data_1F2O # _model_server_result.job_id H08YySF8Jmm7kWAOj8Z6xA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 23:16:51' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1f2o # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":905}' # _entry.id 1F2O # _exptl.entry_id 1F2O _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1F2O _cell.length_a 61.99 _cell.length_b 61.99 _cell.length_c 146.87 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1F2O _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id D _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 245 A CYS 245 1_555 A SG CYS 250 A CYS 250 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 3 A ASP 3 1_555 D CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc2 A O ILE 4 A ILE 4 1_555 D CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? metalc ? metalc3 A NE2 HIS 85 A HIS 85 1_555 B ZN ZN . A ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.008 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 97 A ASP 97 1_555 B ZN ZN . A ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 97 A ASP 97 1_555 C ZN ZN . A ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc6 A OE1 GLU 132 A GLU 132 1_555 C ZN ZN . A ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.639 ? metalc ? metalc7 A OE2 GLU 132 A GLU 132 1_555 C ZN ZN . A ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 160 A ASP 160 1_555 B ZN ZN . A ZN 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? metalc ? metalc9 A NE2 HIS 247 A HIS 247 1_555 C ZN ZN . A ZN 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 262 A ASP 262 1_555 D CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.286 ? metalc ? metalc11 A OD2 ASP 266 A ASP 266 1_555 D CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.516 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 266 A ASP 266 1_555 D CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.527 ? metalc ? metalc13 F O HOH . A HOH 349 1_555 D CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? metalc ? metalc14 F O HOH . A HOH 519 1_555 D CA CA . A CA 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.519 ? metalc ? metalc15 B ZN ZN . A ZN 901 1_555 E OXT LEU . A LEU 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.217 ? metalc ? metalc16 C ZN ZN . A ZN 902 1_555 E OXT LEU . A LEU 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.678 ? metalc ? metalc17 C ZN ZN . A ZN 902 1_555 E O LEU . A LEU 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.089 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1F2O _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016132 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.016132 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006809 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN A 1 901 901 ZN ZN . C 2 ZN A 1 902 902 ZN ZN . D 3 CA A 1 905 905 CA CA . E 4 LEU A 1 903 903 LEU LEU . F 5 HOH A 1 301 301 HOH WAT . F 5 HOH A 2 302 302 HOH WAT . F 5 HOH A 3 303 303 HOH WAT . F 5 HOH A 4 304 304 HOH WAT . F 5 HOH A 5 305 305 HOH WAT . F 5 HOH A 6 306 306 HOH WAT . F 5 HOH A 7 307 307 HOH WAT . F 5 HOH A 8 308 308 HOH WAT . F 5 HOH A 9 309 309 HOH WAT . F 5 HOH A 10 310 310 HOH WAT . F 5 HOH A 11 311 311 HOH WAT . F 5 HOH A 12 312 312 HOH WAT . F 5 HOH A 13 313 313 HOH WAT . F 5 HOH A 14 314 314 HOH WAT . F 5 HOH A 15 315 315 HOH WAT . F 5 HOH A 16 316 316 HOH WAT . F 5 HOH A 17 317 317 HOH WAT . F 5 HOH A 18 318 318 HOH WAT . F 5 HOH A 19 319 319 HOH WAT . F 5 HOH A 20 320 320 HOH WAT . F 5 HOH A 21 321 321 HOH WAT . F 5 HOH A 22 322 322 HOH WAT . F 5 HOH A 23 323 323 HOH WAT . F 5 HOH A 24 325 325 HOH WAT . F 5 HOH A 25 326 326 HOH WAT . F 5 HOH A 26 327 327 HOH WAT . F 5 HOH A 27 328 328 HOH WAT . F 5 HOH A 28 330 330 HOH WAT . F 5 HOH A 29 331 331 HOH WAT . F 5 HOH A 30 332 332 HOH WAT . F 5 HOH A 31 333 333 HOH WAT . F 5 HOH A 32 334 334 HOH WAT . F 5 HOH A 33 335 335 HOH WAT . F 5 HOH A 34 336 336 HOH WAT . F 5 HOH A 35 337 337 HOH WAT . F 5 HOH A 36 338 338 HOH WAT . F 5 HOH A 37 339 339 HOH WAT . F 5 HOH A 38 340 340 HOH WAT . F 5 HOH A 39 341 341 HOH WAT . F 5 HOH A 40 342 342 HOH WAT . F 5 HOH A 41 343 343 HOH WAT . F 5 HOH A 42 344 344 HOH WAT . F 5 HOH A 43 345 345 HOH WAT . F 5 HOH A 44 346 346 HOH WAT . F 5 HOH A 45 347 347 HOH WAT . F 5 HOH A 46 349 349 HOH WAT . F 5 HOH A 47 350 350 HOH WAT . F 5 HOH A 48 351 351 HOH WAT . F 5 HOH A 49 352 352 HOH WAT . F 5 HOH A 50 353 353 HOH WAT . F 5 HOH A 51 354 354 HOH WAT . F 5 HOH A 52 355 355 HOH WAT . F 5 HOH A 53 356 356 HOH WAT . F 5 HOH A 54 357 357 HOH WAT . F 5 HOH A 55 359 359 HOH WAT . F 5 HOH A 56 360 360 HOH WAT . F 5 HOH A 57 361 361 HOH WAT . F 5 HOH A 58 362 362 HOH WAT . F 5 HOH A 59 363 363 HOH WAT . F 5 HOH A 60 364 364 HOH WAT . F 5 HOH A 61 366 366 HOH WAT . F 5 HOH A 62 367 367 HOH WAT . F 5 HOH A 63 368 368 HOH WAT . F 5 HOH A 64 369 369 HOH WAT . F 5 HOH A 65 370 370 HOH WAT . F 5 HOH A 66 372 372 HOH WAT . F 5 HOH A 67 373 373 HOH WAT . F 5 HOH A 68 374 374 HOH WAT . F 5 HOH A 69 375 375 HOH WAT . F 5 HOH A 70 376 376 HOH WAT . F 5 HOH A 71 377 377 HOH WAT . F 5 HOH A 72 379 379 HOH WAT . F 5 HOH A 73 380 380 HOH WAT . F 5 HOH A 74 381 381 HOH WAT . F 5 HOH A 75 382 382 HOH WAT . F 5 HOH A 76 383 383 HOH WAT . F 5 HOH A 77 384 384 HOH WAT . F 5 HOH A 78 387 387 HOH WAT . F 5 HOH A 79 389 389 HOH WAT . F 5 HOH A 80 391 391 HOH WAT . F 5 HOH A 81 394 394 HOH WAT . F 5 HOH A 82 395 395 HOH WAT . F 5 HOH A 83 397 397 HOH WAT . F 5 HOH A 84 398 398 HOH WAT . F 5 HOH A 85 402 402 HOH WAT . F 5 HOH A 86 403 403 HOH WAT . F 5 HOH A 87 404 404 HOH WAT . F 5 HOH A 88 405 405 HOH WAT . F 5 HOH A 89 406 406 HOH WAT . F 5 HOH A 90 407 407 HOH WAT . F 5 HOH A 91 408 408 HOH WAT . F 5 HOH A 92 409 409 HOH WAT . F 5 HOH A 93 411 411 HOH WAT . F 5 HOH A 94 412 412 HOH WAT . F 5 HOH A 95 414 414 HOH WAT . F 5 HOH A 96 415 415 HOH WAT . F 5 HOH A 97 416 416 HOH WAT . F 5 HOH A 98 417 417 HOH WAT . F 5 HOH A 99 418 418 HOH WAT . F 5 HOH A 100 419 419 HOH WAT . F 5 HOH A 101 420 420 HOH WAT . F 5 HOH A 102 423 423 HOH WAT . F 5 HOH A 103 426 426 HOH WAT . F 5 HOH A 104 427 427 HOH WAT . F 5 HOH A 105 428 428 HOH WAT . F 5 HOH A 106 429 429 HOH WAT . F 5 HOH A 107 432 432 HOH WAT . F 5 HOH A 108 433 433 HOH WAT . F 5 HOH A 109 435 435 HOH WAT . F 5 HOH A 110 438 438 HOH WAT . F 5 HOH A 111 439 439 HOH WAT . F 5 HOH A 112 440 440 HOH WAT . F 5 HOH A 113 446 446 HOH WAT . F 5 HOH A 114 449 449 HOH WAT . F 5 HOH A 115 452 452 HOH WAT . F 5 HOH A 116 453 453 HOH WAT . F 5 HOH A 117 454 454 HOH WAT . F 5 HOH A 118 460 460 HOH WAT . F 5 HOH A 119 461 461 HOH WAT . F 5 HOH A 120 462 462 HOH WAT . F 5 HOH A 121 463 463 HOH WAT . F 5 HOH A 122 464 464 HOH WAT . F 5 HOH A 123 468 468 HOH WAT . F 5 HOH A 124 469 469 HOH WAT . F 5 HOH A 125 471 471 HOH WAT . F 5 HOH A 126 473 473 HOH WAT . F 5 HOH A 127 477 477 HOH WAT . F 5 HOH A 128 478 478 HOH WAT . F 5 HOH A 129 479 479 HOH WAT . F 5 HOH A 130 481 481 HOH WAT . F 5 HOH A 131 482 482 HOH WAT . F 5 HOH A 132 491 491 HOH WAT . F 5 HOH A 133 492 492 HOH WAT . F 5 HOH A 134 493 493 HOH WAT . F 5 HOH A 135 495 495 HOH WAT . F 5 HOH A 136 501 501 HOH WAT . F 5 HOH A 137 504 504 HOH WAT . F 5 HOH A 138 507 507 HOH WAT . F 5 HOH A 139 508 508 HOH WAT . F 5 HOH A 140 510 510 HOH WAT . F 5 HOH A 141 519 519 HOH WAT . F 5 HOH A 142 521 521 HOH WAT . F 5 HOH A 143 523 523 HOH WAT . F 5 HOH A 144 524 524 HOH WAT . F 5 HOH A 145 525 525 HOH WAT . F 5 HOH A 146 527 527 HOH WAT . F 5 HOH A 147 529 529 HOH WAT . F 5 HOH A 148 530 530 HOH WAT . F 5 HOH A 149 533 533 HOH WAT . F 5 HOH A 150 534 534 HOH WAT . F 5 HOH A 151 536 536 HOH WAT . F 5 HOH A 152 537 537 HOH WAT . F 5 HOH A 153 539 539 HOH WAT . F 5 HOH A 154 540 540 HOH WAT . F 5 HOH A 155 541 541 HOH WAT . F 5 HOH A 156 544 544 HOH WAT . F 5 HOH A 157 547 547 HOH WAT . F 5 HOH A 158 548 548 HOH WAT . F 5 HOH A 159 549 549 HOH WAT . F 5 HOH A 160 550 550 HOH WAT . F 5 HOH A 161 554 554 HOH WAT . F 5 HOH A 162 556 556 HOH WAT . F 5 HOH A 163 558 558 HOH WAT . F 5 HOH A 164 559 559 HOH WAT . F 5 HOH A 165 563 563 HOH WAT . F 5 HOH A 166 564 564 HOH WAT . F 5 HOH A 167 568 568 HOH WAT . F 5 HOH A 168 569 569 HOH WAT . F 5 HOH A 169 574 574 HOH WAT . F 5 HOH A 170 575 575 HOH WAT . F 5 HOH A 171 581 581 HOH WAT . F 5 HOH A 172 583 583 HOH WAT . F 5 HOH A 173 584 584 HOH WAT . F 5 HOH A 174 585 585 HOH WAT . F 5 HOH A 175 586 586 HOH WAT . F 5 HOH A 176 596 596 HOH WAT . F 5 HOH A 177 600 600 HOH WAT . F 5 HOH A 178 604 604 HOH WAT . F 5 HOH A 179 610 610 HOH WAT . F 5 HOH A 180 616 616 HOH WAT . F 5 HOH A 181 617 617 HOH WAT . F 5 HOH A 182 618 618 HOH WAT . F 5 HOH A 183 619 619 HOH WAT . F 5 HOH A 184 620 620 HOH WAT . F 5 HOH A 185 622 622 HOH WAT . F 5 HOH A 186 623 623 HOH WAT . F 5 HOH A 187 624 624 HOH WAT . F 5 HOH A 188 625 625 HOH WAT . F 5 HOH A 189 626 626 HOH WAT . F 5 HOH A 190 628 628 HOH WAT . F 5 HOH A 191 630 630 HOH WAT . F 5 HOH A 192 631 631 HOH WAT . F 5 HOH A 193 632 632 HOH WAT . F 5 HOH A 194 633 633 HOH WAT . F 5 HOH A 195 634 634 HOH WAT . F 5 HOH A 196 635 635 HOH WAT . F 5 HOH A 197 636 636 HOH WAT . F 5 HOH A 198 637 637 HOH WAT . F 5 HOH A 199 639 639 HOH WAT . F 5 HOH A 200 640 640 HOH WAT . F 5 HOH A 201 641 641 HOH WAT . F 5 HOH A 202 642 642 HOH WAT . F 5 HOH A 203 643 643 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id D _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 22.781 _atom_site.Cartn_y 13.325 _atom_site.Cartn_z 28.799 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 11.76 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 905 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 3 _model_server_stats.query_time_ms 311 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #