data_1FHF # _model_server_result.job_id zlgwjaXGAcLWvRgK3eVwRg _model_server_result.datetime_utc '2024-10-13 17:12:37' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1fhf # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":350}' # _entry.id 1FHF # _exptl.entry_id 1FHF _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 616.487 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' _entity.pdbx_number_of_molecules 3 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1FHF _cell.length_a 106.454 _cell.length_b 106.454 _cell.length_c 104.996 _cell.Z_PDB 9 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1FHF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 144 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 ? monomeric 1 author_defined_assembly 3 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,D,E,F,G,H,S 1 1 B,I,J,K,L,M,T 2 1 C,N,O,P,Q,R,U 3 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 F N N ? 3 K N N ? 3 P N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 11 A CYS 11 1_555 A SG CYS 91 A CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 44 A CYS 44 1_555 A SG CYS 49 A CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 97 A CYS 97 1_555 A SG CYS 299 A CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 176 A CYS 176 1_555 A SG CYS 208 A CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 11 B CYS 11 1_555 B SG CYS 91 B CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 44 B CYS 44 1_555 B SG CYS 49 B CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 97 B CYS 97 1_555 B SG CYS 299 B CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 176 B CYS 176 1_555 B SG CYS 208 B CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf9 C SG CYS 11 C CYS 11 1_555 C SG CYS 91 C CYS 91 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 44 C CYS 44 1_555 C SG CYS 49 C CYS 49 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 97 C CYS 97 1_555 C SG CYS 299 C CYS 299 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 176 C CYS 176 1_555 C SG CYS 208 C CYS 208 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? metalc ? metalc1 A NE2 HIS 169 A HIS 169 1_555 F FE HEM . A HEM 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.243 ? metalc ? metalc2 B NE2 HIS 169 B HIS 169 1_555 K FE HEM . B HEM 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc3 C NE2 HIS 169 C HIS 169 1_555 P FE HEM . C HEM 350 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.242 ? metalc ? metalc4 D CA CA . A CA 501 1_555 A O ASP 43 A ASP 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc5 D CA CA . A CA 501 1_555 A OG SER 52 A SER 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc6 D CA CA . A CA 501 1_555 A OD1 ASP 43 A ASP 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.355 ? metalc ? metalc7 D CA CA . A CA 501 1_555 A O GLY 48 A GLY 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc8 D CA CA . A CA 501 1_555 A OD1 ASP 50 A ASP 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? metalc ? metalc9 D CA CA . A CA 501 1_555 A O VAL 46 A VAL 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc10 E CA CA . A CA 502 1_555 A OD2 ASP 221 A ASP 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc11 E CA CA . A CA 502 1_555 A OG1 THR 224 A THR 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.335 ? metalc ? metalc12 E CA CA . A CA 502 1_555 A OG1 THR 170 A THR 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.265 ? metalc ? metalc13 E CA CA . A CA 502 1_555 A O GLN 227 A GLN 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc14 E CA CA . A CA 502 1_555 A O THR 170 A THR 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc15 E CA CA . A CA 502 1_555 A O THR 224 A THR 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc ? metalc16 E CA CA . A CA 502 1_555 A OD1 ASP 229 A ASP 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc17 I CA CA . B CA 501 1_555 B OD1 ASP 50 B ASP 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? metalc ? metalc18 I CA CA . B CA 501 1_555 B OG SER 52 B SER 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.344 ? metalc ? metalc19 I CA CA . B CA 501 1_555 B O ASP 43 B ASP 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? metalc ? metalc20 I CA CA . B CA 501 1_555 B O VAL 46 B VAL 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc21 I CA CA . B CA 501 1_555 B O GLY 48 B GLY 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.649 ? metalc ? metalc22 I CA CA . B CA 501 1_555 B OD1 ASP 43 B ASP 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc23 J CA CA . B CA 502 1_555 B O THR 170 B THR 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc24 J CA CA . B CA 502 1_555 B OG1 THR 170 B THR 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc25 J CA CA . B CA 502 1_555 B OD2 ASP 221 B ASP 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.483 ? metalc ? metalc26 J CA CA . B CA 502 1_555 B O THR 224 B THR 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.829 ? metalc ? metalc27 J CA CA . B CA 502 1_555 B OD1 ASP 229 B ASP 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.523 ? metalc ? metalc28 J CA CA . B CA 502 1_555 B OG1 THR 224 B THR 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc29 J CA CA . B CA 502 1_555 B O GLN 227 B GLN 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc30 N CA CA . C CA 501 1_555 C O VAL 46 C VAL 46 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc31 N CA CA . C CA 501 1_555 C OG SER 52 C SER 52 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.343 ? metalc ? metalc32 N CA CA . C CA 501 1_555 C O GLY 48 C GLY 48 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.65 ? metalc ? metalc33 N CA CA . C CA 501 1_555 C OD1 ASP 43 C ASP 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.356 ? metalc ? metalc34 N CA CA . C CA 501 1_555 C O ASP 43 C ASP 43 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.55 ? metalc ? metalc35 N CA CA . C CA 501 1_555 C OD1 ASP 50 C ASP 50 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? metalc ? metalc36 O CA CA . C CA 502 1_555 C O GLN 227 C GLN 227 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.278 ? metalc ? metalc37 O CA CA . C CA 502 1_555 C O THR 170 C THR 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.538 ? metalc ? metalc38 O CA CA . C CA 502 1_555 C OD2 ASP 221 C ASP 221 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.484 ? metalc ? metalc39 O CA CA . C CA 502 1_555 C OG1 THR 224 C THR 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.336 ? metalc ? metalc40 O CA CA . C CA 502 1_555 C O THR 224 C THR 224 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc41 O CA CA . C CA 502 1_555 C OG1 THR 170 C THR 170 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.264 ? metalc ? metalc42 O CA CA . C CA 502 1_555 C OD1 ASP 229 C ASP 229 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.524 ? # _chem_comp.formula 'C34 H32 Fe N4 O4' _chem_comp.formula_weight 616.487 _chem_comp.id HEM _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms HEME # _atom_sites.entry_id 1FHF _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.009394 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.005423 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010847 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.009524 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 2 CA A 1 501 501 CA CA . E 2 CA A 1 502 502 CA CA . F 3 HEM A 1 350 350 HEM HEM . G 4 TRS A 1 2001 2001 TRS TRS . H 4 TRS A 1 2002 2002 TRS TRS . I 2 CA B 1 501 501 CA CA . J 2 CA B 1 502 502 CA CA . K 3 HEM B 1 350 350 HEM HEM . L 4 TRS B 1 4001 4001 TRS TRS . M 4 TRS B 1 4002 4002 TRS TRS . N 2 CA C 1 501 501 CA CA . O 2 CA C 1 502 502 CA CA . P 3 HEM C 1 350 350 HEM HEM . Q 4 TRS C 1 6001 6001 TRS TRS . R 4 TRS C 1 6002 6002 TRS TRS . S 5 HOH A 1 1001 1001 HOH HOH . S 5 HOH A 2 1002 1002 HOH HOH . S 5 HOH A 3 1003 1003 HOH HOH . S 5 HOH A 4 1004 1004 HOH HOH . T 5 HOH B 1 3001 3001 HOH HOH . T 5 HOH B 2 3002 3002 HOH HOH . T 5 HOH B 3 3003 3003 HOH HOH . T 5 HOH B 4 3004 3004 HOH HOH . U 5 HOH C 1 5001 5001 HOH HOH . U 5 HOH C 2 5002 5002 HOH HOH . U 5 HOH C 3 5003 5003 HOH HOH . U 5 HOH C 4 5004 5004 HOH HOH . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C CHA HEM . . . K 3 55.279 25.871 40.173 1 8.36 ? CHA HEM 350 B 1 HETATM 2 C CHB HEM . . . K 3 56.932 22.605 43.409 1 13.68 ? CHB HEM 350 B 1 HETATM 3 C CHC HEM . . . K 3 54.947 19.004 40.802 1 9.87 ? CHC HEM 350 B 1 HETATM 4 C CHD HEM . . . K 3 53.34 22.228 37.54 1 10.33 ? CHD HEM 350 B 1 HETATM 5 C C1A HEM . . . K 3 55.791 25.305 41.352 1 11.27 ? C1A HEM 350 B 1 HETATM 6 C C2A HEM . . . K 3 56.484 26.106 42.431 1 12.5 ? C2A HEM 350 B 1 HETATM 7 C C3A HEM . . . K 3 56.938 25.158 43.325 1 12.73 ? C3A HEM 350 B 1 HETATM 8 C C4A HEM . . . K 3 56.591 23.81 42.777 1 12.8 ? C4A HEM 350 B 1 HETATM 9 C CMA HEM . . . K 3 57.684 25.428 44.646 1 9.54 ? CMA HEM 350 B 1 HETATM 10 C CAA HEM . . . K 3 56.944 27.596 42.335 1 15.42 ? CAA HEM 350 B 1 HETATM 11 C CBA HEM . . . K 3 57.145 28.624 43.473 1 15.91 ? CBA HEM 350 B 1 HETATM 12 C CGA HEM . . . K 3 55.969 29.594 43.635 1 15.59 ? CGA HEM 350 B 1 HETATM 13 O O1A HEM . . . K 3 55.522 30.17 42.623 1 18.12 ? O1A HEM 350 B 1 HETATM 14 O O2A HEM . . . K 3 55.494 29.792 44.775 1 12.33 ? O2A HEM 350 B 1 HETATM 15 C C1B HEM . . . K 3 56.561 21.339 42.957 1 12.01 ? C1B HEM 350 B 1 HETATM 16 C C2B HEM . . . K 3 57.043 20.076 43.564 1 11.57 ? C2B HEM 350 B 1 HETATM 17 C C3B HEM . . . K 3 56.482 19.052 42.835 1 11.48 ? C3B HEM 350 B 1 HETATM 18 C C4B HEM . . . K 3 55.674 19.694 41.759 1 11.18 ? C4B HEM 350 B 1 HETATM 19 C CMB HEM . . . K 3 58.011 19.893 44.744 1 9.16 ? CMB HEM 350 B 1 HETATM 20 C CAB HEM . . . K 3 56.638 17.703 43.183 1 11.43 ? CAB HEM 350 B 1 HETATM 21 C CBB HEM . . . K 3 56.808 16.552 42.316 1 10.49 ? CBB HEM 350 B 1 HETATM 22 C C1C HEM . . . K 3 54.266 19.595 39.755 1 10.77 ? C1C HEM 350 B 1 HETATM 23 C C2C HEM . . . K 3 53.353 18.858 38.893 1 11.44 ? C2C HEM 350 B 1 HETATM 24 C C3C HEM . . . K 3 52.847 19.762 38.005 1 11.87 ? C3C HEM 350 B 1 HETATM 25 C C4C HEM . . . K 3 53.501 21.055 38.295 1 11.25 ? C4C HEM 350 B 1 HETATM 26 C CMC HEM . . . K 3 52.977 17.382 39 1 11.45 ? CMC HEM 350 B 1 HETATM 27 C CAC HEM . . . K 3 51.844 19.524 37.061 1 12.43 ? CAC HEM 350 B 1 HETATM 28 C CBC HEM . . . K 3 51.872 18.43 36.084 1 11.53 ? CBC HEM 350 B 1 HETATM 29 C C1D HEM . . . K 3 53.844 23.483 37.922 1 9.37 ? C1D HEM 350 B 1 HETATM 30 C C2D HEM . . . K 3 53.683 24.718 37.162 1 8.49 ? C2D HEM 350 B 1 HETATM 31 C C3D HEM . . . K 3 54.208 25.73 37.914 1 8.63 ? C3D HEM 350 B 1 HETATM 32 C C4D HEM . . . K 3 54.744 25.127 39.113 1 8.52 ? C4D HEM 350 B 1 HETATM 33 C CMD HEM . . . K 3 53.076 24.846 35.771 1 7.37 ? CMD HEM 350 B 1 HETATM 34 C CAD HEM . . . K 3 54.124 27.24 37.659 1 10.06 ? CAD HEM 350 B 1 HETATM 35 C CBD HEM . . . K 3 52.693 27.741 37.488 1 10.57 ? CBD HEM 350 B 1 HETATM 36 C CGD HEM . . . K 3 52.602 29.248 37.425 1 9.53 ? CGD HEM 350 B 1 HETATM 37 O O1D HEM . . . K 3 53.439 29.86 36.73 1 9.61 ? O1D HEM 350 B 1 HETATM 38 O O2D HEM . . . K 3 51.69 29.818 38.059 1 8.62 ? O2D HEM 350 B 1 HETATM 39 N NA HEM . . . K 3 55.868 23.888 41.571 1 11.47 ? NA HEM 350 B 1 HETATM 40 N NB HEM . . . K 3 55.772 21.109 41.805 1 11 ? NB HEM 350 B 1 HETATM 41 N NC HEM . . . K 3 54.308 20.962 39.448 1 10.75 ? NC HEM 350 B 1 HETATM 42 N ND HEM . . . K 3 54.556 23.722 39.121 1 9.68 ? ND HEM 350 B 1 HETATM 43 FE FE HEM . . . K 3 55.175 22.411 40.459 1 12.62 ? FE HEM 350 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 15 _model_server_stats.query_time_ms 294 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 43 #