data_1G4Y
#
_model_server_result.job_id            0dOT7AdxBzJR3iJosSifag 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-01 07:08:13' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1g4y 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":1001}' 
#
_entry.id    1G4Y 
#
_exptl.entry_id    1G4Y 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          93.7 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1G4Y 
_cell.length_a            77.65 
_cell.length_b            66.69 
_cell.length_c            64.69 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1G4Y 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA,PQS 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    tetrameric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      4 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 2_656 -x+1,y,-z+1 -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 73.475405 0 64.555161 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 D N N 
? 4 E N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 B OD1 ASP 20 R ASP 20 1_555 D CA CA . R CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.403 ? 
metalc ? metalc2 B OD1 ASP 22 R ASP 22 1_555 D CA CA . R CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? 
metalc ? metalc3 B OD2 ASP 22 R ASP 22 1_555 D CA CA . R CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.313 ? 
metalc ? metalc4 B OD1 ASP 24 R ASP 24 1_555 D CA CA . R CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.333 ? 
metalc ? metalc5 B O THR 26 R THR 26 1_555 D CA CA . R CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.334 ? 
metalc ? metalc6 B OE2 GLU 31 R GLU 31 1_555 D CA CA . R CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.677 ? 
metalc ? metalc7 B OE1 GLU 31 R GLU 31 1_555 D CA CA . R CA 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.322 ? 
metalc ? metalc8 B OD1 ASP 56 R ASP 56 1_555 E CA CA . R CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.054 ? 
metalc ? metalc9 B OD2 ASP 58 R ASP 58 1_555 E CA CA . R CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.419 ? 
metalc ? metalc10 B OD1 ASN 60 R ASN 60 1_555 E CA CA . R CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.641 ? 
metalc ? metalc11 B O THR 62 R THR 62 1_555 E CA CA . R CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.684 ? 
metalc ? metalc12 B OE1 GLU 67 R GLU 67 1_555 E CA CA . R CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.031 ? 
metalc ? metalc13 B OE2 GLU 67 R GLU 67 1_555 E CA CA . R CA 1002 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.232 ? 
metalc ? metalc14 D CA CA . R CA 1001 1_555 G O HOH . R HOH 1024 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.249 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1G4Y 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.012878 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.000833 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.014995 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.015491 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 3 SO4 B 1 799 799 SO4 SO4 . 
D 4 CA R 1 1001 1 CA CA2 . 
E 4 CA R 1 1002 2 CA CA2 . 
F 5 HOH B 1 800 2 HOH WAT . 
F 5 HOH B 2 801 3 HOH WAT . 
F 5 HOH B 3 802 7 HOH WAT . 
F 5 HOH B 4 803 9 HOH WAT . 
F 5 HOH B 5 804 11 HOH WAT . 
F 5 HOH B 6 805 17 HOH WAT . 
F 5 HOH B 7 806 22 HOH WAT . 
F 5 HOH B 8 807 27 HOH WAT . 
F 5 HOH B 9 808 34 HOH WAT . 
F 5 HOH B 10 809 45 HOH WAT . 
F 5 HOH B 11 810 51 HOH WAT . 
F 5 HOH B 12 811 52 HOH WAT . 
F 5 HOH B 13 812 53 HOH WAT . 
F 5 HOH B 14 813 57 HOH WAT . 
F 5 HOH B 15 814 63 HOH WAT . 
F 5 HOH B 16 815 67 HOH WAT . 
F 5 HOH B 17 816 68 HOH WAT . 
F 5 HOH B 18 817 70 HOH WAT . 
F 5 HOH B 19 818 71 HOH WAT . 
F 5 HOH B 20 819 75 HOH WAT . 
F 5 HOH B 21 820 76 HOH WAT . 
F 5 HOH B 22 821 92 HOH WAT . 
F 5 HOH B 23 822 2 HOH WAT . 
F 5 HOH B 24 823 7 HOH WAT . 
F 5 HOH B 25 824 9 HOH WAT . 
F 5 HOH B 26 825 12 HOH WAT . 
F 5 HOH B 27 826 15 HOH WAT . 
F 5 HOH B 28 827 19 HOH WAT . 
F 5 HOH B 29 828 2 HOH WAT . 
F 5 HOH B 30 829 3 HOH WAT . 
F 5 HOH B 31 830 5 HOH WAT . 
F 5 HOH B 32 831 7 HOH WAT . 
F 5 HOH B 33 832 9 HOH WAT . 
F 5 HOH B 34 833 13 HOH WAT . 
F 5 HOH B 35 834 14 HOH WAT . 
F 5 HOH B 36 835 19 HOH WAT . 
F 5 HOH B 37 836 22 HOH WAT . 
F 5 HOH B 38 837 29 HOH WAT . 
F 5 HOH B 39 838 30 HOH WAT . 
F 5 HOH B 40 839 35 HOH WAT . 
F 5 HOH B 41 840 36 HOH WAT . 
F 5 HOH B 42 841 37 HOH WAT . 
F 5 HOH B 43 842 43 HOH WAT . 
F 5 HOH B 44 843 51 HOH WAT . 
F 5 HOH B 45 844 11 HOH WAT . 
F 5 HOH B 46 845 16 HOH WAT . 
F 5 HOH B 47 846 18 HOH WAT . 
F 5 HOH B 48 847 20 HOH WAT . 
F 5 HOH B 49 848 21 HOH WAT . 
F 5 HOH B 50 849 23 HOH WAT . 
F 5 HOH B 51 850 25 HOH WAT . 
F 5 HOH B 52 851 26 HOH WAT . 
F 5 HOH B 53 852 31 HOH WAT . 
F 5 HOH B 54 853 33 HOH WAT . 
F 5 HOH B 55 854 1 HOH WAT . 
F 5 HOH B 56 855 2 HOH WAT . 
F 5 HOH B 57 856 3 HOH WAT . 
F 5 HOH B 58 857 4 HOH WAT . 
F 5 HOH B 59 858 6 HOH WAT . 
F 5 HOH B 60 859 7 HOH WAT . 
F 5 HOH B 61 860 12 HOH WAT . 
F 5 HOH B 62 861 15 HOH WAT . 
F 5 HOH B 63 862 1 HOH WAT . 
F 5 HOH B 64 863 10 HOH WAT . 
F 5 HOH B 65 864 11 HOH WAT . 
F 5 HOH B 66 865 12 HOH WAT . 
G 5 HOH R 1 1003 1 HOH WAT . 
G 5 HOH R 2 1004 4 HOH WAT . 
G 5 HOH R 3 1005 5 HOH WAT . 
G 5 HOH R 4 1006 8 HOH WAT . 
G 5 HOH R 5 1007 10 HOH WAT . 
G 5 HOH R 6 1008 12 HOH WAT . 
G 5 HOH R 7 1009 13 HOH WAT . 
G 5 HOH R 8 1010 16 HOH WAT . 
G 5 HOH R 9 1011 19 HOH WAT . 
G 5 HOH R 10 1012 20 HOH WAT . 
G 5 HOH R 11 1013 21 HOH WAT . 
G 5 HOH R 12 1014 23 HOH WAT . 
G 5 HOH R 13 1015 24 HOH WAT . 
G 5 HOH R 14 1016 25 HOH WAT . 
G 5 HOH R 15 1017 26 HOH WAT . 
G 5 HOH R 16 1018 28 HOH WAT . 
G 5 HOH R 17 1019 29 HOH WAT . 
G 5 HOH R 18 1020 30 HOH WAT . 
G 5 HOH R 19 1021 32 HOH WAT . 
G 5 HOH R 20 1022 33 HOH WAT . 
G 5 HOH R 21 1023 41 HOH WAT . 
G 5 HOH R 22 1024 43 HOH WAT . 
G 5 HOH R 23 1025 44 HOH WAT . 
G 5 HOH R 24 1026 47 HOH WAT . 
G 5 HOH R 25 1027 48 HOH WAT . 
G 5 HOH R 26 1028 49 HOH WAT . 
G 5 HOH R 27 1029 54 HOH WAT . 
G 5 HOH R 28 1030 55 HOH WAT . 
G 5 HOH R 29 1031 58 HOH WAT . 
G 5 HOH R 30 1032 59 HOH WAT . 
G 5 HOH R 31 1033 62 HOH WAT . 
G 5 HOH R 32 1034 72 HOH WAT . 
G 5 HOH R 33 1035 73 HOH WAT . 
G 5 HOH R 34 1036 77 HOH WAT . 
G 5 HOH R 35 1037 79 HOH WAT . 
G 5 HOH R 36 1038 83 HOH WAT . 
G 5 HOH R 37 1039 84 HOH WAT . 
G 5 HOH R 38 1040 86 HOH WAT . 
G 5 HOH R 39 1041 89 HOH WAT . 
G 5 HOH R 40 1042 95 HOH WAT . 
G 5 HOH R 41 1043 1 HOH WAT . 
G 5 HOH R 42 1044 3 HOH WAT . 
G 5 HOH R 43 1045 4 HOH WAT . 
G 5 HOH R 44 1046 5 HOH WAT . 
G 5 HOH R 45 1047 6 HOH WAT . 
G 5 HOH R 46 1048 8 HOH WAT . 
G 5 HOH R 47 1049 10 HOH WAT . 
G 5 HOH R 48 1050 13 HOH WAT . 
G 5 HOH R 49 1051 16 HOH WAT . 
G 5 HOH R 50 1052 18 HOH WAT . 
G 5 HOH R 51 1053 20 HOH WAT . 
G 5 HOH R 52 1054 1 HOH WAT . 
G 5 HOH R 53 1055 4 HOH WAT . 
G 5 HOH R 54 1056 6 HOH WAT . 
G 5 HOH R 55 1057 8 HOH WAT . 
G 5 HOH R 56 1058 10 HOH WAT . 
G 5 HOH R 57 1059 11 HOH WAT . 
G 5 HOH R 58 1060 12 HOH WAT . 
G 5 HOH R 59 1061 15 HOH WAT . 
G 5 HOH R 60 1062 16 HOH WAT . 
G 5 HOH R 61 1063 17 HOH WAT . 
G 5 HOH R 62 1064 18 HOH WAT . 
G 5 HOH R 63 1065 20 HOH WAT . 
G 5 HOH R 64 1066 21 HOH WAT . 
G 5 HOH R 65 1067 23 HOH WAT . 
G 5 HOH R 66 1068 24 HOH WAT . 
G 5 HOH R 67 1069 25 HOH WAT . 
G 5 HOH R 68 1070 26 HOH WAT . 
G 5 HOH R 69 1071 27 HOH WAT . 
G 5 HOH R 70 1072 28 HOH WAT . 
G 5 HOH R 71 1073 31 HOH WAT . 
G 5 HOH R 72 1074 32 HOH WAT . 
G 5 HOH R 73 1075 33 HOH WAT . 
G 5 HOH R 74 1076 34 HOH WAT . 
G 5 HOH R 75 1077 38 HOH WAT . 
G 5 HOH R 76 1078 39 HOH WAT . 
G 5 HOH R 77 1079 40 HOH WAT . 
G 5 HOH R 78 1080 41 HOH WAT . 
G 5 HOH R 79 1081 42 HOH WAT . 
G 5 HOH R 80 1082 44 HOH WAT . 
G 5 HOH R 81 1083 45 HOH WAT . 
G 5 HOH R 82 1084 46 HOH WAT . 
G 5 HOH R 83 1085 47 HOH WAT . 
G 5 HOH R 84 1086 48 HOH WAT . 
G 5 HOH R 85 1087 49 HOH WAT . 
G 5 HOH R 86 1088 50 HOH WAT . 
G 5 HOH R 87 1089 52 HOH WAT . 
G 5 HOH R 88 1090 53 HOH WAT . 
G 5 HOH R 89 1091 54 HOH WAT . 
G 5 HOH R 90 1092 55 HOH WAT . 
G 5 HOH R 91 1093 56 HOH WAT . 
G 5 HOH R 92 1094 1 HOH WAT . 
G 5 HOH R 93 1095 2 HOH WAT . 
G 5 HOH R 94 1096 3 HOH WAT . 
G 5 HOH R 95 1097 4 HOH WAT . 
G 5 HOH R 96 1098 5 HOH WAT . 
G 5 HOH R 97 1099 6 HOH WAT . 
G 5 HOH R 98 1100 7 HOH WAT . 
G 5 HOH R 99 1101 8 HOH WAT . 
G 5 HOH R 100 1102 9 HOH WAT . 
G 5 HOH R 101 1103 10 HOH WAT . 
G 5 HOH R 102 1104 12 HOH WAT . 
G 5 HOH R 103 1105 13 HOH WAT . 
G 5 HOH R 104 1106 14 HOH WAT . 
G 5 HOH R 105 1107 15 HOH WAT . 
G 5 HOH R 106 1108 17 HOH WAT . 
G 5 HOH R 107 1109 19 HOH WAT . 
G 5 HOH R 108 1110 22 HOH WAT . 
G 5 HOH R 109 1111 24 HOH WAT . 
G 5 HOH R 110 1112 27 HOH WAT . 
G 5 HOH R 111 1113 28 HOH WAT . 
G 5 HOH R 112 1114 29 HOH WAT . 
G 5 HOH R 113 1115 30 HOH WAT . 
G 5 HOH R 114 1116 32 HOH WAT . 
G 5 HOH R 115 1117 34 HOH WAT . 
G 5 HOH R 116 1118 5 HOH WAT . 
G 5 HOH R 117 1119 8 HOH WAT . 
G 5 HOH R 118 1120 9 HOH WAT . 
G 5 HOH R 119 1121 10 HOH WAT . 
G 5 HOH R 120 1122 11 HOH WAT . 
G 5 HOH R 121 1123 13 HOH WAT . 
G 5 HOH R 122 1124 14 HOH WAT . 
G 5 HOH R 123 1125 16 HOH WAT . 
G 5 HOH R 124 1126 2 HOH WAT . 
G 5 HOH R 125 1127 3 HOH WAT . 
G 5 HOH R 126 1128 4 HOH WAT . 
G 5 HOH R 127 1129 5 HOH WAT . 
G 5 HOH R 128 1130 6 HOH WAT . 
G 5 HOH R 129 1131 7 HOH WAT . 
G 5 HOH R 130 1132 8 HOH WAT . 
G 5 HOH R 131 1133 9 HOH WAT . 
G 5 HOH R 132 1134 13 HOH WAT . 
G 5 HOH R 133 1135 14 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         D 
_atom_site.label_entity_id       4 
_atom_site.Cartn_x               31.405 
_atom_site.Cartn_y               39.428 
_atom_site.Cartn_z               55.998 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        42.01 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           1001 
_atom_site.auth_asym_id          R 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              6 
_model_server_stats.parse_time_ms           7 
_model_server_stats.create_model_time_ms    3 
_model_server_stats.query_time_ms           244 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#