data_1HQF
#
_model_server_result.job_id            45J_L9B980QslRiWX05GhQ 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-04 23:29:58' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1hqf 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":501}' 
#
_entry.id    1HQF 
#
_exptl.entry_id    1HQF 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              54.938 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'MANGANESE (II) ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    6 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         120 
_cell.entry_id            1HQF 
_cell.length_a            88 
_cell.length_b            88 
_cell.length_c            112 
_cell.Z_PDB               9 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1HQF 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        145 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 32' 
#
_pdbx_struct_assembly.method_details        PISA 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details    trimeric 
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count      3 
_pdbx_struct_assembly.details               author_and_software_defined_assembly 
_pdbx_struct_assembly.id                    1 
#
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list       A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O 
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id        1 
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression    1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 D N N 
? 2 E N N 
? 2 G N N 
? 2 H N N 
? 2 J N N 
? 2 K N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
metalc ? metalc1 A ND1 HIS 101 A HIS 101 1_555 D MN MN . A MN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc2 A OD2 ASP 124 A ASP 124 1_555 D MN MN . A MN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
metalc ? metalc3 A OD1 ASP 124 A ASP 124 1_555 E MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? 
metalc ? metalc4 A ND1 HIS 126 A HIS 126 1_555 E MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.991 ? 
metalc ? metalc5 A OD2 ASP 128 A ASP 128 1_555 D MN MN . A MN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc6 A OD2 ASP 232 A ASP 232 1_555 E MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? 
metalc ? metalc7 A OD1 ASP 234 A ASP 234 1_555 E MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.481 ? 
metalc ? metalc8 A OD2 ASP 234 A ASP 234 1_555 E MN MN . A MN 501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? 
metalc ? metalc9 D MN MN . A MN 500 1_555 F OH1 HAR . A HAR 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? 
metalc ? metalc10 E MN MN . A MN 501 1_555 F OH1 HAR . A HAR 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? 
metalc ? metalc11 E MN MN . A MN 501 1_555 F NH1 HAR . A HAR 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc12 B ND1 HIS 101 B HIS 101 1_555 G MN MN . B MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.351 ? 
metalc ? metalc13 B OD2 ASP 124 B ASP 124 1_555 G MN MN . B MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? 
metalc ? metalc14 B OD1 ASP 124 B ASP 124 1_555 H MN MN . B MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? 
metalc ? metalc15 B ND1 HIS 126 B HIS 126 1_555 H MN MN . B MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.991 ? 
metalc ? metalc16 B OD2 ASP 128 B ASP 128 1_555 G MN MN . B MN 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc17 B OD2 ASP 232 B ASP 232 1_555 H MN MN . B MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? 
metalc ? metalc18 B OD1 ASP 234 B ASP 234 1_555 H MN MN . B MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.583 ? 
metalc ? metalc19 B OD2 ASP 234 B ASP 234 1_555 H MN MN . B MN 503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.885 ? 
metalc ? metalc20 G MN MN . B MN 502 1_555 I OH1 HAR . B HAR 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.636 ? 
metalc ? metalc21 H MN MN . B MN 503 1_555 I OH1 HAR . B HAR 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? 
metalc ? metalc22 H MN MN . B MN 503 1_555 I NH1 HAR . B HAR 907 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
metalc ? metalc23 C ND1 HIS 101 C HIS 101 1_555 J MN MN . C MN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? 
metalc ? metalc24 C OD2 ASP 124 C ASP 124 1_555 J MN MN . C MN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
metalc ? metalc25 C OD1 ASP 124 C ASP 124 1_555 K MN MN . C MN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? 
metalc ? metalc26 C ND1 HIS 126 C HIS 126 1_555 K MN MN . C MN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.991 ? 
metalc ? metalc27 C OD2 ASP 128 C ASP 128 1_555 J MN MN . C MN 504 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? 
metalc ? metalc28 C OD2 ASP 232 C ASP 232 1_555 K MN MN . C MN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.493 ? 
metalc ? metalc29 C OD1 ASP 234 C ASP 234 1_555 K MN MN . C MN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.586 ? 
metalc ? metalc30 C OD2 ASP 234 C ASP 234 1_555 K MN MN . C MN 505 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.881 ? 
metalc ? metalc31 J MN MN . C MN 504 1_555 L OH1 HAR . C HAR 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? 
metalc ? metalc32 K MN MN . C MN 505 1_555 L OH1 HAR . C HAR 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.214 ? 
metalc ? metalc33 K MN MN . C MN 505 1_555 L NH1 HAR . C HAR 908 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.337 ? 
#
_chem_comp.formula           'Mn 2' 
_chem_comp.formula_weight    54.938 
_chem_comp.id                MN 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'MANGANESE (II) ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1HQF 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.011364 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0.006561 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013122 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008929 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
D 2 MN A 1 500 500 MN MN . 
E 2 MN A 1 501 501 MN MN . 
F 3 HAR A 1 906 906 HAR HAR . 
G 2 MN B 1 502 502 MN MN . 
H 2 MN B 1 503 503 MN MN . 
I 3 HAR B 1 907 907 HAR HAR . 
J 2 MN C 1 504 504 MN MN . 
K 2 MN C 1 505 505 MN MN . 
L 3 HAR C 1 908 908 HAR HAR . 
M 4 HOH A 1 601 601 HOH WAT . 
M 4 HOH A 2 602 602 HOH WAT . 
M 4 HOH A 3 603 603 HOH WAT . 
M 4 HOH A 4 604 604 HOH WAT . 
M 4 HOH A 5 605 605 HOH WAT . 
N 4 HOH B 1 606 606 HOH WAT . 
N 4 HOH B 2 607 607 HOH WAT . 
N 4 HOH B 3 608 608 HOH WAT . 
N 4 HOH B 4 609 609 HOH WAT . 
N 4 HOH B 5 610 610 HOH WAT . 
O 4 HOH C 1 611 611 HOH WAT . 
O 4 HOH C 2 612 612 HOH WAT . 
O 4 HOH C 3 613 613 HOH WAT . 
O 4 HOH C 4 614 614 HOH WAT . 
O 4 HOH C 5 615 615 HOH WAT . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           MN 
_atom_site.label_atom_id         MN 
_atom_site.label_comp_id         MN 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         E 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               -3.619 
_atom_site.Cartn_y               40.64 
_atom_site.Cartn_z               7.969 
_atom_site.occupancy             1 
_atom_site.B_iso_or_equiv        56.97 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          MN 
_atom_site.auth_comp_id          MN 
_atom_site.auth_seq_id           501 
_atom_site.auth_asym_id          A 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              9 
_model_server_stats.parse_time_ms           12 
_model_server_stats.create_model_time_ms    8 
_model_server_stats.query_time_ms           276 
_model_server_stats.encode_time_ms          4 
_model_server_stats.element_count           1 
#