data_1FNN
#
_model_server_result.job_id            kd5alBWzhL2c8TkRjlHQuQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 17:25:10' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1fnn 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":398}' 
#
_entry.id    1FNN 
#
_exptl.entry_id    1FNN 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              427.201 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            1FNN 
_cell.length_a            132.07 
_cell.length_b            132.07 
_cell.length_c            82.2 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1FNN 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        144 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 31' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,G 1 1 
B,E,F,H 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 D N N 
? 3 F N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A OG1 THR 58 A THR 57 1_555 C MG MG . A MG 390 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.123 ? 
metalc ? metalc2 C MG MG . A MG 390 1_555 D O1B ADP . A ADP 398 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.881 ? 
metalc ? metalc3 C MG MG . A MG 390 1_555 G O HOH . A HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? 
metalc ? metalc4 C MG MG . A MG 390 1_555 G O HOH . A HOH 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
metalc ? metalc5 C MG MG . A MG 390 1_555 G O HOH . A HOH 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.211 ? 
metalc ? metalc6 C MG MG . A MG 390 1_555 G O HOH . A HOH 426 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.22 ? 
metalc ? metalc7 B OG1 THR 58 B THR 57 1_555 E MG MG . B MG 391 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.068 ? 
metalc ? metalc8 E MG MG . B MG 391 1_555 F O1B ADP . B ADP 399 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.971 ? 
metalc ? metalc9 E MG MG . B MG 391 1_555 H O HOH . B HOH 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? 
metalc ? metalc10 E MG MG . B MG 391 1_555 H O HOH . B HOH 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
metalc ? metalc11 E MG MG . B MG 391 1_555 H O HOH . B HOH 420 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? 
metalc ? metalc12 E MG MG . B MG 391 1_555 H O HOH . B HOH 421 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H15 N5 O10 P2' 
_chem_comp.formula_weight    427.201 
_chem_comp.id                ADP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PB O1B ADP doub 1 n n 
PB O2B ADP sing 2 n n 
PB O3B ADP sing 3 n n 
PB O3A ADP sing 4 n n 
O2B HOB2 ADP sing 5 n n 
O3B HOB3 ADP sing 6 n n 
PA O1A ADP doub 7 n n 
PA O2A ADP sing 8 n n 
PA O3A ADP sing 9 n n 
PA O5' ADP sing 10 n n 
O2A HOA2 ADP sing 11 n n 
O5' C5' ADP sing 12 n n 
C5' C4' ADP sing 13 n n 
C5' "H5'1" ADP sing 14 n n 
C5' "H5'2" ADP sing 15 n n 
C4' O4' ADP sing 16 n n 
C4' C3' ADP sing 17 n n 
C4' H4' ADP sing 18 n n 
O4' C1' ADP sing 19 n n 
C3' O3' ADP sing 20 n n 
C3' C2' ADP sing 21 n n 
C3' H3' ADP sing 22 n n 
O3' HO3' ADP sing 23 n n 
C2' O2' ADP sing 24 n n 
C2' C1' ADP sing 25 n n 
C2' H2' ADP sing 26 n n 
O2' HO2' ADP sing 27 n n 
C1' N9 ADP sing 28 n n 
C1' H1' ADP sing 29 n n 
N9 C8 ADP sing 30 n y 
N9 C4 ADP sing 31 n y 
C8 N7 ADP doub 32 n y 
C8 H8 ADP sing 33 n n 
N7 C5 ADP sing 34 n y 
C5 C6 ADP sing 35 n y 
C5 C4 ADP doub 36 n y 
C6 N6 ADP sing 37 n n 
C6 N1 ADP doub 38 n y 
N6 HN61 ADP sing 39 n n 
N6 HN62 ADP sing 40 n n 
N1 C2 ADP sing 41 n y 
C2 N3 ADP doub 42 n y 
C2 H2 ADP sing 43 n n 
N3 C4 ADP sing 44 n y 
#
_atom_sites.entry_id                     1FNN 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007572 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.004372 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.008743 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.012165 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 MG A 1 390 390 MG MG . 
D 3 ADP A 1 398 398 ADP ADP . 
E 2 MG B 1 391 391 MG MG . 
F 3 ADP B 1 399 399 ADP ADP . 
G 4 HOH A 1 399 4 HOH WAT . 
G 4 HOH A 2 400 12 HOH WAT . 
G 4 HOH A 3 401 13 HOH WAT . 
G 4 HOH A 4 402 14 HOH WAT . 
G 4 HOH A 5 403 15 HOH WAT . 
G 4 HOH A 6 404 18 HOH WAT . 
G 4 HOH A 7 405 19 HOH WAT . 
G 4 HOH A 8 406 26 HOH WAT . 
G 4 HOH A 9 407 31 HOH WAT . 
G 4 HOH A 10 408 35 HOH WAT . 
G 4 HOH A 11 409 36 HOH WAT . 
G 4 HOH A 12 410 38 HOH WAT . 
G 4 HOH A 13 411 39 HOH WAT . 
G 4 HOH A 14 412 40 HOH WAT . 
G 4 HOH A 15 413 43 HOH WAT . 
G 4 HOH A 16 414 46 HOH WAT . 
G 4 HOH A 17 415 48 HOH WAT . 
G 4 HOH A 18 416 49 HOH WAT . 
G 4 HOH A 19 417 50 HOH WAT . 
G 4 HOH A 20 418 52 HOH WAT . 
G 4 HOH A 21 419 53 HOH WAT . 
G 4 HOH A 22 420 55 HOH WAT . 
G 4 HOH A 23 421 57 HOH WAT . 
G 4 HOH A 24 422 62 HOH WAT . 
G 4 HOH A 25 423 64 HOH WAT . 
G 4 HOH A 26 424 66 HOH WAT . 
G 4 HOH A 27 425 68 HOH WAT . 
G 4 HOH A 28 426 71 HOH WAT . 
G 4 HOH A 29 427 72 HOH WAT . 
G 4 HOH A 30 428 74 HOH WAT . 
G 4 HOH A 31 429 75 HOH WAT . 
G 4 HOH A 32 430 77 HOH WAT . 
G 4 HOH A 33 431 78 HOH WAT . 
G 4 HOH A 34 432 82 HOH WAT . 
G 4 HOH A 35 433 83 HOH WAT . 
G 4 HOH A 36 434 86 HOH WAT . 
G 4 HOH A 37 435 87 HOH WAT . 
G 4 HOH A 38 436 88 HOH WAT . 
G 4 HOH A 39 437 89 HOH WAT . 
G 4 HOH A 40 438 91 HOH WAT . 
G 4 HOH A 41 439 92 HOH WAT . 
G 4 HOH A 42 440 93 HOH WAT . 
G 4 HOH A 43 441 94 HOH WAT . 
G 4 HOH A 44 442 95 HOH WAT . 
G 4 HOH A 45 443 96 HOH WAT . 
G 4 HOH A 46 444 97 HOH WAT . 
G 4 HOH A 47 445 99 HOH WAT . 
G 4 HOH A 48 446 102 HOH WAT . 
G 4 HOH A 49 447 103 HOH WAT . 
G 4 HOH A 50 448 104 HOH WAT . 
G 4 HOH A 51 449 105 HOH WAT . 
G 4 HOH A 52 450 107 HOH WAT . 
G 4 HOH A 53 451 108 HOH WAT . 
G 4 HOH A 54 452 109 HOH WAT . 
G 4 HOH A 55 453 110 HOH WAT . 
G 4 HOH A 56 454 112 HOH WAT . 
G 4 HOH A 57 455 113 HOH WAT . 
G 4 HOH A 58 456 114 HOH WAT . 
G 4 HOH A 59 457 115 HOH WAT . 
G 4 HOH A 60 458 116 HOH WAT . 
G 4 HOH A 61 459 117 HOH WAT . 
G 4 HOH A 62 460 118 HOH WAT . 
G 4 HOH A 63 461 119 HOH WAT . 
G 4 HOH A 64 462 120 HOH WAT . 
G 4 HOH A 65 463 121 HOH WAT . 
G 4 HOH A 66 464 124 HOH WAT . 
G 4 HOH A 67 465 125 HOH WAT . 
G 4 HOH A 68 466 126 HOH WAT . 
G 4 HOH A 69 467 127 HOH WAT . 
G 4 HOH A 70 468 172 HOH WAT . 
G 4 HOH A 71 469 174 HOH WAT . 
G 4 HOH A 72 470 176 HOH WAT . 
G 4 HOH A 73 471 182 HOH WAT . 
G 4 HOH A 74 472 184 HOH WAT . 
G 4 HOH A 75 473 185 HOH WAT . 
G 4 HOH A 76 474 187 HOH WAT . 
G 4 HOH A 77 475 188 HOH WAT . 
G 4 HOH A 78 476 190 HOH WAT . 
G 4 HOH A 79 477 192 HOH WAT . 
G 4 HOH A 80 478 193 HOH WAT . 
G 4 HOH A 81 479 194 HOH WAT . 
G 4 HOH A 82 480 200 HOH WAT . 
G 4 HOH A 83 481 201 HOH WAT . 
G 4 HOH A 84 482 203 HOH WAT . 
G 4 HOH A 85 483 205 HOH WAT . 
G 4 HOH A 86 484 211 HOH WAT . 
G 4 HOH A 87 485 212 HOH WAT . 
G 4 HOH A 88 486 213 HOH WAT . 
G 4 HOH A 89 487 215 HOH WAT . 
G 4 HOH A 90 488 217 HOH WAT . 
G 4 HOH A 91 489 219 HOH WAT . 
G 4 HOH A 92 490 225 HOH WAT . 
G 4 HOH A 93 491 227 HOH WAT . 
G 4 HOH A 94 492 228 HOH WAT . 
G 4 HOH A 95 493 230 HOH WAT . 
G 4 HOH A 96 494 233 HOH WAT . 
G 4 HOH A 97 495 235 HOH WAT . 
G 4 HOH A 98 496 237 HOH WAT . 
G 4 HOH A 99 497 238 HOH WAT . 
G 4 HOH A 100 498 241 HOH WAT . 
G 4 HOH A 101 499 242 HOH WAT . 
G 4 HOH A 102 500 243 HOH WAT . 
G 4 HOH A 103 501 247 HOH WAT . 
G 4 HOH A 104 502 248 HOH WAT . 
G 4 HOH A 105 503 249 HOH WAT . 
G 4 HOH A 106 504 250 HOH WAT . 
G 4 HOH A 107 505 251 HOH WAT . 
G 4 HOH A 108 506 254 HOH WAT . 
G 4 HOH A 109 507 256 HOH WAT . 
G 4 HOH A 110 508 267 HOH WAT . 
G 4 HOH A 111 509 268 HOH WAT . 
G 4 HOH A 112 510 269 HOH WAT . 
G 4 HOH A 113 511 270 HOH WAT . 
G 4 HOH A 114 512 271 HOH WAT . 
G 4 HOH A 115 513 272 HOH WAT . 
G 4 HOH A 116 514 273 HOH WAT . 
G 4 HOH A 117 515 274 HOH WAT . 
G 4 HOH A 118 516 275 HOH WAT . 
G 4 HOH A 119 517 276 HOH WAT . 
G 4 HOH A 120 518 277 HOH WAT . 
G 4 HOH A 121 519 278 HOH WAT . 
G 4 HOH A 122 520 279 HOH WAT . 
G 4 HOH A 123 521 280 HOH WAT . 
G 4 HOH A 124 522 281 HOH WAT . 
G 4 HOH A 125 523 283 HOH WAT . 
G 4 HOH A 126 524 284 HOH WAT . 
G 4 HOH A 127 525 290 HOH WAT . 
G 4 HOH A 128 526 291 HOH WAT . 
G 4 HOH A 129 527 292 HOH WAT . 
G 4 HOH A 130 528 293 HOH WAT . 
G 4 HOH A 131 529 295 HOH WAT . 
G 4 HOH A 132 530 296 HOH WAT . 
G 4 HOH A 133 531 297 HOH WAT . 
G 4 HOH A 134 532 299 HOH WAT . 
G 4 HOH A 135 533 300 HOH WAT . 
G 4 HOH A 136 534 301 HOH WAT . 
G 4 HOH A 137 535 303 HOH WAT . 
G 4 HOH A 138 536 353 HOH WAT . 
G 4 HOH A 139 537 365 HOH WAT . 
G 4 HOH A 140 538 366 HOH WAT . 
G 4 HOH A 141 539 367 HOH WAT . 
G 4 HOH A 142 540 368 HOH WAT . 
G 4 HOH A 143 541 371 HOH WAT . 
G 4 HOH A 144 542 372 HOH WAT . 
G 4 HOH A 145 543 375 HOH WAT . 
G 4 HOH A 146 544 377 HOH WAT . 
G 4 HOH A 147 545 379 HOH WAT . 
G 4 HOH A 148 546 381 HOH WAT . 
G 4 HOH A 149 547 383 HOH WAT . 
G 4 HOH A 150 548 384 HOH WAT . 
G 4 HOH A 151 549 386 HOH WAT . 
G 4 HOH A 152 550 387 HOH WAT . 
G 4 HOH A 153 551 389 HOH WAT . 
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