data_1FY8 # _model_server_result.job_id lLFFh5glKt8SRf7jck8gHg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-30 18:40:36' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1fy8 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":500}' # _entry.id 1FY8 # _exptl.entry_id 1FY8 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1FY8 _cell.length_a 92.6 _cell.length_b 92.6 _cell.length_c 62.06 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1FY8 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 154 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 32 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 15 E CYS 22 1_555 A SG CYS 145 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 33 E CYS 42 1_555 A SG CYS 49 E CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 117 E CYS 128 1_555 A SG CYS 218 E CYS 232 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 124 E CYS 136 1_555 A SG CYS 191 E CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 156 E CYS 168 1_555 A SG CYS 170 E CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 181 E CYS 191 1_555 A SG CYS 205 E CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 5 I CYS 5 1_555 B SG CYS 55 I CYS 55 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 14 I CYS 14 1_555 B SG CYS 38 I CYS 38 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 30 I CYS 30 1_555 B SG CYS 51 I CYS 51 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? metalc ? metalc1 A OE1 GLU 60 E GLU 70 1_555 C CA CA . E CA 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc ? metalc2 A O ASN 62 E ASN 72 1_555 C CA CA . E CA 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? metalc ? metalc3 A O VAL 65 E VAL 75 1_555 C CA CA . E CA 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.331 ? metalc ? metalc4 A OE1 GLU 67 E GLU 77 1_555 C CA CA . E CA 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.561 ? metalc ? metalc5 A OE2 GLU 70 E GLU 80 1_555 C CA CA . E CA 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.282 ? metalc ? metalc6 C CA CA . E CA 500 1_555 G O HOH . E HOH 524 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1FY8 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010799 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.006235 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.01247 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.016113 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 3 CA E 1 500 500 CA CAL . D 4 SO4 I 1 990 990 SO4 SO4 . E 4 SO4 I 1 991 991 SO4 SO4 . F 4 SO4 I 1 992 992 SO4 SO4 . G 5 HOH E 1 501 501 HOH WAT . G 5 HOH E 2 502 502 HOH WAT . G 5 HOH E 3 503 503 HOH WAT . G 5 HOH E 4 504 504 HOH WAT . G 5 HOH E 5 507 507 HOH WAT . G 5 HOH E 6 509 509 HOH WAT . G 5 HOH E 7 510 510 HOH WAT . G 5 HOH E 8 512 512 HOH WAT . G 5 HOH E 9 513 513 HOH WAT . G 5 HOH E 10 514 514 HOH WAT . G 5 HOH E 11 515 515 HOH WAT . G 5 HOH E 12 516 516 HOH WAT . G 5 HOH E 13 517 517 HOH WAT . G 5 HOH E 14 518 518 HOH WAT . G 5 HOH E 15 519 519 HOH WAT . G 5 HOH E 16 520 520 HOH WAT . G 5 HOH E 17 522 522 HOH WAT . G 5 HOH E 18 523 523 HOH WAT . G 5 HOH E 19 524 524 HOH WAT . G 5 HOH E 20 525 525 HOH WAT . G 5 HOH E 21 526 526 HOH WAT . G 5 HOH E 22 527 527 HOH WAT . G 5 HOH E 23 528 528 HOH WAT . G 5 HOH E 24 529 529 HOH WAT . G 5 HOH E 25 530 530 HOH WAT . G 5 HOH E 26 531 531 HOH WAT . G 5 HOH E 27 532 532 HOH WAT . G 5 HOH E 28 534 534 HOH WAT . G 5 HOH E 29 535 535 HOH WAT . G 5 HOH E 30 536 536 HOH WAT . G 5 HOH E 31 537 537 HOH WAT . G 5 HOH E 32 539 539 HOH WAT . G 5 HOH E 33 541 541 HOH WAT . G 5 HOH E 34 542 542 HOH WAT . G 5 HOH E 35 543 543 HOH WAT . G 5 HOH E 36 544 544 HOH WAT . G 5 HOH E 37 545 545 HOH WAT . G 5 HOH E 38 546 546 HOH WAT . G 5 HOH E 39 547 547 HOH WAT . G 5 HOH E 40 548 548 HOH WAT . G 5 HOH E 41 549 549 HOH WAT . G 5 HOH E 42 550 550 HOH WAT . G 5 HOH E 43 551 551 HOH WAT . G 5 HOH E 44 552 552 HOH WAT . G 5 HOH E 45 553 553 HOH WAT . G 5 HOH E 46 555 555 HOH WAT . G 5 HOH E 47 556 556 HOH WAT . G 5 HOH E 48 558 558 HOH WAT . G 5 HOH E 49 559 559 HOH WAT . G 5 HOH E 50 560 560 HOH WAT . G 5 HOH E 51 561 561 HOH WAT . G 5 HOH E 52 562 562 HOH WAT . G 5 HOH E 53 563 563 HOH WAT . G 5 HOH E 54 564 564 HOH WAT . G 5 HOH E 55 565 565 HOH WAT . G 5 HOH E 56 566 566 HOH WAT . G 5 HOH E 57 567 567 HOH WAT . G 5 HOH E 58 568 568 HOH WAT . G 5 HOH E 59 569 569 HOH WAT . G 5 HOH E 60 570 570 HOH WAT . G 5 HOH E 61 571 571 HOH WAT . G 5 HOH E 62 572 572 HOH WAT . G 5 HOH E 63 573 573 HOH WAT . G 5 HOH E 64 575 575 HOH WAT . G 5 HOH E 65 576 576 HOH WAT . G 5 HOH E 66 580 580 HOH WAT . G 5 HOH E 67 581 581 HOH WAT . G 5 HOH E 68 582 582 HOH WAT . G 5 HOH E 69 583 583 HOH WAT . G 5 HOH E 70 584 584 HOH WAT . G 5 HOH E 71 585 585 HOH WAT . G 5 HOH E 72 586 586 HOH WAT . G 5 HOH E 73 588 588 HOH WAT . G 5 HOH E 74 589 589 HOH WAT . G 5 HOH E 75 590 590 HOH WAT . G 5 HOH E 76 591 591 HOH WAT . G 5 HOH E 77 592 592 HOH WAT . G 5 HOH E 78 593 593 HOH WAT . G 5 HOH E 79 594 594 HOH WAT . G 5 HOH E 80 596 596 HOH WAT . G 5 HOH E 81 597 597 HOH WAT . G 5 HOH E 82 599 599 HOH WAT . G 5 HOH E 83 600 600 HOH WAT . G 5 HOH E 84 601 601 HOH WAT . G 5 HOH E 85 602 602 HOH WAT . G 5 HOH E 86 603 603 HOH WAT . G 5 HOH E 87 605 605 HOH WAT . G 5 HOH E 88 607 607 HOH WAT . G 5 HOH E 89 608 608 HOH WAT . G 5 HOH E 90 609 609 HOH WAT . G 5 HOH E 91 610 610 HOH WAT . G 5 HOH E 92 612 612 HOH WAT . G 5 HOH E 93 613 613 HOH WAT . G 5 HOH E 94 615 615 HOH WAT . G 5 HOH E 95 617 617 HOH WAT . G 5 HOH E 96 618 618 HOH WAT . G 5 HOH E 97 619 619 HOH WAT . G 5 HOH E 98 620 620 HOH WAT . G 5 HOH E 99 621 621 HOH WAT . G 5 HOH E 100 624 624 HOH WAT . G 5 HOH E 101 625 625 HOH WAT . G 5 HOH E 102 626 626 HOH WAT . G 5 HOH E 103 627 627 HOH WAT . G 5 HOH E 104 628 628 HOH WAT . G 5 HOH E 105 629 629 HOH WAT . G 5 HOH E 106 630 630 HOH WAT . G 5 HOH E 107 631 631 HOH WAT . G 5 HOH E 108 632 632 HOH WAT . G 5 HOH E 109 634 634 HOH WAT . G 5 HOH E 110 635 635 HOH WAT . G 5 HOH E 111 637 637 HOH WAT . G 5 HOH E 112 639 639 HOH WAT . G 5 HOH E 113 640 640 HOH WAT . G 5 HOH E 114 642 642 HOH WAT . G 5 HOH E 115 644 644 HOH WAT . G 5 HOH E 116 645 645 HOH WAT . G 5 HOH E 117 646 646 HOH WAT . G 5 HOH E 118 649 649 HOH WAT . G 5 HOH E 119 651 651 HOH WAT . G 5 HOH E 120 652 652 HOH WAT . G 5 HOH E 121 653 653 HOH WAT . G 5 HOH E 122 654 654 HOH WAT . G 5 HOH E 123 655 655 HOH WAT . G 5 HOH E 124 656 656 HOH WAT . G 5 HOH E 125 657 657 HOH WAT . G 5 HOH E 126 658 658 HOH WAT . G 5 HOH E 127 660 660 HOH WAT . G 5 HOH E 128 662 662 HOH WAT . G 5 HOH E 129 664 664 HOH WAT . G 5 HOH E 130 666 666 HOH WAT . G 5 HOH E 131 667 667 HOH WAT . G 5 HOH E 132 668 668 HOH WAT . G 5 HOH E 133 669 669 HOH WAT . G 5 HOH E 134 670 670 HOH WAT . G 5 HOH E 135 671 671 HOH WAT . G 5 HOH E 136 672 672 HOH WAT . G 5 HOH E 137 674 674 HOH WAT . G 5 HOH E 138 675 675 HOH WAT . G 5 HOH E 139 676 676 HOH WAT . G 5 HOH E 140 677 677 HOH WAT . G 5 HOH E 141 678 678 HOH WAT . G 5 HOH E 142 679 679 HOH WAT . G 5 HOH E 143 680 680 HOH WAT . G 5 HOH E 144 682 682 HOH WAT . G 5 HOH E 145 683 683 HOH WAT . G 5 HOH E 146 684 684 HOH WAT . G 5 HOH E 147 687 687 HOH WAT . G 5 HOH E 148 688 688 HOH WAT . G 5 HOH E 149 690 690 HOH WAT . G 5 HOH E 150 691 691 HOH WAT . G 5 HOH E 151 692 692 HOH WAT . G 5 HOH E 152 693 693 HOH WAT . G 5 HOH E 153 694 694 HOH WAT . G 5 HOH E 154 695 695 HOH WAT . G 5 HOH E 155 696 696 HOH WAT . G 5 HOH E 156 697 697 HOH WAT . G 5 HOH E 157 699 699 HOH WAT . G 5 HOH E 158 701 701 HOH WAT . G 5 HOH E 159 702 702 HOH WAT . G 5 HOH E 160 704 704 HOH WAT . G 5 HOH E 161 705 705 HOH WAT . G 5 HOH E 162 706 706 HOH WAT . G 5 HOH E 163 707 707 HOH WAT . G 5 HOH E 164 708 708 HOH WAT . G 5 HOH E 165 709 709 HOH WAT . G 5 HOH E 166 710 710 HOH WAT . G 5 HOH E 167 711 711 HOH WAT . G 5 HOH E 168 712 712 HOH WAT . G 5 HOH E 169 713 713 HOH WAT . G 5 HOH E 170 714 714 HOH WAT . G 5 HOH E 171 715 715 HOH WAT . G 5 HOH E 172 716 716 HOH WAT . H 5 HOH I 1 505 505 HOH WAT . H 5 HOH I 2 506 506 HOH WAT . H 5 HOH I 3 508 508 HOH WAT . H 5 HOH I 4 511 511 HOH WAT . H 5 HOH I 5 521 521 HOH WAT . H 5 HOH I 6 533 533 HOH WAT . H 5 HOH I 7 538 538 HOH WAT . H 5 HOH I 8 540 540 HOH WAT . H 5 HOH I 9 554 554 HOH WAT . H 5 HOH I 10 557 557 HOH WAT . H 5 HOH I 11 574 574 HOH WAT . H 5 HOH I 12 577 577 HOH WAT . H 5 HOH I 13 578 578 HOH WAT . H 5 HOH I 14 579 579 HOH WAT . H 5 HOH I 15 587 587 HOH WAT . H 5 HOH I 16 595 595 HOH WAT . H 5 HOH I 17 598 598 HOH WAT . H 5 HOH I 18 604 604 HOH WAT . H 5 HOH I 19 606 606 HOH WAT . H 5 HOH I 20 611 611 HOH WAT . H 5 HOH I 21 614 614 HOH WAT . H 5 HOH I 22 616 616 HOH WAT . H 5 HOH I 23 622 622 HOH WAT . H 5 HOH I 24 623 623 HOH WAT . H 5 HOH I 25 633 633 HOH WAT . H 5 HOH I 26 636 636 HOH WAT . H 5 HOH I 27 638 638 HOH WAT . H 5 HOH I 28 641 641 HOH WAT . H 5 HOH I 29 643 643 HOH WAT . H 5 HOH I 30 647 647 HOH WAT . H 5 HOH I 31 648 648 HOH WAT . H 5 HOH I 32 650 650 HOH WAT . H 5 HOH I 33 659 659 HOH WAT . H 5 HOH I 34 661 661 HOH WAT . H 5 HOH I 35 663 663 HOH WAT . H 5 HOH I 36 665 665 HOH WAT . H 5 HOH I 37 673 673 HOH WAT . H 5 HOH I 38 681 681 HOH WAT . H 5 HOH I 39 685 685 HOH WAT . H 5 HOH I 40 686 686 HOH WAT . H 5 HOH I 41 689 689 HOH WAT . H 5 HOH I 42 698 698 HOH WAT . H 5 HOH I 43 700 700 HOH WAT . H 5 HOH I 44 703 703 HOH WAT . H 5 HOH I 45 717 717 HOH WAT . H 5 HOH I 46 718 718 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x -9.088 _atom_site.Cartn_y -74.966 _atom_site.Cartn_z -13.311 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 11.67 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 500 _atom_site.auth_asym_id E _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 9 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 278 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 1 #