data_1EIZ # _model_server_result.job_id RhUH_WCKY1RaXtnpOBWH1A _model_server_result.datetime_utc '2024-12-02 05:22:54' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1eiz # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":301}' # _entry.id 1EIZ # _exptl.entry_id 1EIZ _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 398.437 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description S-ADENOSYLMETHIONINE _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1EIZ _cell.length_a 36.457 _cell.length_b 65.867 _cell.length_c 72.877 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1EIZ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C15 H22 N6 O5 S' _chem_comp.formula_weight 398.437 _chem_comp.id SAM _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name S-ADENOSYLMETHIONINE _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N CA SAM sing 256 n n N HN1 SAM sing 257 n n N HN2 SAM sing 258 n n CA C SAM sing 259 n n CA CB SAM sing 260 n n CA HA SAM sing 261 n n C O SAM doub 262 n n C OXT SAM sing 263 n n CB CG SAM sing 264 n n CB HB1 SAM sing 265 n n CB HB2 SAM sing 266 n n CG SD SAM sing 267 n n CG HG1 SAM sing 268 n n CG HG2 SAM sing 269 n n SD CE SAM sing 270 n n SD C5' SAM sing 271 n n CE HE1 SAM sing 272 n n CE HE2 SAM sing 273 n n CE HE3 SAM sing 274 n n C5' C4' SAM sing 275 n n C5' "H5'1" SAM sing 276 n n C5' "H5'2" SAM sing 277 n n C4' O4' SAM sing 278 n n C4' C3' SAM sing 279 n n C4' H4' SAM sing 280 n n O4' C1' SAM sing 281 n n C3' O3' SAM sing 282 n n C3' C2' SAM sing 283 n n C3' H3' SAM sing 284 n n O3' HO3' SAM sing 285 n n C2' O2' SAM sing 286 n n C2' C1' SAM sing 287 n n C2' H2' SAM sing 288 n n O2' HO2' SAM sing 289 n n C1' N9 SAM sing 290 n n C1' H1' SAM sing 291 n n N9 C8 SAM sing 292 n y N9 C4 SAM sing 293 n y C8 N7 SAM doub 294 n y C8 H8 SAM sing 295 n n N7 C5 SAM sing 296 n y C5 C6 SAM sing 297 n y C5 C4 SAM doub 298 n y C6 N6 SAM sing 299 n n C6 N1 SAM doub 300 n y N6 HN61 SAM sing 301 n n N6 HN62 SAM sing 302 n n N1 C2 SAM sing 303 n y C2 N3 SAM doub 304 n y C2 H2 SAM sing 305 n n N3 C4 SAM sing 306 n y # _atom_sites.entry_id 1EIZ _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.02743 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015182 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013722 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 SAM A 1 301 301 SAM SAM . C 3 HOH A 1 401 401 HOH WAT . C 3 HOH A 2 402 402 HOH WAT . C 3 HOH A 3 403 403 HOH WAT . C 3 HOH A 4 404 404 HOH WAT . C 3 HOH A 5 405 405 HOH WAT . C 3 HOH A 6 406 406 HOH WAT . C 3 HOH A 7 407 407 HOH WAT . C 3 HOH A 8 408 408 HOH WAT . C 3 HOH A 9 409 409 HOH WAT . C 3 HOH A 10 410 410 HOH WAT . C 3 HOH A 11 411 411 HOH WAT . C 3 HOH A 12 412 412 HOH WAT . C 3 HOH A 13 413 413 HOH WAT . C 3 HOH A 14 414 414 HOH WAT . C 3 HOH A 15 415 415 HOH WAT . C 3 HOH A 16 416 416 HOH WAT . C 3 HOH A 17 417 417 HOH WAT . C 3 HOH A 18 418 418 HOH WAT . C 3 HOH A 19 419 419 HOH WAT . C 3 HOH A 20 420 420 HOH WAT . C 3 HOH A 21 421 421 HOH WAT . C 3 HOH A 22 423 423 HOH WAT . C 3 HOH A 23 424 424 HOH WAT . C 3 HOH A 24 425 425 HOH WAT . C 3 HOH A 25 426 426 HOH WAT . C 3 HOH A 26 427 427 HOH WAT . C 3 HOH A 27 428 428 HOH WAT . C 3 HOH A 28 429 429 HOH WAT . C 3 HOH A 29 430 430 HOH WAT . C 3 HOH A 30 431 431 HOH WAT . C 3 HOH A 31 432 432 HOH WAT . C 3 HOH A 32 433 433 HOH WAT . C 3 HOH A 33 434 434 HOH WAT . C 3 HOH A 34 435 435 HOH WAT . C 3 HOH A 35 436 436 HOH WAT . C 3 HOH A 36 437 437 HOH WAT . C 3 HOH A 37 438 438 HOH WAT . C 3 HOH A 38 440 440 HOH WAT . C 3 HOH A 39 441 441 HOH WAT . C 3 HOH A 40 442 442 HOH WAT . C 3 HOH A 41 443 443 HOH WAT . C 3 HOH A 42 444 444 HOH WAT . C 3 HOH A 43 445 445 HOH WAT . C 3 HOH A 44 446 446 HOH WAT . C 3 HOH A 45 447 447 HOH WAT . C 3 HOH A 46 448 448 HOH WAT . C 3 HOH A 47 449 449 HOH WAT . C 3 HOH A 48 450 450 HOH WAT . C 3 HOH A 49 451 451 HOH WAT . C 3 HOH A 50 452 452 HOH WAT . C 3 HOH A 51 453 453 HOH WAT . C 3 HOH A 52 454 454 HOH WAT . C 3 HOH A 53 455 455 HOH WAT . C 3 HOH A 54 456 456 HOH WAT . C 3 HOH A 55 457 457 HOH WAT . C 3 HOH A 56 459 459 HOH WAT . C 3 HOH A 57 460 460 HOH WAT . C 3 HOH A 58 461 461 HOH WAT . C 3 HOH A 59 462 462 HOH WAT . C 3 HOH A 60 466 466 HOH WAT . C 3 HOH A 61 467 467 HOH WAT . C 3 HOH A 62 468 468 HOH WAT . C 3 HOH A 63 470 470 HOH WAT . C 3 HOH A 64 471 471 HOH WAT . C 3 HOH A 65 472 472 HOH WAT . C 3 HOH A 66 473 473 HOH WAT . C 3 HOH A 67 474 474 HOH WAT . C 3 HOH A 68 477 477 HOH WAT . C 3 HOH A 69 478 478 HOH WAT . C 3 HOH A 70 479 479 HOH WAT . C 3 HOH A 71 480 480 HOH WAT . C 3 HOH A 72 481 481 HOH WAT . C 3 HOH A 73 482 482 HOH WAT . C 3 HOH A 74 483 483 HOH WAT . C 3 HOH A 75 484 484 HOH WAT . C 3 HOH A 76 486 486 HOH WAT . C 3 HOH A 77 487 487 HOH WAT . C 3 HOH A 78 488 488 HOH WAT . C 3 HOH A 79 489 489 HOH WAT . C 3 HOH A 80 490 490 HOH WAT . C 3 HOH A 81 491 491 HOH WAT . C 3 HOH A 82 492 492 HOH WAT . C 3 HOH A 83 493 493 HOH WAT . C 3 HOH A 84 494 494 HOH WAT . C 3 HOH A 85 496 496 HOH WAT . C 3 HOH A 86 506 506 HOH WAT . C 3 HOH A 87 518 518 HOH WAT . C 3 HOH A 88 533 533 HOH WAT . C 3 HOH A 89 537 537 HOH WAT . C 3 HOH A 90 542 542 HOH WAT . C 3 HOH A 91 575 575 HOH WAT . C 3 HOH A 92 583 583 HOH WAT . C 3 HOH A 93 586 586 HOH WAT . C 3 HOH A 94 587 587 HOH WAT . C 3 HOH A 95 588 588 HOH WAT . C 3 HOH A 96 589 589 HOH WAT . C 3 HOH A 97 590 590 HOH WAT . C 3 HOH A 98 615 615 HOH WAT . C 3 HOH A 99 623 623 HOH WAT . C 3 HOH A 100 625 625 HOH WAT . C 3 HOH A 101 638 638 HOH WAT . C 3 HOH A 102 677 677 HOH WAT . C 3 HOH A 103 689 689 HOH WAT . C 3 HOH A 104 693 693 HOH WAT . C 3 HOH A 105 701 701 HOH WAT . C 3 HOH A 106 707 707 HOH WAT . C 3 HOH A 107 729 729 HOH WAT . C 3 HOH A 108 733 733 HOH WAT . C 3 HOH A 109 734 734 HOH WAT . C 3 HOH A 110 758 758 HOH WAT . C 3 HOH A 111 760 760 HOH WAT . C 3 HOH A 112 761 761 HOH WAT . C 3 HOH A 113 762 762 HOH WAT . C 3 HOH A 114 763 763 HOH WAT . C 3 HOH A 115 764 764 HOH WAT . C 3 HOH A 116 765 765 HOH WAT . C 3 HOH A 117 766 766 HOH WAT . C 3 HOH A 118 767 767 HOH WAT . C 3 HOH A 119 768 768 HOH WAT . C 3 HOH A 120 769 769 HOH WAT . C 3 HOH A 121 770 770 HOH WAT . C 3 HOH A 122 781 781 HOH WAT . C 3 HOH A 123 782 782 HOH WAT . C 3 HOH A 124 784 784 HOH WAT . C 3 HOH A 125 785 785 HOH WAT . C 3 HOH A 126 786 786 HOH WAT . C 3 HOH A 127 788 788 HOH WAT . C 3 HOH A 128 789 789 HOH WAT . C 3 HOH A 129 790 790 HOH WAT . C 3 HOH A 130 791 791 HOH WAT . C 3 HOH A 131 792 792 HOH WAT . C 3 HOH A 132 797 797 HOH WAT . C 3 HOH A 133 799 799 HOH WAT . C 3 HOH A 134 800 800 HOH WAT . C 3 HOH A 135 804 804 HOH WAT . C 3 HOH A 136 807 807 HOH WAT . C 3 HOH A 137 808 808 HOH WAT . C 3 HOH A 138 809 809 HOH WAT . C 3 HOH A 139 810 810 HOH WAT . C 3 HOH A 140 811 811 HOH WAT . C 3 HOH A 141 812 812 HOH WAT . C 3 HOH A 142 813 813 HOH WAT . C 3 HOH A 143 814 814 HOH WAT . C 3 HOH A 144 815 815 HOH WAT . C 3 HOH A 145 818 818 HOH WAT . C 3 HOH A 146 819 819 HOH WAT . C 3 HOH A 147 821 821 HOH WAT . C 3 HOH A 148 823 823 HOH WAT . C 3 HOH A 149 824 824 HOH WAT . C 3 HOH A 150 825 825 HOH WAT . C 3 HOH A 151 901 901 HOH WAT . C 3 HOH A 152 902 902 HOH WAT . C 3 HOH A 153 903 903 HOH WAT . C 3 HOH A 154 904 904 HOH WAT . C 3 HOH A 155 905 905 HOH WAT . C 3 HOH A 156 906 906 HOH WAT . C 3 HOH A 157 907 907 HOH WAT . C 3 HOH A 158 908 908 HOH WAT . C 3 HOH A 159 909 909 HOH WAT . C 3 HOH A 160 910 910 HOH WAT . C 3 HOH A 161 911 911 HOH WAT . C 3 HOH A 162 912 912 HOH WAT . C 3 HOH A 163 913 913 HOH WAT . C 3 HOH A 164 914 914 HOH WAT . C 3 HOH A 165 915 915 HOH WAT . C 3 HOH A 166 916 916 HOH WAT . C 3 HOH A 167 917 917 HOH WAT . C 3 HOH A 168 918 918 HOH WAT . C 3 HOH A 169 919 919 HOH WAT . C 3 HOH A 170 920 920 HOH WAT . C 3 HOH A 171 921 921 HOH WAT . C 3 HOH A 172 922 922 HOH WAT . C 3 HOH A 173 923 923 HOH WAT . C 3 HOH A 174 924 924 HOH WAT . C 3 HOH A 175 925 925 HOH WAT . C 3 HOH A 176 926 926 HOH WAT . C 3 HOH A 177 927 927 HOH WAT . C 3 HOH A 178 928 928 HOH WAT . C 3 HOH A 179 929 929 HOH WAT . C 3 HOH A 180 930 930 HOH WAT . C 3 HOH A 181 931 931 HOH WAT . C 3 HOH A 182 932 932 HOH WAT . C 3 HOH A 183 933 933 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N SAM . . . B 2 0.778 40.744 12.8 1 11.42 ? N SAM 301 A 1 HETATM 2 C CA SAM . . . B 2 -0.506 40.525 12.059 1 10.63 ? CA SAM 301 A 1 HETATM 3 C C SAM . . . B 2 -1.009 41.872 11.545 1 11.29 ? C SAM 301 A 1 HETATM 4 O O SAM . . . B 2 -0.357 42.885 11.844 1 13.8 ? O SAM 301 A 1 HETATM 5 O OXT SAM . . . B 2 -2.065 41.893 10.873 1 12.56 ? OXT SAM 301 A 1 HETATM 6 C CB SAM . . . B 2 -1.561 39.888 12.987 1 13.75 ? CB SAM 301 A 1 HETATM 7 C CG SAM . . . B 2 -1.289 38.409 13.226 1 14.57 ? CG SAM 301 A 1 HETATM 8 S SD SAM . . . B 2 -2.512 37.548 14.253 1 17.54 ? SD SAM 301 A 1 HETATM 9 C CE SAM . . . B 2 -1.962 38.089 15.933 1 15.73 ? CE SAM 301 A 1 HETATM 10 C C5' SAM . . . B 2 -1.842 35.897 14.258 1 16.77 ? C5' SAM 301 A 1 HETATM 11 C C4' SAM . . . B 2 -1.97 35.111 12.979 1 16.85 ? C4' SAM 301 A 1 HETATM 12 O O4' SAM . . . B 2 -1.178 33.912 13.086 1 16.52 ? O4' SAM 301 A 1 HETATM 13 C C3' SAM . . . B 2 -3.386 34.622 12.651 1 15.93 ? C3' SAM 301 A 1 HETATM 14 O O3' SAM . . . B 2 -3.718 35.423 11.484 1 14.41 ? O3' SAM 301 A 1 HETATM 15 C C2' SAM . . . B 2 -3.19 33.185 12.157 1 15.23 ? C2' SAM 301 A 1 HETATM 16 O O2' SAM . . . B 2 -3.945 32.676 11.071 1 12.53 ? O2' SAM 301 A 1 HETATM 17 C C1' SAM . . . B 2 -1.671 33.015 12.126 1 15.28 ? C1' SAM 301 A 1 HETATM 18 N N9 SAM . . . B 2 -1.186 31.662 12.36 1 14.41 ? N9 SAM 301 A 1 HETATM 19 C C8 SAM . . . B 2 -1.374 30.826 13.439 1 11.78 ? C8 SAM 301 A 1 HETATM 20 N N7 SAM . . . B 2 -0.901 29.622 13.256 1 11.89 ? N7 SAM 301 A 1 HETATM 21 C C5 SAM . . . B 2 -0.346 29.664 11.989 1 12.53 ? C5 SAM 301 A 1 HETATM 22 C C6 SAM . . . B 2 0.293 28.685 11.195 1 12.94 ? C6 SAM 301 A 1 HETATM 23 N N6 SAM . . . B 2 0.432 27.398 11.561 1 13.81 ? N6 SAM 301 A 1 HETATM 24 N N1 SAM . . . B 2 0.761 29.063 9.99 1 13 ? N1 SAM 301 A 1 HETATM 25 C C2 SAM . . . B 2 0.565 30.337 9.591 1 11.99 ? C2 SAM 301 A 1 HETATM 26 N N3 SAM . . . B 2 -0.045 31.331 10.237 1 12.82 ? N3 SAM 301 A 1 HETATM 27 C C4 SAM . . . B 2 -0.483 30.924 11.439 1 13.51 ? C4 SAM 301 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 47 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 263 _model_server_stats.encode_time_ms 7 _model_server_stats.element_count 27 #