data_1F5R # _model_server_result.job_id lb_ukhlnOsv0jmbVakxQBw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-02 19:08:10' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1f5r # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":800}' # _entry.id 1F5R # _exptl.entry_id 1F5R _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1F5R _cell.length_a 92.568 _cell.length_b 92.568 _cell.length_c 62.126 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1F5R _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 15 A CYS 22 1_555 A SG CYS 145 A CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 33 A CYS 42 1_555 A SG CYS 49 A CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 117 A CYS 128 1_555 A SG CYS 218 A CYS 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 124 A CYS 136 1_555 A SG CYS 191 A CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 156 A CYS 168 1_555 A SG CYS 170 A CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 181 A CYS 191 1_555 A SG CYS 205 A CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 5 I CYS 5 1_555 B SG CYS 55 I CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 14 I CYS 14 1_555 B SG CYS 38 I CYS 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 30 I CYS 30 1_555 B SG CYS 51 I CYS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 60 A GLU 70 1_555 C CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.317 ? metalc ? metalc2 A O ASN 62 A ASN 72 1_555 C CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.508 ? metalc ? metalc3 A O VAL 65 A VAL 75 1_555 C CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.323 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 67 A GLU 77 1_555 C CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.518 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 70 A GLU 80 1_555 C CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? metalc ? metalc6 D O HOH . A HOH 535 1_555 C CA CA . A CA 800 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.924 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1F5R _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010803 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.006237 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012474 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016096 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 CA A 1 800 800 CA CA . D 4 HOH A 1 501 501 HOH WAT . D 4 HOH A 2 502 502 HOH WAT . D 4 HOH A 3 504 504 HOH WAT . D 4 HOH A 4 506 506 HOH WAT . D 4 HOH A 5 507 507 HOH WAT . D 4 HOH A 6 508 508 HOH WAT . D 4 HOH A 7 509 509 HOH WAT . D 4 HOH A 8 510 510 HOH WAT . D 4 HOH A 9 511 511 HOH WAT . D 4 HOH A 10 512 512 HOH WAT . D 4 HOH A 11 513 513 HOH WAT . D 4 HOH A 12 515 515 HOH WAT . D 4 HOH A 13 516 516 HOH WAT . D 4 HOH A 14 517 517 HOH WAT . D 4 HOH A 15 518 518 HOH WAT . D 4 HOH A 16 519 519 HOH WAT . D 4 HOH A 17 520 520 HOH WAT . D 4 HOH A 18 521 521 HOH WAT . D 4 HOH A 19 523 523 HOH WAT . D 4 HOH A 20 524 524 HOH WAT . D 4 HOH A 21 525 525 HOH WAT . D 4 HOH A 22 526 526 HOH WAT . D 4 HOH A 23 527 527 HOH WAT . D 4 HOH A 24 528 528 HOH WAT . D 4 HOH A 25 529 529 HOH WAT . D 4 HOH A 26 530 530 HOH WAT . D 4 HOH A 27 531 531 HOH WAT . D 4 HOH A 28 532 532 HOH WAT . D 4 HOH A 29 533 533 HOH WAT . D 4 HOH A 30 534 534 HOH WAT . D 4 HOH A 31 535 535 HOH WAT . D 4 HOH A 32 536 536 HOH WAT . D 4 HOH A 33 538 538 HOH WAT . D 4 HOH A 34 539 539 HOH WAT . D 4 HOH A 35 541 541 HOH WAT . D 4 HOH A 36 542 542 HOH WAT . D 4 HOH A 37 543 543 HOH WAT . D 4 HOH A 38 544 544 HOH WAT . D 4 HOH A 39 545 545 HOH WAT . D 4 HOH A 40 546 546 HOH WAT . D 4 HOH A 41 547 547 HOH WAT . D 4 HOH A 42 549 549 HOH WAT . D 4 HOH A 43 550 550 HOH WAT . D 4 HOH A 44 551 551 HOH WAT . D 4 HOH A 45 552 552 HOH WAT . D 4 HOH A 46 553 553 HOH WAT . D 4 HOH A 47 554 554 HOH WAT . D 4 HOH A 48 555 555 HOH WAT . D 4 HOH A 49 556 556 HOH WAT . D 4 HOH A 50 557 557 HOH WAT . D 4 HOH A 51 558 558 HOH WAT . D 4 HOH A 52 559 559 HOH WAT . D 4 HOH A 53 560 560 HOH WAT . D 4 HOH A 54 561 561 HOH WAT . D 4 HOH A 55 562 562 HOH WAT . D 4 HOH A 56 563 563 HOH WAT . D 4 HOH A 57 564 564 HOH WAT . D 4 HOH A 58 565 565 HOH WAT . D 4 HOH A 59 566 566 HOH WAT . D 4 HOH A 60 567 567 HOH WAT . D 4 HOH A 61 569 569 HOH WAT . D 4 HOH A 62 570 570 HOH WAT . D 4 HOH A 63 571 571 HOH WAT . D 4 HOH A 64 572 572 HOH WAT . D 4 HOH A 65 573 573 HOH WAT . D 4 HOH A 66 574 574 HOH WAT . D 4 HOH A 67 575 575 HOH WAT . D 4 HOH A 68 576 576 HOH WAT . D 4 HOH A 69 577 577 HOH WAT . D 4 HOH A 70 579 579 HOH WAT . D 4 HOH A 71 580 580 HOH WAT . D 4 HOH A 72 581 581 HOH WAT . D 4 HOH A 73 582 582 HOH WAT . D 4 HOH A 74 583 583 HOH WAT . D 4 HOH A 75 584 584 HOH WAT . D 4 HOH A 76 585 585 HOH WAT . D 4 HOH A 77 586 586 HOH WAT . D 4 HOH A 78 587 587 HOH WAT . D 4 HOH A 79 588 588 HOH WAT . D 4 HOH A 80 590 590 HOH WAT . D 4 HOH A 81 591 591 HOH WAT . D 4 HOH A 82 592 592 HOH WAT . D 4 HOH A 83 593 593 HOH WAT . D 4 HOH A 84 596 596 HOH WAT . D 4 HOH A 85 597 597 HOH WAT . D 4 HOH A 86 598 598 HOH WAT . D 4 HOH A 87 599 599 HOH WAT . D 4 HOH A 88 600 600 HOH WAT . D 4 HOH A 89 601 601 HOH WAT . D 4 HOH A 90 603 603 HOH WAT . D 4 HOH A 91 604 604 HOH WAT . D 4 HOH A 92 605 605 HOH WAT . D 4 HOH A 93 606 606 HOH WAT . D 4 HOH A 94 607 607 HOH WAT . D 4 HOH A 95 608 608 HOH WAT . D 4 HOH A 96 609 609 HOH WAT . D 4 HOH A 97 610 610 HOH WAT . D 4 HOH A 98 611 611 HOH WAT . D 4 HOH A 99 612 612 HOH WAT . D 4 HOH A 100 613 613 HOH WAT . D 4 HOH A 101 614 614 HOH WAT . D 4 HOH A 102 615 615 HOH WAT . D 4 HOH A 103 616 616 HOH WAT . D 4 HOH A 104 617 617 HOH WAT . D 4 HOH A 105 618 618 HOH WAT . D 4 HOH A 106 619 619 HOH WAT . D 4 HOH A 107 620 620 HOH WAT . D 4 HOH A 108 621 621 HOH WAT . D 4 HOH A 109 623 623 HOH WAT . D 4 HOH A 110 625 625 HOH WAT . D 4 HOH A 111 628 628 HOH WAT . D 4 HOH A 112 629 629 HOH WAT . D 4 HOH A 113 631 631 HOH WAT . D 4 HOH A 114 632 632 HOH WAT . D 4 HOH A 115 633 633 HOH WAT . D 4 HOH A 116 634 634 HOH WAT . D 4 HOH A 117 635 635 HOH WAT . D 4 HOH A 118 637 637 HOH WAT . D 4 HOH A 119 638 638 HOH WAT . D 4 HOH A 120 640 640 HOH WAT . D 4 HOH A 121 642 642 HOH WAT . D 4 HOH A 122 644 644 HOH WAT . D 4 HOH A 123 645 645 HOH WAT . D 4 HOH A 124 646 646 HOH WAT . D 4 HOH A 125 647 647 HOH WAT . D 4 HOH A 126 648 648 HOH WAT . D 4 HOH A 127 650 650 HOH WAT . D 4 HOH A 128 651 651 HOH WAT . D 4 HOH A 129 652 652 HOH WAT . D 4 HOH A 130 654 654 HOH WAT . D 4 HOH A 131 655 655 HOH WAT . D 4 HOH A 132 656 656 HOH WAT . D 4 HOH A 133 658 658 HOH WAT . D 4 HOH A 134 660 660 HOH WAT . D 4 HOH A 135 661 661 HOH WAT . D 4 HOH A 136 662 662 HOH WAT . D 4 HOH A 137 664 664 HOH WAT . D 4 HOH A 138 665 665 HOH WAT . D 4 HOH A 139 666 666 HOH WAT . D 4 HOH A 140 667 667 HOH WAT . D 4 HOH A 141 668 668 HOH WAT . D 4 HOH A 142 670 670 HOH WAT . D 4 HOH A 143 671 671 HOH WAT . D 4 HOH A 144 672 672 HOH WAT . D 4 HOH A 145 674 674 HOH WAT . D 4 HOH A 146 675 675 HOH WAT . D 4 HOH A 147 676 676 HOH WAT . D 4 HOH A 148 677 677 HOH WAT . D 4 HOH A 149 678 678 HOH WAT . D 4 HOH A 150 679 679 HOH WAT . D 4 HOH A 151 680 680 HOH WAT . D 4 HOH A 152 681 681 HOH WAT . D 4 HOH A 153 682 682 HOH WAT . D 4 HOH A 154 683 683 HOH WAT . D 4 HOH A 155 684 684 HOH WAT . D 4 HOH A 156 685 685 HOH WAT . D 4 HOH A 157 686 686 HOH WAT . D 4 HOH A 158 687 687 HOH WAT . D 4 HOH A 159 689 689 HOH WAT . D 4 HOH A 160 693 693 HOH WAT . D 4 HOH A 161 695 695 HOH WAT . D 4 HOH A 162 696 696 HOH WAT . D 4 HOH A 163 697 697 HOH WAT . D 4 HOH A 164 698 698 HOH WAT . D 4 HOH A 165 699 699 HOH WAT . D 4 HOH A 166 701 701 HOH WAT . D 4 HOH A 167 702 702 HOH WAT . D 4 HOH A 168 703 703 HOH WAT . D 4 HOH A 169 706 706 HOH WAT . D 4 HOH A 170 707 707 HOH WAT . D 4 HOH A 171 708 708 HOH WAT . D 4 HOH A 172 711 711 HOH WAT . D 4 HOH A 173 712 712 HOH WAT . D 4 HOH A 174 713 713 HOH WAT . D 4 HOH A 175 715 715 HOH WAT . D 4 HOH A 176 716 716 HOH WAT . D 4 HOH A 177 717 717 HOH WAT . D 4 HOH A 178 718 718 HOH WAT . D 4 HOH A 179 719 719 HOH WAT . D 4 HOH A 180 720 720 HOH WAT . D 4 HOH A 181 721 721 HOH WAT . D 4 HOH A 182 723 723 HOH WAT . D 4 HOH A 183 724 724 HOH WAT . D 4 HOH A 184 725 725 HOH WAT . D 4 HOH A 185 728 728 HOH WAT . D 4 HOH A 186 729 729 HOH WAT . D 4 HOH A 187 730 730 HOH WAT . D 4 HOH A 188 731 731 HOH WAT . D 4 HOH A 189 732 732 HOH WAT . D 4 HOH A 190 733 733 HOH WAT . D 4 HOH A 191 736 736 HOH WAT . D 4 HOH A 192 737 737 HOH WAT . D 4 HOH A 193 739 739 HOH WAT . D 4 HOH A 194 741 741 HOH WAT . D 4 HOH A 195 742 742 HOH WAT . D 4 HOH A 196 743 743 HOH WAT . D 4 HOH A 197 744 744 HOH WAT . D 4 HOH A 198 745 745 HOH WAT . D 4 HOH A 199 746 746 HOH WAT . D 4 HOH A 200 748 748 HOH WAT . D 4 HOH A 201 749 749 HOH WAT . D 4 HOH A 202 750 750 HOH WAT . D 4 HOH A 203 751 751 HOH WAT . D 4 HOH A 204 752 752 HOH WAT . D 4 HOH A 205 754 754 HOH WAT . D 4 HOH A 206 755 755 HOH WAT . D 4 HOH A 207 756 756 HOH WAT . D 4 HOH A 208 759 759 HOH WAT . D 4 HOH A 209 761 761 HOH WAT . D 4 HOH A 210 762 762 HOH WAT . D 4 HOH A 211 764 764 HOH WAT . D 4 HOH A 212 765 765 HOH WAT . D 4 HOH A 213 767 767 HOH WAT . D 4 HOH A 214 770 770 HOH WAT . E 4 HOH I 1 503 503 HOH WAT . E 4 HOH I 2 505 505 HOH WAT . E 4 HOH I 3 514 514 HOH WAT . E 4 HOH I 4 522 522 HOH WAT . E 4 HOH I 5 537 537 HOH WAT . E 4 HOH I 6 540 540 HOH WAT . E 4 HOH I 7 548 548 HOH WAT . E 4 HOH I 8 568 568 HOH WAT . E 4 HOH I 9 578 578 HOH WAT . E 4 HOH I 10 589 589 HOH WAT . E 4 HOH I 11 594 594 HOH WAT . E 4 HOH I 12 595 595 HOH WAT . E 4 HOH I 13 602 602 HOH WAT . E 4 HOH I 14 622 622 HOH WAT . E 4 HOH I 15 624 624 HOH WAT . E 4 HOH I 16 626 626 HOH WAT . E 4 HOH I 17 627 627 HOH WAT . E 4 HOH I 18 630 630 HOH WAT . E 4 HOH I 19 636 636 HOH WAT . E 4 HOH I 20 639 639 HOH WAT . E 4 HOH I 21 641 641 HOH WAT . E 4 HOH I 22 643 643 HOH WAT . E 4 HOH I 23 649 649 HOH WAT . E 4 HOH I 24 653 653 HOH WAT . E 4 HOH I 25 657 657 HOH WAT . E 4 HOH I 26 659 659 HOH WAT . E 4 HOH I 27 663 663 HOH WAT . E 4 HOH I 28 669 669 HOH WAT . E 4 HOH I 29 673 673 HOH WAT . E 4 HOH I 30 688 688 HOH WAT . E 4 HOH I 31 690 690 HOH WAT . E 4 HOH I 32 691 691 HOH WAT . E 4 HOH I 33 692 692 HOH WAT . E 4 HOH I 34 694 694 HOH WAT . E 4 HOH I 35 700 700 HOH WAT . E 4 HOH I 36 704 704 HOH WAT . E 4 HOH I 37 705 705 HOH WAT . E 4 HOH I 38 709 709 HOH WAT . E 4 HOH I 39 710 710 HOH WAT . E 4 HOH I 40 714 714 HOH WAT . E 4 HOH I 41 722 722 HOH WAT . E 4 HOH I 42 726 726 HOH WAT . E 4 HOH I 43 727 727 HOH WAT . E 4 HOH I 44 734 734 HOH WAT . E 4 HOH I 45 735 735 HOH WAT . E 4 HOH I 46 738 738 HOH WAT . E 4 HOH I 47 740 740 HOH WAT . E 4 HOH I 48 747 747 HOH WAT . E 4 HOH I 49 753 753 HOH WAT . E 4 HOH I 50 757 757 HOH WAT . E 4 HOH I 51 758 758 HOH WAT . E 4 HOH I 52 760 760 HOH WAT . E 4 HOH I 53 763 763 HOH WAT . E 4 HOH I 54 766 766 HOH WAT . E 4 HOH I 55 768 768 HOH WAT . E 4 HOH I 56 769 769 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -8.997 _atom_site.Cartn_y -74.905 _atom_site.Cartn_z -13.278 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 21.74 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 800 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 271 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #