data_1I5R
#
_model_server_result.job_id            BAAYG2_P99eYmus_1V8Gmg 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-12-02 17:47:53' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1i5r 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"D","auth_seq_id":402}' 
#
_entry.id    1I5R 
#
_exptl.entry_id    1I5R 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              92.094 
_entity.id                          3 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            GLYCEROL 
_entity.pdbx_number_of_molecules    3 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          99.16 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1I5R 
_cell.length_a            119.272 
_cell.length_b            42.706 
_cell.length_c            58.732 
_cell.Z_PDB               4 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1I5R 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        5 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'C 1 2 1' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA dimeric 2 author_and_software_defined_assembly 1 
PQS monomeric 1 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F 1 1,2 
A,B,C,D,E,F 2 1 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 2_555 -x,y,-z -1 0 0 0 1 0 0 0 -1 0 0 0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 3 C N N 
? 3 D N N 
? 3 E N N 
#
_chem_comp.formula           'C3 H8 O3' 
_chem_comp.formula_weight    92.094 
_chem_comp.id                GOL 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              GLYCEROL 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     GLYCERIN;PROPANE-1,2,3-TRIOL 
#
loop_
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
C1 O1 GOL sing 129 n n 
C1 C2 GOL sing 130 n n 
C1 H11 GOL sing 131 n n 
C1 H12 GOL sing 132 n n 
O1 HO1 GOL sing 133 n n 
C2 O2 GOL sing 134 n n 
C2 C3 GOL sing 135 n n 
C2 H2 GOL sing 136 n n 
O2 HO2 GOL sing 137 n n 
C3 O3 GOL sing 138 n n 
C3 H31 GOL sing 139 n n 
C3 H32 GOL sing 140 n n 
O3 HO3 GOL sing 141 n n 
#
_atom_sites.entry_id                     1I5R 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.008384 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0.001352 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.023416 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.017246 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
B 2 HYC A 1 328 301 HYC HYC . 
C 3 GOL A 1 401 1 GOL GOL . 
D 3 GOL A 1 402 2 GOL GOL . 
E 3 GOL A 1 403 3 GOL GOL . 
F 4 HOH A 1 404 1 HOH WAT . 
F 4 HOH A 2 405 2 HOH WAT . 
F 4 HOH A 3 406 3 HOH WAT . 
F 4 HOH A 4 407 4 HOH WAT . 
F 4 HOH A 5 408 5 HOH WAT . 
F 4 HOH A 6 409 6 HOH WAT . 
F 4 HOH A 7 410 7 HOH WAT . 
F 4 HOH A 8 411 8 HOH WAT . 
F 4 HOH A 9 412 9 HOH WAT . 
F 4 HOH A 10 413 10 HOH WAT . 
F 4 HOH A 11 414 11 HOH WAT . 
F 4 HOH A 12 415 12 HOH WAT . 
F 4 HOH A 13 416 13 HOH WAT . 
F 4 HOH A 14 417 14 HOH WAT . 
F 4 HOH A 15 418 15 HOH WAT . 
F 4 HOH A 16 419 16 HOH WAT . 
F 4 HOH A 17 420 17 HOH WAT . 
F 4 HOH A 18 421 18 HOH WAT . 
F 4 HOH A 19 422 19 HOH WAT . 
F 4 HOH A 20 423 20 HOH WAT . 
F 4 HOH A 21 424 21 HOH WAT . 
F 4 HOH A 22 425 22 HOH WAT . 
F 4 HOH A 23 426 23 HOH WAT . 
F 4 HOH A 24 427 24 HOH WAT . 
F 4 HOH A 25 428 25 HOH WAT . 
F 4 HOH A 26 429 26 HOH WAT . 
F 4 HOH A 27 430 27 HOH WAT . 
F 4 HOH A 28 431 28 HOH WAT . 
F 4 HOH A 29 432 29 HOH WAT . 
F 4 HOH A 30 433 30 HOH WAT . 
F 4 HOH A 31 434 31 HOH WAT . 
F 4 HOH A 32 435 32 HOH WAT . 
F 4 HOH A 33 436 33 HOH WAT . 
F 4 HOH A 34 437 34 HOH WAT . 
F 4 HOH A 35 438 35 HOH WAT . 
F 4 HOH A 36 439 36 HOH WAT . 
F 4 HOH A 37 440 37 HOH WAT . 
F 4 HOH A 38 441 38 HOH WAT . 
F 4 HOH A 39 442 39 HOH WAT . 
F 4 HOH A 40 443 40 HOH WAT . 
F 4 HOH A 41 444 41 HOH WAT . 
F 4 HOH A 42 445 42 HOH WAT . 
F 4 HOH A 43 446 43 HOH WAT . 
F 4 HOH A 44 447 44 HOH WAT . 
F 4 HOH A 45 448 45 HOH WAT . 
F 4 HOH A 46 449 46 HOH WAT . 
F 4 HOH A 47 450 47 HOH WAT . 
F 4 HOH A 48 451 48 HOH WAT . 
F 4 HOH A 49 452 49 HOH WAT . 
F 4 HOH A 50 453 50 HOH WAT . 
F 4 HOH A 51 454 51 HOH WAT . 
F 4 HOH A 52 455 52 HOH WAT . 
F 4 HOH A 53 456 53 HOH WAT . 
F 4 HOH A 54 457 54 HOH WAT . 
F 4 HOH A 55 458 55 HOH WAT . 
F 4 HOH A 56 459 56 HOH WAT . 
F 4 HOH A 57 460 57 HOH WAT . 
F 4 HOH A 58 461 58 HOH WAT . 
F 4 HOH A 59 462 59 HOH WAT . 
F 4 HOH A 60 463 60 HOH WAT . 
F 4 HOH A 61 464 61 HOH WAT . 
F 4 HOH A 62 465 62 HOH WAT . 
F 4 HOH A 63 466 63 HOH WAT . 
F 4 HOH A 64 467 64 HOH WAT . 
F 4 HOH A 65 468 65 HOH WAT . 
F 4 HOH A 66 469 66 HOH WAT . 
F 4 HOH A 67 470 67 HOH WAT . 
F 4 HOH A 68 471 68 HOH WAT . 
F 4 HOH A 69 472 69 HOH WAT . 
F 4 HOH A 70 473 70 HOH WAT . 
F 4 HOH A 71 474 71 HOH WAT . 
F 4 HOH A 72 475 72 HOH WAT . 
F 4 HOH A 73 476 73 HOH WAT . 
F 4 HOH A 74 477 74 HOH WAT . 
F 4 HOH A 75 478 75 HOH WAT . 
F 4 HOH A 76 479 76 HOH WAT . 
F 4 HOH A 77 480 77 HOH WAT . 
F 4 HOH A 78 481 78 HOH WAT . 
F 4 HOH A 79 482 79 HOH WAT . 
F 4 HOH A 80 483 80 HOH WAT . 
F 4 HOH A 81 484 81 HOH WAT . 
F 4 HOH A 82 485 82 HOH WAT . 
F 4 HOH A 83 486 83 HOH WAT . 
F 4 HOH A 84 487 84 HOH WAT . 
F 4 HOH A 85 488 85 HOH WAT . 
F 4 HOH A 86 489 86 HOH WAT . 
F 4 HOH A 87 490 87 HOH WAT . 
F 4 HOH A 88 491 88 HOH WAT . 
F 4 HOH A 89 492 89 HOH WAT . 
F 4 HOH A 90 493 90 HOH WAT . 
F 4 HOH A 91 494 91 HOH WAT . 
F 4 HOH A 92 495 92 HOH WAT . 
F 4 HOH A 93 496 93 HOH WAT . 
F 4 HOH A 94 497 94 HOH WAT . 
F 4 HOH A 95 498 95 HOH WAT . 
F 4 HOH A 96 499 96 HOH WAT . 
F 4 HOH A 97 500 97 HOH WAT . 
F 4 HOH A 98 501 98 HOH WAT . 
F 4 HOH A 99 502 99 HOH WAT . 
F 4 HOH A 100 503 100 HOH WAT . 
F 4 HOH A 101 504 101 HOH WAT . 
F 4 HOH A 102 505 102 HOH WAT . 
F 4 HOH A 103 506 103 HOH WAT . 
F 4 HOH A 104 507 104 HOH WAT . 
F 4 HOH A 105 508 105 HOH WAT . 
F 4 HOH A 106 509 106 HOH WAT . 
F 4 HOH A 107 510 107 HOH WAT . 
F 4 HOH A 108 511 108 HOH WAT . 
F 4 HOH A 109 512 109 HOH WAT . 
F 4 HOH A 110 513 110 HOH WAT . 
F 4 HOH A 111 514 111 HOH WAT . 
F 4 HOH A 112 515 112 HOH WAT . 
F 4 HOH A 113 516 113 HOH WAT . 
F 4 HOH A 114 517 114 HOH WAT . 
F 4 HOH A 115 518 115 HOH WAT . 
F 4 HOH A 116 519 116 HOH WAT . 
F 4 HOH A 117 520 117 HOH WAT . 
F 4 HOH A 118 521 118 HOH WAT . 
F 4 HOH A 119 522 119 HOH WAT . 
F 4 HOH A 120 523 120 HOH WAT . 
F 4 HOH A 121 524 121 HOH WAT . 
F 4 HOH A 122 525 122 HOH WAT . 
F 4 HOH A 123 526 123 HOH WAT . 
F 4 HOH A 124 527 124 HOH WAT . 
F 4 HOH A 125 528 125 HOH WAT . 
F 4 HOH A 126 529 126 HOH WAT . 
F 4 HOH A 127 530 127 HOH WAT . 
F 4 HOH A 128 531 128 HOH WAT . 
F 4 HOH A 129 532 129 HOH WAT . 
F 4 HOH A 130 533 130 HOH WAT . 
F 4 HOH A 131 534 131 HOH WAT . 
F 4 HOH A 132 535 132 HOH WAT . 
F 4 HOH A 133 536 133 HOH WAT . 
F 4 HOH A 134 537 134 HOH WAT . 
F 4 HOH A 135 538 135 HOH WAT . 
F 4 HOH A 136 539 136 HOH WAT . 
F 4 HOH A 137 540 137 HOH WAT . 
F 4 HOH A 138 541 138 HOH WAT . 
F 4 HOH A 139 542 139 HOH WAT . 
F 4 HOH A 140 543 140 HOH WAT . 
F 4 HOH A 141 544 141 HOH WAT . 
F 4 HOH A 142 545 142 HOH WAT . 
F 4 HOH A 143 546 143 HOH WAT . 
F 4 HOH A 144 547 144 HOH WAT . 
F 4 HOH A 145 548 145 HOH WAT . 
F 4 HOH A 146 549 146 HOH WAT . 
F 4 HOH A 147 550 147 HOH WAT . 
F 4 HOH A 148 551 148 HOH WAT . 
F 4 HOH A 149 552 149 HOH WAT . 
F 4 HOH A 150 553 150 HOH WAT . 
F 4 HOH A 151 554 151 HOH WAT . 
F 4 HOH A 152 555 152 HOH WAT . 
F 4 HOH A 153 556 153 HOH WAT . 
F 4 HOH A 154 557 154 HOH WAT . 
F 4 HOH A 155 558 155 HOH WAT . 
F 4 HOH A 156 559 156 HOH WAT . 
F 4 HOH A 157 560 157 HOH WAT . 
F 4 HOH A 158 561 158 HOH WAT . 
F 4 HOH A 159 562 159 HOH WAT . 
F 4 HOH A 160 563 160 HOH WAT . 
F 4 HOH A 161 564 161 HOH WAT . 
F 4 HOH A 162 565 162 HOH WAT . 
F 4 HOH A 163 566 163 HOH WAT . 
F 4 HOH A 164 567 164 HOH WAT . 
F 4 HOH A 165 568 165 HOH WAT . 
F 4 HOH A 166 569 166 HOH WAT . 
F 4 HOH A 167 570 167 HOH WAT . 
F 4 HOH A 168 571 168 HOH WAT . 
F 4 HOH A 169 572 169 HOH WAT . 
F 4 HOH A 170 573 170 HOH WAT . 
F 4 HOH A 171 574 171 HOH WAT . 
F 4 HOH A 172 575 172 HOH WAT . 
F 4 HOH A 173 576 173 HOH WAT . 
F 4 HOH A 174 577 174 HOH WAT . 
F 4 HOH A 175 578 175 HOH WAT . 
F 4 HOH A 176 579 176 HOH WAT . 
F 4 HOH A 177 580 177 HOH WAT . 
F 4 HOH A 178 581 178 HOH WAT . 
F 4 HOH A 179 582 179 HOH WAT . 
F 4 HOH A 180 583 180 HOH WAT . 
F 4 HOH A 181 584 181 HOH WAT . 
F 4 HOH A 182 585 182 HOH WAT . 
F 4 HOH A 183 586 183 HOH WAT . 
F 4 HOH A 184 587 184 HOH WAT . 
F 4 HOH A 185 588 185 HOH WAT . 
F 4 HOH A 186 589 186 HOH WAT . 
F 4 HOH A 187 590 187 HOH WAT . 
F 4 HOH A 188 591 188 HOH WAT . 
F 4 HOH A 189 592 189 HOH WAT . 
F 4 HOH A 190 593 190 HOH WAT . 
F 4 HOH A 191 594 191 HOH WAT . 
F 4 HOH A 192 595 192 HOH WAT . 
F 4 HOH A 193 596 193 HOH WAT . 
F 4 HOH A 194 597 194 HOH WAT . 
F 4 HOH A 195 598 195 HOH WAT . 
F 4 HOH A 196 599 196 HOH WAT . 
F 4 HOH A 197 600 197 HOH WAT . 
F 4 HOH A 198 601 198 HOH WAT . 
F 4 HOH A 199 602 199 HOH WAT . 
F 4 HOH A 200 603 200 HOH WAT . 
F 4 HOH A 201 604 201 HOH WAT . 
F 4 HOH A 202 605 202 HOH WAT . 
F 4 HOH A 203 606 203 HOH WAT . 
F 4 HOH A 204 607 204 HOH WAT . 
F 4 HOH A 205 608 205 HOH WAT . 
F 4 HOH A 206 609 206 HOH WAT . 
F 4 HOH A 207 610 207 HOH WAT . 
F 4 HOH A 208 611 208 HOH WAT . 
F 4 HOH A 209 612 209 HOH WAT . 
F 4 HOH A 210 613 210 HOH WAT . 
F 4 HOH A 211 614 211 HOH WAT . 
F 4 HOH A 212 615 212 HOH WAT . 
F 4 HOH A 213 616 213 HOH WAT . 
F 4 HOH A 214 617 214 HOH WAT . 
F 4 HOH A 215 618 215 HOH WAT . 
F 4 HOH A 216 619 216 HOH WAT . 
F 4 HOH A 217 620 217 HOH WAT . 
F 4 HOH A 218 621 218 HOH WAT . 
F 4 HOH A 219 622 219 HOH WAT . 
F 4 HOH A 220 623 220 HOH WAT . 
F 4 HOH A 221 624 221 HOH WAT . 
F 4 HOH A 222 625 222 HOH WAT . 
F 4 HOH A 223 626 223 HOH WAT . 
F 4 HOH A 224 627 224 HOH WAT . 
F 4 HOH A 225 628 225 HOH WAT . 
F 4 HOH A 226 629 226 HOH WAT . 
F 4 HOH A 227 630 227 HOH WAT . 
F 4 HOH A 228 631 228 HOH WAT . 
F 4 HOH A 229 632 229 HOH WAT . 
F 4 HOH A 230 633 230 HOH WAT . 
F 4 HOH A 231 634 231 HOH WAT . 
#
loop_
_atom_site.group_PDB
_atom_site.id
_atom_site.type_symbol
_atom_site.label_atom_id
_atom_site.label_comp_id
_atom_site.label_seq_id
_atom_site.label_alt_id
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code
_atom_site.label_asym_id
_atom_site.label_entity_id
_atom_site.Cartn_x
_atom_site.Cartn_y
_atom_site.Cartn_z
_atom_site.occupancy
_atom_site.B_iso_or_equiv
_atom_site.pdbx_formal_charge
_atom_site.auth_atom_id
_atom_site.auth_comp_id
_atom_site.auth_seq_id
_atom_site.auth_asym_id
_atom_site.pdbx_PDB_model_num
HETATM 1 C C1 GOL . . . D 3 -3.774 15.374 -2.606 1 32.61 ? C1 GOL 402 A 1 
HETATM 2 O O1 GOL . . . D 3 -3.704 15.36 -4.214 1 30.29 ? O1 GOL 402 A 1 
HETATM 3 C C2 GOL . . . D 3 -4.619 14.603 -1.818 1 32.96 ? C2 GOL 402 A 1 
HETATM 4 O O2 GOL . . . D 3 -5.902 14.95 -1.953 1 36.1 ? O2 GOL 402 A 1 
HETATM 5 C C3 GOL . . . D 3 -3.929 14.033 -0.991 1 33.26 ? C3 GOL 402 A 1 
HETATM 6 O O3 GOL . . . D 3 -2.676 13.111 -0.788 1 30.71 ? O3 GOL 402 A 1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              8 
_model_server_stats.parse_time_ms           13 
_model_server_stats.create_model_time_ms    8 
_model_server_stats.query_time_ms           288 
_model_server_stats.encode_time_ms          5 
_model_server_stats.element_count           6 
#