data_1F28
#
_model_server_result.job_id            Shxc0-bjGKxFnc2ujrUP2w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-24 22:55:46' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1f28 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"F","auth_seq_id":401}' 
#
_entry.id    1F28 
#
_exptl.entry_id    1F28 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              500.503 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'S)-2-(5(((1,2-DIHYDRO-3-METHYL-1-OXOBENZO(F)QUINAZOLIN-9-YL)METHYL)AMINO)1-OXO-2-ISOINDOLINYL)GLUTARIC ACID' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    4 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90.24 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1F28 
_cell.length_a            54.442 
_cell.length_b            65.898 
_cell.length_c            184.938 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1F28 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,E,F,G,H,M,N 1 1 
C,D,I,J,K,L,O,P 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 F N N 
? 3 H N N 
? 3 J N N 
? 3 L N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A SG CYS 173 A CYS 173 1_555 E C6 UMP . A UMP 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.883 ? 
covale ? covale2 C SG CYS 173 C CYS 173 1_555 I C6 UMP . C UMP 303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.876 ? 
#
_chem_comp.formula           'C27 H24 N4 O6' 
_chem_comp.formula_weight    500.503 
_chem_comp.id                F89 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'S)-2-(5(((1,2-DIHYDRO-3-METHYL-1-OXOBENZO(F)QUINAZOLIN-9-YL)METHYL)AMINO)1-OXO-2-ISOINDOLINYL)GLUTARIC ACID' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     'FOLATE ANALOG 1843U89' 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1A F89 doub 83 n n 
C1 N2 F89 sing 84 n y 
C1 C1A F89 sing 85 n y 
N2 C3 F89 sing 86 n y 
N2 HN2 F89 sing 87 n n 
C3 C3M F89 sing 88 n n 
C3 N4 F89 doub 89 n y 
C3M H3M1 F89 sing 90 n n 
C3M H3M2 F89 sing 91 n n 
C3M H3M3 F89 sing 92 n n 
N4 C4A F89 sing 93 n y 
C4A C5 F89 doub 94 n y 
C4A C1A F89 sing 95 n y 
C5 C6 F89 sing 96 n y 
C5 H5 F89 sing 97 n n 
C6 C6A F89 doub 98 n y 
C6 H6 F89 sing 99 n n 
C6A C7 F89 sing 100 n y 
C6A C1B F89 sing 101 n y 
C7 C8 F89 doub 102 n y 
C7 H7 F89 sing 103 n n 
C8 C9 F89 sing 104 n y 
C8 H8 F89 sing 105 n n 
C9 C10 F89 doub 106 n y 
C9 C11 F89 sing 107 n n 
C10 C1B F89 sing 108 n y 
C10 H10 F89 sing 109 n n 
C1B C1A F89 doub 110 n y 
C11 N12 F89 sing 111 n n 
C11 H111 F89 sing 112 n n 
C11 H112 F89 sing 113 n n 
N12 C13 F89 sing 114 n n 
N12 HN12 F89 sing 115 n n 
C13 C14 F89 doub 116 n y 
C13 C18 F89 sing 117 n y 
C14 C15 F89 sing 118 n y 
C14 H14 F89 sing 119 n n 
C15 C16 F89 doub 120 n y 
C15 C19 F89 sing 121 n n 
C16 C17 F89 sing 122 n y 
C16 C F89 sing 123 n n 
C17 C18 F89 doub 124 n y 
C17 H17 F89 sing 125 n n 
C18 H18 F89 sing 126 n n 
C19 N F89 sing 127 n n 
C19 H191 F89 sing 128 n n 
C19 H192 F89 sing 129 n n 
C O F89 doub 130 n n 
C N F89 sing 131 n n 
N CA F89 sing 132 n n 
CA CT F89 sing 133 n n 
CA CB F89 sing 134 n n 
CA HA F89 sing 135 n n 
CT O1 F89 doub 136 n n 
CT O2 F89 sing 137 n n 
O2 HO2 F89 sing 138 n n 
CB CG F89 sing 139 n n 
CB HB1 F89 sing 140 n n 
CB HB2 F89 sing 141 n n 
CG CD F89 sing 142 n n 
CG HG1 F89 sing 143 n n 
CG HG2 F89 sing 144 n n 
CD OE1 F89 doub 145 n n 
CD OE2 F89 sing 146 n n 
OE2 HOE2 F89 sing 147 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1F28 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.018368 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000076 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.015175 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.005407 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
E 2 UMP A 1 301 301 UMP UMP . 
F 3 F89 A 1 401 401 F89 F89 . 
G 2 UMP B 1 302 302 UMP UMP . 
H 3 F89 B 1 402 402 F89 F89 . 
I 2 UMP C 1 303 303 UMP UMP . 
J 3 F89 C 1 403 403 F89 F89 . 
K 2 UMP D 1 304 304 UMP UMP . 
L 3 F89 D 1 404 404 F89 F89 . 
M 4 HOH A 1 511 511 HOH WAT . 
M 4 HOH A 2 512 512 HOH WAT . 
M 4 HOH A 3 513 513 HOH WAT . 
M 4 HOH A 4 519 519 HOH WAT . 
M 4 HOH A 5 521 521 HOH WAT . 
M 4 HOH A 6 529 529 HOH WAT . 
M 4 HOH A 7 534 534 HOH WAT . 
M 4 HOH A 8 535 535 HOH WAT . 
M 4 HOH A 9 539 539 HOH WAT . 
M 4 HOH A 10 544 544 HOH WAT . 
M 4 HOH A 11 552 552 HOH WAT . 
M 4 HOH A 12 554 554 HOH WAT . 
M 4 HOH A 13 563 563 HOH WAT . 
M 4 HOH A 14 570 570 HOH WAT . 
M 4 HOH A 15 579 579 HOH WAT . 
M 4 HOH A 16 581 581 HOH WAT . 
M 4 HOH A 17 583 583 HOH WAT . 
M 4 HOH A 18 586 586 HOH WAT . 
M 4 HOH A 19 588 588 HOH WAT . 
M 4 HOH A 20 594 594 HOH WAT . 
M 4 HOH A 21 599 599 HOH WAT . 
M 4 HOH A 22 600 600 HOH WAT . 
M 4 HOH A 23 602 602 HOH WAT . 
M 4 HOH A 24 613 613 HOH WAT . 
M 4 HOH A 25 617 617 HOH WAT . 
M 4 HOH A 26 618 618 HOH WAT . 
M 4 HOH A 27 626 626 HOH WAT . 
M 4 HOH A 28 629 629 HOH WAT . 
M 4 HOH A 29 636 636 HOH WAT . 
M 4 HOH A 30 638 638 HOH WAT . 
M 4 HOH A 31 642 642 HOH WAT . 
M 4 HOH A 32 646 646 HOH WAT . 
M 4 HOH A 33 651 651 HOH WAT . 
M 4 HOH A 34 654 654 HOH WAT . 
M 4 HOH A 35 657 657 HOH WAT . 
M 4 HOH A 36 661 661 HOH WAT . 
M 4 HOH A 37 664 664 HOH WAT . 
M 4 HOH A 38 665 665 HOH WAT . 
M 4 HOH A 39 671 671 HOH WAT . 
M 4 HOH A 40 672 672 HOH WAT . 
M 4 HOH A 41 674 674 HOH WAT . 
M 4 HOH A 42 677 677 HOH WAT . 
M 4 HOH A 43 678 678 HOH WAT . 
M 4 HOH A 44 692 692 HOH WAT . 
M 4 HOH A 45 696 696 HOH WAT . 
M 4 HOH A 46 704 704 HOH WAT . 
M 4 HOH A 47 706 706 HOH WAT . 
M 4 HOH A 48 707 707 HOH WAT . 
M 4 HOH A 49 717 717 HOH WAT . 
M 4 HOH A 50 727 727 HOH WAT . 
M 4 HOH A 51 732 732 HOH WAT . 
M 4 HOH A 52 743 743 HOH WAT . 
M 4 HOH A 53 744 744 HOH WAT . 
M 4 HOH A 54 746 746 HOH WAT . 
M 4 HOH A 55 747 747 HOH WAT . 
M 4 HOH A 56 749 749 HOH WAT . 
M 4 HOH A 57 751 751 HOH WAT . 
M 4 HOH A 58 753 753 HOH WAT . 
M 4 HOH A 59 755 755 HOH WAT . 
M 4 HOH A 60 757 757 HOH WAT . 
M 4 HOH A 61 758 758 HOH WAT . 
M 4 HOH A 62 760 760 HOH WAT . 
M 4 HOH A 63 761 761 HOH WAT . 
M 4 HOH A 64 764 764 HOH WAT . 
M 4 HOH A 65 777 777 HOH WAT . 
M 4 HOH A 66 780 780 HOH WAT . 
M 4 HOH A 67 784 784 HOH WAT . 
M 4 HOH A 68 785 785 HOH WAT . 
M 4 HOH A 69 786 786 HOH WAT . 
M 4 HOH A 70 787 787 HOH WAT . 
M 4 HOH A 71 788 788 HOH WAT . 
M 4 HOH A 72 790 790 HOH WAT . 
M 4 HOH A 73 792 792 HOH WAT . 
M 4 HOH A 74 793 793 HOH WAT . 
M 4 HOH A 75 794 794 HOH WAT . 
M 4 HOH A 76 795 795 HOH WAT . 
M 4 HOH A 77 796 796 HOH WAT . 
M 4 HOH A 78 797 797 HOH WAT . 
M 4 HOH A 79 798 798 HOH WAT . 
M 4 HOH A 80 799 799 HOH WAT . 
M 4 HOH A 81 800 800 HOH WAT . 
M 4 HOH A 82 802 802 HOH WAT . 
M 4 HOH A 83 803 803 HOH WAT . 
M 4 HOH A 84 804 804 HOH WAT . 
M 4 HOH A 85 805 805 HOH WAT . 
M 4 HOH A 86 806 806 HOH WAT . 
M 4 HOH A 87 807 807 HOH WAT . 
M 4 HOH A 88 808 808 HOH WAT . 
M 4 HOH A 89 809 809 HOH WAT . 
M 4 HOH A 90 810 810 HOH WAT . 
M 4 HOH A 91 811 811 HOH WAT . 
M 4 HOH A 92 812 812 HOH WAT . 
M 4 HOH A 93 813 813 HOH WAT . 
M 4 HOH A 94 814 814 HOH WAT . 
M 4 HOH A 95 815 815 HOH WAT . 
M 4 HOH A 96 816 816 HOH WAT . 
M 4 HOH A 97 817 817 HOH WAT . 
M 4 HOH A 98 818 818 HOH WAT . 
M 4 HOH A 99 819 819 HOH WAT . 
M 4 HOH A 100 820 820 HOH WAT . 
M 4 HOH A 101 821 821 HOH WAT . 
M 4 HOH A 102 822 822 HOH WAT . 
M 4 HOH A 103 823 823 HOH WAT . 
M 4 HOH A 104 824 824 HOH WAT . 
M 4 HOH A 105 825 825 HOH WAT . 
M 4 HOH A 106 826 826 HOH WAT . 
M 4 HOH A 107 827 827 HOH WAT . 
M 4 HOH A 108 828 828 HOH WAT . 
M 4 HOH A 109 829 829 HOH WAT . 
M 4 HOH A 110 830 830 HOH WAT . 
M 4 HOH A 111 831 831 HOH WAT . 
M 4 HOH A 112 832 832 HOH WAT . 
M 4 HOH A 113 834 834 HOH WAT . 
M 4 HOH A 114 836 836 HOH WAT . 
M 4 HOH A 115 838 838 HOH WAT . 
M 4 HOH A 116 841 841 HOH WAT . 
M 4 HOH A 117 842 842 HOH WAT . 
M 4 HOH A 118 843 843 HOH WAT . 
M 4 HOH A 119 844 844 HOH WAT . 
M 4 HOH A 120 845 845 HOH WAT . 
M 4 HOH A 121 961 961 HOH WAT . 
N 4 HOH B 1 500 500 HOH WAT . 
N 4 HOH B 2 504 504 HOH WAT . 
N 4 HOH B 3 505 505 HOH WAT . 
N 4 HOH B 4 506 506 HOH WAT . 
N 4 HOH B 5 507 507 HOH WAT . 
N 4 HOH B 6 509 509 HOH WAT . 
N 4 HOH B 7 514 514 HOH WAT . 
N 4 HOH B 8 520 520 HOH WAT . 
N 4 HOH B 9 522 522 HOH WAT . 
N 4 HOH B 10 523 523 HOH WAT . 
N 4 HOH B 11 524 524 HOH WAT . 
N 4 HOH B 12 538 538 HOH WAT . 
N 4 HOH B 13 540 540 HOH WAT . 
N 4 HOH B 14 545 545 HOH WAT . 
N 4 HOH B 15 550 550 HOH WAT . 
N 4 HOH B 16 559 559 HOH WAT . 
N 4 HOH B 17 560 560 HOH WAT . 
N 4 HOH B 18 568 568 HOH WAT . 
N 4 HOH B 19 571 571 HOH WAT . 
N 4 HOH B 20 578 578 HOH WAT . 
N 4 HOH B 21 584 584 HOH WAT . 
N 4 HOH B 22 591 591 HOH WAT . 
N 4 HOH B 23 595 595 HOH WAT . 
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