data_1FE8 # _model_server_result.job_id NuX1lkqQS-6lTXpEbdm7Lw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 16:06:36' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1fe8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":1001}' # _entry.id 1FE8 # _exptl.entry_id 1FE8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 136.989 _entity.id 6 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CACODYLATE ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 116.2 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1FE8 _cell.length_a 121.8 _cell.length_b 183.6 _cell.length_c 131.8 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1FE8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 3 PISA octadecameric 18 software_defined_assembly 4 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,J,M,N,P,Q,R 1 1 D,E,F,K,O,S,T,U 2 1 G,H,I,L,V,W,X 3 1 A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X 4 1,2 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 63.609529 0 118.258653 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 6 _struct_asym.id N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _pdbx_entity_branch.entity_id 4 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.details ? _pdbx_entity_branch_link.entity_id 4 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 FUC _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_1 . _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O6 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO6 _pdbx_entity_branch_link.atom_stereo_config_2 . _pdbx_entity_branch_link.value_order sing # loop_ _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.hetero _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id 4 n J NAG 1 D 1 NAG H 551 NAG 4 n J FUC 2 D 2 FUC H 552 FUC 4 n K NAG 1 E 1 NAG I 551 NAG 4 n K FUC 2 E 2 FUC I 552 FUC 4 n L NAG 1 F 1 NAG J 551 NAG 4 n L FUC 2 F 2 FUC J 552 FUC # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 8 A CYS 923 1_555 A SG CYS 194 A CYS 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 22 H CYS 22 1_555 B SG CYS 95 H CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 136 H CYS 142 1_555 B SG CYS 191 H CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 C SG CYS 23 L CYS 23 1_555 C SG CYS 88 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? disulf ? disulf5 C SG CYS 134 L CYS 134 1_555 C SG CYS 194 L CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf6 D SG CYS 8 B CYS 923 1_555 D SG CYS 194 B CYS 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf7 E SG CYS 22 I CYS 22 1_555 E SG CYS 95 I CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? disulf ? disulf8 E SG CYS 136 I CYS 142 1_555 E SG CYS 191 I CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf9 F SG CYS 23 M CYS 23 1_555 F SG CYS 88 M CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.058 ? disulf ? disulf10 F SG CYS 134 M CYS 134 1_555 F SG CYS 194 M CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.051 ? disulf ? disulf11 G SG CYS 8 C CYS 923 1_555 G SG CYS 194 C CYS 1109 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf12 H SG CYS 22 J CYS 22 1_555 H SG CYS 95 J CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.04 ? disulf ? disulf13 H SG CYS 136 J CYS 142 1_555 H SG CYS 191 J CYS 197 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? disulf ? disulf14 I SG CYS 23 N CYS 23 1_555 I SG CYS 88 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? disulf ? disulf15 I SG CYS 134 N CYS 134 1_555 I SG CYS 194 N CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? covale ? covale1 A C GLU 31 A GLU 946 1_555 A N MSE 32 A MSE 947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.332 ? covale ? covale2 A C MSE 32 A MSE 947 1_555 A N LYS 33 A LYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale3 A C VAL 82 A VAL 997 1_555 A N MSE 83 A MSE 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale4 A C MSE 83 A MSE 998 1_555 A N GLN 84 A GLN 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale5 A C GLU 106 A GLU 1021 1_555 A N MSE 107 A MSE 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale6 A C MSE 107 A MSE 1022 1_555 A N HIS 108 A HIS 1023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.334 ? covale ? covale7 A C THR 181 A THR 1096 1_555 A N MSE 182 A MSE 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.32 ? covale ? covale8 A C MSE 182 A MSE 1097 1_555 A N VAL 183 A VAL 1098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale9 B ND2 ASN 56 H ASN 56 1_555 J C1 NAG . D NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? covale ? covale10 D C GLU 31 B GLU 946 1_555 D N MSE 32 B MSE 947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale11 D C MSE 32 B MSE 947 1_555 D N LYS 33 B LYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? covale ? covale12 D C VAL 82 B VAL 997 1_555 D N MSE 83 B MSE 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale13 D C MSE 83 B MSE 998 1_555 D N GLN 84 B GLN 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale14 D C GLU 106 B GLU 1021 1_555 D N MSE 107 B MSE 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale15 D C MSE 107 B MSE 1022 1_555 D N HIS 108 B HIS 1023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale16 D C THR 181 B THR 1096 1_555 D N MSE 182 B MSE 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? covale ? covale17 D C MSE 182 B MSE 1097 1_555 D N VAL 183 B VAL 1098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale18 E ND2 ASN 56 I ASN 56 1_555 K C1 NAG . E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? covale ? covale19 G C GLU 31 C GLU 946 1_555 G N MSE 32 C MSE 947 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale20 G C MSE 32 C MSE 947 1_555 G N LYS 33 C LYS 948 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale21 G C VAL 82 C VAL 997 1_555 G N MSE 83 C MSE 998 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? covale ? covale22 G C MSE 83 C MSE 998 1_555 G N GLN 84 C GLN 999 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale23 G C GLU 106 C GLU 1021 1_555 G N MSE 107 C MSE 1022 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? covale ? covale24 G C MSE 107 C MSE 1022 1_555 G N HIS 108 C HIS 1023 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.333 ? covale ? covale25 G C THR 181 C THR 1096 1_555 G N MSE 182 C MSE 1097 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? covale ? covale26 G C MSE 182 C MSE 1097 1_555 G N VAL 183 C VAL 1098 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.33 ? covale ? covale27 H ND2 ASN 56 J ASN 56 1_555 L C1 NAG . F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.45 ? covale ? covale28 J O6 NAG . D NAG 1 1_555 J C1 FUC . D FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? covale ? covale29 K O6 NAG . E NAG 1 1_555 K C1 FUC . E FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? covale ? covale30 L O6 NAG . F NAG 1 1_555 L C1 FUC . F FUC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? # _chem_comp.formula 'C2 H6 As O2 -1' _chem_comp.formula_weight 136.989 _chem_comp.id CAC _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CACODYLATE ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms dimethylarsinate # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag AS O1 CAC doub 70 n n AS O2 CAC sing 71 n n AS C1 CAC sing 72 n n AS C2 CAC sing 73 n n C1 H11 CAC sing 74 n n C1 H12 CAC sing 75 n n C1 H13 CAC sing 76 n n C2 H21 CAC sing 77 n n C2 H22 CAC sing 78 n n C2 H23 CAC sing 79 n n # _atom_sites.entry_id 1FE8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00821 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.00404 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005447 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008456 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code M 5 NAG H 1 553 553 NAG NAG . 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