data_1G8R # _model_server_result.job_id Q6uugQVkBH7Cq394Q6OAYw _model_server_result.datetime_utc '2024-12-26 13:37:51' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1g8r # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":413}' # _entry.id 1G8R # _exptl.entry_id 1G8R _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 92.094 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description GLYCEROL _entity.pdbx_number_of_molecules 12 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1G8R _cell.length_a 68.9 _cell.length_b 98.6 _cell.length_c 159.4 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1G8R _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 E N N ? 2 F N N ? 2 G N N ? 2 H N N ? 2 I N N ? 2 J N N ? 2 K N N ? 2 L N N ? 2 M N N ? 2 N N N # _chem_comp.formula 'C3 H8 O3' _chem_comp.formula_weight 92.094 _chem_comp.id GOL _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name GLYCEROL _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 O1 GOL sing 129 n n C1 C2 GOL sing 130 n n C1 H11 GOL sing 131 n n C1 H12 GOL sing 132 n n O1 HO1 GOL sing 133 n n C2 O2 GOL sing 134 n n C2 C3 GOL sing 135 n n C2 H2 GOL sing 136 n n O2 HO2 GOL sing 137 n n C3 O3 GOL sing 138 n n C3 H31 GOL sing 139 n n C3 H32 GOL sing 140 n n O3 HO3 GOL sing 141 n n # _atom_sites.entry_id 1G8R _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014514 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010142 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.006274 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 GOL A 1 412 4 GOL GOL . D 2 GOL A 1 413 5 GOL GOL . E 2 GOL A 1 414 6 GOL GOL . F 2 GOL A 1 415 8 GOL GOL . G 2 GOL B 1 412 1 GOL GOL . H 2 GOL B 1 413 2 GOL GOL . I 2 GOL B 1 414 3 GOL GOL . J 2 GOL B 1 415 7 GOL GOL . K 2 GOL B 1 416 9 GOL GOL . L 2 GOL B 1 417 10 GOL GOL . M 2 GOL B 1 418 11 GOL GOL . N 2 GOL B 1 419 12 GOL GOL . O 3 HOH A 1 416 1 HOH WAT . O 3 HOH A 2 417 2 HOH WAT . O 3 HOH A 3 418 4 HOH WAT . O 3 HOH A 4 419 6 HOH WAT . O 3 HOH A 5 420 8 HOH WAT . O 3 HOH A 6 421 9 HOH WAT . O 3 HOH A 7 422 14 HOH WAT . O 3 HOH A 8 423 15 HOH WAT . O 3 HOH A 9 424 16 HOH WAT . O 3 HOH A 10 425 17 HOH WAT . O 3 HOH A 11 426 19 HOH WAT . O 3 HOH A 12 427 20 HOH WAT . O 3 HOH A 13 428 23 HOH WAT . O 3 HOH A 14 429 24 HOH WAT . O 3 HOH A 15 430 34 HOH WAT . O 3 HOH A 16 431 35 HOH WAT . O 3 HOH A 17 432 37 HOH WAT . O 3 HOH A 18 433 39 HOH WAT . O 3 HOH A 19 434 40 HOH WAT . O 3 HOH A 20 435 42 HOH WAT . O 3 HOH A 21 436 44 HOH WAT . O 3 HOH A 22 437 48 HOH WAT . O 3 HOH A 23 438 49 HOH WAT . O 3 HOH A 24 439 52 HOH WAT . O 3 HOH A 25 440 58 HOH WAT . O 3 HOH A 26 441 59 HOH WAT . O 3 HOH A 27 442 60 HOH WAT . O 3 HOH A 28 443 65 HOH WAT . O 3 HOH A 29 444 66 HOH WAT . O 3 HOH A 30 445 70 HOH WAT . O 3 HOH A 31 446 72 HOH WAT . O 3 HOH A 32 447 73 HOH WAT . O 3 HOH A 33 448 76 HOH WAT . O 3 HOH A 34 449 78 HOH WAT . O 3 HOH A 35 450 80 HOH WAT . O 3 HOH A 36 451 83 HOH WAT . O 3 HOH A 37 452 85 HOH WAT . O 3 HOH A 38 453 86 HOH WAT . O 3 HOH A 39 454 89 HOH WAT . O 3 HOH A 40 455 92 HOH WAT . O 3 HOH A 41 456 93 HOH WAT . O 3 HOH A 42 457 94 HOH WAT . O 3 HOH A 43 458 95 HOH WAT . O 3 HOH A 44 459 97 HOH WAT . O 3 HOH A 45 460 98 HOH WAT . O 3 HOH A 46 461 100 HOH WAT . O 3 HOH A 47 462 102 HOH WAT . O 3 HOH A 48 463 103 HOH WAT . O 3 HOH A 49 464 104 HOH WAT . O 3 HOH A 50 465 108 HOH WAT . O 3 HOH A 51 466 111 HOH WAT . O 3 HOH A 52 467 115 HOH WAT . O 3 HOH A 53 468 116 HOH WAT . O 3 HOH A 54 469 118 HOH WAT . O 3 HOH A 55 470 122 HOH WAT . O 3 HOH A 56 471 123 HOH WAT . O 3 HOH A 57 472 124 HOH WAT . O 3 HOH A 58 473 126 HOH WAT . O 3 HOH A 59 474 133 HOH WAT . O 3 HOH A 60 475 139 HOH WAT . O 3 HOH A 61 476 143 HOH WAT . O 3 HOH A 62 477 146 HOH WAT . O 3 HOH A 63 478 152 HOH WAT . O 3 HOH A 64 479 153 HOH WAT . O 3 HOH A 65 480 155 HOH WAT . O 3 HOH A 66 481 161 HOH WAT . O 3 HOH A 67 482 162 HOH WAT . O 3 HOH A 68 483 164 HOH WAT . O 3 HOH A 69 484 168 HOH WAT . O 3 HOH A 70 485 170 HOH WAT . O 3 HOH A 71 486 175 HOH WAT . O 3 HOH A 72 487 180 HOH WAT . O 3 HOH A 73 488 182 HOH WAT . O 3 HOH A 74 489 189 HOH WAT . O 3 HOH A 75 490 197 HOH WAT . O 3 HOH A 76 491 203 HOH WAT . O 3 HOH A 77 492 205 HOH WAT . O 3 HOH A 78 493 207 HOH WAT . O 3 HOH A 79 494 210 HOH WAT . O 3 HOH A 80 495 212 HOH WAT . O 3 HOH A 81 496 215 HOH WAT . O 3 HOH A 82 497 218 HOH WAT . O 3 HOH A 83 498 228 HOH WAT . O 3 HOH A 84 499 229 HOH WAT . O 3 HOH A 85 500 230 HOH WAT . O 3 HOH A 86 501 232 HOH WAT . O 3 HOH A 87 502 233 HOH WAT . O 3 HOH A 88 503 234 HOH WAT . O 3 HOH A 89 504 235 HOH WAT . O 3 HOH A 90 505 239 HOH WAT . O 3 HOH A 91 506 240 HOH WAT . O 3 HOH A 92 507 242 HOH WAT . O 3 HOH A 93 508 243 HOH WAT . O 3 HOH A 94 509 247 HOH WAT . P 3 HOH B 1 420 3 HOH WAT . P 3 HOH B 2 421 5 HOH WAT . P 3 HOH B 3 422 7 HOH WAT . P 3 HOH B 4 423 10 HOH WAT . P 3 HOH B 5 424 12 HOH WAT . P 3 HOH B 6 425 13 HOH WAT . P 3 HOH B 7 426 18 HOH WAT . P 3 HOH B 8 427 21 HOH WAT . P 3 HOH B 9 428 22 HOH WAT . P 3 HOH B 10 429 25 HOH WAT . P 3 HOH B 11 430 26 HOH WAT . P 3 HOH B 12 431 27 HOH WAT . P 3 HOH B 13 432 28 HOH WAT . P 3 HOH B 14 433 29 HOH WAT . P 3 HOH B 15 434 30 HOH WAT . P 3 HOH B 16 435 31 HOH WAT . P 3 HOH B 17 436 32 HOH WAT . P 3 HOH B 18 437 33 HOH WAT . P 3 HOH B 19 438 36 HOH WAT . P 3 HOH B 20 439 38 HOH WAT . P 3 HOH B 21 440 41 HOH WAT . P 3 HOH B 22 441 43 HOH WAT . P 3 HOH B 23 442 45 HOH WAT . P 3 HOH B 24 443 46 HOH WAT . P 3 HOH B 25 444 47 HOH WAT . P 3 HOH B 26 445 50 HOH WAT . P 3 HOH B 27 446 51 HOH WAT . P 3 HOH B 28 447 53 HOH WAT . P 3 HOH B 29 448 54 HOH WAT . P 3 HOH B 30 449 55 HOH WAT . P 3 HOH B 31 450 56 HOH WAT . P 3 HOH B 32 451 57 HOH WAT . P 3 HOH B 33 452 61 HOH WAT . P 3 HOH B 34 453 62 HOH WAT . P 3 HOH B 35 454 63 HOH WAT . P 3 HOH B 36 455 64 HOH WAT . P 3 HOH B 37 456 67 HOH WAT . P 3 HOH B 38 457 68 HOH WAT . P 3 HOH B 39 458 69 HOH WAT . P 3 HOH B 40 459 71 HOH WAT . P 3 HOH B 41 460 74 HOH WAT . P 3 HOH B 42 461 75 HOH WAT . P 3 HOH B 43 462 77 HOH WAT . P 3 HOH B 44 463 79 HOH WAT . P 3 HOH B 45 464 81 HOH WAT . P 3 HOH B 46 465 82 HOH WAT . P 3 HOH B 47 466 84 HOH WAT . P 3 HOH B 48 467 87 HOH WAT . P 3 HOH B 49 468 88 HOH WAT . P 3 HOH B 50 469 90 HOH WAT . P 3 HOH B 51 470 91 HOH WAT . P 3 HOH B 52 471 96 HOH WAT . P 3 HOH B 53 472 99 HOH WAT . P 3 HOH B 54 473 101 HOH WAT . P 3 HOH B 55 474 105 HOH WAT . P 3 HOH B 56 475 106 HOH WAT . P 3 HOH B 57 476 107 HOH WAT . P 3 HOH B 58 477 109 HOH WAT . P 3 HOH B 59 478 110 HOH WAT . P 3 HOH B 60 479 112 HOH WAT . P 3 HOH B 61 480 113 HOH WAT . P 3 HOH B 62 481 114 HOH WAT . P 3 HOH B 63 482 117 HOH WAT . P 3 HOH B 64 483 119 HOH WAT . P 3 HOH B 65 484 120 HOH WAT . P 3 HOH B 66 485 121 HOH WAT . P 3 HOH B 67 486 125 HOH WAT . P 3 HOH B 68 487 127 HOH WAT . P 3 HOH B 69 488 130 HOH WAT . P 3 HOH B 70 489 136 HOH WAT . P 3 HOH B 71 490 137 HOH WAT . P 3 HOH B 72 491 141 HOH WAT . P 3 HOH B 73 492 148 HOH WAT . P 3 HOH B 74 493 150 HOH WAT . P 3 HOH B 75 494 156 HOH WAT . P 3 HOH B 76 495 157 HOH WAT . P 3 HOH B 77 496 158 HOH WAT . P 3 HOH B 78 497 159 HOH WAT . P 3 HOH B 79 498 163 HOH WAT . P 3 HOH B 80 499 166 HOH WAT . P 3 HOH B 81 500 169 HOH WAT . P 3 HOH B 82 501 172 HOH WAT . P 3 HOH B 83 502 177 HOH WAT . P 3 HOH B 84 503 178 HOH WAT . P 3 HOH B 85 504 179 HOH WAT . P 3 HOH B 86 505 184 HOH WAT . P 3 HOH B 87 506 185 HOH WAT . P 3 HOH B 88 507 186 HOH WAT . P 3 HOH B 89 508 187 HOH WAT . P 3 HOH B 90 509 188 HOH WAT . P 3 HOH B 91 510 190 HOH WAT . P 3 HOH B 92 511 196 HOH WAT . P 3 HOH B 93 512 198 HOH WAT . P 3 HOH B 94 513 199 HOH WAT . P 3 HOH B 95 514 200 HOH WAT . P 3 HOH B 96 515 202 HOH WAT . P 3 HOH B 97 516 204 HOH WAT . P 3 HOH B 98 517 209 HOH WAT . P 3 HOH B 99 518 211 HOH WAT . P 3 HOH B 100 519 216 HOH WAT . P 3 HOH B 101 520 217 HOH WAT . P 3 HOH B 102 521 220 HOH WAT . P 3 HOH B 103 522 222 HOH WAT . P 3 HOH B 104 523 225 HOH WAT . P 3 HOH B 105 524 226 HOH WAT . P 3 HOH B 106 525 231 HOH WAT . P 3 HOH B 107 526 237 HOH WAT . P 3 HOH B 108 527 238 HOH WAT . P 3 HOH B 109 528 241 HOH WAT . P 3 HOH B 110 529 244 HOH WAT . P 3 HOH B 111 530 246 HOH WAT . P 3 HOH B 112 531 248 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 GOL . . . H 2 -1.931 42.852 58.796 1 47.48 ? C1 GOL 413 B 1 HETATM 2 O O1 GOL . . . H 2 -2.871 43.877 58.494 1 33.63 ? O1 GOL 413 B 1 HETATM 3 C C2 GOL . . . H 2 -2.616 41.612 59.426 1 56.74 ? C2 GOL 413 B 1 HETATM 4 O O2 GOL . . . H 2 -1.915 40.409 59.158 1 60.95 ? O2 GOL 413 B 1 HETATM 5 C C3 GOL . . . H 2 -4.044 41.433 58.906 1 60.6 ? C3 GOL 413 B 1 HETATM 6 O O3 GOL . . . H 2 -5.009 41.936 59.86 1 50.55 ? O3 GOL 413 B 1 # _model_server_stats.io_time_ms 7 _model_server_stats.parse_time_ms 6 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 304 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 6 #