data_1FHF # _model_server_result.job_id VPBbcNg9UIJgBkBwD4IMMQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 23:22:07' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1fhf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":2001}' # _entry.id 1FHF # _exptl.entry_id 1FHF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 122.143 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1FHF _cell.length_a 106.454 _cell.length_b 106.454 _cell.length_c 104.996 _cell.Z_PDB 9 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1FHF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 144 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,E,F,G,H,S 1 1 B,I,J,K,L,M,T 2 1 C,N,O,P,Q,R,U 3 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 G N N ? 4 H N N ? 4 L N N ? 4 M N N ? 4 Q N N ? 4 R N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 11 A CYS 11 1_555 A SG CYS 91 A CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 44 A CYS 44 1_555 A SG CYS 49 A CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 97 A CYS 97 1_555 A SG CYS 299 A CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 176 A CYS 176 1_555 A SG CYS 208 A CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 11 B CYS 11 1_555 B SG CYS 91 B CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 44 B CYS 44 1_555 B SG CYS 49 B CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 97 B CYS 97 1_555 B SG CYS 299 B CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 176 B CYS 176 1_555 B SG CYS 208 B CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 11 C CYS 11 1_555 C SG CYS 91 C CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 44 C CYS 44 1_555 C SG CYS 49 C CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 97 C CYS 97 1_555 C SG CYS 299 C CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 176 C CYS 176 1_555 C SG CYS 208 C CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc1 A O ASP 43 A ASP 43 1_555 D CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 43 A ASP 43 1_555 D CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc3 A O VAL 46 A VAL 46 1_555 D CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc4 A O GLY 48 A GLY 48 1_555 D CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 50 A ASP 50 1_555 D CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? metalc ? metalc6 A OG SER 52 A SER 52 1_555 D CA CA . A CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc7 A NE2 HIS 169 A HIS 169 1_555 F FE HEM . A HEM 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc ? metalc8 A OG1 THR 170 A THR 170 1_555 E CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc9 A O THR 170 A THR 170 1_555 E CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc10 A OD2 ASP 221 A ASP 221 1_555 E CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc11 A OG1 THR 224 A THR 224 1_555 E CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc12 A O THR 224 A THR 224 1_555 E CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc ? metalc13 A O GLN 227 A GLN 227 1_555 E CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 229 A ASP 229 1_555 E CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc15 B O ASP 43 B ASP 43 1_555 I CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc16 B OD1 ASP 43 B ASP 43 1_555 I CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc17 B O VAL 46 B VAL 46 1_555 I CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc18 B O GLY 48 B GLY 48 1_555 I CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc19 B OD1 ASP 50 B ASP 50 1_555 I CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? metalc ? metalc20 B OG SER 52 B SER 52 1_555 I CA CA . B CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc21 B NE2 HIS 169 B HIS 169 1_555 K FE HEM . B HEM 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc22 B O THR 170 B THR 170 1_555 J CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc23 B OG1 THR 170 B THR 170 1_555 J CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc24 B OD2 ASP 221 B ASP 221 1_555 J CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc25 B O THR 224 B THR 224 1_555 J CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc ? metalc26 B OG1 THR 224 B THR 224 1_555 J CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc27 B O GLN 227 B GLN 227 1_555 J CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc28 B OD1 ASP 229 B ASP 229 1_555 J CA CA . B CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc29 C OD1 ASP 43 C ASP 43 1_555 N CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc30 C O ASP 43 C ASP 43 1_555 N CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? metalc ? metalc31 C O VAL 46 C VAL 46 1_555 N CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc32 C O GLY 48 C GLY 48 1_555 N CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc33 C OD1 ASP 50 C ASP 50 1_555 N CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? metalc ? metalc34 C OG SER 52 C SER 52 1_555 N CA CA . C CA 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc35 C NE2 HIS 169 C HIS 169 1_555 P FE HEM . C HEM 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc36 C O THR 170 C THR 170 1_555 O CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc37 C OG1 THR 170 C THR 170 1_555 O CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc38 C OD2 ASP 221 C ASP 221 1_555 O CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc39 C OG1 THR 224 C THR 224 1_555 O CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc40 C O THR 224 C THR 224 1_555 O CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc41 C O GLN 227 C GLN 227 1_555 O CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc42 C OD1 ASP 229 C ASP 229 1_555 O CA CA . C CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? # _chem_comp.formula 'C4 H12 N O3 1' _chem_comp.formula_weight 122.143 _chem_comp.id TRS _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'TRIS BUFFER' # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C C1 TRS sing 416 n n C C2 TRS sing 417 n n C C3 TRS sing 418 n n C N TRS sing 419 n n C1 O1 TRS sing 420 n n C1 H11 TRS sing 421 n n C1 H12 TRS sing 422 n n C2 O2 TRS sing 423 n n C2 H21 TRS sing 424 n n C2 H22 TRS sing 425 n n C3 O3 TRS sing 426 n n C3 H31 TRS sing 427 n n C3 H32 TRS sing 428 n n N HN1 TRS sing 429 n n N HN2 TRS sing 430 n n N HN3 TRS sing 431 n n O1 HO1 TRS sing 432 n n O2 HO2 TRS sing 433 n n O3 HO3 TRS sing 434 n n # _atom_sites.entry_id 1FHF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009394 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.005423 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010847 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009524 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 CA A 1 501 501 CA CA . E 2 CA A 1 502 502 CA CA . F 3 HEM A 1 350 350 HEM HEM . G 4 TRS A 1 2001 2001 TRS TRS . H 4 TRS A 1 2002 2002 TRS TRS . I 2 CA B 1 501 501 CA CA . J 2 CA B 1 502 502 CA CA . K 3 HEM B 1 350 350 HEM HEM . L 4 TRS B 1 4001 4001 TRS TRS . M 4 TRS B 1 4002 4002 TRS TRS . N 2 CA C 1 501 501 CA CA . O 2 CA C 1 502 502 CA CA . P 3 HEM C 1 350 350 HEM HEM . Q 4 TRS C 1 6001 6001 TRS TRS . R 4 TRS C 1 6002 6002 TRS TRS . S 5 HOH A 1 1001 1001 HOH HOH . S 5 HOH A 2 1002 1002 HOH HOH . S 5 HOH A 3 1003 1003 HOH HOH . S 5 HOH A 4 1004 1004 HOH HOH . T 5 HOH B 1 3001 3001 HOH HOH . T 5 HOH B 2 3002 3002 HOH HOH . T 5 HOH B 3 3003 3003 HOH HOH . T 5 HOH B 4 3004 3004 HOH HOH . U 5 HOH C 1 5001 5001 HOH HOH . U 5 HOH C 2 5002 5002 HOH HOH . U 5 HOH C 3 5003 5003 HOH HOH . U 5 HOH C 4 5004 5004 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C TRS . . . G 4 -3.657 56.791 -12.877 1 38.03 ? C TRS 2001 A 1 HETATM 2 C C1 TRS . . . G 4 -3.123 57.765 -11.794 1 38.45 ? C1 TRS 2001 A 1 HETATM 3 C C2 TRS . . . G 4 -2.969 55.558 -12.745 1 36.76 ? C2 TRS 2001 A 1 HETATM 4 C C3 TRS . . . G 4 -3.455 57.507 -14.23 1 37.72 ? C3 TRS 2001 A 1 HETATM 5 N N TRS . . . G 4 -5.103 56.568 -12.663 1 38.43 ? N TRS 2001 A 1 HETATM 6 O O1 TRS . . . G 4 -3.987 58.778 -11.519 1 37.61 ? O1 TRS 2001 A 1 HETATM 7 O O2 TRS . . . G 4 -3.086 54.832 -11.557 1 36.26 ? O2 TRS 2001 A 1 HETATM 8 O O3 TRS . . . G 4 -3.869 56.823 -15.38 1 37.63 ? O3 TRS 2001 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 273 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 8 #