data_1J1A # _model_server_result.job_id tAYz3oEg_YuSzNqe8L281w _model_server_result.datetime_utc '2024-12-12 17:23:22' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1j1a # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":201}' # _entry.id 1J1A # _exptl.entry_id 1J1A _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 2 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 4 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 120 _cell.entry_id 1J1A _cell.length_a 75.11 _cell.length_b 75.11 _cell.length_c 50.03 _cell.Z_PDB 6 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1J1A _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 144 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 31' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 2 C N N ? 2 D N N ? 2 F N N ? 2 G N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 26 A CYS 26 1_555 A SG CYS 117 A CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 28 A CYS 28 1_555 A SG CYS 44 A CYS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.08 ? disulf ? disulf3 A SG CYS 43 A CYS 43 1_555 A SG CYS 97 A CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf ? disulf4 A SG CYS 49 A CYS 49 1_555 A SG CYS 124 A CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf5 A SG CYS 50 A CYS 50 1_555 A SG CYS 90 A CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.001 ? disulf ? disulf6 A SG CYS 59 A CYS 59 1_555 A SG CYS 83 A CYS 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf7 A SG CYS 77 A CYS 77 1_555 A SG CYS 88 A CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 26 B CYS 26 1_555 B SG CYS 117 B CYS 117 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 28 B CYS 28 1_555 B SG CYS 44 B CYS 44 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.06 ? disulf ? disulf10 B SG CYS 43 B CYS 43 1_555 B SG CYS 97 B CYS 97 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? disulf ? disulf11 B SG CYS 49 B CYS 49 1_555 B SG CYS 124 B CYS 124 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf12 B SG CYS 50 B CYS 50 1_555 B SG CYS 90 B CYS 90 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? disulf ? disulf13 B SG CYS 59 B CYS 59 1_555 B SG CYS 83 B CYS 83 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? disulf ? disulf14 B SG CYS 77 B CYS 77 1_555 B SG CYS 88 B CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? covale ? covale1 E C23 BHP . A BHP 1301 1_555 H C26 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.878 ? covale ? covale2 E C24 BHP . A BHP 1301 1_555 H C27 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? covale ? covale3 E C24 BHP . A BHP 1301 1_555 H C24 BHP . B BHP 2301 1_555 ? B ? ? B ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? covale ? covale4 E C28 BHP . A BHP 1301 1_555 H C25 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.833 ? covale ? covale5 E C25 BHP . A BHP 1301 1_555 H C28 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.337 ? covale ? covale6 E C27 BHP . A BHP 1301 1_555 H C27 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.844 ? covale ? covale7 E C27 BHP . A BHP 1301 1_555 H C24 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? covale ? covale8 E C26 BHP . A BHP 1301 1_555 H C28 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.372 ? covale ? covale9 E C26 BHP . A BHP 1301 1_555 H C26 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? covale ? covale10 E C26 BHP . A BHP 1301 1_555 H C23 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.947 ? covale ? covale11 E C26 BHP . A BHP 1301 1_555 H C25 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 1.958 ? covale ? covale12 E C23 BHP . A BHP 1301 1_555 H C27 BHP . B BHP 2301 1_555 ? A ? ? A ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? metalc ? metalc1 A O PHE 23 A PHE 23 1_555 D CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.705 ? metalc ? metalc2 A O GLY 25 A GLY 25 1_555 D CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.608 ? metalc ? metalc3 A O HIS 27 A HIS 27 1_555 C CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc4 A O GLY 29 A GLY 29 1_555 C CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.384 ? metalc ? metalc5 A O GLY 31 A GLY 31 1_555 C CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.536 ? metalc ? metalc6 A OD1 ASP 48 A ASP 48 1_555 C CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.706 ? metalc ? metalc7 A OD2 ASP 48 A ASP 48 1_555 C CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.673 ? metalc ? metalc8 A O TYR 112 A TYR 112 1_555 D CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.422 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASN 114 A ASN 114 1_555 D CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.461 ? metalc ? metalc10 C CA CA . A CA 201 1_555 E O3 BHP . A BHP 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.544 ? metalc ? metalc11 C CA CA . A CA 201 1_555 E O1 BHP . A BHP 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.417 ? metalc ? metalc12 D CA CA . A CA 202 1_555 I O HOH . A HOH 309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.879 ? metalc ? metalc13 D CA CA . A CA 202 1_555 I O HOH . A HOH 325 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.908 ? metalc ? metalc14 B O PHE 23 B PHE 23 1_555 G CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.626 ? metalc ? metalc15 B O GLY 25 B GLY 25 1_555 G CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.59 ? metalc ? metalc16 B O HIS 27 B HIS 27 1_555 F CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.525 ? metalc ? metalc17 B O GLY 29 B GLY 29 1_555 F CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.423 ? metalc ? metalc18 B O GLY 31 B GLY 31 1_555 F CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.5 ? metalc ? metalc19 B OD1 ASP 48 B ASP 48 1_555 F CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.713 ? metalc ? metalc20 B OD2 ASP 48 B ASP 48 1_555 F CA CA . B CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc21 B O TYR 112 B TYR 112 1_555 G CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.449 ? metalc ? metalc22 B OD1 ASN 114 B ASN 114 1_555 G CA CA . B CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.426 ? metalc ? metalc23 F CA CA . B CA 201 1_555 H O3 BHP . B BHP 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.568 ? metalc ? metalc24 F CA CA . B CA 201 1_555 H O1 BHP . B BHP 2301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? metalc ? metalc25 G CA CA . B CA 202 1_555 J O HOH . B HOH 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.827 ? metalc ? metalc26 G CA CA . B CA 202 1_555 J O HOH . B HOH 392 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.89 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1J1A _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.013314 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.007687 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.015373 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.019988 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code C 2 CA A 1 201 201 CA CA . D 2 CA A 1 202 202 CA CA . E 3 BHP A 1 1301 301 BHP AAA . F 2 CA B 1 201 201 CA CA . G 2 CA B 1 202 202 CA CA . H 3 BHP B 1 2301 301 BHP AAA . I 4 HOH A 1 301 301 HOH WAT . I 4 HOH A 2 302 302 HOH WAT . I 4 HOH A 3 303 303 HOH WAT . I 4 HOH A 4 304 304 HOH WAT . I 4 HOH A 5 305 305 HOH WAT . I 4 HOH A 6 306 306 HOH WAT . I 4 HOH A 7 307 307 HOH WAT . I 4 HOH A 8 308 308 HOH WAT . I 4 HOH A 9 309 309 HOH WAT . I 4 HOH A 10 310 310 HOH WAT . I 4 HOH A 11 311 311 HOH WAT . I 4 HOH A 12 312 312 HOH WAT . I 4 HOH A 13 314 314 HOH WAT . I 4 HOH A 14 315 315 HOH WAT . I 4 HOH A 15 316 316 HOH WAT . I 4 HOH A 16 318 318 HOH WAT . I 4 HOH A 17 319 319 HOH WAT . I 4 HOH A 18 320 320 HOH WAT . I 4 HOH A 19 323 323 HOH WAT . I 4 HOH A 20 324 324 HOH WAT . I 4 HOH A 21 325 325 HOH WAT . I 4 HOH A 22 326 326 HOH WAT . I 4 HOH A 23 327 327 HOH WAT . I 4 HOH A 24 328 328 HOH WAT . I 4 HOH A 25 329 329 HOH WAT . I 4 HOH A 26 330 330 HOH WAT . I 4 HOH A 27 331 331 HOH WAT . I 4 HOH A 28 332 332 HOH WAT . I 4 HOH A 29 333 333 HOH WAT . I 4 HOH A 30 334 334 HOH WAT . I 4 HOH A 31 335 335 HOH WAT . I 4 HOH A 32 336 336 HOH WAT . I 4 HOH A 33 337 337 HOH WAT . I 4 HOH A 34 338 338 HOH WAT . I 4 HOH A 35 339 339 HOH WAT . I 4 HOH A 36 340 340 HOH WAT . I 4 HOH A 37 342 342 HOH WAT . I 4 HOH A 38 343 343 HOH WAT . I 4 HOH A 39 345 345 HOH WAT . I 4 HOH A 40 346 346 HOH WAT . I 4 HOH A 41 347 347 HOH WAT . I 4 HOH A 42 348 348 HOH WAT . I 4 HOH A 43 349 349 HOH WAT . I 4 HOH A 44 350 350 HOH WAT . I 4 HOH A 45 351 351 HOH WAT . I 4 HOH A 46 352 352 HOH WAT . I 4 HOH A 47 353 353 HOH WAT . I 4 HOH A 48 354 354 HOH WAT . I 4 HOH A 49 355 355 HOH WAT . I 4 HOH A 50 356 356 HOH WAT . I 4 HOH A 51 357 357 HOH WAT . I 4 HOH A 52 358 358 HOH WAT . I 4 HOH A 53 359 359 HOH WAT . I 4 HOH A 54 360 360 HOH WAT . I 4 HOH A 55 361 361 HOH WAT . I 4 HOH A 56 362 362 HOH WAT . I 4 HOH A 57 363 363 HOH WAT . I 4 HOH A 58 364 364 HOH WAT . I 4 HOH A 59 365 365 HOH WAT . I 4 HOH A 60 366 366 HOH WAT . I 4 HOH A 61 367 367 HOH WAT . I 4 HOH A 62 375 375 HOH WAT . I 4 HOH A 63 410 410 HOH WAT . I 4 HOH A 64 437 437 HOH WAT . I 4 HOH A 65 438 438 HOH WAT . I 4 HOH A 66 441 441 HOH WAT . I 4 HOH A 67 443 443 HOH WAT . I 4 HOH A 68 445 445 HOH WAT . I 4 HOH A 69 446 446 HOH WAT . I 4 HOH A 70 448 448 HOH WAT . J 4 HOH B 1 368 368 HOH WAT . J 4 HOH B 2 369 369 HOH WAT . J 4 HOH B 3 370 370 HOH WAT . J 4 HOH B 4 371 371 HOH WAT . J 4 HOH B 5 372 372 HOH WAT . J 4 HOH B 6 373 373 HOH WAT . J 4 HOH B 7 374 374 HOH WAT . J 4 HOH B 8 376 376 HOH WAT . J 4 HOH B 9 377 377 HOH WAT . J 4 HOH B 10 378 378 HOH WAT . J 4 HOH B 11 379 379 HOH WAT . J 4 HOH B 12 381 381 HOH WAT . J 4 HOH B 13 382 382 HOH WAT . J 4 HOH B 14 383 383 HOH WAT . J 4 HOH B 15 385 385 HOH WAT . J 4 HOH B 16 386 386 HOH WAT . J 4 HOH B 17 387 387 HOH WAT . J 4 HOH B 18 388 388 HOH WAT . J 4 HOH B 19 389 389 HOH WAT . J 4 HOH B 20 390 390 HOH WAT . J 4 HOH B 21 391 391 HOH WAT . J 4 HOH B 22 392 392 HOH WAT . J 4 HOH B 23 393 393 HOH WAT . J 4 HOH B 24 394 394 HOH WAT . J 4 HOH B 25 395 395 HOH WAT . J 4 HOH B 26 396 396 HOH WAT . J 4 HOH B 27 397 397 HOH WAT . J 4 HOH B 28 398 398 HOH WAT . J 4 HOH B 29 399 399 HOH WAT . J 4 HOH B 30 400 400 HOH WAT . J 4 HOH B 31 401 401 HOH WAT . J 4 HOH B 32 402 402 HOH WAT . J 4 HOH B 33 403 403 HOH WAT . J 4 HOH B 34 404 404 HOH WAT . J 4 HOH B 35 405 405 HOH WAT . J 4 HOH B 36 406 406 HOH WAT . J 4 HOH B 37 407 407 HOH WAT . J 4 HOH B 38 409 409 HOH WAT . J 4 HOH B 39 412 412 HOH WAT . J 4 HOH B 40 413 413 HOH WAT . J 4 HOH B 41 414 414 HOH WAT . J 4 HOH B 42 415 415 HOH WAT . J 4 HOH B 43 416 416 HOH WAT . J 4 HOH B 44 417 417 HOH WAT . J 4 HOH B 45 418 418 HOH WAT . J 4 HOH B 46 419 419 HOH WAT . J 4 HOH B 47 420 420 HOH WAT . J 4 HOH B 48 422 422 HOH WAT . J 4 HOH B 49 423 423 HOH WAT . J 4 HOH B 50 424 424 HOH WAT . J 4 HOH B 51 425 425 HOH WAT . J 4 HOH B 52 426 426 HOH WAT . J 4 HOH B 53 427 427 HOH WAT . J 4 HOH B 54 428 428 HOH WAT . J 4 HOH B 55 429 429 HOH WAT . J 4 HOH B 56 430 430 HOH WAT . J 4 HOH B 57 431 431 HOH WAT . J 4 HOH B 58 432 432 HOH WAT . J 4 HOH B 59 433 433 HOH WAT . J 4 HOH B 60 434 434 HOH WAT . J 4 HOH B 61 436 436 HOH WAT . J 4 HOH B 62 439 439 HOH WAT . J 4 HOH B 63 440 440 HOH WAT . J 4 HOH B 64 442 442 HOH WAT . J 4 HOH B 65 444 444 HOH WAT . J 4 HOH B 66 447 447 HOH WAT . J 4 HOH B 67 449 449 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id C _atom_site.label_entity_id 2 _atom_site.Cartn_x -12.274 _atom_site.Cartn_y 26.405 _atom_site.Cartn_z 16.648 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 34.9 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 201 _atom_site.auth_asym_id A _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 20 _model_server_stats.create_model_time_ms 23 _model_server_stats.query_time_ms 1183 _model_server_stats.encode_time_ms 13 _model_server_stats.element_count 1 #