data_1JA9 # _model_server_result.job_id LnfCo1U8gW8_H0wo8niH-Q _model_server_result.datetime_utc '2024-11-21 22:22:11' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1ja9 # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"C","auth_seq_id":406}' # _entry.id 1JA9 # _exptl.entry_id 1JA9 _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 173.211 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description PYROQUILON _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 90 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1JA9 _cell.length_a 94.8 _cell.length_b 94.8 _cell.length_c 71.2 _cell.Z_PDB 8 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1JA9 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 94 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 42 21 2' # _pdbx_struct_assembly.method_details PISA,PQS _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetrameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 4 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.id 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1,2,3,4 # loop_ _pdbx_struct_oper_list.id _pdbx_struct_oper_list.type _pdbx_struct_oper_list.name _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] _pdbx_struct_oper_list.vector[1] _pdbx_struct_oper_list.vector[2] _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 1 'identity operation' 1_555 x,y,z 1 0 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 2 'crystal symmetry operation' 2_755 -x+2,-y,z -1 0 0 0 -1 0 0 0 1 189.6 0 0 3 'crystal symmetry operation' 7_645 y+1,x-1,-z 0 1 0 1 0 0 0 0 -1 94.8 -94.8 0 4 'crystal symmetry operation' 8_665 -y+1,-x+1,-z 0 -1 0 -1 0 0 0 0 -1 94.8 94.8 0 # _struct_asym.details ? _struct_asym.entity_id 3 _struct_asym.id C _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N # _chem_comp.formula 'C11 H11 N O' _chem_comp.formula_weight 173.211 _chem_comp.id PYQ _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name PYROQUILON _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms 1,2,5,6-TETRAHYDRO-4H-PYRROLO(3,2,1-IJ)QUINOLIN-4-ONE # loop_ _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_ordinal _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag C1 C2 PYQ doub 359 n y C1 C14 PYQ sing 360 n y C1 H11 PYQ sing 361 n n C2 C3 PYQ sing 362 n y C2 C12 PYQ sing 363 n n C3 C5 PYQ doub 364 n y C3 N8 PYQ sing 365 n n C5 C6 PYQ sing 366 n n C5 C13 PYQ sing 367 n y C6 C7 PYQ sing 368 n n C6 H61 PYQ sing 369 n n C6 H62 PYQ sing 370 n n C7 N8 PYQ sing 371 n n C7 H71 PYQ sing 372 n n C7 H72 PYQ sing 373 n n N8 C9 PYQ sing 374 n n C9 O10 PYQ doub 375 n n C9 C11 PYQ sing 376 n n C11 C12 PYQ sing 377 n n C11 H111 PYQ sing 378 n n C11 H112 PYQ sing 379 n n C12 H121 PYQ sing 380 n n C12 H122 PYQ sing 381 n n C13 C14 PYQ doub 382 n y C13 H131 PYQ sing 383 n n C14 H141 PYQ sing 384 n n # _atom_sites.entry_id 1JA9 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.010549 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.010549 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.014045 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code B 2 NDP A 1 402 402 NDP NDP . C 3 PYQ A 1 406 406 PYQ PYQ . D 4 HOH A 1 501 501 HOH WAT . D 4 HOH A 2 502 502 HOH WAT . D 4 HOH A 3 503 503 HOH WAT . D 4 HOH A 4 504 504 HOH WAT . D 4 HOH A 5 505 505 HOH WAT . D 4 HOH A 6 506 506 HOH WAT . D 4 HOH A 7 507 507 HOH WAT . D 4 HOH A 8 508 508 HOH WAT . D 4 HOH A 9 509 509 HOH WAT . D 4 HOH A 10 510 510 HOH WAT . D 4 HOH A 11 511 511 HOH WAT . D 4 HOH A 12 512 512 HOH WAT . D 4 HOH A 13 513 513 HOH WAT . D 4 HOH A 14 514 514 HOH WAT . D 4 HOH A 15 515 515 HOH WAT . D 4 HOH A 16 516 516 HOH WAT . D 4 HOH A 17 517 517 HOH WAT . D 4 HOH A 18 518 518 HOH WAT . D 4 HOH A 19 519 519 HOH WAT . D 4 HOH A 20 520 520 HOH WAT . D 4 HOH A 21 521 521 HOH WAT . D 4 HOH A 22 522 522 HOH WAT . D 4 HOH A 23 523 523 HOH WAT . D 4 HOH A 24 524 524 HOH WAT . D 4 HOH A 25 525 525 HOH WAT . D 4 HOH A 26 526 526 HOH WAT . D 4 HOH A 27 527 527 HOH WAT . D 4 HOH A 28 528 528 HOH WAT . D 4 HOH A 29 529 529 HOH WAT . D 4 HOH A 30 530 530 HOH WAT . D 4 HOH A 31 531 531 HOH WAT . D 4 HOH A 32 532 532 HOH WAT . D 4 HOH A 33 533 533 HOH WAT . D 4 HOH A 34 534 534 HOH WAT . D 4 HOH A 35 535 535 HOH WAT . D 4 HOH A 36 536 536 HOH WAT . D 4 HOH A 37 537 537 HOH WAT . D 4 HOH A 38 538 538 HOH WAT . D 4 HOH A 39 539 539 HOH WAT . D 4 HOH A 40 540 540 HOH WAT . D 4 HOH A 41 541 541 HOH WAT . D 4 HOH A 42 542 542 HOH WAT . D 4 HOH A 43 543 543 HOH WAT . D 4 HOH A 44 544 544 HOH WAT . D 4 HOH A 45 545 545 HOH WAT . D 4 HOH A 46 546 546 HOH WAT . D 4 HOH A 47 547 547 HOH WAT . D 4 HOH A 48 548 548 HOH WAT . D 4 HOH A 49 549 549 HOH WAT . D 4 HOH A 50 550 550 HOH WAT . D 4 HOH A 51 551 551 HOH WAT . D 4 HOH A 52 552 552 HOH WAT . D 4 HOH A 53 553 553 HOH WAT . D 4 HOH A 54 554 554 HOH WAT . D 4 HOH A 55 555 555 HOH WAT . D 4 HOH A 56 556 556 HOH WAT . D 4 HOH A 57 557 557 HOH WAT . D 4 HOH A 58 558 558 HOH WAT . D 4 HOH A 59 559 559 HOH WAT . D 4 HOH A 60 560 560 HOH WAT . D 4 HOH A 61 561 561 HOH WAT . D 4 HOH A 62 562 562 HOH WAT . D 4 HOH A 63 563 563 HOH WAT . D 4 HOH A 64 564 564 HOH WAT . D 4 HOH A 65 565 565 HOH WAT . D 4 HOH A 66 566 566 HOH WAT . D 4 HOH A 67 567 567 HOH WAT . D 4 HOH A 68 568 568 HOH WAT . D 4 HOH A 69 569 569 HOH WAT . D 4 HOH A 70 570 570 HOH WAT . D 4 HOH A 71 571 571 HOH WAT . D 4 HOH A 72 572 572 HOH WAT . D 4 HOH A 73 573 573 HOH WAT . D 4 HOH A 74 574 574 HOH WAT . D 4 HOH A 75 575 575 HOH WAT . D 4 HOH A 76 576 576 HOH WAT . D 4 HOH A 77 577 577 HOH WAT . D 4 HOH A 78 578 578 HOH WAT . D 4 HOH A 79 579 579 HOH WAT . D 4 HOH A 80 580 580 HOH WAT . D 4 HOH A 81 581 581 HOH WAT . D 4 HOH A 82 582 582 HOH WAT . D 4 HOH A 83 583 583 HOH WAT . D 4 HOH A 84 584 584 HOH WAT . D 4 HOH A 85 585 585 HOH WAT . D 4 HOH A 86 586 586 HOH WAT . D 4 HOH A 87 587 587 HOH WAT . D 4 HOH A 88 588 588 HOH WAT . D 4 HOH A 89 589 589 HOH WAT . D 4 HOH A 90 590 590 HOH WAT . D 4 HOH A 91 591 591 HOH WAT . D 4 HOH A 92 592 592 HOH WAT . D 4 HOH A 93 593 593 HOH WAT . D 4 HOH A 94 594 594 HOH WAT . D 4 HOH A 95 595 595 HOH WAT . D 4 HOH A 96 596 596 HOH WAT . D 4 HOH A 97 597 597 HOH WAT . D 4 HOH A 98 598 598 HOH WAT . D 4 HOH A 99 599 599 HOH WAT . D 4 HOH A 100 600 600 HOH WAT . D 4 HOH A 101 601 601 HOH WAT . D 4 HOH A 102 602 602 HOH WAT . D 4 HOH A 103 603 603 HOH WAT . D 4 HOH A 104 604 604 HOH WAT . D 4 HOH A 105 605 605 HOH WAT . D 4 HOH A 106 606 606 HOH WAT . D 4 HOH A 107 607 607 HOH WAT . D 4 HOH A 108 608 608 HOH WAT . D 4 HOH A 109 609 609 HOH WAT . D 4 HOH A 110 610 610 HOH WAT . D 4 HOH A 111 611 611 HOH WAT . D 4 HOH A 112 612 612 HOH WAT . D 4 HOH A 113 613 613 HOH WAT . D 4 HOH A 114 614 614 HOH WAT . D 4 HOH A 115 615 615 HOH WAT . D 4 HOH A 116 616 616 HOH WAT . D 4 HOH A 117 617 617 HOH WAT . D 4 HOH A 118 618 618 HOH WAT . D 4 HOH A 119 619 619 HOH WAT . D 4 HOH A 120 620 620 HOH WAT . D 4 HOH A 121 621 621 HOH WAT . D 4 HOH A 122 622 622 HOH WAT . D 4 HOH A 123 623 623 HOH WAT . D 4 HOH A 124 624 624 HOH WAT . D 4 HOH A 125 625 625 HOH WAT . D 4 HOH A 126 626 626 HOH WAT . D 4 HOH A 127 627 627 HOH WAT . D 4 HOH A 128 628 628 HOH WAT . D 4 HOH A 129 629 629 HOH WAT . D 4 HOH A 130 630 630 HOH WAT . D 4 HOH A 131 631 631 HOH WAT . D 4 HOH A 132 632 632 HOH WAT . D 4 HOH A 133 633 633 HOH WAT . D 4 HOH A 134 634 634 HOH WAT . D 4 HOH A 135 635 635 HOH WAT . D 4 HOH A 136 636 636 HOH WAT . D 4 HOH A 137 637 637 HOH WAT . D 4 HOH A 138 638 638 HOH WAT . D 4 HOH A 139 639 639 HOH WAT . D 4 HOH A 140 640 640 HOH WAT . D 4 HOH A 141 641 641 HOH WAT . D 4 HOH A 142 642 642 HOH WAT . D 4 HOH A 143 643 643 HOH WAT . D 4 HOH A 144 644 644 HOH WAT . D 4 HOH A 145 645 645 HOH WAT . D 4 HOH A 146 646 646 HOH WAT . D 4 HOH A 147 647 647 HOH WAT . D 4 HOH A 148 648 648 HOH WAT . D 4 HOH A 149 649 649 HOH WAT . D 4 HOH A 150 650 650 HOH WAT . D 4 HOH A 151 651 651 HOH WAT . D 4 HOH A 152 652 652 HOH WAT . D 4 HOH A 153 653 653 HOH WAT . D 4 HOH A 154 654 654 HOH WAT . D 4 HOH A 155 655 655 HOH WAT . D 4 HOH A 156 656 656 HOH WAT . D 4 HOH A 157 657 657 HOH WAT . D 4 HOH A 158 658 658 HOH WAT . D 4 HOH A 159 659 659 HOH WAT . D 4 HOH A 160 660 660 HOH WAT . D 4 HOH A 161 661 661 HOH WAT . D 4 HOH A 162 662 662 HOH WAT . D 4 HOH A 163 663 663 HOH WAT . D 4 HOH A 164 664 664 HOH WAT . D 4 HOH A 165 665 665 HOH WAT . D 4 HOH A 166 666 666 HOH WAT . D 4 HOH A 167 667 667 HOH WAT . D 4 HOH A 168 668 668 HOH WAT . D 4 HOH A 169 669 669 HOH WAT . D 4 HOH A 170 670 670 HOH WAT . D 4 HOH A 171 671 671 HOH WAT . D 4 HOH A 172 672 672 HOH WAT . D 4 HOH A 173 673 673 HOH WAT . D 4 HOH A 174 674 674 HOH WAT . D 4 HOH A 175 675 675 HOH WAT . D 4 HOH A 176 676 676 HOH WAT . D 4 HOH A 177 677 677 HOH WAT . D 4 HOH A 178 678 678 HOH WAT . D 4 HOH A 179 679 679 HOH WAT . D 4 HOH A 180 680 680 HOH WAT . D 4 HOH A 181 681 681 HOH WAT . D 4 HOH A 182 682 682 HOH WAT . D 4 HOH A 183 683 683 HOH WAT . D 4 HOH A 184 684 684 HOH WAT . D 4 HOH A 185 685 685 HOH WAT . D 4 HOH A 186 686 686 HOH WAT . D 4 HOH A 187 687 687 HOH WAT . D 4 HOH A 188 688 688 HOH WAT . D 4 HOH A 189 689 689 HOH WAT . D 4 HOH A 190 690 690 HOH WAT . D 4 HOH A 191 691 691 HOH WAT . D 4 HOH A 192 692 692 HOH WAT . D 4 HOH A 193 693 693 HOH WAT . D 4 HOH A 194 694 694 HOH WAT . D 4 HOH A 195 695 695 HOH WAT . D 4 HOH A 196 696 696 HOH WAT . D 4 HOH A 197 697 697 HOH WAT . D 4 HOH A 198 698 698 HOH WAT . D 4 HOH A 199 699 699 HOH WAT . D 4 HOH A 200 700 700 HOH WAT . D 4 HOH A 201 701 701 HOH WAT . D 4 HOH A 202 702 702 HOH WAT . D 4 HOH A 203 703 703 HOH WAT . D 4 HOH A 204 704 704 HOH WAT . D 4 HOH A 205 705 705 HOH WAT . D 4 HOH A 206 706 706 HOH WAT . D 4 HOH A 207 707 707 HOH WAT . D 4 HOH A 208 708 708 HOH WAT . D 4 HOH A 209 709 709 HOH WAT . D 4 HOH A 210 710 710 HOH WAT . D 4 HOH A 211 711 711 HOH WAT . D 4 HOH A 212 712 712 HOH WAT . D 4 HOH A 213 713 713 HOH WAT . D 4 HOH A 214 714 714 HOH WAT . D 4 HOH A 215 715 715 HOH WAT . D 4 HOH A 216 716 716 HOH WAT . D 4 HOH A 217 717 717 HOH WAT . D 4 HOH A 218 718 718 HOH WAT . # loop_ _atom_site.group_PDB _atom_site.id _atom_site.type_symbol _atom_site.label_atom_id _atom_site.label_comp_id _atom_site.label_seq_id _atom_site.label_alt_id _atom_site.pdbx_PDB_ins_code _atom_site.label_asym_id _atom_site.label_entity_id _atom_site.Cartn_x _atom_site.Cartn_y _atom_site.Cartn_z _atom_site.occupancy _atom_site.B_iso_or_equiv _atom_site.pdbx_formal_charge _atom_site.auth_atom_id _atom_site.auth_comp_id _atom_site.auth_seq_id _atom_site.auth_asym_id _atom_site.pdbx_PDB_model_num HETATM 1 C C1 PYQ . . . C 3 100.94 18.289 10.414 1 12.97 ? C1 PYQ 406 A 1 HETATM 2 C C2 PYQ . . . C 3 100.26 17.148 10.892 1 13.55 ? C2 PYQ 406 A 1 HETATM 3 C C3 PYQ . . . C 3 99.968 16.133 9.94 1 12.11 ? C3 PYQ 406 A 1 HETATM 4 C C5 PYQ . . . C 3 100.316 16.218 8.579 1 12.47 ? C5 PYQ 406 A 1 HETATM 5 C C6 PYQ . . . C 3 99.838 14.95 7.882 1 13.04 ? C6 PYQ 406 A 1 HETATM 6 C C7 PYQ . . . C 3 99.175 14.177 9.075 1 13.07 ? C7 PYQ 406 A 1 HETATM 7 N N8 PYQ . . . C 3 99.32 14.977 10.226 1 13.59 ? N8 PYQ 406 A 1 HETATM 8 C C9 PYQ . . . C 3 98.907 14.729 11.497 1 12.79 ? C9 PYQ 406 A 1 HETATM 9 O O10 PYQ . . . C 3 98.293 13.641 11.767 1 13.6 ? O10 PYQ 406 A 1 HETATM 10 C C11 PYQ . . . C 3 99.158 15.686 12.525 1 12.93 ? C11 PYQ 406 A 1 HETATM 11 C C12 PYQ . . . C 3 99.833 16.903 12.239 1 13.27 ? C12 PYQ 406 A 1 HETATM 12 C C13 PYQ . . . C 3 100.993 17.355 8.098 1 11.66 ? C13 PYQ 406 A 1 HETATM 13 C C14 PYQ . . . C 3 101.302 18.389 9.03 1 12.89 ? C14 PYQ 406 A 1 # _model_server_stats.io_time_ms 24 _model_server_stats.parse_time_ms 8 _model_server_stats.create_model_time_ms 27 _model_server_stats.query_time_ms 336 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 13 #