data_1EQW # _model_server_result.job_id oNmfABT8hat_1MQvNiEhMg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-19 04:40:22' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1eqw # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":502}' # _entry.id 1EQW # _exptl.entry_id 1EQW _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 63.546 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'COPPER (II) ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 107.73 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1EQW _cell.length_a 142.14 _cell.length_b 40.659 _cell.length_c 114.254 _cell.Z_PDB 16 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1EQW _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E,F,I,J,M,O 1 1 B,D,G,H,K,L,N,P 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 F N N ? 3 H N N ? 3 J N N ? 3 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 55 A CYS 51 1_555 A SG CYS 151 A CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.096 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 55 B CYS 51 1_555 B SG CYS 151 B CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.705 ? disulf ? disulf3 C SG CYS 55 C CYS 51 1_555 C SG CYS 151 C CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.978 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 55 D CYS 51 1_555 D SG CYS 151 D CYS 144 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.688 ? metalc ? metalc1 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 A ND1 HIS 73 A HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.112 ? metalc ? metalc2 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 A ND1 HIS 82 A HIS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.916 ? metalc ? metalc3 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 A ND1 HIS 91 A HIS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc4 E ZN ZN . A ZN 501 1_555 A OD1 ASP 94 A ASP 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.113 ? metalc ? metalc5 F CU CU . A CU 502 1_555 A NE2 HIS 50 A HIS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? metalc ? metalc6 F CU CU . A CU 502 1_555 A NE2 HIS 73 A HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.468 ? metalc ? metalc7 F CU CU . A CU 502 1_555 A NE2 HIS 129 A HIS 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.917 ? metalc ? metalc8 F CU CU . A CU 502 1_555 A ND1 HIS 48 A HIS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.29 ? metalc ? metalc9 G ZN ZN . B ZN 503 1_555 B ND1 HIS 73 B HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? metalc ? metalc10 G ZN ZN . B ZN 503 1_555 B ND1 HIS 91 B HIS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? metalc ? metalc11 G ZN ZN . B ZN 503 1_555 B ND1 HIS 82 B HIS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? metalc ? metalc12 G ZN ZN . B ZN 503 1_555 B OD1 ASP 94 B ASP 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? metalc ? metalc13 H CU CU . B CU 504 1_555 B NE2 HIS 129 B HIS 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.952 ? metalc ? metalc14 H CU CU . B CU 504 1_555 B NE2 HIS 73 B HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.501 ? metalc ? metalc15 H CU CU . B CU 504 1_555 B NE2 HIS 50 B HIS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.156 ? metalc ? metalc16 H CU CU . B CU 504 1_555 B ND1 HIS 48 B HIS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? metalc ? metalc17 I ZN ZN . C ZN 505 1_555 C ND1 HIS 91 C HIS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.959 ? metalc ? metalc18 I ZN ZN . C ZN 505 1_555 C OD1 ASP 94 C ASP 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.999 ? metalc ? metalc19 I ZN ZN . C ZN 505 1_555 C ND1 HIS 82 C HIS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.976 ? metalc ? metalc20 I ZN ZN . C ZN 505 1_555 C ND1 HIS 73 C HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.941 ? metalc ? metalc21 J CU CU . C CU 506 1_555 C NE2 HIS 73 C HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? metalc ? metalc22 J CU CU . C CU 506 1_555 C ND1 HIS 48 C HIS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.206 ? metalc ? metalc23 J CU CU . C CU 506 1_555 C NE2 HIS 129 C HIS 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.927 ? metalc ? metalc24 J CU CU . C CU 506 1_555 C NE2 HIS 50 C HIS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? metalc ? metalc25 K ZN ZN . D ZN 507 1_555 D ND1 HIS 91 D HIS 78 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.302 ? metalc ? metalc26 K ZN ZN . D ZN 507 1_555 D ND1 HIS 73 D HIS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc27 K ZN ZN . D ZN 507 1_555 D ND1 HIS 82 D HIS 69 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? metalc ? metalc28 K ZN ZN . D ZN 507 1_555 D OD1 ASP 94 D ASP 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.977 ? metalc ? metalc29 L CU CU . D CU 508 1_555 D NE2 HIS 50 D HIS 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.195 ? metalc ? metalc30 L CU CU . D CU 508 1_555 D NE2 HIS 129 D HIS 118 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.95 ? metalc ? metalc31 L CU CU . D CU 508 1_555 D ND1 HIS 48 D HIS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? # _chem_comp.formula 'Cu 2' _chem_comp.formula_weight 63.546 _chem_comp.id CU _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'COPPER (II) ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1EQW _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.007035 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002249 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.024595 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009189 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 2 ZN A 1 501 160 ZN ZN2 . F 3 CU A 1 502 161 CU CU2 . G 2 ZN B 1 503 160 ZN ZN2 . H 3 CU B 1 504 161 CU CU2 . I 2 ZN C 1 505 160 ZN ZN2 . J 3 CU C 1 506 161 CU CU2 . K 2 ZN D 1 507 160 ZN ZN2 . L 3 CU D 1 508 161 CU CU2 . M 4 HOH A 1 503 101 HOH WAT . M 4 HOH A 2 504 102 HOH WAT . M 4 HOH A 3 505 103 HOH WAT . M 4 HOH A 4 506 104 HOH WAT . M 4 HOH A 5 507 105 HOH WAT . M 4 HOH A 6 508 106 HOH WAT . M 4 HOH A 7 509 107 HOH WAT . M 4 HOH A 8 510 108 HOH WAT . M 4 HOH A 9 511 109 HOH WAT . M 4 HOH A 10 512 110 HOH WAT . M 4 HOH A 11 513 111 HOH WAT . M 4 HOH A 12 514 112 HOH WAT . M 4 HOH A 13 515 113 HOH WAT . M 4 HOH A 14 516 114 HOH WAT . M 4 HOH A 15 517 115 HOH WAT . M 4 HOH A 16 518 116 HOH WAT . M 4 HOH A 17 519 117 HOH WAT . M 4 HOH A 18 520 118 HOH WAT . M 4 HOH A 19 521 119 HOH WAT . M 4 HOH A 20 522 120 HOH WAT . M 4 HOH A 21 523 121 HOH WAT . M 4 HOH A 22 524 122 HOH WAT . M 4 HOH A 23 525 123 HOH WAT . M 4 HOH A 24 526 124 HOH WAT . M 4 HOH A 25 527 125 HOH WAT . M 4 HOH A 26 528 126 HOH WAT . M 4 HOH A 27 529 127 HOH WAT . M 4 HOH A 28 530 128 HOH WAT . M 4 HOH A 29 531 130 HOH WAT . M 4 HOH A 30 532 131 HOH WAT . M 4 HOH A 31 533 132 HOH WAT . M 4 HOH A 32 534 133 HOH WAT . M 4 HOH A 33 535 134 HOH WAT . M 4 HOH A 34 536 135 HOH WAT . M 4 HOH A 35 537 137 HOH WAT . M 4 HOH A 36 538 138 HOH WAT . M 4 HOH A 37 539 139 HOH WAT . M 4 HOH A 38 540 140 HOH WAT . M 4 HOH A 39 541 141 HOH WAT . M 4 HOH A 40 542 142 HOH WAT . M 4 HOH A 41 543 143 HOH WAT . M 4 HOH A 42 544 144 HOH WAT . M 4 HOH A 43 545 224 HOH WAT . N 4 HOH B 1 505 100 HOH WAT . N 4 HOH B 2 506 200 HOH WAT . N 4 HOH B 3 507 201 HOH WAT . N 4 HOH B 4 508 202 HOH WAT . N 4 HOH B 5 509 203 HOH WAT . N 4 HOH B 6 510 204 HOH WAT . N 4 HOH B 7 511 205 HOH WAT . N 4 HOH B 8 512 206 HOH WAT . N 4 HOH B 9 513 207 HOH WAT . N 4 HOH B 10 514 208 HOH WAT . N 4 HOH B 11 515 209 HOH WAT . N 4 HOH B 12 516 210 HOH WAT . N 4 HOH B 13 517 211 HOH WAT . N 4 HOH B 14 518 212 HOH WAT . N 4 HOH B 15 519 213 HOH WAT . N 4 HOH B 16 520 214 HOH WAT . N 4 HOH B 17 521 215 HOH WAT . N 4 HOH B 18 522 216 HOH WAT . N 4 HOH B 19 523 217 HOH WAT . N 4 HOH B 20 524 218 HOH WAT . N 4 HOH B 21 525 219 HOH WAT . N 4 HOH B 22 526 220 HOH WAT . N 4 HOH B 23 527 221 HOH WAT . N 4 HOH B 24 528 222 HOH WAT . N 4 HOH B 25 529 225 HOH WAT . N 4 HOH B 26 530 226 HOH WAT . N 4 HOH B 27 531 227 HOH WAT . N 4 HOH B 28 532 228 HOH WAT . N 4 HOH B 29 533 229 HOH WAT . N 4 HOH B 30 534 230 HOH WAT . N 4 HOH B 31 535 231 HOH WAT . N 4 HOH B 32 536 232 HOH WAT . N 4 HOH B 33 537 233 HOH WAT . N 4 HOH B 34 538 234 HOH WAT . N 4 HOH B 35 539 235 HOH WAT . N 4 HOH B 36 540 236 HOH WAT . N 4 HOH B 37 541 237 HOH WAT . N 4 HOH B 38 542 238 HOH WAT . N 4 HOH B 39 543 239 HOH WAT . N 4 HOH B 40 544 240 HOH WAT . N 4 HOH B 41 545 241 HOH WAT . N 4 HOH B 42 546 242 HOH WAT . N 4 HOH B 43 547 313 HOH WAT . N 4 HOH B 44 548 333 HOH WAT . O 4 HOH C 1 507 129 HOH WAT . O 4 HOH C 2 508 136 HOH WAT . O 4 HOH C 3 509 300 HOH WAT . O 4 HOH C 4 510 301 HOH WAT . O 4 HOH C 5 511 302 HOH WAT . O 4 HOH C 6 512 303 HOH WAT . O 4 HOH C 7 513 304 HOH WAT . O 4 HOH C 8 514 305 HOH WAT . O 4 HOH C 9 515 306 HOH WAT . O 4 HOH C 10 516 307 HOH WAT . O 4 HOH C 11 517 308 HOH WAT . O 4 HOH C 12 518 309 HOH WAT . O 4 HOH C 13 519 310 HOH WAT . O 4 HOH C 14 520 311 HOH WAT . O 4 HOH C 15 521 312 HOH WAT . O 4 HOH C 16 522 314 HOH WAT . O 4 HOH C 17 523 315 HOH WAT . O 4 HOH C 18 524 316 HOH WAT . O 4 HOH C 19 525 317 HOH WAT . O 4 HOH C 20 526 318 HOH WAT . O 4 HOH C 21 527 319 HOH WAT . O 4 HOH C 22 528 320 HOH WAT . O 4 HOH C 23 529 321 HOH WAT . O 4 HOH C 24 530 322 HOH WAT . O 4 HOH C 25 531 323 HOH WAT . O 4 HOH C 26 532 324 HOH WAT . O 4 HOH C 27 533 325 HOH WAT . O 4 HOH C 28 534 326 HOH WAT . O 4 HOH C 29 535 327 HOH WAT . O 4 HOH C 30 536 328 HOH WAT . O 4 HOH C 31 537 329 HOH WAT . O 4 HOH C 32 538 330 HOH WAT . O 4 HOH C 33 539 331 HOH WAT . O 4 HOH C 34 540 332 HOH WAT . O 4 HOH C 35 541 334 HOH WAT . O 4 HOH C 36 542 335 HOH WAT . O 4 HOH C 37 543 336 HOH WAT . O 4 HOH C 38 544 337 HOH WAT . O 4 HOH C 39 545 338 HOH WAT . O 4 HOH C 40 546 339 HOH WAT . O 4 HOH C 41 547 340 HOH WAT . O 4 HOH C 42 548 341 HOH WAT . O 4 HOH C 43 549 342 HOH WAT . O 4 HOH C 44 550 343 HOH WAT . O 4 HOH C 45 551 344 HOH WAT . O 4 HOH C 46 552 345 HOH WAT . O 4 HOH C 47 553 346 HOH WAT . O 4 HOH C 48 554 347 HOH WAT . O 4 HOH C 49 555 348 HOH WAT . O 4 HOH C 50 556 349 HOH WAT . O 4 HOH C 51 557 350 HOH WAT . O 4 HOH C 52 558 351 HOH WAT . O 4 HOH C 53 559 352 HOH WAT . O 4 HOH C 54 560 353 HOH WAT . P 4 HOH D 1 223 223 HOH WAT . P 4 HOH D 2 400 400 HOH WAT . P 4 HOH D 3 401 401 HOH WAT . P 4 HOH D 4 402 402 HOH WAT . P 4 HOH D 5 403 403 HOH WAT . P 4 HOH D 6 404 404 HOH WAT . P 4 HOH D 7 405 405 HOH WAT . P 4 HOH D 8 406 406 HOH WAT . P 4 HOH D 9 407 407 HOH WAT . P 4 HOH D 10 408 408 HOH WAT . P 4 HOH D 11 409 409 HOH WAT . P 4 HOH D 12 410 410 HOH WAT . P 4 HOH D 13 411 411 HOH WAT . P 4 HOH D 14 412 412 HOH WAT . P 4 HOH D 15 413 413 HOH WAT . P 4 HOH D 16 414 414 HOH WAT . P 4 HOH D 17 415 415 HOH WAT . P 4 HOH D 18 416 416 HOH WAT . P 4 HOH D 19 417 417 HOH WAT . P 4 HOH D 20 418 418 HOH WAT . P 4 HOH D 21 419 419 HOH WAT . P 4 HOH D 22 420 420 HOH WAT . P 4 HOH D 23 421 421 HOH WAT . P 4 HOH D 24 422 422 HOH WAT . P 4 HOH D 25 423 423 HOH WAT . P 4 HOH D 26 424 424 HOH WAT . P 4 HOH D 27 425 425 HOH WAT . P 4 HOH D 28 426 426 HOH WAT . P 4 HOH D 29 427 427 HOH WAT . P 4 HOH D 30 428 428 HOH WAT . P 4 HOH D 31 429 429 HOH WAT . P 4 HOH D 32 430 430 HOH WAT . P 4 HOH D 33 431 431 HOH WAT . P 4 HOH D 34 432 432 HOH WAT . P 4 HOH D 35 433 433 HOH WAT . P 4 HOH D 36 434 434 HOH WAT . P 4 HOH D 37 435 435 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CU _atom_site.label_atom_id CU _atom_site.label_comp_id CU _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id F _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 17.523 _atom_site.Cartn_y 3.275 _atom_site.Cartn_z -0.713 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 42.91 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CU _atom_site.auth_comp_id CU _atom_site.auth_seq_id 502 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 15 _model_server_stats.query_time_ms 286 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #