data_1HI0
#
_model_server_result.job_id            AjS4S0ViqceIn4GwiTP0DA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-01 04:39:31' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1hi0 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"N","auth_seq_id":667}' 
#
_entry.id    1HI0 
#
_exptl.entry_id    1HI0 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              523.18 
_entity.id                          4 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          101.09 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1HI0 
_cell.length_a            105.65 
_cell.length_b            92.7 
_cell.length_c            140.79 
_cell.Z_PDB               6 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1HI0 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        4 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 1 21 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PQS dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PQS dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 2 
PQS dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 3 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,D,G,H,I,J,K 1 1 
B,E,L,M,N,O,P 2 1 
C,F,Q,R,S,T,U 3 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 4 H N N 
? 4 I N N 
? 4 M N N 
? 4 N N N 
? 4 R N N 
? 4 S N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 D O VAL 325 P VAL 325 1_555 J MG MG . P MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.868 ? 
metalc ? metalc2 D OD1 ASP 453 P ASP 453 1_555 J MG MG . P MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? 
metalc ? metalc3 D OD1 ASP 454 P ASP 454 1_555 G MN MN . P MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? 
metalc ? metalc4 D OE1 GLU 491 P GLU 491 1_555 G MN MN . P MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.9 ? 
metalc ? metalc5 D O ALA 495 P ALA 495 1_555 G MN MN . P MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? 
metalc ? metalc6 I O2B GTP . P GTP 667 1_555 J MG MG . P MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? 
metalc ? metalc7 I O2G GTP . P GTP 667 1_555 J MG MG . P MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.142 ? 
metalc ? metalc8 I O1A GTP . P GTP 667 1_555 K MG MG . P MG 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? 
metalc ? metalc9 I O2G GTP . P GTP 667 1_555 K MG MG . P MG 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? 
metalc ? metalc10 E O VAL 325 Q VAL 325 1_555 O MG MG . Q MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.868 ? 
metalc ? metalc11 E OD1 ASP 453 Q ASP 453 1_555 O MG MG . Q MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.687 ? 
metalc ? metalc12 E OD1 ASP 454 Q ASP 454 1_555 L MN MN . Q MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? 
metalc ? metalc13 E OE1 GLU 491 Q GLU 491 1_555 L MN MN . Q MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? 
metalc ? metalc14 E O ALA 495 Q ALA 495 1_555 L MN MN . Q MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? 
metalc ? metalc15 N O2G GTP . Q GTP 667 1_555 O MG MG . Q MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.142 ? 
metalc ? metalc16 N O2B GTP . Q GTP 667 1_555 O MG MG . Q MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? 
metalc ? metalc17 N O1A GTP . Q GTP 667 1_555 P MG MG . Q MG 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? 
metalc ? metalc18 N O2G GTP . Q GTP 667 1_555 P MG MG . Q MG 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? 
metalc ? metalc19 F O VAL 325 R VAL 325 1_555 T MG MG . R MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.868 ? 
metalc ? metalc20 F OD1 ASP 453 R ASP 453 1_555 T MG MG . R MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.686 ? 
metalc ? metalc21 F OD1 ASP 454 R ASP 454 1_555 Q MN MN . R MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.931 ? 
metalc ? metalc22 F OE1 GLU 491 R GLU 491 1_555 Q MN MN . R MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.901 ? 
metalc ? metalc23 F O ALA 495 R ALA 495 1_555 Q MN MN . R MN 665 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? 
metalc ? metalc24 S O2G GTP . R GTP 667 1_555 T MG MG . R MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.142 ? 
metalc ? metalc25 S O2B GTP . R GTP 667 1_555 T MG MG . R MG 668 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.042 ? 
metalc ? metalc26 S O1A GTP . R GTP 667 1_555 U MG MG . R MG 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.551 ? 
metalc ? metalc27 S O2G GTP . R GTP 667 1_555 U MG MG . R MG 669 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.941 ? 
#
_chem_comp.formula           'C10 H16 N5 O14 P3' 
_chem_comp.formula_weight    523.18 
_chem_comp.id                GTP 
_chem_comp.mon_nstd_flag     n 
_chem_comp.name              "GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
PG O1G GTP doub 201 n n 
PG O2G GTP sing 202 n n 
PG O3G GTP sing 203 n n 
PG O3B GTP sing 204 n n 
O2G HOG2 GTP sing 205 n n 
O3G HOG3 GTP sing 206 n n 
O3B PB GTP sing 207 n n 
PB O1B GTP doub 208 n n 
PB O2B GTP sing 209 n n 
PB O3A GTP sing 210 n n 
O2B HOB2 GTP sing 211 n n 
O3A PA GTP sing 212 n n 
PA O1A GTP doub 213 n n 
PA O2A GTP sing 214 n n 
PA O5' GTP sing 215 n n 
O2A HOA2 GTP sing 216 n n 
O5' C5' GTP sing 217 n n 
C5' C4' GTP sing 218 n n 
C5' H5' GTP sing 219 n n 
C5' "H5''" GTP sing 220 n n 
C4' O4' GTP sing 221 n n 
C4' C3' GTP sing 222 n n 
C4' H4' GTP sing 223 n n 
O4' C1' GTP sing 224 n n 
C3' O3' GTP sing 225 n n 
C3' C2' GTP sing 226 n n 
C3' H3' GTP sing 227 n n 
O3' HO3' GTP sing 228 n n 
C2' O2' GTP sing 229 n n 
C2' C1' GTP sing 230 n n 
C2' H2' GTP sing 231 n n 
O2' HO2' GTP sing 232 n n 
C1' N9 GTP sing 233 n n 
C1' H1' GTP sing 234 n n 
N9 C8 GTP sing 235 n y 
N9 C4 GTP sing 236 n y 
C8 N7 GTP doub 237 n y 
C8 H8 GTP sing 238 n n 
N7 C5 GTP sing 239 n y 
C5 C6 GTP sing 240 n n 
C5 C4 GTP doub 241 n y 
C6 O6 GTP doub 242 n n 
C6 N1 GTP sing 243 n n 
N1 C2 GTP sing 244 n n 
N1 HN1 GTP sing 245 n n 
C2 N2 GTP sing 246 n n 
C2 N3 GTP doub 247 n n 
N2 HN21 GTP sing 248 n n 
N2 HN22 GTP sing 249 n n 
N3 C4 GTP sing 250 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1HI0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.009465 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001855 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.010787 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.007238 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
G 3 MN P 1 665 665 MN MN . 
H 4 GTP P 1 666 666 GTP GTP . 
I 4 GTP P 1 667 667 GTP GTP . 
J 5 MG P 1 668 668 MG MG . 
K 5 MG P 1 669 669 MG MG . 
L 3 MN Q 1 665 665 MN MN . 
M 4 GTP Q 1 666 666 GTP GTP . 
N 4 GTP Q 1 667 667 GTP GTP . 
O 5 MG Q 1 668 668 MG MG . 
P 5 MG Q 1 669 669 MG MG . 
Q 3 MN R 1 665 665 MN MN . 
R 4 GTP R 1 666 666 GTP GTP . 
S 4 GTP R 1 667 667 GTP GTP . 
T 5 MG R 1 668 668 MG MG . 
U 5 MG R 1 669 669 MG MG . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 P PG GTP . . . N 4 53.502 20.974 64.382 1 131.8 ? PG GTP 667 Q 1 
HETATM 2 O O1G GTP . . . N 4 52.234 21.291 63.618 1 131.55 ? O1G GTP 667 Q 1 
HETATM 3 O O2G GTP . . . N 4 54.26 19.747 63.884 1 131.4 ? O2G GTP 667 Q 1 
HETATM 4 O O3G GTP . . . N 4 53.156 20.93 65.809 1 124.3 ? O3G GTP 667 Q 1 
HETATM 5 O O3B GTP . . . N 4 54.466 22.336 64.113 1 138.57 ? O3B GTP 667 Q 1 
HETATM 6 P PB GTP . . . N 4 55.56 22.816 62.884 1 144.21 ? PB GTP 667 Q 1 
HETATM 7 O O1B GTP . . . N 4 55.147 24.198 62.341 1 134.07 ? O1B GTP 667 Q 1 
HETATM 8 O O2B GTP . . . N 4 56.933 22.799 63.431 1 141.03 ? O2B GTP 667 Q 1 
HETATM 9 O O3A GTP . . . N 4 55.386 21.727 61.756 1 140.26 ? O3A GTP 667 Q 1 
HETATM 10 P PA GTP . . . N 4 56.416 20.649 61.107 1 134.36 ? PA GTP 667 Q 1 
HETATM 11 O O1A GTP . . . N 4 56.6 19.484 61.954 1 130.51 ? O1A GTP 667 Q 1 
HETATM 12 O O2A GTP . . . N 4 55.854 20.365 59.704 1 132.61 ? O2A GTP 667 Q 1 
HETATM 13 O O5' GTP . . . N 4 57.915 21.487 61.093 1 123.68 ? O5' GTP 667 Q 1 
HETATM 14 C C5' GTP . . . N 4 57.957 22.768 60.288 1 107.24 ? C5' GTP 667 Q 1 
HETATM 15 C C4' GTP . . . N 4 59.369 22.563 59.482 1 102.53 ? C4' GTP 667 Q 1 
HETATM 16 O O4' GTP . . . N 4 59.223 21.576 58.442 1 108.07 ? O4' GTP 667 Q 1 
HETATM 17 C C3' GTP . . . N 4 59.895 23.783 58.829 1 100.46 ? C3' GTP 667 Q 1 
HETATM 18 O O3' GTP . . . N 4 61.093 24.231 59.409 1 89.63 ? O3' GTP 667 Q 1 
HETATM 19 C C2' GTP . . . N 4 60.066 23.616 57.271 1 106.95 ? C2' GTP 667 Q 1 
HETATM 20 O O2' GTP . . . N 4 61.313 23.796 56.82 1 102.49 ? O2' GTP 667 Q 1 
HETATM 21 C C1' GTP . . . N 4 59.534 22.006 57.096 1 111.82 ? C1' GTP 667 Q 1 
HETATM 22 N N9 GTP . . . N 4 58.208 21.925 56.259 1 112.71 ? N9 GTP 667 Q 1 
HETATM 23 C C8 GTP . . . N 4 57.086 21.179 56.687 1 109.63 ? C8 GTP 667 Q 1 
HETATM 24 N N7 GTP . . . N 4 56.246 21.416 55.654 1 105.04 ? N7 GTP 667 Q 1 
HETATM 25 C C5 GTP . . . N 4 56.739 22.232 54.632 1 106.55 ? C5 GTP 667 Q 1 
HETATM 26 C C6 GTP . . . N 4 56.151 22.609 53.547 1 100 ? C6 GTP 667 Q 1 
HETATM 27 O O6 GTP . . . N 4 55.033 22.461 52.947 1 84.96 ? O6 GTP 667 Q 1 
HETATM 28 N N1 GTP . . . N 4 57.069 23.513 52.698 1 96.93 ? N1 GTP 667 Q 1 
HETATM 29 C C2 GTP . . . N 4 58.254 23.746 53.197 1 97.55 ? C2 GTP 667 Q 1 
HETATM 30 N N2 GTP . . . N 4 59.119 24.63 52.351 1 91.57 ? N2 GTP 667 Q 1 
HETATM 31 N N3 GTP . . . N 4 58.876 23.353 54.337 1 106.42 ? N3 GTP 667 Q 1 
HETATM 32 C C4 GTP . . . N 4 57.989 22.552 55.028 1 110.13 ? C4 GTP 667 Q 1 
#
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