data_1I53 # _model_server_result.job_id h1VqlHqDiQx3a7_qEZgnfw _model_server_result.datetime_utc '2024-10-18 18:16:57' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1i53 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":903}' # _entry.id 1I53 # _exptl.entry_id 1I53 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 270.237 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'RHENIUM (I) TRICARBONYL' _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 80.52 _cell.angle_beta 77.69 _cell.angle_gamma 66.97 _cell.entry_id 1I53 _cell.length_a 35 _cell.length_b 42.87 _cell.length_c 48.51 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1I53 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? monomeric 1 author_defined_assembly 1 ? monomeric 1 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,D,E,I 1 1 B,F,G,H,J 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 D N N ? 3 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 3 A CYS 3 1_555 A SG CYS 26 A CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf2 B SG CYS 3 B CYS 3 1_555 B SG CYS 26 B CYS 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? metalc ? metalc1 A ND1 HIS 46 A HIS 46 1_555 C CU CU . A CU 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc ? metalc2 A NE2 HIS 107 A HIS 107 1_555 D RE RTC . A RTC 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.201 ? metalc ? metalc3 A ND1 HIS 117 A HIS 117 1_555 C CU CU . A CU 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? metalc ? metalc4 D RE RTC . A RTC 903 1_555 E N1 DPT . A DPT 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.163 ? metalc ? metalc5 D RE RTC . A RTC 903 1_555 E N10 DPT . A DPT 904 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.155 ? metalc ? metalc6 B ND1 HIS 46 B HIS 46 1_555 F CU CU . B CU 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.95 ? metalc ? metalc7 B NE2 HIS 107 B HIS 107 1_555 G RE RTC . B RTC 905 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? metalc ? metalc8 B ND1 HIS 117 B HIS 117 1_555 F CU CU . B CU 902 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? metalc ? metalc9 G RE RTC . B RTC 905 1_555 H N1 DPT . B DPT 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? metalc ? metalc10 G RE RTC . B RTC 905 1_555 H N10 DPT . B DPT 906 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.167 ? # _chem_comp.formula 'C3 O3 Re' _chem_comp.formula_weight 270.237 _chem_comp.id RTC _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'RHENIUM (I) TRICARBONYL' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag RE C1 RTC sing 307 n n RE C2 RTC sing 308 n n RE C3 RTC sing 309 n n O1 C1 RTC trip 310 n n O2 C2 RTC trip 311 n n O3 C3 RTC trip 312 n n # _atom_sites.entry_id 1I53 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.028571 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] -0.012146 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] -0.005158 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.025346 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] -0.002301 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.021186 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CU A 1 901 901 CU CU . D 3 RTC A 1 903 903 RTC REP . E 4 DPT A 1 904 903 DPT REP . F 2 CU B 1 902 902 CU CU . G 3 RTC B 1 905 904 RTC REP . H 4 DPT B 1 906 904 DPT REP . I 5 HOH A 1 905 2 HOH WAT . I 5 HOH A 2 906 4 HOH WAT . I 5 HOH A 3 907 5 HOH WAT . I 5 HOH A 4 908 6 HOH WAT . I 5 HOH A 5 909 8 HOH WAT . I 5 HOH A 6 910 10 HOH WAT . I 5 HOH A 7 911 11 HOH WAT . I 5 HOH A 8 912 15 HOH WAT . I 5 HOH A 9 913 17 HOH WAT . I 5 HOH A 10 914 21 HOH WAT . I 5 HOH A 11 915 26 HOH WAT . I 5 HOH A 12 916 31 HOH WAT . I 5 HOH A 13 917 32 HOH WAT . I 5 HOH A 14 918 34 HOH WAT . I 5 HOH A 15 919 35 HOH WAT . I 5 HOH A 16 920 38 HOH WAT . I 5 HOH A 17 921 39 HOH WAT . I 5 HOH A 18 922 40 HOH WAT . I 5 HOH A 19 923 46 HOH WAT . I 5 HOH A 20 924 48 HOH WAT . I 5 HOH A 21 925 50 HOH WAT . I 5 HOH A 22 926 51 HOH WAT . I 5 HOH A 23 927 52 HOH WAT . I 5 HOH A 24 928 53 HOH WAT . I 5 HOH A 25 929 54 HOH WAT . I 5 HOH A 26 930 55 HOH WAT . I 5 HOH A 27 931 56 HOH WAT . I 5 HOH A 28 932 59 HOH WAT . I 5 HOH A 29 933 60 HOH WAT . I 5 HOH A 30 934 61 HOH WAT . I 5 HOH A 31 935 64 HOH WAT . I 5 HOH A 32 936 66 HOH WAT . I 5 HOH A 33 937 67 HOH WAT . I 5 HOH A 34 938 69 HOH WAT . I 5 HOH A 35 939 70 HOH WAT . I 5 HOH A 36 940 71 HOH WAT . I 5 HOH A 37 941 73 HOH WAT . I 5 HOH A 38 942 74 HOH WAT . I 5 HOH A 39 943 76 HOH WAT . I 5 HOH A 40 944 77 HOH WAT . I 5 HOH A 41 945 78 HOH WAT . I 5 HOH A 42 946 79 HOH WAT . I 5 HOH A 43 947 82 HOH WAT . I 5 HOH A 44 948 86 HOH WAT . I 5 HOH A 45 949 88 HOH WAT . I 5 HOH A 46 950 89 HOH WAT . I 5 HOH A 47 951 90 HOH WAT . I 5 HOH A 48 952 91 HOH WAT . I 5 HOH A 49 953 92 HOH WAT . I 5 HOH A 50 954 93 HOH WAT . I 5 HOH A 51 955 94 HOH WAT . I 5 HOH A 52 956 95 HOH WAT . I 5 HOH A 53 957 96 HOH WAT . I 5 HOH A 54 958 97 HOH WAT . I 5 HOH A 55 959 98 HOH WAT . I 5 HOH A 56 960 99 HOH WAT . I 5 HOH A 57 961 114 HOH WAT . I 5 HOH A 58 962 115 HOH WAT . I 5 HOH A 59 963 116 HOH WAT . I 5 HOH A 60 964 117 HOH WAT . I 5 HOH A 61 965 118 HOH WAT . I 5 HOH A 62 966 119 HOH WAT . I 5 HOH A 63 967 120 HOH WAT . I 5 HOH A 64 968 122 HOH WAT . I 5 HOH A 65 969 123 HOH WAT . I 5 HOH A 66 970 124 HOH WAT . I 5 HOH A 67 971 125 HOH WAT . I 5 HOH A 68 972 126 HOH WAT . I 5 HOH A 69 973 127 HOH WAT . I 5 HOH A 70 974 128 HOH WAT . I 5 HOH A 71 975 129 HOH WAT . I 5 HOH A 72 976 131 HOH WAT . I 5 HOH A 73 977 132 HOH WAT . I 5 HOH A 74 978 133 HOH WAT . I 5 HOH A 75 979 134 HOH WAT . I 5 HOH A 76 980 135 HOH WAT . I 5 HOH A 77 981 136 HOH WAT . I 5 HOH A 78 982 137 HOH WAT . I 5 HOH A 79 983 138 HOH WAT . I 5 HOH A 80 984 139 HOH WAT . I 5 HOH A 81 985 140 HOH WAT . I 5 HOH A 82 986 141 HOH WAT . I 5 HOH A 83 987 142 HOH WAT . I 5 HOH A 84 988 143 HOH WAT . I 5 HOH A 85 989 144 HOH WAT . I 5 HOH A 86 990 145 HOH WAT . I 5 HOH A 87 991 146 HOH WAT . I 5 HOH A 88 992 147 HOH WAT . I 5 HOH A 89 993 148 HOH WAT . I 5 HOH A 90 994 149 HOH WAT . I 5 HOH A 91 995 150 HOH WAT . I 5 HOH A 92 996 151 HOH WAT . I 5 HOH A 93 997 152 HOH WAT . I 5 HOH A 94 998 153 HOH WAT . I 5 HOH A 95 999 154 HOH WAT . I 5 HOH A 96 1000 155 HOH WAT . I 5 HOH A 97 1001 156 HOH WAT . I 5 HOH A 98 1002 157 HOH WAT . I 5 HOH A 99 1003 158 HOH WAT . I 5 HOH A 100 1004 163 HOH WAT . I 5 HOH A 101 1005 165 HOH WAT . I 5 HOH A 102 1006 189 HOH WAT . I 5 HOH A 103 1007 190 HOH WAT . I 5 HOH A 104 1008 191 HOH WAT . I 5 HOH A 105 1009 192 HOH WAT . I 5 HOH A 106 1010 193 HOH WAT . I 5 HOH A 107 1011 194 HOH WAT . I 5 HOH A 108 1012 195 HOH WAT . I 5 HOH A 109 1013 196 HOH WAT . I 5 HOH A 110 1014 197 HOH WAT . I 5 HOH A 111 1015 198 HOH WAT . I 5 HOH A 112 1016 199 HOH WAT . I 5 HOH A 113 1017 200 HOH WAT . I 5 HOH A 114 1018 201 HOH WAT . I 5 HOH A 115 1019 202 HOH WAT . I 5 HOH A 116 1020 203 HOH WAT . I 5 HOH A 117 1021 204 HOH WAT . I 5 HOH A 118 1022 205 HOH WAT . I 5 HOH A 119 1023 206 HOH WAT . I 5 HOH A 120 1024 207 HOH WAT . I 5 HOH A 121 1025 208 HOH WAT . I 5 HOH A 122 1026 209 HOH WAT . I 5 HOH A 123 1027 210 HOH WAT . I 5 HOH A 124 1028 211 HOH WAT . I 5 HOH A 125 1029 212 HOH WAT . I 5 HOH A 126 1030 213 HOH WAT . I 5 HOH A 127 1031 214 HOH WAT . I 5 HOH A 128 1032 215 HOH WAT . J 5 HOH B 1 907 1 HOH WAT . J 5 HOH B 2 908 3 HOH WAT . J 5 HOH B 3 909 7 HOH WAT . J 5 HOH B 4 910 9 HOH WAT . J 5 HOH B 5 911 12 HOH WAT . J 5 HOH B 6 912 13 HOH WAT . J 5 HOH B 7 913 14 HOH WAT . J 5 HOH B 8 914 16 HOH WAT . J 5 HOH B 9 915 18 HOH WAT . J 5 HOH B 10 916 19 HOH WAT . J 5 HOH B 11 917 20 HOH WAT . J 5 HOH B 12 918 22 HOH WAT . J 5 HOH B 13 919 23 HOH WAT . J 5 HOH B 14 920 24 HOH WAT . J 5 HOH B 15 921 25 HOH WAT . J 5 HOH B 16 922 27 HOH WAT . J 5 HOH B 17 923 28 HOH WAT . J 5 HOH B 18 924 29 HOH WAT . J 5 HOH B 19 925 30 HOH WAT . J 5 HOH B 20 926 33 HOH WAT . J 5 HOH B 21 927 36 HOH WAT . J 5 HOH B 22 928 37 HOH WAT . J 5 HOH B 23 929 41 HOH WAT . J 5 HOH B 24 930 42 HOH WAT . J 5 HOH B 25 931 43 HOH WAT . J 5 HOH B 26 932 44 HOH WAT . J 5 HOH B 27 933 45 HOH WAT . J 5 HOH B 28 934 47 HOH WAT . J 5 HOH B 29 935 49 HOH WAT . J 5 HOH B 30 936 57 HOH WAT . J 5 HOH B 31 937 58 HOH WAT . J 5 HOH B 32 938 62 HOH WAT . J 5 HOH B 33 939 63 HOH WAT . J 5 HOH B 34 940 65 HOH WAT . J 5 HOH B 35 941 68 HOH WAT . J 5 HOH B 36 942 72 HOH WAT . J 5 HOH B 37 943 75 HOH WAT . J 5 HOH B 38 944 80 HOH WAT . J 5 HOH B 39 945 81 HOH WAT . J 5 HOH B 40 946 83 HOH WAT . J 5 HOH B 41 947 84 HOH WAT . J 5 HOH B 42 948 85 HOH WAT . J 5 HOH B 43 949 87 HOH WAT . J 5 HOH B 44 950 100 HOH WAT . J 5 HOH B 45 951 101 HOH WAT . J 5 HOH B 46 952 102 HOH WAT . J 5 HOH B 47 953 103 HOH WAT . J 5 HOH B 48 954 104 HOH WAT . J 5 HOH B 49 955 105 HOH WAT . J 5 HOH B 50 956 106 HOH WAT . J 5 HOH B 51 957 107 HOH WAT . J 5 HOH B 52 958 108 HOH WAT . J 5 HOH B 53 959 109 HOH WAT . J 5 HOH B 54 960 110 HOH WAT . J 5 HOH B 55 961 111 HOH WAT . J 5 HOH B 56 962 112 HOH WAT . J 5 HOH B 57 963 113 HOH WAT . J 5 HOH B 58 964 121 HOH WAT . J 5 HOH B 59 965 130 HOH WAT . J 5 HOH B 60 966 159 HOH WAT . J 5 HOH B 61 967 160 HOH WAT . J 5 HOH B 62 968 161 HOH WAT . J 5 HOH B 63 969 162 HOH WAT . J 5 HOH B 64 970 164 HOH WAT . J 5 HOH B 65 971 166 HOH WAT . J 5 HOH B 66 972 167 HOH WAT . J 5 HOH B 67 973 168 HOH WAT . J 5 HOH B 68 974 169 HOH WAT . J 5 HOH B 69 975 170 HOH WAT . J 5 HOH B 70 976 171 HOH WAT . J 5 HOH B 71 977 172 HOH WAT . J 5 HOH B 72 978 173 HOH WAT . J 5 HOH B 73 979 174 HOH WAT . J 5 HOH B 74 980 175 HOH WAT . J 5 HOH B 75 981 176 HOH WAT . J 5 HOH B 76 982 177 HOH WAT . J 5 HOH B 77 983 178 HOH WAT . J 5 HOH B 78 984 179 HOH WAT . J 5 HOH B 79 985 180 HOH WAT . J 5 HOH B 80 986 181 HOH WAT . J 5 HOH B 81 987 182 HOH WAT . J 5 HOH B 82 988 183 HOH WAT . J 5 HOH B 83 989 184 HOH WAT . J 5 HOH B 84 990 185 HOH WAT . J 5 HOH B 85 991 186 HOH WAT . J 5 HOH B 86 992 187 HOH WAT . J 5 HOH B 87 993 188 HOH WAT . J 5 HOH B 88 994 216 HOH WAT . J 5 HOH B 89 995 217 HOH WAT . J 5 HOH B 90 996 218 HOH WAT . J 5 HOH B 91 997 219 HOH WAT . J 5 HOH B 92 998 220 HOH WAT . J 5 HOH B 93 999 221 HOH WAT . J 5 HOH B 94 1000 222 HOH WAT . J 5 HOH B 95 1001 223 HOH WAT . J 5 HOH B 96 1002 224 HOH WAT . J 5 HOH B 97 1003 225 HOH WAT . J 5 HOH B 98 1004 226 HOH WAT . J 5 HOH B 99 1005 227 HOH WAT . J 5 HOH B 100 1006 228 HOH WAT . J 5 HOH B 101 1007 229 HOH WAT . J 5 HOH B 102 1008 230 HOH WAT . J 5 HOH B 103 1009 231 HOH WAT . J 5 HOH B 104 1010 232 HOH WAT . J 5 HOH B 105 1011 233 HOH WAT . J 5 HOH B 106 1012 234 HOH WAT . J 5 HOH B 107 1013 235 HOH WAT . J 5 HOH B 108 1014 236 HOH WAT . J 5 HOH B 109 1015 237 HOH WAT . J 5 HOH B 110 1016 238 HOH WAT . J 5 HOH B 111 1017 239 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 RE RE RTC . . . D 3 -4.976 38.575 56.235 1 22.12 ? RE RTC 903 A 1 HETATM 2 O O1 RTC . . . D 3 -7.717 38.544 57.629 1 22.9 ? O1 RTC 903 A 1 HETATM 3 O O2 RTC . . . D 3 -6.389 39.386 53.604 1 22.26 ? O2 RTC 903 A 1 HETATM 4 O O3 RTC . . . D 3 -5.529 35.659 55.502 1 22.23 ? O3 RTC 903 A 1 HETATM 5 C C1 RTC . . . D 3 -6.7 38.556 57.113 1 22.31 ? C1 RTC 903 A 1 HETATM 6 C C2 RTC . . . D 3 -5.856 39.083 54.574 1 22.21 ? C2 RTC 903 A 1 HETATM 7 C C3 RTC . . . D 3 -5.328 36.727 55.769 1 22.16 ? C3 RTC 903 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 53 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 4 _model_server_stats.query_time_ms 307 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 7 #