data_1G2W # _model_server_result.job_id FrhScZeOH_m1892HdBS_pQ _model_server_result.datetime_utc '2025-04-27 05:49:35' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1g2w # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":285}' # _entry.id 1G2W # _exptl.entry_id 1G2W _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 247.142 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description "PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE" _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1G2W _cell.length_a 77.187 _cell.length_b 90.522 _cell.length_c 89.097 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1G2W _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 F N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale ? covale1 A NZ LYS 145 A LYS 145 1_555 E C4A PLP . A PLP 285 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.286 ? covale ? covale2 B NZ LYS 145 B LYS 445 1_555 F C4A PLP . B PLP 585 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.276 ? # _chem_comp.formula 'C8 H10 N O6 P' _chem_comp.formula_weight 247.142 _chem_comp.id PLP _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name "PYRIDOXAL-5'-PHOSPHATE" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 'VITAMIN B6 Phosphate' # _atom_sites.entry_id 1G2W _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012956 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.011047 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.011224 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 ACT A 1 900 900 ACT ACT . D 2 ACT A 1 901 901 ACT ACT . E 3 PLP A 1 285 285 PLP PLP . F 3 PLP B 1 585 585 PLP PLP . G 4 HOH A 1 600 600 HOH WAT . G 4 HOH A 2 601 601 HOH WAT . G 4 HOH A 3 604 604 HOH WAT . G 4 HOH A 4 608 608 HOH WAT . G 4 HOH A 5 610 610 HOH WAT . G 4 HOH A 6 614 614 HOH WAT . G 4 HOH A 7 615 615 HOH WAT . G 4 HOH A 8 617 617 HOH WAT . G 4 HOH A 9 619 619 HOH WAT . G 4 HOH A 10 620 620 HOH WAT . G 4 HOH A 11 621 621 HOH WAT . G 4 HOH A 12 622 622 HOH WAT . G 4 HOH A 13 623 623 HOH WAT . G 4 HOH A 14 625 625 HOH WAT . G 4 HOH A 15 626 626 HOH WAT . G 4 HOH A 16 627 627 HOH WAT . G 4 HOH A 17 628 628 HOH WAT . G 4 HOH A 18 629 629 HOH WAT . G 4 HOH A 19 632 632 HOH WAT . G 4 HOH A 20 634 634 HOH WAT . G 4 HOH A 21 639 639 HOH WAT . G 4 HOH A 22 641 641 HOH WAT . G 4 HOH A 23 642 642 HOH WAT . G 4 HOH A 24 643 643 HOH WAT . G 4 HOH A 25 644 644 HOH WAT . G 4 HOH A 26 645 645 HOH WAT . G 4 HOH A 27 647 647 HOH WAT . G 4 HOH A 28 649 649 HOH WAT . G 4 HOH A 29 651 651 HOH WAT . G 4 HOH A 30 652 652 HOH WAT . G 4 HOH A 31 654 654 HOH WAT . G 4 HOH A 32 655 655 HOH WAT . G 4 HOH A 33 657 657 HOH WAT . G 4 HOH A 34 660 660 HOH WAT . G 4 HOH A 35 662 662 HOH WAT . G 4 HOH A 36 664 664 HOH WAT . G 4 HOH A 37 667 667 HOH WAT . G 4 HOH A 38 670 670 HOH WAT . G 4 HOH A 39 671 671 HOH WAT . G 4 HOH A 40 677 677 HOH WAT . G 4 HOH A 41 678 678 HOH WAT . G 4 HOH A 42 679 679 HOH WAT . G 4 HOH A 43 681 681 HOH WAT . G 4 HOH A 44 682 682 HOH WAT . G 4 HOH A 45 683 683 HOH WAT . G 4 HOH A 46 684 684 HOH WAT . G 4 HOH A 47 685 685 HOH WAT . G 4 HOH A 48 688 688 HOH WAT . G 4 HOH A 49 692 692 HOH WAT . G 4 HOH A 50 693 693 HOH WAT . G 4 HOH A 51 694 694 HOH WAT . G 4 HOH A 52 696 696 HOH WAT . G 4 HOH A 53 698 698 HOH WAT . G 4 HOH A 54 700 700 HOH WAT . G 4 HOH A 55 701 701 HOH WAT . G 4 HOH A 56 702 702 HOH WAT . G 4 HOH A 57 705 705 HOH WAT . G 4 HOH A 58 706 706 HOH WAT . G 4 HOH A 59 708 708 HOH WAT . G 4 HOH A 60 712 712 HOH WAT . G 4 HOH A 61 716 716 HOH WAT . G 4 HOH A 62 721 721 HOH WAT . G 4 HOH A 63 722 722 HOH WAT . G 4 HOH A 64 723 723 HOH WAT . G 4 HOH A 65 725 725 HOH WAT . G 4 HOH A 66 726 726 HOH WAT . G 4 HOH A 67 730 730 HOH WAT . G 4 HOH A 68 733 733 HOH WAT . G 4 HOH A 69 734 734 HOH WAT . G 4 HOH A 70 739 739 HOH WAT . G 4 HOH A 71 740 740 HOH WAT . G 4 HOH A 72 741 741 HOH WAT . G 4 HOH A 73 742 742 HOH WAT . G 4 HOH A 74 743 743 HOH WAT . G 4 HOH A 75 744 744 HOH WAT . G 4 HOH A 76 745 745 HOH WAT . G 4 HOH A 77 746 746 HOH WAT . G 4 HOH A 78 747 747 HOH WAT . G 4 HOH A 79 748 748 HOH WAT . G 4 HOH A 80 749 749 HOH WAT . G 4 HOH A 81 750 750 HOH WAT . G 4 HOH A 82 751 751 HOH WAT . G 4 HOH A 83 754 754 HOH WAT . G 4 HOH A 84 755 755 HOH WAT . G 4 HOH A 85 760 760 HOH WAT . G 4 HOH A 86 765 765 HOH WAT . G 4 HOH A 87 767 767 HOH WAT . G 4 HOH A 88 772 772 HOH WAT . G 4 HOH A 89 776 776 HOH WAT . G 4 HOH A 90 777 777 HOH WAT . G 4 HOH A 91 779 779 HOH WAT . G 4 HOH A 92 781 781 HOH WAT . G 4 HOH A 93 783 783 HOH WAT . G 4 HOH A 94 784 784 HOH WAT . G 4 HOH A 95 788 788 HOH WAT . G 4 HOH A 96 789 789 HOH WAT . G 4 HOH A 97 790 790 HOH WAT . G 4 HOH A 98 792 792 HOH WAT . G 4 HOH A 99 793 793 HOH WAT . G 4 HOH A 100 794 794 HOH WAT . G 4 HOH A 101 795 795 HOH WAT . H 4 HOH B 1 602 602 HOH WAT . H 4 HOH B 2 603 603 HOH WAT . H 4 HOH B 3 605 605 HOH WAT . H 4 HOH B 4 606 606 HOH WAT . H 4 HOH B 5 607 607 HOH WAT . H 4 HOH B 6 609 609 HOH WAT . H 4 HOH B 7 611 611 HOH WAT . H 4 HOH B 8 612 612 HOH WAT . H 4 HOH B 9 613 613 HOH WAT . H 4 HOH B 10 616 616 HOH WAT . H 4 HOH B 11 618 618 HOH WAT . H 4 HOH B 12 624 624 HOH WAT . H 4 HOH B 13 630 630 HOH WAT . H 4 HOH B 14 631 631 HOH WAT . H 4 HOH B 15 633 633 HOH WAT . H 4 HOH B 16 635 635 HOH WAT . H 4 HOH B 17 636 636 HOH WAT . H 4 HOH B 18 637 637 HOH WAT . H 4 HOH B 19 638 638 HOH WAT . H 4 HOH B 20 640 640 HOH WAT . H 4 HOH B 21 646 646 HOH WAT . H 4 HOH B 22 648 648 HOH WAT . H 4 HOH B 23 650 650 HOH WAT . H 4 HOH B 24 653 653 HOH WAT . H 4 HOH B 25 656 656 HOH WAT . H 4 HOH B 26 658 658 HOH WAT . H 4 HOH B 27 659 659 HOH WAT . H 4 HOH B 28 661 661 HOH WAT . H 4 HOH B 29 663 663 HOH WAT . H 4 HOH B 30 665 665 HOH WAT . H 4 HOH B 31 666 666 HOH WAT . H 4 HOH B 32 668 668 HOH WAT . H 4 HOH B 33 669 669 HOH WAT . H 4 HOH B 34 672 672 HOH WAT . H 4 HOH B 35 673 673 HOH WAT . H 4 HOH B 36 674 674 HOH WAT . H 4 HOH B 37 675 675 HOH WAT . H 4 HOH B 38 676 676 HOH WAT . H 4 HOH B 39 680 680 HOH WAT . H 4 HOH B 40 686 686 HOH WAT . H 4 HOH B 41 687 687 HOH WAT . H 4 HOH B 42 689 689 HOH WAT . H 4 HOH B 43 690 690 HOH WAT . H 4 HOH B 44 691 691 HOH WAT . H 4 HOH B 45 695 695 HOH WAT . H 4 HOH B 46 697 697 HOH WAT . H 4 HOH B 47 699 699 HOH WAT . H 4 HOH B 48 703 703 HOH WAT . H 4 HOH B 49 704 704 HOH WAT . H 4 HOH B 50 707 707 HOH WAT . H 4 HOH B 51 709 709 HOH WAT . H 4 HOH B 52 710 710 HOH WAT . H 4 HOH B 53 711 711 HOH WAT . H 4 HOH B 54 713 713 HOH WAT . H 4 HOH B 55 714 714 HOH WAT . H 4 HOH B 56 715 715 HOH WAT . H 4 HOH B 57 717 717 HOH WAT . H 4 HOH B 58 718 718 HOH WAT . H 4 HOH B 59 719 719 HOH WAT . H 4 HOH B 60 720 720 HOH WAT . H 4 HOH B 61 724 724 HOH WAT . H 4 HOH B 62 727 727 HOH WAT . H 4 HOH B 63 728 728 HOH WAT . H 4 HOH B 64 729 729 HOH WAT . H 4 HOH B 65 731 731 HOH WAT . H 4 HOH B 66 732 732 HOH WAT . H 4 HOH B 67 735 735 HOH WAT . H 4 HOH B 68 736 736 HOH WAT . H 4 HOH B 69 737 737 HOH WAT . H 4 HOH B 70 738 738 HOH WAT . H 4 HOH B 71 752 752 HOH WAT . H 4 HOH B 72 753 753 HOH WAT . H 4 HOH B 73 756 756 HOH WAT . H 4 HOH B 74 757 757 HOH WAT . H 4 HOH B 75 758 758 HOH WAT . H 4 HOH B 76 759 759 HOH WAT . H 4 HOH B 77 761 761 HOH WAT . H 4 HOH B 78 762 762 HOH WAT . H 4 HOH B 79 763 763 HOH WAT . H 4 HOH B 80 764 764 HOH WAT . H 4 HOH B 81 766 766 HOH WAT . H 4 HOH B 82 768 768 HOH WAT . H 4 HOH B 83 769 769 HOH WAT . H 4 HOH B 84 770 770 HOH WAT . H 4 HOH B 85 771 771 HOH WAT . H 4 HOH B 86 773 773 HOH WAT . H 4 HOH B 87 774 774 HOH WAT . H 4 HOH B 88 775 775 HOH WAT . H 4 HOH B 89 778 778 HOH WAT . H 4 HOH B 90 780 780 HOH WAT . H 4 HOH B 91 782 782 HOH WAT . H 4 HOH B 92 785 785 HOH WAT . H 4 HOH B 93 786 786 HOH WAT . H 4 HOH B 94 787 787 HOH WAT . H 4 HOH B 95 791 791 HOH WAT . H 4 HOH B 96 796 796 HOH WAT . H 4 HOH B 97 797 797 HOH WAT . H 4 HOH B 98 798 798 HOH WAT . H 4 HOH B 99 799 799 HOH WAT . H 4 HOH B 100 800 800 HOH WAT . H 4 HOH B 101 801 801 HOH WAT . H 4 HOH B 102 802 802 HOH WAT . H 4 HOH B 103 803 803 HOH WAT . H 4 HOH B 104 804 804 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 N N1 PLP . . . E 3 43.469 18.222 11.662 1 21.47 ? N1 PLP 285 A 1 HETATM 2 C C2 PLP . . . E 3 43.058 18.179 12.959 1 26.69 ? C2 PLP 285 A 1 HETATM 3 C C2A PLP . . . E 3 41.809 17.365 13.277 1 20.2 ? C2A PLP 285 A 1 HETATM 4 C C3 PLP . . . E 3 43.846 18.913 13.905 1 21.57 ? C3 PLP 285 A 1 HETATM 5 O O3 PLP . . . E 3 43.403 18.852 15.175 1 24.77 ? O3 PLP 285 A 1 HETATM 6 C C4 PLP . . . E 3 45 19.648 13.497 1 20.65 ? C4 PLP 285 A 1 HETATM 7 C C4A PLP . . . E 3 45.792 20.408 14.466 1 23.44 ? C4A PLP 285 A 1 HETATM 8 C C5 PLP . . . E 3 45.317 19.592 12.077 1 23.38 ? C5 PLP 285 A 1 HETATM 9 C C6 PLP . . . E 3 44.553 18.886 11.194 1 20.73 ? C6 PLP 285 A 1 HETATM 10 C C5A PLP . . . E 3 46.53 20.303 11.439 1 14.35 ? C5A PLP 285 A 1 HETATM 11 O O4P PLP . . . E 3 46.604 21.674 11.656 1 14.11 ? O4P PLP 285 A 1 HETATM 12 P P PLP . . . E 3 48.039 22.308 11.614 1 17.17 ? P PLP 285 A 1 HETATM 13 O O1P PLP . . . E 3 48.933 21.509 12.466 1 16.54 ? O1P PLP 285 A 1 HETATM 14 O O2P PLP . . . E 3 47.934 23.749 12.142 1 14.04 ? O2P PLP 285 A 1 HETATM 15 O O3P PLP . . . E 3 48.473 22.321 10.195 1 21.52 ? O3P PLP 285 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 7 _model_server_stats.create_model_time_ms 5 _model_server_stats.query_time_ms 586 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 15 #