data_1G12 # _model_server_result.job_id orvRoLeJ0Wu6ZA4DaaiPng _model_server_result.datetime_utc '2025-04-24 01:34:08' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1g12 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":900}' # _entry.id 1G12 # _exptl.entry_id 1G12 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 180.156 _entity.id 2 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description alpha-D-mannopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 95.48 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1G12 _cell.length_a 43.631 _cell.length_b 41.757 _cell.length_c 76.941 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1G12 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 5 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'C 1 2 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 5 A CYS 5 1_555 A SG CYS 75 A CYS 75 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 77 A CYS 77 1_555 A SG CYS 97 A CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? covale ? covale1 A OG1 THR 42 A THR 42 1_555 B C1 MAN . A MAN 900 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.482 ? metalc ? metalc1 A NE2 HIS 117 A HIS 117 1_555 C ZN ZN . A ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.996 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 121 A HIS 121 1_555 C ZN ZN . A ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 130 A ASP 130 1_555 C ZN ZN . A ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.14 ? metalc ? metalc4 A OD2 ASP 130 A ASP 130 1_555 C ZN ZN . A ZN 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.459 ? metalc ? metalc5 C ZN ZN . A ZN 200 1_555 D O HOH . A HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.258 ? metalc ? metalc6 C ZN ZN . A ZN 200 1_555 D O HOH . A HOH 754 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? # _chem_comp.formula 'C6 H12 O6' _chem_comp.formula_weight 180.156 _chem_comp.id MAN _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name alpha-D-mannopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, alpha linking' _chem_comp.pdbx_synonyms alpha-D-mannose;D-mannose;mannose # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 MAN sing 218 n n C1 O1 MAN sing 219 n n C1 O5 MAN sing 220 n n C1 H1 MAN sing 221 n n C2 C3 MAN sing 222 n n C2 O2 MAN sing 223 n n C2 H2 MAN sing 224 n n C3 C4 MAN sing 225 n n C3 O3 MAN sing 226 n n C3 H3 MAN sing 227 n n C4 C5 MAN sing 228 n n C4 O4 MAN sing 229 n n C4 H4 MAN sing 230 n n C5 C6 MAN sing 231 n n C5 O5 MAN sing 232 n n C5 H5 MAN sing 233 n n C6 O6 MAN sing 234 n n C6 H61 MAN sing 235 n n C6 H62 MAN sing 236 n n O1 HO1 MAN sing 237 n n O2 HO2 MAN sing 238 n n O3 HO3 MAN sing 239 n n O4 HO4 MAN sing 240 n n O6 HO6 MAN sing 241 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version MAN DManpa 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 MAN a-D-mannopyranose 'COMMON NAME' GMML 1 MAN a-D-Manp 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 MAN Man 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 1G12 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.022919 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.002199 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.023948 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.013057 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 MAN A 1 900 900 MAN MAN . C 3 ZN A 1 200 200 ZN ZN . D 4 HOH A 1 201 201 HOH WAT . D 4 HOH A 2 202 202 HOH WAT . D 4 HOH A 3 204 204 HOH WAT . D 4 HOH A 4 205 205 HOH WAT . D 4 HOH A 5 206 206 HOH WAT . D 4 HOH A 6 207 207 HOH WAT . D 4 HOH A 7 208 208 HOH WAT . D 4 HOH A 8 209 209 HOH WAT . D 4 HOH A 9 210 210 HOH WAT . D 4 HOH A 10 211 211 HOH WAT . D 4 HOH A 11 212 212 HOH WAT . D 4 HOH A 12 213 213 HOH WAT . D 4 HOH A 13 214 214 HOH WAT . D 4 HOH A 14 215 215 HOH WAT . D 4 HOH A 15 216 216 HOH WAT . D 4 HOH A 16 217 217 HOH WAT . D 4 HOH A 17 219 219 HOH WAT . D 4 HOH A 18 220 220 HOH WAT . D 4 HOH A 19 221 221 HOH WAT . D 4 HOH A 20 222 222 HOH WAT . D 4 HOH A 21 223 223 HOH WAT . D 4 HOH A 22 224 224 HOH WAT . D 4 HOH A 23 225 225 HOH WAT . D 4 HOH A 24 226 226 HOH WAT . D 4 HOH A 25 227 227 HOH WAT . D 4 HOH A 26 228 228 HOH WAT . D 4 HOH A 27 229 229 HOH WAT . D 4 HOH A 28 230 230 HOH WAT . D 4 HOH A 29 231 231 HOH WAT . D 4 HOH A 30 232 232 HOH WAT . D 4 HOH A 31 233 233 HOH WAT . D 4 HOH A 32 234 234 HOH WAT . D 4 HOH A 33 235 235 HOH WAT . D 4 HOH A 34 236 236 HOH WAT . D 4 HOH A 35 238 238 HOH WAT . D 4 HOH A 36 240 240 HOH WAT . D 4 HOH A 37 241 241 HOH WAT . D 4 HOH A 38 242 242 HOH WAT . D 4 HOH A 39 243 243 HOH WAT . D 4 HOH A 40 244 244 HOH WAT . D 4 HOH A 41 246 246 HOH WAT . D 4 HOH A 42 247 247 HOH WAT . D 4 HOH A 43 248 248 HOH WAT . D 4 HOH A 44 249 249 HOH WAT . D 4 HOH A 45 250 250 HOH WAT . D 4 HOH A 46 251 251 HOH WAT . D 4 HOH A 47 252 252 HOH WAT . D 4 HOH A 48 253 253 HOH WAT . D 4 HOH A 49 255 255 HOH WAT . D 4 HOH A 50 256 256 HOH WAT . D 4 HOH A 51 257 257 HOH WAT . D 4 HOH A 52 259 259 HOH WAT . D 4 HOH A 53 260 260 HOH WAT . D 4 HOH A 54 263 263 HOH WAT . D 4 HOH A 55 267 267 HOH WAT . D 4 HOH A 56 269 269 HOH WAT . D 4 HOH A 57 271 271 HOH WAT . D 4 HOH A 58 272 272 HOH WAT . D 4 HOH A 59 273 273 HOH WAT . D 4 HOH A 60 275 275 HOH WAT . D 4 HOH A 61 276 276 HOH WAT . D 4 HOH A 62 277 277 HOH WAT . D 4 HOH A 63 279 279 HOH WAT . D 4 HOH A 64 281 281 HOH WAT . D 4 HOH A 65 282 282 HOH WAT . D 4 HOH A 66 284 284 HOH WAT . D 4 HOH A 67 289 289 HOH WAT . D 4 HOH A 68 290 290 HOH WAT . D 4 HOH A 69 291 291 HOH WAT . D 4 HOH A 70 293 293 HOH WAT . D 4 HOH A 71 299 299 HOH WAT . D 4 HOH A 72 301 301 HOH WAT . D 4 HOH A 73 305 305 HOH WAT . D 4 HOH A 74 311 311 HOH WAT . D 4 HOH A 75 316 316 HOH WAT . D 4 HOH A 76 327 327 HOH WAT . D 4 HOH A 77 330 330 HOH WAT . D 4 HOH A 78 332 332 HOH WAT . D 4 HOH A 79 335 335 HOH WAT . D 4 HOH A 80 344 344 HOH WAT . D 4 HOH A 81 349 349 HOH WAT . D 4 HOH A 82 352 352 HOH WAT . D 4 HOH A 83 353 353 HOH WAT . D 4 HOH A 84 354 354 HOH WAT . D 4 HOH A 85 356 356 HOH WAT . D 4 HOH A 86 357 357 HOH WAT . D 4 HOH A 87 366 366 HOH WAT . D 4 HOH A 88 401 401 HOH WAT . D 4 HOH A 89 405 405 HOH WAT . D 4 HOH A 90 407 407 HOH WAT . D 4 HOH A 91 413 413 HOH WAT . D 4 HOH A 92 415 415 HOH WAT . D 4 HOH A 93 416 416 HOH WAT . D 4 HOH A 94 419 419 HOH WAT . D 4 HOH A 95 422 422 HOH WAT . D 4 HOH A 96 423 423 HOH WAT . D 4 HOH A 97 424 424 HOH WAT . D 4 HOH A 98 425 425 HOH WAT . D 4 HOH A 99 427 427 HOH WAT . D 4 HOH A 100 428 428 HOH WAT . D 4 HOH A 101 429 429 HOH WAT . D 4 HOH A 102 430 430 HOH WAT . D 4 HOH A 103 432 432 HOH WAT . D 4 HOH A 104 441 441 HOH WAT . D 4 HOH A 105 505 505 HOH WAT . D 4 HOH A 106 508 508 HOH WAT . D 4 HOH A 107 510 510 HOH WAT . D 4 HOH A 108 512 512 HOH WAT . D 4 HOH A 109 514 514 HOH WAT . D 4 HOH A 110 515 515 HOH WAT . D 4 HOH A 111 516 516 HOH WAT . D 4 HOH A 112 521 521 HOH WAT . D 4 HOH A 113 522 522 HOH WAT . D 4 HOH A 114 525 525 HOH WAT . D 4 HOH A 115 526 526 HOH WAT . D 4 HOH A 116 531 531 HOH WAT . D 4 HOH A 117 534 534 HOH WAT . D 4 HOH A 118 538 538 HOH WAT . D 4 HOH A 119 539 539 HOH WAT . D 4 HOH A 120 540 540 HOH WAT . D 4 HOH A 121 541 541 HOH WAT . D 4 HOH A 122 543 543 HOH WAT . D 4 HOH A 123 545 545 HOH WAT . D 4 HOH A 124 547 547 HOH WAT . D 4 HOH A 125 549 549 HOH WAT . D 4 HOH A 126 558 558 HOH WAT . D 4 HOH A 127 559 559 HOH WAT . D 4 HOH A 128 562 562 HOH WAT . D 4 HOH A 129 566 566 HOH WAT . D 4 HOH A 130 568 568 HOH WAT . D 4 HOH A 131 572 572 HOH WAT . D 4 HOH A 132 574 574 HOH WAT . D 4 HOH A 133 575 575 HOH WAT . D 4 HOH A 134 576 576 HOH WAT . D 4 HOH A 135 577 577 HOH WAT . D 4 HOH A 136 579 579 HOH WAT . D 4 HOH A 137 584 584 HOH WAT . D 4 HOH A 138 585 585 HOH WAT . D 4 HOH A 139 586 586 HOH WAT . D 4 HOH A 140 587 587 HOH WAT . D 4 HOH A 141 588 588 HOH WAT . D 4 HOH A 142 591 591 HOH WAT . D 4 HOH A 143 593 593 HOH WAT . D 4 HOH A 144 594 594 HOH WAT . D 4 HOH A 145 595 595 HOH WAT . D 4 HOH A 146 601 601 HOH WAT . D 4 HOH A 147 602 602 HOH WAT . D 4 HOH A 148 603 603 HOH WAT . D 4 HOH A 149 607 607 HOH WAT . D 4 HOH A 150 608 608 HOH WAT . D 4 HOH A 151 609 609 HOH WAT . D 4 HOH A 152 612 612 HOH WAT . D 4 HOH A 153 617 617 HOH WAT . D 4 HOH A 154 618 618 HOH WAT . D 4 HOH A 155 622 622 HOH WAT . D 4 HOH A 156 626 626 HOH WAT . D 4 HOH A 157 629 629 HOH WAT . D 4 HOH A 158 631 631 HOH WAT . D 4 HOH A 159 632 632 HOH WAT . D 4 HOH A 160 633 633 HOH WAT . D 4 HOH A 161 634 634 HOH WAT . D 4 HOH A 162 635 635 HOH WAT . D 4 HOH A 163 636 636 HOH WAT . D 4 HOH A 164 637 637 HOH WAT . D 4 HOH A 165 642 642 HOH WAT . D 4 HOH A 166 643 643 HOH WAT . D 4 HOH A 167 644 644 HOH WAT . D 4 HOH A 168 646 646 HOH WAT . D 4 HOH A 169 650 650 HOH WAT . D 4 HOH A 170 656 656 HOH WAT . D 4 HOH A 171 657 657 HOH WAT . D 4 HOH A 172 665 665 HOH WAT . D 4 HOH A 173 669 669 HOH WAT . D 4 HOH A 174 670 670 HOH WAT . D 4 HOH A 175 674 674 HOH WAT . D 4 HOH A 176 677 677 HOH WAT . D 4 HOH A 177 680 680 HOH WAT . D 4 HOH A 178 681 681 HOH WAT . D 4 HOH A 179 696 696 HOH WAT . D 4 HOH A 180 699 699 HOH WAT . D 4 HOH A 181 702 702 HOH WAT . D 4 HOH A 182 707 707 HOH WAT . D 4 HOH A 183 716 716 HOH WAT . D 4 HOH A 184 718 718 HOH WAT . D 4 HOH A 185 719 719 HOH WAT . D 4 HOH A 186 723 723 HOH WAT . D 4 HOH A 187 724 724 HOH WAT . D 4 HOH A 188 728 728 HOH WAT . D 4 HOH A 189 733 733 HOH WAT . D 4 HOH A 190 735 735 HOH WAT . D 4 HOH A 191 736 736 HOH WAT . D 4 HOH A 192 738 738 HOH WAT . D 4 HOH A 193 739 739 HOH WAT . D 4 HOH A 194 740 740 HOH WAT . D 4 HOH A 195 741 741 HOH WAT . D 4 HOH A 196 742 742 HOH WAT . D 4 HOH A 197 743 743 HOH WAT . D 4 HOH A 198 751 751 HOH WAT . D 4 HOH A 199 752 752 HOH WAT . D 4 HOH A 200 753 753 HOH WAT . D 4 HOH A 201 754 754 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 MAN . . . B 2 29.936 0.554 31.014 1 19.2 ? C1 MAN 900 A 1 HETATM 2 C C2 MAN . . . B 2 31.179 0.777 30.244 1 19.95 ? C2 MAN 900 A 1 HETATM 3 C C3 MAN . . . B 2 32.24 -0.375 30.493 1 20.69 ? C3 MAN 900 A 1 HETATM 4 C C4 MAN . . . B 2 32.368 -0.787 31.998 1 21 ? C4 MAN 900 A 1 HETATM 5 C C5 MAN . . . B 2 31.099 -0.619 32.809 1 20.91 ? C5 MAN 900 A 1 HETATM 6 C C6 MAN . . . B 2 31.277 -0.43 34.308 1 21.36 ? C6 MAN 900 A 1 HETATM 7 O O2 MAN . . . B 2 31.736 2.052 30.621 1 20.7 ? O2 MAN 900 A 1 HETATM 8 O O3 MAN . . . B 2 33.539 0.009 30.019 1 20.81 ? O3 MAN 900 A 1 HETATM 9 O O4 MAN . . . B 2 32.748 -2.161 32.108 1 21.67 ? O4 MAN 900 A 1 HETATM 10 O O5 MAN . . . B 2 30.257 0.535 32.432 1 20.26 ? O5 MAN 900 A 1 HETATM 11 O O6 MAN . . . B 2 30.793 -1.503 35.12 1 22.24 ? O6 MAN 900 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 6 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 311 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 11 #