data_1I54
#
_model_server_result.job_id            77MHkNAjwWmrV46FKMks9w 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-22 09:23:57' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1i54 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":1106}' 
#
_entry.id    1I54 
#
_exptl.entry_id    1I54 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              618.503 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'HEME C' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    2 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1I54 
_cell.length_a            74.18 
_cell.length_b            74.18 
_cell.length_c            35.538 
_cell.Z_PDB               8 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1I54 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        78 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 43' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
? monomeric 1 author_defined_assembly 1 
? monomeric 1 author_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,C,D,G 1 1 
B,E,F,H 2 1 
#
_pdbx_struct_oper_list.id                    1 
_pdbx_struct_oper_list.type                  'identity operation' 
_pdbx_struct_oper_list.name                  1_555 
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation    x,y,z 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]          1 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]          0 
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]          1 
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]             0 
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]             0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 C N N 
? 2 E N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
covale ? covale1 A SG CYS 14 A CYS 14 1_555 C CAB HEC . A HEC 1104 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.89 ? 
covale ? covale2 A SG CYS 14 A CYS 14 1_555 D CAB ZNH . A ZNH 1105 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.897 ? 
covale ? covale3 A SG CYS 17 A CYS 17 1_555 C CAC HEC . A HEC 1104 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.997 ? 
covale ? covale4 A SG CYS 17 A CYS 17 1_555 D CAC ZNH . A ZNH 1105 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? 
covale ? covale5 B SG CYS 14 B CYS 14 1_555 E CAB HEC . B HEC 1106 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.829 ? 
covale ? covale6 B SG CYS 14 B CYS 14 1_555 F CAB ZNH . B ZNH 1107 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.83 ? 
covale ? covale7 B SG CYS 17 B CYS 17 1_555 E CAC HEC . B HEC 1106 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? 
covale ? covale8 B SG CYS 17 B CYS 17 1_555 F CAC ZNH . B ZNH 1107 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? 
metalc ? metalc1 A NE2 HIS 18 A HIS 18 1_555 C FE HEC . A HEC 1104 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.987 ? 
metalc ? metalc2 A NE2 HIS 18 A HIS 18 1_555 D ZN ZNH . A ZNH 1105 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? 
metalc ? metalc3 A SD MET 80 A MET 80 1_555 C FE HEC . A HEC 1104 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.495 ? 
metalc ? metalc4 A SD MET 80 A MET 80 1_555 D ZN ZNH . A ZNH 1105 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.498 ? 
metalc ? metalc5 B NE2 HIS 18 B HIS 18 1_555 E FE HEC . B HEC 1106 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.003 ? 
metalc ? metalc6 B NE2 HIS 18 B HIS 18 1_555 F ZN ZNH . B ZNH 1107 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? 
metalc ? metalc7 B SD MET 80 B MET 80 1_555 E FE HEC . B HEC 1106 1_555 ? ? ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? 
metalc ? metalc8 B SD MET 80 B MET 80 1_555 F ZN ZNH . B ZNH 1107 1_555 ? ? ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.389 ? 
#
_chem_comp.formula           'C34 H34 Fe N4 O4' 
_chem_comp.formula_weight    618.503 
_chem_comp.id                HEC 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'HEME C' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
FE NA HEC sing 129 n n 
FE NB HEC sing 130 n n 
FE NC HEC sing 131 n n 
FE ND HEC sing 132 n n 
CHA C1A HEC doub 133 n n 
CHA C4D HEC sing 134 n n 
CHA HHA HEC sing 135 n n 
CHB C4A HEC doub 136 n n 
CHB C1B HEC sing 137 n n 
CHB HHB HEC sing 138 n n 
CHC C4B HEC doub 139 n n 
CHC C1C HEC sing 140 n n 
CHC HHC HEC sing 141 n n 
CHD C4C HEC doub 142 n n 
CHD C1D HEC sing 143 n n 
CHD HHD HEC sing 144 n n 
NA C1A HEC sing 145 n y 
NA C4A HEC sing 146 n y 
C1A C2A HEC sing 147 n y 
C2A C3A HEC doub 148 n y 
C2A CAA HEC sing 149 n n 
C3A C4A HEC sing 150 n y 
C3A CMA HEC sing 151 n n 
CMA HMA1 HEC sing 152 n n 
CMA HMA2 HEC sing 153 n n 
CMA HMA3 HEC sing 154 n n 
CAA CBA HEC sing 155 n n 
CAA HAA1 HEC sing 156 n n 
CAA HAA2 HEC sing 157 n n 
CBA CGA HEC sing 158 n n 
CBA HBA1 HEC sing 159 n n 
CBA HBA2 HEC sing 160 n n 
CGA O1A HEC doub 161 n n 
CGA O2A HEC sing 162 n n 
O2A H2A HEC sing 163 n n 
NB C1B HEC sing 164 n y 
NB C4B HEC sing 165 n y 
C1B C2B HEC doub 166 n y 
C2B C3B HEC sing 167 n y 
C2B CMB HEC sing 168 n n 
C3B C4B HEC sing 169 n y 
C3B CAB HEC doub 170 e n 
CMB HMB1 HEC sing 171 n n 
CMB HMB2 HEC sing 172 n n 
CMB HMB3 HEC sing 173 n n 
CAB CBB HEC sing 174 n n 
CAB HAB HEC sing 175 n n 
CBB HBB1 HEC sing 176 n n 
CBB HBB2 HEC sing 177 n n 
CBB HBB3 HEC sing 178 n n 
NC C1C HEC sing 179 n y 
NC C4C HEC sing 180 n y 
C1C C2C HEC doub 181 n y 
C2C C3C HEC sing 182 n y 
C2C CMC HEC sing 183 n n 
C3C C4C HEC sing 184 n y 
C3C CAC HEC doub 185 e n 
CMC HMC1 HEC sing 186 n n 
CMC HMC2 HEC sing 187 n n 
CMC HMC3 HEC sing 188 n n 
CAC CBC HEC sing 189 n n 
CAC HAC HEC sing 190 n n 
CBC HBC1 HEC sing 191 n n 
CBC HBC2 HEC sing 192 n n 
CBC HBC3 HEC sing 193 n n 
ND C1D HEC sing 194 n y 
ND C4D HEC sing 195 n y 
C1D C2D HEC doub 196 n y 
C2D C3D HEC sing 197 n y 
C2D CMD HEC sing 198 n n 
C3D C4D HEC doub 199 n y 
C3D CAD HEC sing 200 n n 
CMD HMD1 HEC sing 201 n n 
CMD HMD2 HEC sing 202 n n 
CMD HMD3 HEC sing 203 n n 
CAD CBD HEC sing 204 n n 
CAD HAD1 HEC sing 205 n n 
CAD HAD2 HEC sing 206 n n 
CBD CGD HEC sing 207 n n 
CBD HBD1 HEC sing 208 n n 
CBD HBD2 HEC sing 209 n n 
CGD O1D HEC doub 210 n n 
CGD O2D HEC sing 211 n n 
O2D H2D HEC sing 212 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1I54 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.013481 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.013481 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.028139 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
C 2 HEC A 1 1104 104 HEC HEM . 
D 3 ZNH A 1 1105 105 ZNH ZNH . 
E 2 HEC B 1 1106 106 HEC HEM . 
F 3 ZNH B 1 1107 107 ZNH ZNH . 
G 4 HOH A 1 1106 1 HOH WAT . 
G 4 HOH A 2 1107 4 HOH WAT . 
G 4 HOH A 3 1108 5 HOH WAT . 
G 4 HOH A 4 1109 6 HOH WAT . 
G 4 HOH A 5 1110 7 HOH WAT . 
G 4 HOH A 6 1111 9 HOH WAT . 
G 4 HOH A 7 1112 10 HOH WAT . 
G 4 HOH A 8 1113 14 HOH WAT . 
G 4 HOH A 9 1114 17 HOH WAT . 
G 4 HOH A 10 1115 18 HOH WAT . 
G 4 HOH A 11 1116 19 HOH WAT . 
G 4 HOH A 12 1117 22 HOH WAT . 
G 4 HOH A 13 1118 23 HOH WAT . 
G 4 HOH A 14 1119 24 HOH WAT . 
G 4 HOH A 15 1120 26 HOH WAT . 
G 4 HOH A 16 1121 27 HOH WAT . 
G 4 HOH A 17 1122 29 HOH WAT . 
G 4 HOH A 18 1123 31 HOH WAT . 
G 4 HOH A 19 1124 32 HOH WAT . 
G 4 HOH A 20 1125 35 HOH WAT . 
G 4 HOH A 21 1126 37 HOH WAT . 
G 4 HOH A 22 1127 39 HOH WAT . 
G 4 HOH A 23 1128 43 HOH WAT . 
G 4 HOH A 24 1129 44 HOH WAT . 
G 4 HOH A 25 1130 45 HOH WAT . 
G 4 HOH A 26 1131 46 HOH WAT . 
G 4 HOH A 27 1132 47 HOH WAT . 
G 4 HOH A 28 1133 50 HOH WAT . 
G 4 HOH A 29 1134 53 HOH WAT . 
G 4 HOH A 30 1135 54 HOH WAT . 
G 4 HOH A 31 1136 55 HOH WAT . 
G 4 HOH A 32 1137 59 HOH WAT . 
G 4 HOH A 33 1138 60 HOH WAT . 
G 4 HOH A 34 1139 61 HOH WAT . 
G 4 HOH A 35 1140 62 HOH WAT . 
G 4 HOH A 36 1141 67 HOH WAT . 
G 4 HOH A 37 1142 68 HOH WAT . 
G 4 HOH A 38 1143 69 HOH WAT . 
G 4 HOH A 39 1144 71 HOH WAT . 
G 4 HOH A 40 1145 72 HOH WAT . 
G 4 HOH A 41 1146 74 HOH WAT . 
G 4 HOH A 42 1147 75 HOH WAT . 
G 4 HOH A 43 1148 78 HOH WAT . 
G 4 HOH A 44 1149 80 HOH WAT . 
G 4 HOH A 45 1150 81 HOH WAT . 
G 4 HOH A 46 1151 82 HOH WAT . 
G 4 HOH A 47 1152 84 HOH WAT . 
G 4 HOH A 48 1153 86 HOH WAT . 
G 4 HOH A 49 1154 89 HOH WAT . 
G 4 HOH A 50 1155 92 HOH WAT . 
G 4 HOH A 51 1156 93 HOH WAT . 
G 4 HOH A 52 1157 94 HOH WAT . 
G 4 HOH A 53 1158 95 HOH WAT . 
G 4 HOH A 54 1159 96 HOH WAT . 
G 4 HOH A 55 1160 98 HOH WAT . 
G 4 HOH A 56 1161 99 HOH WAT . 
G 4 HOH A 57 1162 100 HOH WAT . 
G 4 HOH A 58 1163 101 HOH WAT . 
G 4 HOH A 59 1164 103 HOH WAT . 
G 4 HOH A 60 1165 105 HOH WAT . 
G 4 HOH A 61 1166 108 HOH WAT . 
G 4 HOH A 62 1167 110 HOH WAT . 
G 4 HOH A 63 1168 113 HOH WAT . 
G 4 HOH A 64 1169 115 HOH WAT . 
G 4 HOH A 65 1170 117 HOH WAT . 
G 4 HOH A 66 1171 119 HOH WAT . 
G 4 HOH A 67 1172 120 HOH WAT . 
G 4 HOH A 68 1173 124 HOH WAT . 
G 4 HOH A 69 1174 126 HOH WAT . 
G 4 HOH A 70 1175 128 HOH WAT . 
G 4 HOH A 71 1176 131 HOH WAT . 
G 4 HOH A 72 1177 133 HOH WAT . 
G 4 HOH A 73 1178 134 HOH WAT . 
G 4 HOH A 74 1179 135 HOH WAT . 
G 4 HOH A 75 1180 137 HOH WAT . 
G 4 HOH A 76 1181 140 HOH WAT . 
G 4 HOH A 77 1182 143 HOH WAT . 
G 4 HOH A 78 1183 144 HOH WAT . 
G 4 HOH A 79 1184 145 HOH WAT . 
G 4 HOH A 80 1185 147 HOH WAT . 
G 4 HOH A 81 1186 151 HOH WAT . 
G 4 HOH A 82 1187 154 HOH WAT . 
G 4 HOH A 83 1188 155 HOH WAT . 
G 4 HOH A 84 1189 156 HOH WAT . 
G 4 HOH A 85 1190 159 HOH WAT . 
G 4 HOH A 86 1191 162 HOH WAT . 
G 4 HOH A 87 1192 163 HOH WAT . 
G 4 HOH A 88 1193 166 HOH WAT . 
G 4 HOH A 89 1194 170 HOH WAT . 
G 4 HOH A 90 1195 171 HOH WAT . 
G 4 HOH A 91 1196 176 HOH WAT . 
G 4 HOH A 92 1197 178 HOH WAT . 
G 4 HOH A 93 1198 179 HOH WAT . 
G 4 HOH A 94 1199 182 HOH WAT . 
G 4 HOH A 95 1200 183 HOH WAT . 
G 4 HOH A 96 1201 184 HOH WAT . 
G 4 HOH A 97 1202 188 HOH WAT . 
G 4 HOH A 98 1203 189 HOH WAT . 
G 4 HOH A 99 1204 191 HOH WAT . 
G 4 HOH A 100 1205 192 HOH WAT . 
G 4 HOH A 101 1206 193 HOH WAT . 
G 4 HOH A 102 1207 194 HOH WAT . 
G 4 HOH A 103 1208 195 HOH WAT . 
G 4 HOH A 104 1209 196 HOH WAT . 
G 4 HOH A 105 1210 197 HOH WAT . 
G 4 HOH A 106 1211 198 HOH WAT . 
G 4 HOH A 107 1212 199 HOH WAT . 
G 4 HOH A 108 1213 200 HOH WAT . 
G 4 HOH A 109 1214 211 HOH WAT . 
G 4 HOH A 110 1215 212 HOH WAT . 
G 4 HOH A 111 1216 213 HOH WAT . 
G 4 HOH A 112 1217 214 HOH WAT . 
G 4 HOH A 113 1218 215 HOH WAT . 
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HETATM 23 C CAB HEC . A . E 2 28.963 21.274 5.44 0.68 10.14 ? CAB HEC 1106 B 1 
HETATM 24 C CBB HEC . A . E 2 29.942 21.356 6.437 0.68 10.16 ? CBB HEC 1106 B 1 
HETATM 25 N NC HEC . A . E 2 27.915 24.583 1.317 0.68 9.78 ? NC HEC 1106 B 1 
HETATM 26 C C1C HEC . A . E 2 27.568 24.475 2.643 0.68 9.78 ? C1C HEC 1106 B 1 
HETATM 27 C C2C HEC . A . E 2 26.526 25.407 2.969 0.68 9.77 ? C2C HEC 1106 B 1 
HETATM 28 C C3C HEC . A . E 2 26.211 26.072 1.809 0.68 9.76 ? C3C HEC 1106 B 1 
HETATM 29 C C4C HEC . A . E 2 27.1 25.544 0.786 0.68 9.74 ? C4C HEC 1106 B 1 
HETATM 30 C CMC HEC . A . E 2 25.913 25.558 4.356 0.68 9.75 ? CMC HEC 1106 B 1 
HETATM 31 C CAC HEC . A . E 2 25.197 27 1.593 0.68 9.86 ? CAC HEC 1106 B 1 
HETATM 32 C CBC HEC . A . E 2 25.05 28.19 2.325 0.68 9.92 ? CBC HEC 1106 B 1 
HETATM 33 N ND HEC . A . E 2 28.911 24.472 -1.416 0.68 9.72 ? ND HEC 1106 B 1 
HETATM 34 C C1D HEC . A . E 2 27.974 25.457 -1.584 0.68 9.65 ? C1D HEC 1106 B 1 
HETATM 35 C C2D HEC . A . E 2 28.07 26.018 -2.916 0.68 9.62 ? C2D HEC 1106 B 1 
HETATM 36 C C3D HEC . A . E 2 29.092 25.368 -3.545 0.68 9.59 ? C3D HEC 1106 B 1 
HETATM 37 C C4D HEC . A . E 2 29.609 24.396 -2.597 0.68 9.66 ? C4D HEC 1106 B 1 
HETATM 38 C CMD HEC . A . E 2 27.196 27.139 -3.459 0.68 9.55 ? CMD HEC 1106 B 1 
HETATM 39 C CAD HEC . A . E 2 29.648 25.676 -4.934 0.68 9.56 ? CAD HEC 1106 B 1 
HETATM 40 C CBD HEC . A . E 2 30.742 26.713 -4.693 0.68 9.46 ? CBD HEC 1106 B 1 
HETATM 41 C CGD HEC . A . E 2 31.356 27.293 -5.961 0.68 9.43 ? CGD HEC 1106 B 1 
HETATM 42 O O1D HEC . A . E 2 30.928 26.942 -7.083 0.68 9.39 ? O1D HEC 1106 B 1 
HETATM 43 O O2D HEC . A . E 2 32.269 28.134 -5.825 0.68 9.45 ? O2D HEC 1106 B 1 
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