data_1JBT # _model_server_result.job_id 0zVPyox0RG80jEsDQnsV9A _model_server_result.datetime_utc '2024-11-22 09:35:32' _model_server_result.server_version 0.9.12 _model_server_result.query_name ligand _model_server_result.source_id pdb-bcif _model_server_result.entry_id 1jbt # _model_server_params.name atom_site _model_server_params.value '{"label_asym_id":"E","auth_seq_id":30}' # _entry.id 1JBT # _exptl.entry_id 1JBT _exptl.method 'X-RAY DIFFRACTION' # _entity.details ? _entity.formula_weight 39.098 _entity.id 3 _entity.src_method syn _entity.type non-polymer _entity.pdbx_description 'POTASSIUM ION' _entity.pdbx_number_of_molecules 6 _entity.pdbx_parent_entity_id . _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.pdbx_ec ? # _cell.angle_alpha 90 _cell.angle_beta 93.88 _cell.angle_gamma 90 _cell.entry_id 1JBT _cell.length_a 62.001 _cell.length_b 102.822 _cell.length_c 41.617 _cell.Z_PDB 4 _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 1JBT _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall . _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' # loop_ _pdbx_struct_assembly.method_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count _pdbx_struct_assembly.details _pdbx_struct_assembly.id ? dimeric 2 author_defined_assembly 1 ? dimeric 2 author_defined_assembly 2 # loop_ _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression A,C,E,F,G 1 1 B,D,H,I,J 2 1 # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0 # loop_ _struct_asym.details _struct_asym.entity_id _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag ? 3 E N N ? 3 F N N ? 3 G N N ? 3 H N N ? 3 I N N ? 3 J N N # loop_ _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.details _struct_conn.id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf ? disulf1 C SG CYS 5 A CYS 5 1_555 C SG CYS 147 A CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf ? disulf2 C SG CYS 75 A CYS 75 1_555 C SG CYS 131 A CYS 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? disulf ? disulf3 D SG CYS 5 B CYS 5 1_555 D SG CYS 147 B CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.03 ? disulf ? disulf4 D SG CYS 75 B CYS 75 1_555 D SG CYS 131 B CYS 131 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? metalc ? metalc1 A O4 U 7 C U 7 1_555 E K K . C K 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.526 ? metalc ? metalc2 A O6 G 14 C G 14 1_555 F K K . C K 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.591 ? metalc ? metalc3 A N7 G 24 C G 24 1_555 G K K . C K 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.953 ? metalc ? metalc4 A O6 G 24 C G 24 1_555 G K K . C K 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.571 ? metalc ? metalc5 B O4 U 7 D U 7 1_555 J K K . D K 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.732 ? metalc ? metalc6 B O6 G 14 D G 14 1_555 H K K . D K 30 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.817 ? metalc ? metalc7 B OP2 A 21 D A 21 1_555 J K K . D K 32 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.65 ? metalc ? metalc8 B O6 G 24 D G 24 1_555 I K K . D K 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2.679 ? metalc ? metalc9 B N7 G 24 D G 24 1_555 I K K . D K 31 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3.281 ? hydrog WATSON-CRICK hydrog1 A N3 C 1 C C 1 1_555 A N1 G 29 C G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog2 A N4 C 1 C C 1 1_555 A O6 G 29 C G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog3 A O2 C 1 C C 1 1_555 A N2 G 29 C G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog4 A N1 G 2 C G 2 1_555 A N3 C 28 C C 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog5 A N2 G 2 C G 2 1_555 A O2 C 28 C C 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog6 A O6 G 2 C G 2 1_555 A N4 C 28 C C 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog7 A N3 C 3 C C 3 1_555 A N1 G 27 C G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog8 A N4 C 3 C C 3 1_555 A O6 G 27 C G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog9 A O2 C 3 C C 3 1_555 A N2 G 27 C G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog10 A N3 U 4 C U 4 1_555 A N1 A 26 C A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog11 A O4 U 4 C U 4 1_555 A N6 A 26 C A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog12 A N3 C 5 C C 5 1_555 A N1 G 25 C G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog13 A N4 C 5 C C 5 1_555 A O6 G 25 C G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog14 A O2 C 5 C C 5 1_555 A N2 G 25 C G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog15 A N3 C 6 C C 6 1_555 A N1 G 24 C G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog16 A N4 C 6 C C 6 1_555 A O6 G 24 C G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog17 A O2 C 6 C C 6 1_555 A N2 G 24 C G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-C MISPAIR' hydrog18 A O2 U 7 C U 7 1_555 A N4 C 23 C C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-C MISPAIR' hydrog19 A O2 C 8 C C 8 1_555 A N4 C 22 C C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-C MISPAIR' hydrog20 A O2 C 8 C C 8 1_555 A N4 C 23 C C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog21 A N6 A 9 C A 9 1_555 A N7 A 21 C A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog22 A N7 A 9 C A 9 1_555 A N6 A 21 C A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog23 A N2 G 10 C G 10 1_555 A O4 U 11 C U 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog24 A N3 U 11 C U 11 1_555 A N7 A 20 C A 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog25 A O2 U 11 C U 11 1_555 A N6 A 20 C A 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog26 A N6 A 12 C A 12 1_555 A N3 G 19 C G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog27 A N7 A 12 C A 12 1_555 A N2 G 19 C G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog28 A N3 C 13 C C 13 1_555 A N1 G 18 C G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog29 A N4 C 13 C C 13 1_555 A O6 G 18 C G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog30 A O2 C 13 C C 13 1_555 A N2 G 18 C G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog31 B N3 C 1 D C 1 1_555 B N1 G 29 D G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog32 B N4 C 1 D C 1 1_555 B O6 G 29 D G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog33 B O2 C 1 D C 1 1_555 B N2 G 29 D G 29 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog34 B N1 G 2 D G 2 1_555 B N3 C 28 D C 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog35 B N2 G 2 D G 2 1_555 B O2 C 28 D C 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog36 B O6 G 2 D G 2 1_555 B N4 C 28 D C 28 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog37 B N3 C 3 D C 3 1_555 B N1 G 27 D G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog38 B N4 C 3 D C 3 1_555 B O6 G 27 D G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog39 B O2 C 3 D C 3 1_555 B N2 G 27 D G 27 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog40 B N3 U 4 D U 4 1_555 B N1 A 26 D A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog41 B O4 U 4 D U 4 1_555 B N6 A 26 D A 26 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog42 B N3 C 5 D C 5 1_555 B N1 G 25 D G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog43 B N4 C 5 D C 5 1_555 B O6 G 25 D G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog44 B O2 C 5 D C 5 1_555 B N2 G 25 D G 25 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog45 B N3 C 6 D C 6 1_555 B N1 G 24 D G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog46 B N4 C 6 D C 6 1_555 B O6 G 24 D G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog47 B O2 C 6 D C 6 1_555 B N2 G 24 D G 24 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'U-C MISPAIR' hydrog48 B O2 U 7 D U 7 1_555 B N4 C 23 D C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-C MISPAIR' hydrog49 B O2 C 8 D C 8 1_555 B N4 C 22 D C 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'C-C MISPAIR' hydrog50 B O2 C 8 D C 8 1_555 B N4 C 23 D C 23 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog51 B N6 A 9 D A 9 1_555 B N7 A 21 D A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_2_PAIR hydrog52 B N7 A 9 D A 9 1_555 B N6 A 21 D A 21 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'G-U MISPAIR' hydrog53 B N2 G 10 D G 10 1_555 B O4 U 11 D U 11 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog54 B N3 U 11 D U 11 1_555 B N7 A 20 D A 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog 'REVERSED HOOGSTEEN' hydrog55 B O2 U 11 D U 11 1_555 B N6 A 20 D A 20 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog56 B N6 A 12 D A 12 1_555 B N3 G 19 D G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog TYPE_11_PAIR hydrog57 B N7 A 12 D A 12 1_555 B N2 G 19 D G 19 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog58 B N3 C 13 D C 13 1_555 B N1 G 18 D G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog59 B N4 C 13 D C 13 1_555 B O6 G 18 D G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? hydrog WATSON-CRICK hydrog60 B O2 C 13 D C 13 1_555 B N2 G 18 D G 18 1_555 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _chem_comp.formula 'K 1' _chem_comp.formula_weight 39.098 _chem_comp.id K _chem_comp.mon_nstd_flag . _chem_comp.name 'POTASSIUM ION' _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_synonyms ? # _atom_sites.entry_id 1JBT _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 0.016129 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.001094 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 0.009726 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 0.024084 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0 # loop_ _pdbx_nonpoly_scheme.asym_id _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_strand_id _pdbx_nonpoly_scheme.ndb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_ins_code E 3 K C 1 30 1 K K . F 3 K C 1 31 2 K K . G 3 K C 1 32 4 K K . H 3 K D 1 30 3 K K . I 3 K D 1 31 5 K K . J 3 K D 1 32 6 K K . # _atom_site.group_PDB HETATM _atom_site.id 1 _atom_site.type_symbol K _atom_site.label_atom_id K _atom_site.label_comp_id K _atom_site.label_seq_id . _atom_site.label_alt_id . _atom_site.pdbx_PDB_ins_code . _atom_site.label_asym_id E _atom_site.label_entity_id 3 _atom_site.Cartn_x 27.085 _atom_site.Cartn_y 54.086 _atom_site.Cartn_z 16.398 _atom_site.occupancy 1 _atom_site.B_iso_or_equiv 39.78 _atom_site.pdbx_formal_charge ? _atom_site.auth_atom_id K _atom_site.auth_comp_id K _atom_site.auth_seq_id 30 _atom_site.auth_asym_id C _atom_site.pdbx_PDB_model_num 1 # _model_server_stats.io_time_ms 38 _model_server_stats.parse_time_ms 16 _model_server_stats.create_model_time_ms 14 _model_server_stats.query_time_ms 660 _model_server_stats.encode_time_ms 3 _model_server_stats.element_count 1 #