data_1FJT # _model_server_result.job_id XBwSuxUitnbOfzlIjbOKgw _model_server_result.datetime_utc '2025-04-06 04:08:23' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1fjt # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"G","auth_seq_id":374}' # _entry.id 1FJT # _exptl.entry_id 1FJT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 78.133 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'DIMETHYL SULFOXIDE' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1FJT _cell.length_a 93.811 _cell.length_b 93.811 _cell.length_c 131.101 _cell.Z_PDB 12 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1FJT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 178 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 61 2 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 4 _struct_asym.id G _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 H C VAL . A VAL 506 1_555 I N LYS . A LYS 507 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.339 ? metalc ? metalc1 A OD2 ASP 57 A ASP 57 1_555 E CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 57 A ASP 57 1_555 E CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.629 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 59 A ASP 59 1_555 E CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.66 ? metalc ? metalc4 A O GLN 61 A GLN 61 1_555 E CA CA . A CA 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.535 ? metalc ? metalc5 A OD2 ASP 138 A ASP 138 1_555 C CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? metalc ? metalc6 A NE2 HIS 142 A HIS 142 1_555 B ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? metalc ? metalc7 A NE2 HIS 146 A HIS 146 1_555 B ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 166 A GLU 166 1_555 B ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.26 ? metalc ? metalc9 A OE1 GLU 166 A GLU 166 1_555 B ZN ZN . A ZN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? metalc ? metalc10 A OE1 GLU 177 A GLU 177 1_555 C CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.703 ? metalc ? metalc11 A OE2 GLU 177 A GLU 177 1_555 C CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.993 ? metalc ? metalc12 A OE2 GLU 177 A GLU 177 1_555 D CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.61 ? metalc ? metalc13 A O ASN 183 A ASN 183 1_555 D CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.632 ? metalc ? metalc14 A OD1 ASP 185 A ASP 185 1_555 C CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.654 ? metalc ? metalc15 A OD2 ASP 185 A ASP 185 1_555 D CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.559 ? metalc ? metalc16 A O GLU 187 A GLU 187 1_555 C CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 190 A GLU 190 1_555 C CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.751 ? metalc ? metalc18 A OE2 GLU 190 A GLU 190 1_555 C CA CA . A CA 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc19 A OE2 GLU 190 A GLU 190 1_555 D CA CA . A CA 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.602 ? metalc ? metalc20 A O TYR 193 A TYR 193 1_555 F CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.717 ? metalc ? metalc21 A OG1 THR 194 A THR 194 1_555 F CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.67 ? metalc ? metalc22 A O THR 194 A THR 194 1_555 F CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc23 A O ILE 197 A ILE 197 1_555 F CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.689 ? metalc ? metalc24 A OD1 ASP 200 A ASP 200 1_555 F CA CA . A CA 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.631 ? metalc ? metalc25 B ZN ZN . A ZN 501 1_555 J O HOH . A HOH 508 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.949 ? metalc ? metalc26 C CA CA . A CA 502 1_555 J O HOH . A HOH 520 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.62 ? metalc ? metalc27 D CA CA . A CA 503 1_555 J O HOH . A HOH 519 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.584 ? metalc ? metalc28 D CA CA . A CA 503 1_555 J O HOH . A HOH 536 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.609 ? metalc ? metalc29 E CA CA . A CA 504 1_555 J O HOH . A HOH 522 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.563 ? metalc ? metalc30 E CA CA . A CA 504 1_555 J O HOH . A HOH 533 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.755 ? metalc ? metalc31 E CA CA . A CA 504 1_555 J O HOH . A HOH 553 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? metalc ? metalc32 F CA CA . A CA 505 1_555 J O HOH . A HOH 544 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.766 ? metalc ? metalc33 F CA CA . A CA 505 1_555 J O HOH . A HOH 571 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? # _chem_comp.formula 'C2 H6 O S' _chem_comp.formula_weight 78.133 _chem_comp.id DMS _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'DIMETHYL SULFOXIDE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag S O DMS doub 70 n n S C1 DMS sing 71 n n S C2 DMS sing 72 n n C1 H11 DMS sing 73 n n C1 H12 DMS sing 74 n n C1 H13 DMS sing 75 n n C2 H21 DMS sing 76 n n C2 H22 DMS sing 77 n n C2 H23 DMS sing 78 n n # _atom_sites.entry_id 1FJT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.01066 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.006154 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.012309 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.007628 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 ZN A 1 501 1 ZN ZN . C 3 CA A 1 502 2 CA CA . D 3 CA A 1 503 3 CA CA . E 3 CA A 1 504 4 CA CA . F 3 CA A 1 505 5 CA CA . G 4 DMS A 1 374 1 DMS DMS . H 5 VAL A 1 506 1 VAL VAL . I 6 LYS A 1 507 2 LYS LYS . J 7 HOH A 1 508 2 HOH WAT . J 7 HOH A 2 509 3 HOH WAT . J 7 HOH A 3 510 4 HOH WAT . J 7 HOH A 4 511 5 HOH WAT . J 7 HOH A 5 512 6 HOH WAT . J 7 HOH A 6 513 7 HOH WAT . J 7 HOH A 7 514 8 HOH WAT . J 7 HOH A 8 515 9 HOH WAT . J 7 HOH A 9 516 10 HOH WAT . J 7 HOH A 10 517 11 HOH WAT . J 7 HOH A 11 518 12 HOH WAT . J 7 HOH A 12 519 13 HOH WAT . J 7 HOH A 13 520 14 HOH WAT . J 7 HOH A 14 521 15 HOH WAT . J 7 HOH A 15 522 16 HOH WAT . J 7 HOH A 16 523 17 HOH WAT . J 7 HOH A 17 524 18 HOH WAT . J 7 HOH A 18 525 19 HOH WAT . J 7 HOH A 19 526 20 HOH WAT . J 7 HOH A 20 527 21 HOH WAT . J 7 HOH A 21 528 22 HOH WAT . J 7 HOH A 22 529 23 HOH WAT . J 7 HOH A 23 530 24 HOH WAT . J 7 HOH A 24 531 25 HOH WAT . J 7 HOH A 25 532 26 HOH WAT . J 7 HOH A 26 533 27 HOH WAT . J 7 HOH A 27 534 28 HOH WAT . J 7 HOH A 28 535 29 HOH WAT . J 7 HOH A 29 536 30 HOH WAT . J 7 HOH A 30 537 31 HOH WAT . J 7 HOH A 31 538 32 HOH WAT . J 7 HOH A 32 539 33 HOH WAT . J 7 HOH A 33 540 34 HOH WAT . J 7 HOH A 34 541 35 HOH WAT . J 7 HOH A 35 542 36 HOH WAT . J 7 HOH A 36 543 37 HOH WAT . J 7 HOH A 37 544 38 HOH WAT . J 7 HOH A 38 545 39 HOH WAT . J 7 HOH A 39 546 40 HOH WAT . J 7 HOH A 40 547 41 HOH WAT . J 7 HOH A 41 548 42 HOH WAT . J 7 HOH A 42 549 43 HOH WAT . J 7 HOH A 43 550 44 HOH WAT . J 7 HOH A 44 551 45 HOH WAT . J 7 HOH A 45 552 46 HOH WAT . J 7 HOH A 46 553 47 HOH WAT . J 7 HOH A 47 554 48 HOH WAT . J 7 HOH A 48 555 49 HOH WAT . J 7 HOH A 49 556 50 HOH WAT . J 7 HOH A 50 557 51 HOH WAT . J 7 HOH A 51 558 52 HOH WAT . J 7 HOH A 52 559 53 HOH WAT . J 7 HOH A 53 560 54 HOH WAT . J 7 HOH A 54 561 55 HOH WAT . J 7 HOH A 55 562 56 HOH WAT . J 7 HOH A 56 563 57 HOH WAT . J 7 HOH A 57 564 58 HOH WAT . J 7 HOH A 58 565 59 HOH WAT . J 7 HOH A 59 566 60 HOH WAT . J 7 HOH A 60 567 61 HOH WAT . J 7 HOH A 61 568 62 HOH WAT . J 7 HOH A 62 569 63 HOH WAT . J 7 HOH A 63 570 64 HOH WAT . J 7 HOH A 64 571 65 HOH WAT . J 7 HOH A 65 572 67 HOH WAT . J 7 HOH A 66 573 68 HOH WAT . J 7 HOH A 67 574 69 HOH WAT . J 7 HOH A 68 575 70 HOH WAT . J 7 HOH A 69 576 71 HOH WAT . J 7 HOH A 70 577 72 HOH WAT . J 7 HOH A 71 578 73 HOH WAT . J 7 HOH A 72 579 74 HOH WAT . J 7 HOH A 73 580 75 HOH WAT . J 7 HOH A 74 581 76 HOH WAT . J 7 HOH A 75 582 78 HOH WAT . J 7 HOH A 76 583 79 HOH WAT . J 7 HOH A 77 584 80 HOH WAT . J 7 HOH A 78 585 81 HOH WAT . J 7 HOH A 79 586 82 HOH WAT . J 7 HOH A 80 587 83 HOH WAT . J 7 HOH A 81 588 84 HOH WAT . J 7 HOH A 82 589 85 HOH WAT . J 7 HOH A 83 590 86 HOH WAT . J 7 HOH A 84 591 87 HOH WAT . J 7 HOH A 85 592 88 HOH WAT . J 7 HOH A 86 593 89 HOH WAT . J 7 HOH A 87 594 90 HOH WAT . J 7 HOH A 88 595 91 HOH WAT . J 7 HOH A 89 596 92 HOH WAT . J 7 HOH A 90 597 93 HOH WAT . J 7 HOH A 91 598 94 HOH WAT . J 7 HOH A 92 599 95 HOH WAT . J 7 HOH A 93 600 96 HOH WAT . J 7 HOH A 94 601 97 HOH WAT . J 7 HOH A 95 602 98 HOH WAT . J 7 HOH A 96 603 99 HOH WAT . J 7 HOH A 97 604 100 HOH WAT . J 7 HOH A 98 605 101 HOH WAT . J 7 HOH A 99 606 102 HOH WAT . J 7 HOH A 100 607 104 HOH WAT . J 7 HOH A 101 608 107 HOH WAT . J 7 HOH A 102 609 108 HOH WAT . J 7 HOH A 103 610 109 HOH WAT . J 7 HOH A 104 611 110 HOH WAT . J 7 HOH A 105 612 111 HOH WAT . J 7 HOH A 106 613 112 HOH WAT . J 7 HOH A 107 614 113 HOH WAT . J 7 HOH A 108 615 114 HOH WAT . J 7 HOH A 109 616 115 HOH WAT . J 7 HOH A 110 617 116 HOH WAT . J 7 HOH A 111 618 117 HOH WAT . J 7 HOH A 112 619 120 HOH WAT . J 7 HOH A 113 620 121 HOH WAT . J 7 HOH A 114 621 122 HOH WAT . J 7 HOH A 115 622 123 HOH WAT . J 7 HOH A 116 623 124 HOH WAT . J 7 HOH A 117 624 126 HOH WAT . J 7 HOH A 118 625 127 HOH WAT . J 7 HOH A 119 626 128 HOH WAT . J 7 HOH A 120 627 129 HOH WAT . J 7 HOH A 121 628 130 HOH WAT . J 7 HOH A 122 629 132 HOH WAT . J 7 HOH A 123 630 134 HOH WAT . J 7 HOH A 124 631 135 HOH WAT . J 7 HOH A 125 632 136 HOH WAT . J 7 HOH A 126 633 137 HOH WAT . J 7 HOH A 127 634 139 HOH WAT . J 7 HOH A 128 635 140 HOH WAT . J 7 HOH A 129 636 141 HOH WAT . J 7 HOH A 130 637 143 HOH WAT . J 7 HOH A 131 638 145 HOH WAT . J 7 HOH A 132 639 146 HOH WAT . J 7 HOH A 133 640 147 HOH WAT . J 7 HOH A 134 641 148 HOH WAT . J 7 HOH A 135 642 149 HOH WAT . J 7 HOH A 136 643 150 HOH WAT . J 7 HOH A 137 644 151 HOH WAT . J 7 HOH A 138 645 152 HOH WAT . J 7 HOH A 139 646 153 HOH WAT . J 7 HOH A 140 647 154 HOH WAT . J 7 HOH A 141 648 155 HOH WAT . J 7 HOH A 142 649 156 HOH WAT . J 7 HOH A 143 650 157 HOH WAT . J 7 HOH A 144 651 158 HOH WAT . J 7 HOH A 145 652 159 HOH WAT . J 7 HOH A 146 653 160 HOH WAT . J 7 HOH A 147 654 161 HOH WAT . J 7 HOH A 148 655 162 HOH WAT . J 7 HOH A 149 656 163 HOH WAT . J 7 HOH A 150 657 164 HOH WAT . J 7 HOH A 151 658 165 HOH WAT . J 7 HOH A 152 659 166 HOH WAT . J 7 HOH A 153 660 167 HOH WAT . J 7 HOH A 154 661 168 HOH WAT . J 7 HOH A 155 662 169 HOH WAT . J 7 HOH A 156 663 170 HOH WAT . J 7 HOH A 157 664 171 HOH WAT . J 7 HOH A 158 665 172 HOH WAT . J 7 HOH A 159 666 173 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 S S DMS . . . G 4 63.746 45.754 -11.605 1 58.76 ? S DMS 374 A 1 HETATM 2 O O DMS . . . G 4 63.513 45.861 -13.054 1 61.15 ? O DMS 374 A 1 HETATM 3 C C1 DMS . . . G 4 63.845 47.377 -10.894 1 60.33 ? C1 DMS 374 A 1 HETATM 4 C C2 DMS . . . G 4 62.237 45.008 -10.877 1 58.98 ? C2 DMS 374 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 8 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 326 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 4 #