data_1GCY # _model_server_result.job_id LibOcZDDUEUHx4cI8ajtUg _model_server_result.datetime_utc '2024-12-22 08:39:59' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1gcy # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":528}' # _entry.id 1GCY # _exptl.entry_id 1GCY _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1GCY _cell.length_a 69.42 _cell.length_b 171.66 _cell.length_c 46.35 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1GCY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 19 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 21 21 21' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 B N N ? 2 C N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 140 A CYS 140 1_555 A SG CYS 150 A CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 216 A CYS 216 1_555 A SG CYS 251 A CYS 251 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc ? metalc1 A OD1 ASP 1 A ASP 1 1_555 C CA CA . A CA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.607 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 1 A ASP 1 1_555 C CA CA . A CA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.666 ? metalc ? metalc3 A O GLN 2 A GLN 2 1_555 C CA CA . A CA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.402 ? metalc ? metalc4 A ND1 HIS 13 A HIS 13 1_555 C CA CA . A CA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc5 A O HIS 13 A HIS 13 1_555 C CA CA . A CA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.424 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 16 A ASP 16 1_555 C CA CA . A CA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.429 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 17 A GLU 17 1_555 C CA CA . A CA 529 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.399 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASN 116 A ASN 116 1_555 B CA CA . A CA 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.428 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 151 A ASP 151 1_555 B CA CA . A CA 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 151 A ASP 151 1_555 B CA CA . A CA 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc11 A O ASP 154 A ASP 154 1_555 B CA CA . A CA 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 162 A ASP 162 1_555 B CA CA . A CA 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.539 ? metalc ? metalc13 A O GLY 197 A GLY 197 1_555 B CA CA . A CA 528 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.342 ? metalc ? metalc14 B CA CA . A CA 528 1_555 D O HOH . A HOH 555 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.56 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1GCY _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.014405 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005825 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.021575 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 CA A 1 528 451 CA CAL . C 2 CA A 1 529 452 CA CAL . D 3 HOH A 1 530 501 HOH WAT . D 3 HOH A 2 531 502 HOH WAT . D 3 HOH A 3 532 503 HOH WAT . D 3 HOH A 4 533 504 HOH WAT . D 3 HOH A 5 534 505 HOH WAT . D 3 HOH A 6 535 506 HOH WAT . D 3 HOH A 7 536 507 HOH WAT . D 3 HOH A 8 537 508 HOH WAT . D 3 HOH A 9 538 509 HOH WAT . D 3 HOH A 10 539 510 HOH WAT . D 3 HOH A 11 540 511 HOH WAT . D 3 HOH A 12 541 512 HOH WAT . D 3 HOH A 13 542 513 HOH WAT . D 3 HOH A 14 543 514 HOH WAT . D 3 HOH A 15 544 515 HOH WAT . D 3 HOH A 16 545 516 HOH WAT . D 3 HOH A 17 546 517 HOH WAT . D 3 HOH A 18 547 518 HOH WAT . D 3 HOH A 19 548 519 HOH WAT . D 3 HOH A 20 549 520 HOH WAT . D 3 HOH A 21 550 521 HOH WAT . D 3 HOH A 22 551 522 HOH WAT . D 3 HOH A 23 552 523 HOH WAT . D 3 HOH A 24 553 524 HOH WAT . D 3 HOH A 25 554 525 HOH WAT . D 3 HOH A 26 555 526 HOH WAT . D 3 HOH A 27 556 527 HOH WAT . D 3 HOH A 28 557 528 HOH WAT . D 3 HOH A 29 558 529 HOH WAT . D 3 HOH A 30 559 530 HOH WAT . D 3 HOH A 31 560 531 HOH WAT . D 3 HOH A 32 561 532 HOH WAT . D 3 HOH A 33 562 533 HOH WAT . D 3 HOH A 34 563 534 HOH WAT . D 3 HOH A 35 564 535 HOH WAT . D 3 HOH A 36 565 536 HOH WAT . D 3 HOH A 37 566 537 HOH WAT . D 3 HOH A 38 567 538 HOH WAT . D 3 HOH A 39 568 539 HOH WAT . D 3 HOH A 40 569 540 HOH WAT . D 3 HOH A 41 570 541 HOH WAT . D 3 HOH A 42 571 542 HOH WAT . D 3 HOH A 43 572 543 HOH WAT . D 3 HOH A 44 573 544 HOH WAT . D 3 HOH A 45 574 545 HOH WAT . D 3 HOH A 46 575 546 HOH WAT . D 3 HOH A 47 576 547 HOH WAT . D 3 HOH A 48 577 548 HOH WAT . D 3 HOH A 49 578 549 HOH WAT . D 3 HOH A 50 579 550 HOH WAT . D 3 HOH A 51 580 551 HOH WAT . D 3 HOH A 52 581 552 HOH WAT . D 3 HOH A 53 582 553 HOH WAT . D 3 HOH A 54 583 554 HOH WAT . D 3 HOH A 55 584 555 HOH WAT . D 3 HOH A 56 585 556 HOH WAT . D 3 HOH A 57 586 557 HOH WAT . D 3 HOH A 58 587 558 HOH WAT . D 3 HOH A 59 588 559 HOH WAT . D 3 HOH A 60 589 560 HOH WAT . D 3 HOH A 61 590 561 HOH WAT . D 3 HOH A 62 591 562 HOH WAT . D 3 HOH A 63 592 563 HOH WAT . D 3 HOH A 64 593 564 HOH WAT . D 3 HOH A 65 594 565 HOH WAT . D 3 HOH A 66 595 566 HOH WAT . D 3 HOH A 67 596 567 HOH WAT . D 3 HOH A 68 597 568 HOH WAT . D 3 HOH A 69 598 569 HOH WAT . D 3 HOH A 70 599 570 HOH WAT . D 3 HOH A 71 600 571 HOH WAT . D 3 HOH A 72 601 572 HOH WAT . D 3 HOH A 73 602 573 HOH WAT . D 3 HOH A 74 603 574 HOH WAT . D 3 HOH A 75 604 575 HOH WAT . D 3 HOH A 76 605 576 HOH WAT . D 3 HOH A 77 606 577 HOH WAT . D 3 HOH A 78 607 578 HOH WAT . D 3 HOH A 79 608 579 HOH WAT . D 3 HOH A 80 609 580 HOH WAT . D 3 HOH A 81 610 581 HOH WAT . D 3 HOH A 82 611 582 HOH WAT . D 3 HOH A 83 612 583 HOH WAT . D 3 HOH A 84 613 584 HOH WAT . D 3 HOH A 85 614 585 HOH WAT . D 3 HOH A 86 615 586 HOH WAT . D 3 HOH A 87 616 587 HOH WAT . D 3 HOH A 88 617 588 HOH WAT . D 3 HOH A 89 618 589 HOH WAT . D 3 HOH A 90 619 590 HOH WAT . D 3 HOH A 91 620 591 HOH WAT . D 3 HOH A 92 621 592 HOH WAT . D 3 HOH A 93 622 593 HOH WAT . D 3 HOH A 94 623 594 HOH WAT . D 3 HOH A 95 624 595 HOH WAT . D 3 HOH A 96 625 596 HOH WAT . D 3 HOH A 97 626 597 HOH WAT . D 3 HOH A 98 627 598 HOH WAT . D 3 HOH A 99 628 599 HOH WAT . D 3 HOH A 100 629 600 HOH WAT . D 3 HOH A 101 630 601 HOH WAT . D 3 HOH A 102 631 602 HOH WAT . D 3 HOH A 103 632 603 HOH WAT . D 3 HOH A 104 633 604 HOH WAT . D 3 HOH A 105 634 605 HOH WAT . D 3 HOH A 106 635 606 HOH WAT . D 3 HOH A 107 636 607 HOH WAT . D 3 HOH A 108 637 608 HOH WAT . D 3 HOH A 109 638 609 HOH WAT . D 3 HOH A 110 639 610 HOH WAT . D 3 HOH A 111 640 611 HOH WAT . D 3 HOH A 112 641 612 HOH WAT . D 3 HOH A 113 642 613 HOH WAT . D 3 HOH A 114 643 614 HOH WAT . D 3 HOH A 115 644 615 HOH WAT . D 3 HOH A 116 645 616 HOH WAT . D 3 HOH A 117 646 617 HOH WAT . D 3 HOH A 118 647 618 HOH WAT . D 3 HOH A 119 648 619 HOH WAT . D 3 HOH A 120 649 620 HOH WAT . D 3 HOH A 121 650 621 HOH WAT . D 3 HOH A 122 651 622 HOH WAT . D 3 HOH A 123 652 623 HOH WAT . D 3 HOH A 124 653 624 HOH WAT . D 3 HOH A 125 654 625 HOH WAT . D 3 HOH A 126 655 626 HOH WAT . D 3 HOH A 127 656 627 HOH WAT . D 3 HOH A 128 657 628 HOH WAT . D 3 HOH A 129 658 629 HOH WAT . D 3 HOH A 130 659 630 HOH WAT . D 3 HOH A 131 660 631 HOH WAT . D 3 HOH A 132 661 632 HOH WAT . D 3 HOH A 133 662 633 HOH WAT . D 3 HOH A 134 663 634 HOH WAT . D 3 HOH A 135 664 635 HOH WAT . D 3 HOH A 136 665 636 HOH WAT . D 3 HOH A 137 666 637 HOH WAT . D 3 HOH A 138 667 638 HOH WAT . D 3 HOH A 139 668 639 HOH WAT . D 3 HOH A 140 669 640 HOH WAT . D 3 HOH A 141 670 641 HOH WAT . D 3 HOH A 142 671 642 HOH WAT . D 3 HOH A 143 672 643 HOH WAT . D 3 HOH A 144 673 644 HOH WAT . D 3 HOH A 145 674 645 HOH WAT . D 3 HOH A 146 675 646 HOH WAT . D 3 HOH A 147 676 647 HOH WAT . D 3 HOH A 148 677 648 HOH WAT . D 3 HOH A 149 678 649 HOH WAT . D 3 HOH A 150 679 650 HOH WAT . D 3 HOH A 151 680 651 HOH WAT . D 3 HOH A 152 681 652 HOH WAT . D 3 HOH A 153 682 653 HOH WAT . D 3 HOH A 154 683 654 HOH WAT . D 3 HOH A 155 684 655 HOH WAT . D 3 HOH A 156 685 656 HOH WAT . D 3 HOH A 157 686 657 HOH WAT . D 3 HOH A 158 687 658 HOH WAT . D 3 HOH A 159 688 659 HOH WAT . D 3 HOH A 160 689 660 HOH WAT . D 3 HOH A 161 690 661 HOH WAT . D 3 HOH A 162 691 662 HOH WAT . D 3 HOH A 163 692 663 HOH WAT . D 3 HOH A 164 693 664 HOH WAT . D 3 HOH A 165 694 665 HOH WAT . D 3 HOH A 166 695 666 HOH WAT . D 3 HOH A 167 696 667 HOH WAT . D 3 HOH A 168 697 668 HOH WAT . D 3 HOH A 169 698 669 HOH WAT . D 3 HOH A 170 699 670 HOH WAT . D 3 HOH A 171 700 671 HOH WAT . D 3 HOH A 172 701 672 HOH WAT . D 3 HOH A 173 702 673 HOH WAT . D 3 HOH A 174 703 674 HOH WAT . D 3 HOH A 175 704 675 HOH WAT . D 3 HOH A 176 705 676 HOH WAT . D 3 HOH A 177 706 677 HOH WAT . D 3 HOH A 178 707 678 HOH WAT . D 3 HOH A 179 708 679 HOH WAT . D 3 HOH A 180 709 680 HOH WAT . D 3 HOH A 181 710 681 HOH WAT . D 3 HOH A 182 711 682 HOH WAT . D 3 HOH A 183 712 683 HOH WAT . D 3 HOH A 184 713 684 HOH WAT . D 3 HOH A 185 714 685 HOH WAT . D 3 HOH A 186 715 686 HOH WAT . D 3 HOH A 187 716 687 HOH WAT . D 3 HOH A 188 717 688 HOH WAT . D 3 HOH A 189 718 689 HOH WAT . D 3 HOH A 190 719 690 HOH WAT . D 3 HOH A 191 720 691 HOH WAT . D 3 HOH A 192 721 692 HOH WAT . D 3 HOH A 193 722 693 HOH WAT . D 3 HOH A 194 723 694 HOH WAT . D 3 HOH A 195 724 695 HOH WAT . D 3 HOH A 196 725 696 HOH WAT . D 3 HOH A 197 726 697 HOH WAT . D 3 HOH A 198 727 698 HOH WAT . D 3 HOH A 199 728 699 HOH WAT . D 3 HOH A 200 729 700 HOH WAT . D 3 HOH A 201 730 701 HOH WAT . D 3 HOH A 202 731 702 HOH WAT . D 3 HOH A 203 732 703 HOH WAT . D 3 HOH A 204 733 704 HOH WAT . D 3 HOH A 205 734 705 HOH WAT . D 3 HOH A 206 735 706 HOH WAT . D 3 HOH A 207 736 707 HOH WAT . D 3 HOH A 208 737 708 HOH WAT . D 3 HOH A 209 738 709 HOH WAT . D 3 HOH A 210 739 710 HOH WAT . D 3 HOH A 211 740 711 HOH WAT . D 3 HOH A 212 741 712 HOH WAT . D 3 HOH A 213 742 713 HOH WAT . D 3 HOH A 214 743 714 HOH WAT . D 3 HOH A 215 744 715 HOH WAT . D 3 HOH A 216 745 716 HOH WAT . D 3 HOH A 217 746 717 HOH WAT . D 3 HOH A 218 747 718 HOH WAT . D 3 HOH A 219 748 719 HOH WAT . D 3 HOH A 220 749 720 HOH WAT . D 3 HOH A 221 750 721 HOH WAT . D 3 HOH A 222 751 722 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id B _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x 25.46 _atom_site.Cartn_y 92.606 _atom_site.Cartn_z 12.498 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 17.29 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 528 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 15 _model_server_stats.parse_time_ms 20 _model_server_stats.create_model_time_ms 9 _model_server_stats.query_time_ms 344 _model_server_stats.encode_time_ms 10 _model_server_stats.element_count 1 #