data_1FLG # _model_server_result.job_id gmNgV-FOrWYTqifBLG6mHQ _model_server_result.datetime_utc '2024-11-27 11:29:31' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1flg # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":702}' # _entry.id 1FLG # _exptl.entry_id 1FLG _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 330.206 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'PYRROLOQUINOLINE QUINONE' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1FLG _cell.length_a 159.4 _cell.length_b 159.4 _cell.length_c 130.95 _cell.Z_PDB 18 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1FLG _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 146 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'H 3' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 H N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 105 A CYS 105 1_555 A SG CYS 106 A CYS 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.005 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 105 B CYS 105 1_555 B SG CYS 106 B CYS 106 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.07 ? metalc ? metalc1 A O ASP 11 A ASP 11 1_555 D CA CA . A CA 761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.85 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 11 A ASP 11 1_555 D CA CA . A CA 761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.875 ? metalc ? metalc3 A O THR 14 A THR 14 1_555 D CA CA . A CA 761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? metalc ? metalc4 A OG1 THR 14 A THR 14 1_555 D CA CA . A CA 761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? metalc ? metalc5 A O ASP 17 A ASP 17 1_555 D CA CA . A CA 761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.698 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 17 A ASP 17 1_555 D CA CA . A CA 761 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.724 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 179 A GLU 179 1_555 C CA CA . A CA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.839 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 179 A GLU 179 1_555 C CA CA . A CA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.928 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASN 266 A ASN 266 1_555 C CA CA . A CA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.916 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 316 A ASP 316 1_555 C CA CA . A CA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.844 ? metalc ? metalc11 E N6 PQQ . A PQQ 701 1_555 C CA CA . A CA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.926 ? metalc ? metalc12 E O5 PQQ . A PQQ 701 1_555 C CA CA . A CA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc13 E O7A PQQ . A PQQ 701 1_555 C CA CA . A CA 751 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.792 ? metalc ? metalc14 B OD1 ASP 11 B ASP 11 1_555 G CA CA . B CA 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.659 ? metalc ? metalc15 B O ASP 11 B ASP 11 1_555 G CA CA . B CA 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.808 ? metalc ? metalc16 B OG1 THR 14 B THR 14 1_555 G CA CA . B CA 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.044 ? metalc ? metalc17 B O THR 14 B THR 14 1_555 G CA CA . B CA 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.72 ? metalc ? metalc18 B OD1 ASP 17 B ASP 17 1_555 G CA CA . B CA 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.651 ? metalc ? metalc19 B O ASP 17 B ASP 17 1_555 G CA CA . B CA 762 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.926 ? metalc ? metalc20 B OE2 GLU 179 B GLU 179 1_555 F CA CA . B CA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.927 ? metalc ? metalc21 B OE1 GLU 179 B GLU 179 1_555 F CA CA . B CA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.785 ? metalc ? metalc22 B OD1 ASN 266 B ASN 266 1_555 F CA CA . B CA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? metalc ? metalc23 B OD1 ASP 316 B ASP 316 1_555 F CA CA . B CA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.166 ? metalc ? metalc24 H O5 PQQ . B PQQ 702 1_555 F CA CA . B CA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.824 ? metalc ? metalc25 H N6 PQQ . B PQQ 702 1_555 F CA CA . B CA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.927 ? metalc ? metalc26 H O7A PQQ . B PQQ 702 1_555 F CA CA . B CA 752 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.794 ? # _chem_comp.formula 'C14 H6 N2 O8' _chem_comp.formula_weight 330.206 _chem_comp.id PQQ _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'PYRROLOQUINOLINE QUINONE' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag N1 C2 PQQ sing 260 n y N1 C1A PQQ sing 261 n y N1 HN1 PQQ sing 262 n n C2 C2X PQQ sing 263 n n C2 C3 PQQ doub 264 n y C2X O2A PQQ doub 265 n n C2X O2B PQQ sing 266 n n O2B HOB2 PQQ sing 267 n n C3 C3A PQQ sing 268 n y C3 H3 PQQ sing 269 n n C3A C1A PQQ doub 270 n y C3A C4 PQQ sing 271 n n C1A C9A PQQ sing 272 n y C4 O4 PQQ doub 273 n n C4 C5 PQQ sing 274 n n C5 O5 PQQ doub 275 n n C5 C6A PQQ sing 276 n n C6A N6 PQQ doub 277 n y C6A C9A PQQ sing 278 n y N6 C7 PQQ sing 279 n y C7 C7X PQQ sing 280 n n C7 C8 PQQ doub 281 n y C7X O7A PQQ doub 282 n n C7X O7B PQQ sing 283 n n O7B HOB7 PQQ sing 284 n n C8 C9 PQQ sing 285 n y C8 H8 PQQ sing 286 n n C9 C9X PQQ sing 287 n n C9 C9A PQQ doub 288 n y C9X O9A PQQ doub 289 n n C9X O9B PQQ sing 290 n n O9B HOB9 PQQ sing 291 n n # _atom_sites.entry_id 1FLG _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.00627 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.00362 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.00724 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.00764 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 751 751 CA IUM . D 2 CA A 1 761 761 CA IUM . E 3 PQQ A 1 701 701 PQQ PQQ . F 2 CA B 1 752 752 CA IUM . G 2 CA B 1 762 762 CA IUM . H 3 PQQ B 1 702 702 PQQ PQQ . I 4 HOH A 1 762 1 HOH WAT . I 4 HOH A 2 763 4 HOH WAT . I 4 HOH A 3 764 5 HOH WAT . I 4 HOH A 4 765 6 HOH WAT . I 4 HOH A 5 766 7 HOH WAT . I 4 HOH A 6 767 8 HOH WAT . I 4 HOH A 7 768 9 HOH WAT . I 4 HOH A 8 769 10 HOH WAT . I 4 HOH A 9 770 11 HOH WAT . I 4 HOH A 10 771 12 HOH WAT . I 4 HOH A 11 772 13 HOH WAT . I 4 HOH A 12 773 14 HOH WAT . I 4 HOH A 13 774 15 HOH WAT . I 4 HOH A 14 775 17 HOH WAT . I 4 HOH A 15 776 18 HOH WAT . I 4 HOH A 16 777 21 HOH WAT . I 4 HOH A 17 778 22 HOH WAT . I 4 HOH A 18 779 23 HOH WAT . I 4 HOH A 19 780 25 HOH WAT . I 4 HOH A 20 781 26 HOH WAT . I 4 HOH A 21 782 27 HOH WAT . I 4 HOH A 22 783 28 HOH WAT . I 4 HOH A 23 784 29 HOH WAT . I 4 HOH A 24 785 31 HOH WAT . I 4 HOH A 25 786 32 HOH WAT . I 4 HOH A 26 787 33 HOH WAT . I 4 HOH A 27 788 34 HOH WAT . I 4 HOH A 28 789 37 HOH WAT . I 4 HOH A 29 790 38 HOH WAT . I 4 HOH A 30 791 39 HOH WAT . I 4 HOH A 31 792 40 HOH WAT . I 4 HOH A 32 793 42 HOH WAT . I 4 HOH A 33 794 44 HOH WAT . I 4 HOH A 34 795 46 HOH WAT . I 4 HOH A 35 796 48 HOH WAT . I 4 HOH A 36 797 49 HOH WAT . I 4 HOH A 37 798 50 HOH WAT . I 4 HOH A 38 799 51 HOH WAT . I 4 HOH A 39 800 53 HOH WAT . I 4 HOH A 40 801 54 HOH WAT . I 4 HOH A 41 802 55 HOH WAT . I 4 HOH A 42 803 56 HOH WAT . I 4 HOH A 43 804 57 HOH WAT . I 4 HOH A 44 805 58 HOH WAT . I 4 HOH A 45 806 59 HOH WAT . I 4 HOH A 46 807 60 HOH WAT . I 4 HOH A 47 808 61 HOH WAT . I 4 HOH A 48 809 63 HOH WAT . I 4 HOH A 49 810 64 HOH WAT . I 4 HOH A 50 811 65 HOH WAT . I 4 HOH A 51 812 66 HOH WAT . I 4 HOH A 52 813 67 HOH WAT . I 4 HOH A 53 814 69 HOH WAT . I 4 HOH A 54 815 70 HOH WAT . I 4 HOH A 55 816 72 HOH WAT . I 4 HOH A 56 817 75 HOH WAT . I 4 HOH A 57 818 76 HOH WAT . I 4 HOH A 58 819 83 HOH WAT . I 4 HOH A 59 820 85 HOH WAT . I 4 HOH A 60 821 86 HOH WAT . I 4 HOH A 61 822 89 HOH WAT . I 4 HOH A 62 823 91 HOH WAT . I 4 HOH A 63 824 92 HOH WAT . I 4 HOH A 64 825 93 HOH WAT . I 4 HOH A 65 826 95 HOH WAT . I 4 HOH A 66 827 96 HOH WAT . I 4 HOH A 67 828 98 HOH WAT . I 4 HOH A 68 829 100 HOH WAT . I 4 HOH A 69 830 101 HOH WAT . I 4 HOH A 70 831 102 HOH WAT . I 4 HOH A 71 832 103 HOH WAT . I 4 HOH A 72 833 105 HOH WAT . I 4 HOH A 73 834 106 HOH WAT . J 4 HOH B 1 763 2 HOH WAT . J 4 HOH B 2 764 3 HOH WAT . J 4 HOH B 3 765 16 HOH WAT . J 4 HOH B 4 766 19 HOH WAT . J 4 HOH B 5 767 20 HOH WAT . J 4 HOH B 6 768 24 HOH WAT . J 4 HOH B 7 769 30 HOH WAT . J 4 HOH B 8 770 35 HOH WAT . J 4 HOH B 9 771 36 HOH WAT . J 4 HOH B 10 772 41 HOH WAT . J 4 HOH B 11 773 43 HOH WAT . J 4 HOH B 12 774 45 HOH WAT . J 4 HOH B 13 775 47 HOH WAT . J 4 HOH B 14 776 52 HOH WAT . J 4 HOH B 15 777 62 HOH WAT . J 4 HOH B 16 778 68 HOH WAT . J 4 HOH B 17 779 71 HOH WAT . J 4 HOH B 18 780 73 HOH WAT . J 4 HOH B 19 781 74 HOH WAT . J 4 HOH B 20 782 77 HOH WAT . J 4 HOH B 21 783 78 HOH WAT . J 4 HOH B 22 784 79 HOH WAT . J 4 HOH B 23 785 80 HOH WAT . J 4 HOH B 24 786 81 HOH WAT . J 4 HOH B 25 787 82 HOH WAT . J 4 HOH B 26 788 84 HOH WAT . J 4 HOH B 27 789 87 HOH WAT . J 4 HOH B 28 790 88 HOH WAT . J 4 HOH B 29 791 90 HOH WAT . J 4 HOH B 30 792 94 HOH WAT . J 4 HOH B 31 793 97 HOH WAT . J 4 HOH B 32 794 99 HOH WAT . J 4 HOH B 33 795 104 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 PQQ . . . H 3 -12.465 35.642 22.254 1 13.64 ? N1 PQQ 702 B 1 HETATM 2 C C2 PQQ . . . H 3 -11.192 35.321 22.071 1 15.44 ? C2 PQQ 702 B 1 HETATM 3 C C2X PQQ . . . H 3 -10.176 36.293 22.248 1 15.51 ? C2X PQQ 702 B 1 HETATM 4 O O2A PQQ . . . H 3 -10.692 37.416 22.302 1 15.12 ? O2A PQQ 702 B 1 HETATM 5 O O2B PQQ . . . H 3 -8.962 35.993 22.144 1 14.9 ? O2B PQQ 702 B 1 HETATM 6 C C3 PQQ . . . H 3 -10.967 33.96 21.98 1 15.31 ? C3 PQQ 702 B 1 HETATM 7 C C3A PQQ . . . H 3 -12.217 33.419 21.908 1 15.57 ? C3A PQQ 702 B 1 HETATM 8 C C1A PQQ . . . H 3 -13.123 34.415 22.336 1 14.6 ? C1A PQQ 702 B 1 HETATM 9 C C4 PQQ . . . H 3 -12.518 32.037 22.015 1 12.61 ? C4 PQQ 702 B 1 HETATM 10 O O4 PQQ . . . H 3 -11.694 30.974 21.681 1 8.19 ? O4 PQQ 702 B 1 HETATM 11 C C5 PQQ . . . H 3 -13.897 31.777 22.053 1 13.75 ? C5 PQQ 702 B 1 HETATM 12 O O5 PQQ . . . H 3 -14.031 30.413 21.747 1 10.1 ? O5 PQQ 702 B 1 HETATM 13 C C6A PQQ . . . H 3 -14.893 32.761 22.279 1 12.51 ? C6A PQQ 702 B 1 HETATM 14 N N6 PQQ . . . H 3 -16.204 32.465 22.186 1 12.43 ? N6 PQQ 702 B 1 HETATM 15 C C7 PQQ . . . H 3 -17.242 33.098 22.766 1 11.58 ? C7 PQQ 702 B 1 HETATM 16 C C7X PQQ . . . H 3 -18.494 32.411 22.705 1 13.12 ? C7X PQQ 702 B 1 HETATM 17 O O7A PQQ . . . H 3 -18.781 31.388 21.975 1 11.43 ? O7A PQQ 702 B 1 HETATM 18 O O7B PQQ . . . H 3 -19.671 32.831 23.061 1 9.66 ? O7B PQQ 702 B 1 HETATM 19 C C8 PQQ . . . H 3 -16.892 34.41 22.99 1 11.64 ? C8 PQQ 702 B 1 HETATM 20 C C9 PQQ . . . H 3 -15.588 34.918 22.835 1 13.65 ? C9 PQQ 702 B 1 HETATM 21 C C9X PQQ . . . H 3 -15.414 36.297 23.168 1 13.01 ? C9X PQQ 702 B 1 HETATM 22 O O9A PQQ . . . H 3 -16.515 36.856 23.426 1 10.79 ? O9A PQQ 702 B 1 HETATM 23 O O9B PQQ . . . H 3 -14.422 37.041 23.117 1 11.06 ? O9B PQQ 702 B 1 HETATM 24 C C9A PQQ . . . H 3 -14.464 34.065 22.695 1 12.06 ? C9A PQQ 702 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 13 _model_server_stats.parse_time_ms 10 _model_server_stats.create_model_time_ms 28 _model_server_stats.query_time_ms 315 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 24 #