data_1J9C # _model_server_result.job_id D0NdQERbTo00qeBNg8IWeA _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 18:26:47' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1j9c # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"H","auth_seq_id":376}' # _entry.id 1J9C # _exptl.entry_id 1J9C _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 40.078 _entity.id 8 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'CALCIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 92.12 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1J9C _cell.length_a 77.038 _cell.length_b 68.302 _cell.length_c 78.438 _cell.Z_PDB 2 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1J9C _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details trimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 3 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 8 _struct_asym.id H _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 A SG CYS 49 T CYS 49 1_555 A SG CYS 57 T CYS 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? disulf ? disulf2 A SG CYS 186 T CYS 186 1_555 A SG CYS 209 T CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf3 B SG CYS 3 L CYS 50 1_555 B SG CYS 14 L CYS 61 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf4 B SG CYS 8 L CYS 55 1_555 B SG CYS 23 L CYS 70 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf ? disulf5 B SG CYS 25 L CYS 72 1_555 B SG CYS 34 L CYS 81 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf ? disulf6 B SG CYS 44 L CYS 91 1_555 B SG CYS 55 L CYS 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? disulf ? disulf7 B SG CYS 51 L CYS 98 1_555 B SG CYS 65 L CYS 112 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf8 B SG CYS 67 L CYS 114 1_555 B SG CYS 80 L CYS 127 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? disulf ? disulf9 B SG CYS 88 L CYS 135 1_555 C SG CYS 110 H CYS 122 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf10 C SG CYS 7 H CYS 22 1_555 C SG CYS 12 H CYS 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf ? disulf11 C SG CYS 26 H CYS 42 1_555 C SG CYS 42 H CYS 58 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? disulf ? disulf12 C SG CYS 158 H CYS 168 1_555 C SG CYS 177 H CYS 182 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf ? disulf13 C SG CYS 188 H CYS 191 1_555 C SG CYS 216 H CYS 220 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? covale ? covale1 B OG SER 5 L SER 52 1_555 D C1 GLC . L GLC 352 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.393 ? covale ? covale2 B OG SER 13 L SER 60 1_555 E C1 FUL . L FUL 360 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? covale ? covale3 F C3 0Z6 . H 0Z6 1 1_555 C NE2 HIS 41 H HIS 57 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.489 ? covale ? covale4 F C2 0Z6 . H 0Z6 1 1_555 C OG SER 192 H SER 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.355 ? covale ? covale5 C ND2 ASN 170 H ASN 175 1_555 G C1 NAG . H NAG 375 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? metalc ? metalc1 C OE1 GLU 58 H GLU 70 1_555 H CA CA . H CA 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.577 ? metalc ? metalc2 C O ASP 60 H ASP 72 1_555 H CA CA . H CA 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.795 ? metalc ? metalc3 C O GLU 63 H GLU 75 1_555 H CA CA . H CA 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.055 ? metalc ? metalc4 C OE2 GLU 68 H GLU 80 1_555 H CA CA . H CA 376 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.531 ? metalc ? metalc5 H CA CA . H CA 376 1_555 K O HOH . H HOH 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.826 ? # _chem_comp.formula 'Ca 2' _chem_comp.formula_weight 40.078 _chem_comp.id CA _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'CALCIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1J9C _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.012981 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000481 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.014641 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.012758 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code D 4 GLC L 1 352 52 GLC GLC . E 5 FUL L 1 360 60 FUL FUC . F 6 0Z6 H 1 1 1 0Z6 PHE . G 7 NAG H 1 375 175 NAG NAG . H 8 CA H 1 376 1 CA CA2 . I 9 HOH T 1 211 4 HOH WAT . I 9 HOH T 2 212 10 HOH WAT . I 9 HOH T 3 213 22 HOH WAT . I 9 HOH T 4 214 24 HOH WAT . I 9 HOH T 5 215 28 HOH WAT . I 9 HOH T 6 216 37 HOH WAT . I 9 HOH T 7 217 39 HOH WAT . I 9 HOH T 8 218 44 HOH WAT . I 9 HOH T 9 219 54 HOH WAT . I 9 HOH T 10 220 62 HOH WAT . I 9 HOH T 11 221 84 HOH WAT . I 9 HOH T 12 222 87 HOH WAT . I 9 HOH T 13 223 89 HOH WAT . I 9 HOH T 14 224 92 HOH WAT . I 9 HOH T 15 225 96 HOH WAT . I 9 HOH T 16 226 101 HOH WAT . I 9 HOH T 17 227 111 HOH WAT . I 9 HOH T 18 228 113 HOH WAT . I 9 HOH T 19 229 120 HOH WAT . I 9 HOH T 20 230 121 HOH WAT . I 9 HOH T 21 231 125 HOH WAT . J 9 HOH L 1 361 6 HOH WAT . J 9 HOH L 2 362 13 HOH WAT . J 9 HOH L 3 363 14 HOH WAT . J 9 HOH L 4 364 18 HOH WAT . J 9 HOH L 5 365 20 HOH WAT . J 9 HOH L 6 366 25 HOH WAT . J 9 HOH L 7 367 26 HOH WAT . J 9 HOH L 8 368 27 HOH WAT . J 9 HOH L 9 369 29 HOH WAT . J 9 HOH L 10 370 30 HOH WAT . J 9 HOH L 11 371 32 HOH WAT . J 9 HOH L 12 372 33 HOH WAT . J 9 HOH L 13 373 38 HOH WAT . J 9 HOH L 14 374 48 HOH WAT . J 9 HOH L 15 375 49 HOH WAT . J 9 HOH L 16 376 50 HOH WAT . J 9 HOH L 17 377 60 HOH WAT . J 9 HOH L 18 378 63 HOH WAT . J 9 HOH L 19 379 64 HOH WAT . J 9 HOH L 20 380 66 HOH WAT . J 9 HOH L 21 381 76 HOH WAT . J 9 HOH L 22 382 79 HOH WAT . J 9 HOH L 23 383 80 HOH WAT . J 9 HOH L 24 384 91 HOH WAT . J 9 HOH L 25 385 99 HOH WAT . J 9 HOH L 26 386 104 HOH WAT . J 9 HOH L 27 387 108 HOH WAT . J 9 HOH L 28 388 117 HOH WAT . J 9 HOH L 29 389 118 HOH WAT . J 9 HOH L 30 390 119 HOH WAT . J 9 HOH L 31 391 124 HOH WAT . K 9 HOH H 1 258 34 HOH WAT . K 9 HOH H 2 377 1 HOH WAT . K 9 HOH H 3 378 2 HOH WAT . K 9 HOH H 4 379 3 HOH WAT . K 9 HOH H 5 380 5 HOH WAT . K 9 HOH H 6 381 7 HOH WAT . K 9 HOH H 7 382 8 HOH WAT . K 9 HOH H 8 383 9 HOH WAT . K 9 HOH H 9 384 11 HOH WAT . K 9 HOH H 10 385 12 HOH WAT . K 9 HOH H 11 386 15 HOH WAT . K 9 HOH H 12 387 16 HOH WAT . K 9 HOH H 13 388 17 HOH WAT . K 9 HOH H 14 389 19 HOH WAT . K 9 HOH H 15 390 21 HOH WAT . K 9 HOH H 16 391 23 HOH WAT . K 9 HOH H 17 392 31 HOH WAT . K 9 HOH H 18 393 35 HOH WAT . K 9 HOH H 19 394 36 HOH WAT . K 9 HOH H 20 395 40 HOH WAT . K 9 HOH H 21 396 41 HOH WAT . K 9 HOH H 22 397 42 HOH WAT . K 9 HOH H 23 398 43 HOH WAT . K 9 HOH H 24 399 45 HOH WAT . K 9 HOH H 25 400 46 HOH WAT . K 9 HOH H 26 401 47 HOH WAT . K 9 HOH H 27 402 51 HOH WAT . K 9 HOH H 28 403 53 HOH WAT . K 9 HOH H 29 404 55 HOH WAT . K 9 HOH H 30 405 56 HOH WAT . K 9 HOH H 31 406 57 HOH WAT . K 9 HOH H 32 407 58 HOH WAT . K 9 HOH H 33 408 59 HOH WAT . K 9 HOH H 34 409 61 HOH WAT . K 9 HOH H 35 410 65 HOH WAT . K 9 HOH H 36 411 67 HOH WAT . K 9 HOH H 37 412 68 HOH WAT . K 9 HOH H 38 413 69 HOH WAT . K 9 HOH H 39 414 70 HOH WAT . K 9 HOH H 40 415 71 HOH WAT . K 9 HOH H 41 416 72 HOH WAT . K 9 HOH H 42 417 73 HOH WAT . K 9 HOH H 43 418 74 HOH WAT . K 9 HOH H 44 419 75 HOH WAT . K 9 HOH H 45 420 77 HOH WAT . K 9 HOH H 46 421 78 HOH WAT . K 9 HOH H 47 422 81 HOH WAT . K 9 HOH H 48 423 82 HOH WAT . K 9 HOH H 49 424 83 HOH WAT . K 9 HOH H 50 425 85 HOH WAT . K 9 HOH H 51 426 86 HOH WAT . K 9 HOH H 52 427 88 HOH WAT . K 9 HOH H 53 428 90 HOH WAT . K 9 HOH H 54 429 93 HOH WAT . K 9 HOH H 55 430 94 HOH WAT . K 9 HOH H 56 431 95 HOH WAT . K 9 HOH H 57 432 97 HOH WAT . K 9 HOH H 58 433 98 HOH WAT . K 9 HOH H 59 434 100 HOH WAT . K 9 HOH H 60 435 102 HOH WAT . K 9 HOH H 61 436 103 HOH WAT . K 9 HOH H 62 437 105 HOH WAT . K 9 HOH H 63 438 106 HOH WAT . K 9 HOH H 64 439 107 HOH WAT . K 9 HOH H 65 440 109 HOH WAT . K 9 HOH H 66 441 110 HOH WAT . K 9 HOH H 67 442 112 HOH WAT . K 9 HOH H 68 443 114 HOH WAT . K 9 HOH H 69 444 115 HOH WAT . K 9 HOH H 70 445 116 HOH WAT . K 9 HOH H 71 446 122 HOH WAT . K 9 HOH H 72 447 123 HOH WAT . K 9 HOH H 73 448 127 HOH WAT . K 9 HOH H 74 449 128 HOH WAT . K 9 HOH H 75 450 130 HOH WAT . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol CA _atom_site.label_atom_id CA _atom_site.label_comp_id CA _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id H _atom_site.label_entity_id 8 _atom_site.Cartn_x 38.593 _atom_site.Cartn_y 3.861 _atom_site.Cartn_z -6.699 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 13.1 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id CA _atom_site.auth_comp_id CA _atom_site.auth_seq_id 376 _atom_site.auth_asym_id H _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 10 _model_server_stats.parse_time_ms 11 _model_server_stats.create_model_time_ms 6 _model_server_stats.query_time_ms 313 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #