data_1J1E # _model_server_result.job_id bIG8YTGCUCcZddKNKULETw _model_server_result.datetime_utc '2024-11-04 20:16:26' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1j1e # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"K","auth_seq_id":202}' # _entry.id 1J1E # _exptl.entry_id 1J1E _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 4 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 102.38 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1J1E _cell.length_a 48.299 _cell.length_b 169.506 _cell.length_c 68.538 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1J1E _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 1 PISA trimeric 3 author_and_software_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,B,C,G,H,I 1 1 D,E,F,J,K,L 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 4 G N N ? 4 H N N ? 4 I N N ? 4 J N N ? 4 K N N ? 4 L N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order metalc ? metalc1 A OD2 ASP 65 A ASP 65 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.951 ? metalc ? metalc2 A OD2 ASP 67 A ASP 67 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? metalc ? metalc3 A OD1 ASP 67 A ASP 67 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.169 ? metalc ? metalc4 A OG SER 69 A SER 69 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.252 ? metalc ? metalc5 A O THR 71 A THR 71 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.909 ? metalc ? metalc6 A OD2 ASP 73 A ASP 73 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.316 ? metalc ? metalc7 A OE1 GLU 76 A GLU 76 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.439 ? metalc ? metalc8 A OE2 GLU 76 A GLU 76 1_555 G CA CA . A CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.382 ? metalc ? metalc9 A OD1 ASP 105 A ASP 105 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.851 ? metalc ? metalc10 A OD1 ASN 107 A ASN 107 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.9 ? metalc ? metalc11 A ND2 ASN 107 A ASN 107 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.343 ? metalc ? metalc12 A OD1 ASP 109 A ASP 109 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.064 ? metalc ? metalc13 A OD2 ASP 109 A ASP 109 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? metalc ? metalc14 A O TYR 111 A TYR 111 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.54 ? metalc ? metalc15 A OE1 GLU 116 A GLU 116 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.17 ? metalc ? metalc16 A OE2 GLU 116 A GLU 116 1_555 H CA CA . A CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.169 ? metalc ? metalc17 A OD2 ASP 141 A ASP 141 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? metalc ? metalc18 A OD1 ASN 143 A ASN 143 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? metalc ? metalc19 A ND2 ASN 143 A ASN 143 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.734 ? metalc ? metalc20 A OD2 ASP 145 A ASP 145 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.156 ? metalc ? metalc21 A OD1 ASP 145 A ASP 145 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.754 ? metalc ? metalc22 A O ARG 147 A ARG 147 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.52 ? metalc ? metalc23 A OE1 GLU 152 A GLU 152 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? metalc ? metalc24 A OE2 GLU 152 A GLU 152 1_555 I CA CA . A CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.572 ? metalc ? metalc25 D OD2 ASP 65 D ASP 65 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.254 ? metalc ? metalc26 D OD2 ASP 67 D ASP 67 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.004 ? metalc ? metalc27 D OD1 ASP 67 D ASP 67 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.326 ? metalc ? metalc28 D OG SER 69 D SER 69 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.496 ? metalc ? metalc29 D O THR 71 D THR 71 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.777 ? metalc ? metalc30 D OD2 ASP 73 D ASP 73 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.009 ? metalc ? metalc31 D OE1 GLU 76 D GLU 76 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.16 ? metalc ? metalc32 D OE2 GLU 76 D GLU 76 1_555 J CA CA . D CA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.407 ? metalc ? metalc33 D OD2 ASP 105 D ASP 105 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.499 ? metalc ? metalc34 D OD1 ASN 107 D ASN 107 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.241 ? metalc ? metalc35 D ND2 ASN 107 D ASN 107 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.791 ? metalc ? metalc36 D OD1 ASP 109 D ASP 109 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.159 ? metalc ? metalc37 D O TYR 111 D TYR 111 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.377 ? metalc ? metalc38 D OE1 GLU 116 D GLU 116 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.83 ? metalc ? metalc39 D OE2 GLU 116 D GLU 116 1_555 K CA CA . D CA 202 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.658 ? metalc ? metalc40 D OD2 ASP 141 D ASP 141 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.987 ? metalc ? metalc41 D OD1 ASN 143 D ASN 143 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.227 ? metalc ? metalc42 D ND2 ASN 143 D ASN 143 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.367 ? metalc ? metalc43 D OD1 ASP 145 D ASP 145 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.218 ? metalc ? metalc44 D OD2 ASP 145 D ASP 145 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.451 ? metalc ? metalc45 D O ARG 147 D ARG 147 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.349 ? metalc ? metalc46 D OE1 GLU 152 D GLU 152 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.552 ? metalc ? metalc47 D OE2 GLU 152 D GLU 152 1_555 L CA CA . D CA 203 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1J1E _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.020704 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.004545 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.005899 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014938 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code G 4 CA A 1 201 201 CA CA . H 4 CA A 1 202 202 CA CA . I 4 CA A 1 203 203 CA CA . J 4 CA D 1 201 201 CA CA . K 4 CA D 1 202 202 CA CA . L 4 CA D 1 203 203 CA CA . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id K _atom_site.label_entity_id 4 _atom_site.Cartn_x 14.37 _atom_site.Cartn_y 25.685 _atom_site.Cartn_z 8.168 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 78.08 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 202 _atom_site.auth_asym_id D _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 9 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 7 _model_server_stats.query_time_ms 284 _model_server_stats.encode_time_ms 4 _model_server_stats.element_count 1 #