 HOH A 39 858 858 HOH WAT . G 5 HOH A 40 859 859 HOH WAT . G 5 HOH A 41 861 861 HOH WAT . G 5 HOH A 42 862 862 HOH WAT . G 5 HOH A 43 863 863 HOH WAT . G 5 HOH A 44 864 864 HOH WAT . G 5 HOH A 45 866 866 HOH WAT . G 5 HOH A 46 867 867 HOH WAT . G 5 HOH A 47 868 868 HOH WAT . G 5 HOH A 48 870 870 HOH WAT . G 5 HOH A 49 873 873 HOH WAT . G 5 HOH A 50 876 876 HOH WAT . G 5 HOH A 51 877 877 HOH WAT . G 5 HOH A 52 878 878 HOH WAT . G 5 HOH A 53 882 882 HOH WAT . G 5 HOH A 54 884 884 HOH WAT . G 5 HOH A 55 886 886 HOH WAT . G 5 HOH A 56 888 888 HOH WAT . G 5 HOH A 57 889 889 HOH WAT . G 5 HOH A 58 894 894 HOH WAT . G 5 HOH A 59 895 895 HOH WAT . G 5 HOH A 60 896 896 HOH WAT . G 5 HOH A 61 897 897 HOH WAT . G 5 HOH A 62 900 900 HOH WAT . G 5 HOH A 63 903 903 HOH WAT . G 5 HOH A 64 904 904 HOH WAT . G 5 HOH A 65 908 908 HOH WAT . G 5 HOH A 66 909 909 HOH WAT . G 5 HOH A 67 910 910 HOH WAT . G 5 HOH A 68 911 911 HOH WAT . G 5 HOH A 69 915 915 HOH WAT . G 5 HOH A 70 916 916 HOH WAT . G 5 HOH A 71 917 917 HOH WAT . G 5 HOH A 72 920 920 HOH WAT . G 5 HOH A 73 923 923 HOH WAT . G 5 HOH A 74 924 924 HOH WAT . G 5 HOH A 75 925 925 HOH WAT . G 5 HOH A 76 926 926 HOH WAT . G 5 HOH A 77 927 927 HOH WAT . G 5 HOH A 78 928 928 HOH WAT . G 5 HOH A 79 930 930 HOH WAT . G 5 HOH A 80 932 932 HOH WAT . G 5 HOH A 81 933 933 HOH WAT . G 5 HOH A 82 935 935 HOH WAT . G 5 HOH A 83 936 936 HOH WAT . G 5 HOH A 84 937 937 HOH WAT . G 5 HOH A 85 938 938 HOH WAT . G 5 HOH A 86 939 939 HOH WAT . G 5 HOH A 87 942 942 HOH WAT . G 5 HOH A 88 944 944 HOH WAT . G 5 HOH A 89 951 951 HOH WAT . G 5 HOH A 90 953 953 HOH WAT . G 5 HOH A 91 954 954 HOH WAT . G 5 HOH A 92 959 959 HOH WAT . G 5 HOH A 93 962 962 HOH WAT . G 5 HOH A 94 964 964 HOH WAT . G 5 HOH A 95 967 967 HOH WAT . G 5 HOH A 96 968 968 HOH WAT . G 5 HOH A 97 969 969 HOH WAT . G 5 HOH A 98 970 970 HOH WAT . G 5 HOH A 99 971 971 HOH WAT . G 5 HOH A 100 973 973 HOH WAT . G 5 HOH A 101 974 974 HOH WAT . G 5 HOH A 102 975 975 HOH WAT . G 5 HOH A 103 977 977 HOH WAT . G 5 HOH A 104 978 978 HOH WAT . G 5 HOH A 105 980 980 HOH WAT . G 5 HOH A 106 981 981 HOH WAT . G 5 HOH A 107 982 982 HOH WAT . G 5 HOH A 108 983 983 HOH WAT . G 5 HOH A 109 984 984 HOH WAT . G 5 HOH A 110 986 986 HOH WAT . G 5 HOH A 111 987 987 HOH WAT . G 5 HOH A 112 989 989 HOH WAT . G 5 HOH A 113 991 991 HOH WAT . G 5 HOH A 114 993 993 HOH WAT . G 5 HOH A 115 997 997 HOH WAT . G 5 HOH A 116 1001 1001 HOH WAT . G 5 HOH A 117 1002 1002 HOH WAT . G 5 HOH A 118 1003 1003 HOH WAT . G 5 HOH A 119 1005 1005 HOH WAT . G 5 HOH A 120 1008 1008 HOH WAT . G 5 HOH A 121 1009 1009 HOH WAT . G 5 HOH A 122 1010 1010 HOH WAT . H 5 HOH B 1 802 802 HOH WAT . H 5 HOH B 2 805 805 HOH WAT . H 5 HOH B 3 806 806 HOH WAT . H 5 HOH B 4 808 808 HOH WAT . H 5 HOH B 5 813 813 HOH WAT . H 5 HOH B 6 814 814 HOH WAT . H 5 HOH B 7 816 816 HOH WAT . H 5 HOH B 8 820 820 HOH WAT . H 5 HOH B 9 821 821 HOH WAT . H 5 HOH B 10 822 822 HOH WAT . H 5 HOH B 11 823 823 HOH WAT . H 5 HOH B 12 830 830 HOH WAT . H 5 HOH B 13 831 831 HOH WAT . H 5 HOH B 14 836 836 HOH WAT . H 5 HOH B 15 839 839 HOH WAT . H 5 HOH B 16 845 845 HOH WAT . H 5 HOH B 17 851 851 HOH WAT . H 5 HOH B 18 856 856 HOH WAT . H 5 HOH B 19 857 857 HOH WAT . H 5 HOH B 20 860 860 HOH WAT . H 5 HOH B 21 865 865 HOH WAT . H 5 HOH B 22 869 869 HOH WAT . H 5 HOH B 23 871 871 HOH WAT . H 5 HOH B 24 872 872 HOH WAT . H 5 HOH B 25 874 874 HOH WAT . H 5 HOH B 26 875 875 HOH WAT . H 5 HOH B 27 879 879 HOH WAT . H 5 HOH B 28 880 880 HOH WAT . H 5 HOH B 29 881 881 HOH WAT . H 5 HOH B 30 883 883 HOH WAT . H 5 HOH B 31 885 885 HOH WAT . H 5 HOH B 32 887 887 HOH WAT . H 5 HOH B 33 890 890 HOH WAT . H 5 HOH B 34 891 891 HOH WAT . H 5 HOH B 35 892 892 HOH WAT . H 5 HOH B 36 893 893 HOH WAT . H 5 HOH B 37 898 898 HOH WAT . H 5 HOH B 38 899 899 HOH WAT . H 5 HOH B 39 901 901 HOH WAT . H 5 HOH B 40 902 902 HOH WAT . H 5 HOH B 41 905 905 HOH WAT . H 5 HOH B 42 906 906 HOH WAT . H 5 HOH B 43 907 907 HOH WAT . H 5 HOH B 44 912 912 HOH WAT . H 5 HOH B 45 913 913 HOH WAT . H 5 HOH B 46 914 914 HOH WAT . H 5 HOH B 47 918 918 HOH WAT . H 5 HOH B 48 919 919 HOH WAT . H 5 HOH B 49 921 921 HOH WAT . H 5 HOH B 50 922 922 HOH WAT . H 5 HOH B 51 929 929 HOH WAT . H 5 HOH B 52 931 931 HOH WAT . H 5 HOH B 53 934 934 HOH WAT . H 5 HOH B 54 940 940 HOH WAT . H 5 HOH B 55 941 941 HOH WAT . H 5 HOH B 56 943 943 HOH WAT . H 5 HOH B 57 945 945 HOH WAT . H 5 HOH B 58 946 946 HOH WAT . H 5 HOH B 59 947 947 HOH WAT . H 5 HOH B 60 948 948 HOH WAT . H 5 HOH B 61 949 949 HOH WAT . H 5 HOH B 62 950 950 HOH WAT . H 5 HOH B 63 952 952 HOH WAT . H 5 HOH B 64 955 955 HOH WAT . H 5 HOH B 65 956 956 HOH WAT . H 5 HOH B 66 957 957 HOH WAT . H 5 HOH B 67 958 958 HOH WAT . H 5 HOH B 68 960 960 HOH WAT . H 5 HOH B 69 961 961 HOH WAT . H 5 HOH B 70 963 963 HOH WAT . H 5 HOH B 71 965 965 HOH WAT . H 5 HOH B 72 966 966 HOH WAT . H 5 HOH B 73 972 972 HOH WAT . H 5 HOH B 74 976 976 HOH WAT . H 5 HOH B 75 979 979 HOH WAT . H 5 HOH B 76 985 985 HOH WAT . H 5 HOH B 77 988 988 HOH WAT . H 5 HOH B 78 990 990 HOH WAT . H 5 HOH B 79 992 992 HOH WAT . H 5 HOH B 80 994 994 HOH WAT . H 5 HOH B 81 995 995 HOH WAT . H 5 HOH B 82 996 996 HOH WAT . H 5 HOH B 83 998 998 HOH WAT . H 5 HOH B 84 999 999 HOH WAT . H 5 HOH B 85 1000 1000 HOH WAT . H 5 HOH B 86 1004 1004 HOH WAT . H 5 HOH B 87 1006 1006 HOH WAT . H 5 HOH B 88 1007 1007 HOH WAT . H 5 HOH B 89 1011 1011 HOH WAT . H 5 HOH B 90 1012 1012 HOH WAT . H 5 HOH B 91 1013 1013 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol MG _atom_site.label_atom_id MG _atom_site.label_comp_id MG _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 41.932 _atom_site.Cartn_y 12.289 _atom_site.Cartn_z 55.443 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 24.52 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id MG _atom_site.auth_comp_id MG _atom_site.auth_seq_id 784 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 250 _model_server_stats.encode_time_ms 1 _model_server_stats.element_count 1 #