data_1I9B
#
_model_server_result.job_id            Uql3RhUMc7KyOJPryrdmvA 
_model_server_result.datetime_utc      '2024-11-07 23:47:56' 
_model_server_result.server_version    0.9.12 
_model_server_result.query_name        ligand 
_model_server_result.source_id         pdb-bcif 
_model_server_result.entry_id          1i9b 
#
_model_server_params.name     atom_site 
_model_server_params.value    '{"label_asym_id":"Q","auth_seq_id":310}' 
#
_entry.id    1I9B 
#
_exptl.entry_id    1I9B 
_exptl.method      'X-RAY DIFFRACTION' 
#
_entity.details                     ? 
_entity.formula_weight              40.078 
_entity.id                          2 
_entity.src_method                  syn 
_entity.type                        non-polymer 
_entity.pdbx_description            'CALCIUM ION' 
_entity.pdbx_number_of_molecules    8 
_entity.pdbx_parent_entity_id       . 
_entity.pdbx_mutation               ? 
_entity.pdbx_fragment               ? 
_entity.pdbx_ec                     ? 
#
_cell.angle_alpha         90 
_cell.angle_beta          90 
_cell.angle_gamma         90 
_cell.entry_id            1I9B 
_cell.length_a            141.66 
_cell.length_b            141.66 
_cell.length_c            120.87 
_cell.Z_PDB               40 
_cell.pdbx_unique_axis    ? 
#
_symmetry.entry_id                 1I9B 
_symmetry.cell_setting             ? 
_symmetry.Int_Tables_number        94 
_symmetry.space_group_name_Hall    . 
_symmetry.space_group_name_H-M     'P 42 21 2' 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly.method_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_details
_pdbx_struct_assembly.oligomeric_count
_pdbx_struct_assembly.details
_pdbx_struct_assembly.id
PISA pentameric 5 author_and_software_defined_assembly 1 
PISA decameric 10 software_defined_assembly 2 
#
loop_
_pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list
_pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id
_pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W 1 1 
A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W 2 1,2 
#
loop_
_pdbx_struct_oper_list.id
_pdbx_struct_oper_list.type
_pdbx_struct_oper_list.name
_pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2]
_pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3]
_pdbx_struct_oper_list.vector[1]
_pdbx_struct_oper_list.vector[2]
_pdbx_struct_oper_list.vector[3]
1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 
2 'crystal symmetry operation' 7_555 y,x,-z 0 1 0 1 0 0 0 0 -1 0 0 0 
#
loop_
_struct_asym.details
_struct_asym.entity_id
_struct_asym.id
_struct_asym.pdbx_modified
_struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag
? 2 F N N 
? 2 G N N 
? 2 I N N 
? 2 K N N 
? 2 M N N 
? 2 O N N 
? 2 P N N 
? 2 Q N N 
#
loop_
_struct_conn.conn_type_id
_struct_conn.details
_struct_conn.id
_struct_conn.ptnr1_label_asym_id
_struct_conn.ptnr1_label_atom_id
_struct_conn.ptnr1_label_comp_id
_struct_conn.ptnr1_label_seq_id
_struct_conn.ptnr1_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr1_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr1_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr1_symmetry
_struct_conn.ptnr2_label_asym_id
_struct_conn.ptnr2_label_atom_id
_struct_conn.ptnr2_label_comp_id
_struct_conn.ptnr2_label_seq_id
_struct_conn.ptnr2_auth_asym_id
_struct_conn.ptnr2_auth_comp_id
_struct_conn.ptnr2_auth_seq_id
_struct_conn.ptnr2_symmetry
_struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id
_struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id
_struct_conn.pdbx_PDB_id
_struct_conn.pdbx_dist_value
_struct_conn.pdbx_value_order
disulf ? disulf1 A SG CYS 130 A CYS 123 1_555 A SG CYS 143 A CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? 
disulf ? disulf2 A SG CYS 194 A CYS 187 1_555 A SG CYS 195 A CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? 
disulf ? disulf3 B SG CYS 130 B CYS 123 1_555 B SG CYS 143 B CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? 
disulf ? disulf4 B SG CYS 194 B CYS 187 1_555 B SG CYS 195 B CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.066 ? 
disulf ? disulf5 C SG CYS 130 C CYS 123 1_555 C SG CYS 143 C CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf6 C SG CYS 194 C CYS 187 1_555 C SG CYS 195 C CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? 
disulf ? disulf7 D SG CYS 130 D CYS 123 1_555 D SG CYS 143 D CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? 
disulf ? disulf8 D SG CYS 194 D CYS 187 1_555 D SG CYS 195 D CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? 
disulf ? disulf9 E SG CYS 130 E CYS 123 1_555 E SG CYS 143 E CYS 136 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? 
disulf ? disulf10 E SG CYS 194 E CYS 187 1_555 E SG CYS 195 E CYS 188 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.064 ? 
metalc ? metalc1 F CA CA . A CA 301 1_555 A O VAL 183 A VAL 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.502 ? 
metalc ? metalc2 F CA CA . A CA 301 1_555 A OD1 ASP 168 A ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.988 ? 
metalc ? metalc3 F CA CA . A CA 301 1_555 A OD2 ASP 168 A ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.578 ? 
metalc ? metalc4 G CA CA . A CA 307 1_555 B OD2 ASP 12 B ASP 5 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.877 ? 
metalc ? metalc5 G CA CA . A CA 307 1_555 B OD1 ASP 9 B ASP 2 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.522 ? 
metalc ? metalc6 G CA CA . A CA 307 1_555 B OD1 ASP 12 B ASP 5 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.175 ? 
metalc ? metalc7 G CA CA . A CA 307 1_555 B OD1 ASP 9 B ASP 2 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.857 ? 
metalc ? metalc8 I CA CA . B CA 302 1_555 B OD1 ASP 182 B ASP 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.762 ? 
metalc ? metalc9 I CA CA . B CA 302 1_555 B O VAL 183 B VAL 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.722 ? 
metalc ? metalc10 I CA CA . B CA 302 1_555 B OD1 ASP 168 B ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.015 ? 
metalc ? metalc11 I CA CA . B CA 302 1_555 B OD2 ASP 168 B ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? 
metalc ? metalc12 K CA CA . C CA 303 1_555 C OD1 ASP 168 C ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.784 ? 
metalc ? metalc13 K CA CA . C CA 303 1_555 C OD2 ASP 168 C ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.764 ? 
metalc ? metalc14 K CA CA . C CA 303 1_555 C O VAL 183 C VAL 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.549 ? 
metalc ? metalc15 M CA CA . D CA 304 1_555 D O VAL 183 D VAL 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.441 ? 
metalc ? metalc16 M CA CA . D CA 304 1_555 D OD2 ASP 168 D ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.08 ? 
metalc ? metalc17 M CA CA . D CA 304 1_555 D OD1 ASP 168 D ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.613 ? 
metalc ? metalc18 O CA CA . E CA 305 1_555 E O VAL 183 E VAL 176 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? 
metalc ? metalc19 O CA CA . E CA 305 1_555 E OD1 ASP 168 E ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.816 ? 
metalc ? metalc20 O CA CA . E CA 305 1_555 E OD2 ASP 168 E ASP 161 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? 
metalc ? metalc21 P CA CA . E CA 306 1_555 A OD2 ASP 12 A ASP 5 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.98 ? 
metalc ? metalc22 P CA CA . E CA 306 1_555 A OD1 ASP 9 A ASP 2 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? 
metalc ? metalc23 P CA CA . E CA 306 1_555 A OD1 ASP 9 A ASP 2 1_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.465 ? 
metalc ? metalc24 P CA CA . E CA 306 1_555 A OD1 ASP 12 A ASP 5 1_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.179 ? 
metalc ? metalc25 Q CA CA . E CA 310 1_555 E OD2 ASP 12 E ASP 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.286 ? 
metalc ? metalc26 Q CA CA . E CA 310 1_555 E OD1 ASP 9 E ASP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc27 Q CA CA . E CA 310 1_555 E OD2 ASP 9 E ASP 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
metalc ? metalc28 G CA CA . A CA 307 1_555 C OD2 ASP 9 C ASP 2 7_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.973 ? 
metalc ? metalc29 G CA CA . A CA 307 1_555 C OD2 ASP 9 C ASP 2 7_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.022 ? 
metalc ? metalc30 G CA CA . A CA 307 1_555 C OD2 ASP 12 C ASP 5 7_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.083 ? 
metalc ? metalc31 P CA CA . E CA 306 1_555 D OD2 ASP 9 D ASP 2 7_555 ? A ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.554 ? 
metalc ? metalc32 P CA CA . E CA 306 1_555 D OD2 ASP 9 D ASP 2 7_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.208 ? 
metalc ? metalc33 P CA CA . E CA 306 1_555 D OD2 ASP 12 D ASP 5 7_555 ? B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.346 ? 
metalc ? metalc34 Q CA CA . E CA 310 1_555 E OD1 ASP 9 E ASP 2 7_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.315 ? 
metalc ? metalc35 Q CA CA . E CA 310 1_555 E OD2 ASP 9 E ASP 2 7_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.353 ? 
metalc ? metalc36 Q CA CA . E CA 310 1_555 E OD2 ASP 12 E ASP 5 7_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.286 ? 
#
_chem_comp.formula           'Ca 2' 
_chem_comp.formula_weight    40.078 
_chem_comp.id                CA 
_chem_comp.mon_nstd_flag     . 
_chem_comp.name              'CALCIUM ION' 
_chem_comp.type              non-polymer 
_chem_comp.pdbx_synonyms     ? 
#
_atom_sites.entry_id                     1I9B 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][1]    0.007059 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[1][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][2]    0.007059 
_atom_sites.fract_transf_matrix[2][3]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][1]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][2]    0 
_atom_sites.fract_transf_matrix[3][3]    0.008273 
_atom_sites.fract_transf_vector[1]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[2]       0 
_atom_sites.fract_transf_vector[3]       0 
#
loop_
_pdbx_nonpoly_scheme.asym_id
_pdbx_nonpoly_scheme.entity_id
_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id
_pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id
_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code
F 2 CA A 1 301 301 CA CA . 
G 2 CA A 1 307 307 CA CA . 
H 3 EPE A 1 1050 1050 EPE EPE . 
I 2 CA B 1 302 302 CA CA . 
J 3 EPE B 1 1051 1051 EPE EPE . 
K 2 CA C 1 303 303 CA CA . 
L 3 EPE C 1 1052 1052 EPE EPE . 
M 2 CA D 1 304 304 CA CA . 
N 3 EPE D 1 1053 1053 EPE EPE . 
O 2 CA E 1 305 305 CA CA . 
P 2 CA E 1 306 306 CA CA . 
Q 2 CA E 1 310 310 CA CA . 
R 3 EPE E 1 1054 1054 EPE EPE . 
S 4 HOH A 1 1051 1 HOH HOH . 
S 4 HOH A 2 1052 2 HOH HOH . 
S 4 HOH A 3 1053 3 HOH HOH . 
S 4 HOH A 4 1054 4 HOH HOH . 
S 4 HOH A 5 1055 19 HOH HOH . 
T 4 HOH B 1 1052 5 HOH HOH . 
T 4 HOH B 2 1053 6 HOH HOH . 
T 4 HOH B 3 1054 15 HOH HOH . 
U 4 HOH C 1 1053 7 HOH HOH . 
U 4 HOH C 2 1054 8 HOH HOH . 
U 4 HOH C 3 1055 16 HOH HOH . 
V 4 HOH D 1 1054 9 HOH HOH . 
V 4 HOH D 2 1055 10 HOH HOH . 
V 4 HOH D 3 1056 11 HOH HOH . 
V 4 HOH D 4 1057 17 HOH HOH . 
W 4 HOH E 1 1055 12 HOH HOH . 
W 4 HOH E 2 1056 13 HOH HOH . 
W 4 HOH E 3 1057 14 HOH HOH . 
W 4 HOH E 4 1058 18 HOH HOH . 
#
_atom_site.group_PDB             HETATM 
_atom_site.id                    1 
_atom_site.type_symbol           CA 
_atom_site.label_atom_id         CA 
_atom_site.label_comp_id         CA 
_atom_site.label_seq_id          . 
_atom_site.label_alt_id          . 
_atom_site.pdbx_PDB_ins_code     . 
_atom_site.label_asym_id         Q 
_atom_site.label_entity_id       2 
_atom_site.Cartn_x               61.599 
_atom_site.Cartn_y               61.599 
_atom_site.Cartn_z               0 
_atom_site.occupancy             0.5 
_atom_site.B_iso_or_equiv        84.18 
_atom_site.pdbx_formal_charge    ? 
_atom_site.auth_atom_id          CA 
_atom_site.auth_comp_id          CA 
_atom_site.auth_seq_id           310 
_atom_site.auth_asym_id          E 
_atom_site.pdbx_PDB_model_num    1 
#
_model_server_stats.io_time_ms              9 
_model_server_stats.parse_time_ms           10 
_model_server_stats.create_model_time_ms    29 
_model_server_stats.query_time_ms           326 
_model_server_stats.encode_time_ms          2 
_model_server_stats.element_count           1 
#