data_1I8A # _model_server_result.job_id hdmyaih-_S2OdCO3oHCXIg _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 17:12:13' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1i8a # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"B","auth_seq_id":189}' # _entry.id 1I8A # _exptl.entry_id 1I8A _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 180.156 _entity.id 2 _entity.src_method man _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description beta-D-glucopyranose _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1I8A _cell.length_a 56.76 _cell.length_b 56.76 _cell.length_c 123.1 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1I8A _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 92 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 41 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 2 _struct_asym.id B _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A O VAL 11 A VAL 10 1_555 D CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.279 ? metalc ? metalc2 A OD1 ASP 13 A ASP 12 1_555 D CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.513 ? metalc ? metalc3 A O GLU 15 A GLU 14 1_555 D CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.35 ? metalc ? metalc4 A OD1 ASP 17 A ASP 16 1_555 D CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.319 ? metalc ? metalc5 A OD1 ASP 61 A ASP 60 1_555 E CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.437 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 61 A ASP 60 1_555 E CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.612 ? metalc ? metalc7 A O VAL 63 A VAL 62 1_555 E CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.281 ? metalc ? metalc8 A OD1 ASP 75 A ASP 74 1_555 E CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.517 ? metalc ? metalc9 A OD2 ASP 75 A ASP 74 1_555 E CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.748 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASP 82 A ASP 81 1_555 C CA CA . A CA 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.645 ? metalc ? metalc11 A OD1 ASN 84 A ASN 83 1_555 C CA CA . A CA 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.598 ? metalc ? metalc12 A OE1 GLU 92 A GLU 91 1_555 C CA CA . A CA 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc13 A OD1 ASP 94 A ASP 93 1_555 C CA CA . A CA 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.582 ? metalc ? metalc14 A OD2 ASP 94 A ASP 93 1_555 C CA CA . A CA 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.398 ? metalc ? metalc15 A OD1 ASP 95 A ASP 94 1_555 C CA CA . A CA 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.392 ? metalc ? metalc16 A OD2 ASP 95 A ASP 94 1_555 C CA CA . A CA 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc ? metalc17 A OE1 GLU 131 A GLU 130 1_555 D CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.505 ? metalc ? metalc18 A OE2 GLU 131 A GLU 130 1_555 D CA CA . A CA 191 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.457 ? metalc ? metalc19 A OD1 ASP 155 A ASP 154 1_555 E CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.371 ? metalc ? metalc20 A O ALA 156 A ALA 155 1_555 E CA CA . A CA 192 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? metalc ? metalc21 C CA CA . A CA 190 1_555 F O HOH . A HOH 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.759 ? metalc ? metalc22 D CA CA . A CA 191 1_555 F O HOH . A HOH 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.592 ? metalc ? metalc23 E CA CA . A CA 192 1_555 F O HOH . A HOH 215 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.921 ? # _chem_comp.formula 'C6 H12 O6' _chem_comp.formula_weight 180.156 _chem_comp.id BGC _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name beta-D-glucopyranose _chem_comp.type 'd-saccharide, beta linking' _chem_comp.pdbx_synonyms beta-D-glucose;D-glucose;glucose # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C2 C3 BGC sing 70 n n C2 C1 BGC sing 71 n n C2 O2 BGC sing 72 n n C2 H2 BGC sing 73 n n C3 C4 BGC sing 74 n n C3 O3 BGC sing 75 n n C3 H3 BGC sing 76 n n C4 C5 BGC sing 77 n n C4 O4 BGC sing 78 n n C4 H4 BGC sing 79 n n C5 C6 BGC sing 80 n n C5 O5 BGC sing 81 n n C5 H5 BGC sing 82 n n C6 O6 BGC sing 83 n n C6 H61 BGC sing 84 n n C6 H62 BGC sing 85 n n C1 O1 BGC sing 86 n n C1 O5 BGC sing 87 n n C1 H1 BGC sing 88 n n O1 HO1 BGC sing 89 n n O2 HO2 BGC sing 90 n n O3 HO3 BGC sing 91 n n O4 HO4 BGC sing 92 n n O6 HO6 BGC sing 93 n n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.identifier _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version BGC DGlcpb 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 BGC b-D-glucopyranose 'COMMON NAME' GMML 1 BGC b-D-Glcp 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1 BGC Glc 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1 # _atom_sites.entry_id 1I8A _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.017618 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.017618 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.008123 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 BGC A 1 189 189 BGC BGC . C 3 CA A 1 190 190 CA CAL . D 3 CA A 1 191 191 CA CAL . E 3 CA A 1 192 192 CA CAL . F 4 HOH A 1 193 193 HOH WAT . F 4 HOH A 2 194 194 HOH WAT . F 4 HOH A 3 195 195 HOH WAT . F 4 HOH A 4 196 196 HOH WAT . F 4 HOH A 5 197 197 HOH WAT . F 4 HOH A 6 198 198 HOH WAT . F 4 HOH A 7 199 199 HOH WAT . F 4 HOH A 8 200 200 HOH WAT . F 4 HOH A 9 201 201 HOH WAT . F 4 HOH A 10 202 202 HOH WAT . F 4 HOH A 11 203 203 HOH WAT . F 4 HOH A 12 204 204 HOH WAT . F 4 HOH A 13 205 205 HOH WAT . F 4 HOH A 14 206 206 HOH WAT . F 4 HOH A 15 207 207 HOH WAT . F 4 HOH A 16 208 208 HOH WAT . F 4 HOH A 17 209 209 HOH WAT . F 4 HOH A 18 210 210 HOH WAT . F 4 HOH A 19 211 211 HOH WAT . F 4 HOH A 20 212 212 HOH WAT . F 4 HOH A 21 213 213 HOH WAT . F 4 HOH A 22 214 214 HOH WAT . F 4 HOH A 23 215 215 HOH WAT . F 4 HOH A 24 216 216 HOH WAT . F 4 HOH A 25 217 217 HOH WAT . F 4 HOH A 26 218 218 HOH WAT . F 4 HOH A 27 219 219 HOH WAT . F 4 HOH A 28 220 220 HOH WAT . F 4 HOH A 29 221 221 HOH WAT . F 4 HOH A 30 222 222 HOH WAT . F 4 HOH A 31 223 223 HOH WAT . F 4 HOH A 32 224 224 HOH WAT . F 4 HOH A 33 225 225 HOH WAT . F 4 HOH A 34 226 226 HOH WAT . F 4 HOH A 35 227 227 HOH WAT . F 4 HOH A 36 228 228 HOH WAT . F 4 HOH A 37 229 229 HOH WAT . F 4 HOH A 38 230 230 HOH WAT . F 4 HOH A 39 231 231 HOH WAT . F 4 HOH A 40 232 232 HOH WAT . F 4 HOH A 41 233 233 HOH WAT . F 4 HOH A 42 234 234 HOH WAT . F 4 HOH A 43 235 235 HOH WAT . F 4 HOH A 44 236 236 HOH WAT . F 4 HOH A 45 237 237 HOH WAT . F 4 HOH A 46 238 238 HOH WAT . F 4 HOH A 47 239 239 HOH WAT . F 4 HOH A 48 240 240 HOH WAT . F 4 HOH A 49 241 241 HOH WAT . F 4 HOH A 50 242 242 HOH WAT . F 4 HOH A 51 243 243 HOH WAT . F 4 HOH A 52 244 244 HOH WAT . F 4 HOH A 53 245 245 HOH WAT . F 4 HOH A 54 246 246 HOH WAT . F 4 HOH A 55 247 247 HOH WAT . F 4 HOH A 56 248 248 HOH WAT . F 4 HOH A 57 249 249 HOH WAT . F 4 HOH A 58 250 250 HOH WAT . F 4 HOH A 59 251 251 HOH WAT . F 4 HOH A 60 252 252 HOH WAT . F 4 HOH A 61 253 253 HOH WAT . F 4 HOH A 62 254 254 HOH WAT . F 4 HOH A 63 255 255 HOH WAT . F 4 HOH A 64 256 256 HOH WAT . F 4 HOH A 65 257 257 HOH WAT . F 4 HOH A 66 258 258 HOH WAT . F 4 HOH A 67 259 259 HOH WAT . F 4 HOH A 68 260 260 HOH WAT . F 4 HOH A 69 261 261 HOH WAT . F 4 HOH A 70 262 262 HOH WAT . F 4 HOH A 71 263 263 HOH WAT . F 4 HOH A 72 264 264 HOH WAT . F 4 HOH A 73 265 265 HOH WAT . F 4 HOH A 74 266 266 HOH WAT . F 4 HOH A 75 267 267 HOH WAT . F 4 HOH A 76 268 268 HOH WAT . F 4 HOH A 77 269 269 HOH WAT . F 4 HOH A 78 270 270 HOH WAT . F 4 HOH A 79 271 271 HOH WAT . F 4 HOH A 80 272 272 HOH WAT . F 4 HOH A 81 273 273 HOH WAT . F 4 HOH A 82 274 274 HOH WAT . F 4 HOH A 83 275 275 HOH WAT . F 4 HOH A 84 276 276 HOH WAT . F 4 HOH A 85 277 277 HOH WAT . F 4 HOH A 86 278 278 HOH WAT . F 4 HOH A 87 279 279 HOH WAT . F 4 HOH A 88 280 280 HOH WAT . F 4 HOH A 89 281 281 HOH WAT . F 4 HOH A 90 282 282 HOH WAT . F 4 HOH A 91 283 283 HOH WAT . F 4 HOH A 92 284 284 HOH WAT . F 4 HOH A 93 285 285 HOH WAT . F 4 HOH A 94 286 286 HOH WAT . F 4 HOH A 95 287 287 HOH WAT . F 4 HOH A 96 288 288 HOH WAT . F 4 HOH A 97 289 289 HOH WAT . F 4 HOH A 98 290 290 HOH WAT . F 4 HOH A 99 291 291 HOH WAT . F 4 HOH A 100 292 292 HOH WAT . F 4 HOH A 101 293 293 HOH WAT . F 4 HOH A 102 294 294 HOH WAT . F 4 HOH A 103 295 295 HOH WAT . F 4 HOH A 104 296 296 HOH WAT . F 4 HOH A 105 297 297 HOH WAT . F 4 HOH A 106 298 298 HOH WAT . F 4 HOH A 107 299 299 HOH WAT . F 4 HOH A 108 300 300 HOH WAT . F 4 HOH A 109 301 301 HOH WAT . F 4 HOH A 110 302 302 HOH WAT . F 4 HOH A 111 303 303 HOH WAT . F 4 HOH A 112 304 304 HOH WAT . F 4 HOH A 113 305 305 HOH WAT . F 4 HOH A 114 306 306 HOH WAT . F 4 HOH A 115 307 307 HOH WAT . F 4 HOH A 116 308 308 HOH WAT . F 4 HOH A 117 309 309 HOH WAT . F 4 HOH A 118 310 310 HOH WAT . F 4 HOH A 119 311 311 HOH WAT . F 4 HOH A 120 312 312 HOH WAT . F 4 HOH A 121 313 313 HOH WAT . F 4 HOH A 122 314 314 HOH WAT . F 4 HOH A 123 315 315 HOH WAT . F 4 HOH A 124 316 316 HOH WAT . F 4 HOH A 125 317 317 HOH WAT . F 4 HOH A 126 318 318 HOH WAT . F 4 HOH A 127 319 319 HOH WAT . F 4 HOH A 128 320 320 HOH WAT . F 4 HOH A 129 321 321 HOH WAT . F 4 HOH A 130 322 322 HOH WAT . F 4 HOH A 131 323 323 HOH WAT . F 4 HOH A 132 324 324 HOH WAT . F 4 HOH A 133 325 325 HOH WAT . F 4 HOH A 134 326 326 HOH WAT . F 4 HOH A 135 327 327 HOH WAT . F 4 HOH A 136 328 328 HOH WAT . F 4 HOH A 137 329 329 HOH WAT . F 4 HOH A 138 330 330 HOH WAT . F 4 HOH A 139 331 331 HOH WAT . F 4 HOH A 140 332 332 HOH WAT . F 4 HOH A 141 333 333 HOH WAT . F 4 HOH A 142 334 334 HOH WAT . F 4 HOH A 143 335 335 HOH WAT . F 4 HOH A 144 336 336 HOH WAT . F 4 HOH A 145 337 337 HOH WAT . F 4 HOH A 146 338 338 HOH WAT . F 4 HOH A 147 339 339 HOH WAT . F 4 HOH A 148 340 340 HOH WAT . F 4 HOH A 149 341 341 HOH WAT . F 4 HOH A 150 342 342 HOH WAT . F 4 HOH A 151 343 343 HOH WAT . F 4 HOH A 152 344 344 HOH WAT . F 4 HOH A 153 345 345 HOH WAT . F 4 HOH A 154 346 346 HOH WAT . F 4 HOH A 155 347 347 HOH WAT . F 4 HOH A 156 348 348 HOH WAT . F 4 HOH A 157 349 349 HOH WAT . F 4 HOH A 158 350 350 HOH WAT . F 4 HOH A 159 351 351 HOH WAT . F 4 HOH A 160 352 352 HOH WAT . F 4 HOH A 161 353 353 HOH WAT . F 4 HOH A 162 354 354 HOH WAT . F 4 HOH A 163 355 355 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C2 BGC . . . B 2 37.15 44.611 22.646 1 14.18 ? C2 BGC 189 A 1 HETATM 2 C C3 BGC . . . B 2 37.381 43.85 23.956 1 15.31 ? C3 BGC 189 A 1 HETATM 3 C C4 BGC . . . B 2 37.368 44.809 25.145 1 16.6 ? C4 BGC 189 A 1 HETATM 4 C C5 BGC . . . B 2 36.069 45.615 25.13 1 15.5 ? C5 BGC 189 A 1 HETATM 5 C C6 BGC . . . B 2 36.017 46.624 26.258 1 15.15 ? C6 BGC 189 A 1 HETATM 6 C C1 BGC . . . B 2 35.903 45.511 22.736 1 14.96 ? C1 BGC 189 A 1 HETATM 7 O O1 BGC . . . B 2 35.85 46.331 21.621 1 13.81 ? O1 BGC 189 A 1 HETATM 8 O O2 BGC . . . B 2 36.99 43.688 21.581 1 14.1 ? O2 BGC 189 A 1 HETATM 9 O O3 BGC . . . B 2 38.638 43.188 23.901 1 16.63 ? O3 BGC 189 A 1 HETATM 10 O O4 BGC . . . B 2 37.466 44.081 26.358 1 16.92 ? O4 BGC 189 A 1 HETATM 11 O O5 BGC . . . B 2 35.965 46.35 23.896 1 14.37 ? O5 BGC 189 A 1 HETATM 12 O O6 BGC . . . B 2 34.77 47.309 26.291 1 13.28 ? O6 BGC 189 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 5 _model_server_stats.parse_time_ms 5 _model_server_stats.create_model_time_ms 2 _model_server_stats.query_time_ms 238 _model_server_stats.encode_time_ms 2 _model_server_stats.element_count 12 #